密級 論文編號： 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 學(xué)位論文 水貂血液蛋白多態(tài)性與經(jīng)濟(jì)性狀 相關(guān)的研究 I s 要 采用垂直板聚丙烯酰胺凝膠電泳法對我國飼養(yǎng)的美國短毛黑，大連金州黑水貂和左家型水貂血液中的紅細(xì)胞血紅蛋白（ 白蛋白（ 紅細(xì)胞酯酶（ 轉(zhuǎn)鐵蛋白（ 慢球蛋白（ 后白蛋白（ 前白蛋白（ 碳酸酐酶（ 血清酯酶 (抗胰蛋白酶（ 過氧化物酶（ 維生素 14個蛋白位點進(jìn)行檢測。檢測結(jié)果表明 三個類型中沒有多態(tài)性， 美國短毛黑和金州黑中沒有多態(tài)性，其他位點都具有多態(tài)性，血清酯酶由三個共顯性等位基因控制，其他位點都有兩個共顯性等位基因控制， 同一種蛋白，（ 離效果不清晰）。 各個群體中不同位點的 （ P,沒有非平衡位點； 左家型水貂中為平衡位點（ P,左家型水貂。 聚類分析結(jié)果反映了 3 個水貂類型間的親緣關(guān)系， 左家型水貂和大連金州黑之間遺傳距離最近（ 金州黑與美國短毛黑之間的遺傳距離最遠(yuǎn)（ 其次是左家型和美國短 毛黑，它們的遺傳距離是 明利用蛋白多態(tài)性識別及探討水貂品種、品系間的親緣關(guān)系是可行的。 通過建立一般線性模型對美國短毛黑，大連金州黑和左家型水貂遺傳標(biāo)記的篩選，方差分析表明： 左家型水貂皮張長度有影響顯著， 美國短毛黑針絨毛長度比之間存在顯著相關(guān) ,， 絨毛長度比 影響較大的位點 , 最小二乘均數(shù)結(jié)果表明 ：左家型水貂 國短毛黑中 州黑水貂 州黑水貂 州黑水貂 關(guān)鍵詞 水貂，雜合度， 液蛋白多態(tài)性，經(jīng)濟(jì)性狀 of in a i b)， f)， o)， r)，A)， GC)s)， by of in C,b in da he of by by o Es It of ox of of of in a i is it be by of it be by of of is ,沒有非平衡位點。 P, , 非平衡位點（ 國短毛黑血液蛋白位點 雜合度的大小順序依次為 o家型水貂血液蛋白位點的 雜合度的大小順序依次為f 不同的水貂類型，其同一位點的雜合度和有效等位基因數(shù)的大小順序也不同。對于 家型水貂 大連金州黑 美國短毛黑， 家型水貂 大連金州黑 美國短毛黑，國短毛黑 左家型水貂 大連金州黑， 國短毛黑 左家型 水貂 大連金州黑， 國短毛黑 大連金州黑 左家型水貂，對于 點，僅在左家型水貂中發(fā)現(xiàn)了多態(tài)性，其它兩個類型是單態(tài)。 在三個類型的水貂中，平均雜合度的順序依次為：美國短毛黑 大連金州黑 左家型水貂 這就說明，不同水貂類型由于遺傳背景不同，變異程度也不盡相同。 同水貂品種的遺傳相似性和聚類分析 遺傳相似性的含義是指兩個類型各基因位點等位基因相同的概率，它反映了不同類型間親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近。遺傳相似性越高，兩個類型的親緣關(guān)系越近；反之，遺傳相似性越小，則類型間的親緣關(guān)系越遠(yuǎn)。聚類分析反映水貂起源 分化的變化走向 23。根據(jù)各個種群已測得的 5個多態(tài)位點（單態(tài)位點除外）等位基因的頻率，計算三個水貂類型間的遺傳相似系數(shù)和遺傳距離，結(jié)果見表 3 表 3水貂類型間的遺傳距離和相似系數(shù) 品種 左家型水貂 大連金州黑 美國短毛黑 左家型水貂 連金州黑 國短毛黑 注：表中下三角的數(shù)為遺傳相似系數(shù)，上三角的數(shù)據(jù)為 遺傳距離 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文 結(jié)果 23 由表 3所比較的 3個水貂類型中，左家型水貂和大連金州黑之間的遺 傳相似系數(shù)最大（ 遺傳距離最近（ 金州黑與美國短毛黑之間的遺傳相似系數(shù)最?。?遺傳距離最遠(yuǎn)（ 其次是左家型和美國短毛黑，這兩個類型間的遺傳相似系數(shù)和遺傳距離分別是（ （ 三個類型間的遺傳距離都很小，這就說明了三個類型的水貂起源相同。 直接根據(jù)遺傳距離按照類平均法聚類繪制聚類圖如圖 1： 金州黑 左家型 美國短毛黑 0 傳距離） 圖 1：三個類型水貂 聚類分析圖 同樣聚類分析結(jié)果也驗證了這一事實的正確性。聚類的結(jié)果與遺傳距離聚類相吻合，類平均法系統(tǒng)聚類結(jié)果見表 3 表 3 類平均法聚類分析表 聚類數(shù) 聚類連接 新類頻數(shù) 正態(tài) 離 2 ：表中的 表金州黑， 表左家型水貂， 表美國短毛黑。 由表可知，根據(jù)平均距離最短的原則，首先將左家型水貂和金州黑聚為 一類（ 然后將美國短毛黑與 并。正態(tài) 離不是品種間的遺傳距離 ,而是觀測之間距離的均方根，結(jié)果與遺傳距離相符合，系統(tǒng)聚類樹狀圖繪改后生成圖 2： 金州黑 左家型 美國短毛黑 0 態(tài) 圖 2：三個類型的水貂聚類分析圖 性模型篩選水貂的生化遺傳標(biāo)記 18 由于本試驗數(shù)據(jù)為非均衡數(shù)據(jù)，也就是數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)中每個分類因子各水平下（或各水平組合下 ）的觀測值數(shù)目不相等，即通常所說的次級樣本含量不等。因此采用最小二乘法（ 由于此法的分析模型靈活，可以消除次級樣本含量不等對均數(shù)和方差的影響，因而非常適用于本實驗資料的分析，在計算平均數(shù)、方差分析和資料校正時都很有用。用統(tǒng)計軟件的一般線性模型過程 我們提供了一個最小二乘分析的強有力工具，可以靈活地設(shè)計不同的分析模型對數(shù)據(jù)進(jìn)行相應(yīng)的處理。 本實驗 通過交叉分組資料的多因素最小二乘分析建立數(shù)學(xué)模型。 首先通過 選出對經(jīng)濟(jì)性狀影響較大的蛋中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文 結(jié)果 24 白位點，在這些多態(tài)蛋白位點和經(jīng)濟(jì)性狀之間建立線性模型。該部分的方差分析與 不設(shè)定假設(shè)檢驗輸出結(jié)果時，系統(tǒng)會自動輸出各因素所引起的型（ 型離均差平方和（ S）。對于非均衡資料而言，通常選用型平方和的結(jié)果。然后 進(jìn)行 不同處理水平間的差異顯著性檢驗。 本實驗主要經(jīng)濟(jì)性狀為左家型水貂的皮張長度，美國短毛黑和金州黑主要性狀是體重、體長、針絨毛的長度和細(xì)度，針絨毛長度比 。 態(tài)蛋白位點與左家型水貂皮張長度的關(guān)系 通過各多態(tài)蛋白位點與左家型水貂皮張長度之間的方差分析，逐個剔除方差分析中影響較小的位點，最后篩選出對皮張長度影響較大的多態(tài)蛋白位點。 1、 方差分析過程見表 3 表 3各多態(tài)蛋白位點與左家型水貂皮張長度之間的方差分析表 F S rF 代表差異顯著 方差分析結(jié)果，對于 F=P=明 于 F=P=明 于 F=P=即不同的 于 =明 于F=P=明 因此，篩選出蛋白位點 左家型水貂皮張長度影響顯著， 由此，將 點定為1 個分類變量，每個基因型為一個分類水平，建立如下線性模型： +家型水貂皮張長度 ，為總體均值， 定服從正態(tài)分布 N（ 0，2）， 進(jìn)行最小二乘均數(shù)及多重比較。 2、最小二乘均數(shù)及多重比較 （ 1）、 不同 張長度之最小二乘均數(shù)（標(biāo)準(zhǔn)誤）分別為 P=,且 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文 結(jié)果 25 統(tǒng)計結(jié)果見表 3 2）、 不同 A、 準(zhǔn)誤）分別為 和 P= P=間差異不顯著。 結(jié)果見表 3 表 3 小二乘均數(shù)及多重比較表 小二乘均數(shù) 標(biāo)準(zhǔn)誤 概率 表 3 之間的 最小二乘均數(shù)及多重比較表 小二乘均數(shù) 標(biāo)準(zhǔn)誤 概率 B A B . B . 上述分析結(jié)果看出 P= 說明 家型水貂皮張長度在遺傳上存在相關(guān)。最小二乘均數(shù)和多重比較結(jié)果表明，盡管 其基因型之間有顯著差異。結(jié)果還表明了其他三個多態(tài)位點（ 基因型之間也無顯著差異。 態(tài)蛋白位點與水貂針毛長度的關(guān)系 通過各多態(tài)蛋白位點與大連金州黑針毛長度之間的方差分析，逐個剔除方差分析中影響較小的位點，最后篩選出對針毛長度影響較大的多態(tài)蛋白位點。 1、 方差分析過程見表 3 方差分析結(jié)果，對于 F=P=明 于 言， F=P=明 于 言， F=P=明 同 基 因 型 對 金 州 黑 針 毛 長 度 無 顯 著 影 響 ; 對于 言 ，F(xiàn)=明 于 而言， F=P=明 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文 結(jié)果 26 表 3態(tài)蛋白位點與大連金州黑針毛長度的關(guān)系 F S rF O 2 此，這五個位點與大連金州黑針毛長度之間不存在顯著相關(guān)，也沒有一個位點有較大影響，而且最小二乘均數(shù)和多重比較結(jié)果也表明了各個位點的基因型之間也沒有顯著差異。 通過各多態(tài)蛋白位點與美國短毛黑針毛長度之間的方差分析，逐個剔除方差分析中影響較小的位點，最后篩選出對針毛長度影響較大的多態(tài)蛋白位點。 1、 方差分析過程見表 3差分析結(jié)果，對于 F=P=明 于 F=P=明 于 F=P=明 于 表 3 態(tài)蛋白位點與美國短毛黑針毛長度的方差分析 F S rF =明 于F=P=明 因此，這五個位點與美國短毛黑針毛長度之間不存在顯著相關(guān)，也沒有一個位點有較大影響，而且最小二乘均數(shù)和多重比較結(jié)果也表明了各個位點的基因型之間也沒有顯著差異。 絨毛長度的關(guān)系 態(tài)蛋白位點與大連金州黑絨毛長度的關(guān)系 通過各多態(tài)蛋白位點與大連金州黑絨毛長度之間的方差分析，逐個剔除方差分析中影響較小的位點，最后篩選出對絨毛長度影響較大的多態(tài)蛋白位點。 1、 方差分析過程 3 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文 結(jié)果 27 表 3多態(tài)蛋白位點與大連金州黑絨毛長度的關(guān)系 F S rF O 2 差分析結(jié)果，對于 言， F=P=明 同基因型對金州黑絨毛長度無顯著影響；對于 言， F=P=明 同基因型對金州黑絨毛長度無顯著影響； 對于 言， F=P=明 同基因型對金州黑絨毛長度無顯著影響 ;對于 言， F= 即這個兩個蛋白位點對金州黑絨毛長度有顯著影響，不同的 因型和不同的 因型絨毛長度間存在著顯著差異 ,將 點各自定為 1 個分類變量，每個基因型為一個分類水平，建立如下線性模型： +州黑絨毛長度 ， 為總體均值， 定服從正態(tài)分布 N（ 0， 2），并進(jìn)行最小二乘均數(shù)及多重比較。 2、最小二乘均數(shù)及多重比較 （ 1）不同 A、 準(zhǔn)誤）分別為 和 （ P=結(jié)果見 3 3小二乘均數(shù)及多重比較 小二乘均數(shù) 標(biāo)準(zhǔn)誤 概率 A . B . 2)不同 B、 準(zhǔn)誤）分別為 （ 其中 P=（ P=結(jié)果見 3上述分析結(jié)果看出 P= 表 3 小二乘均數(shù)及多重比較 小二乘均數(shù) 標(biāo)準(zhǔn)誤 概率 B . . C . 通過各多態(tài)蛋白位點與美國短毛黑絨毛長度之間的方差分析，逐個剔除方差分析中影響較 小的位點，最后篩選出對絨毛長度影響較大的多態(tài)蛋白位點。 1、方差分析過程見表 3 表 3多態(tài)蛋白位點與美國短毛黑絨毛長度的方差分析 F S rF 差分析結(jié)果，對于 F=明 于 F=明 于 F=P=明 于 F=P=明 對于 F=P=明 因此，這五個蛋白位點與美國短毛黑絨毛長度之間不存在顯著相關(guān)，也沒有一個位點有較大影響，而且最小二乘均數(shù)和多重比較結(jié)果也表明了各個位點的基因型之間也沒有顯著差異。 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文 結(jié)果 29 態(tài)蛋白位點與水貂針毛直徑的關(guān)系 態(tài)蛋白位點與大連金州黑針毛直徑的關(guān)系 通過各多態(tài)蛋白位點與大連金州黑針毛直徑之間的 方差分析，逐個剔除方差分析中影響較小的位點，最后篩選出對針毛直徑影響較大的多態(tài)蛋白位點。 1、 方差分析過程見表 3 表 3態(tài)蛋白位點與大連金州黑針毛直徑的方差分析 F S rF O 2 差分析結(jié)果，對于 F=P=明 于 言， F=P=明 于 言， F=P=明 同 基 因 型 對 金 州 黑 針 毛 直 徑 無 顯 著 影 響 ; 對于 言 ，F(xiàn)=明 于 F=明 因此這五個蛋白位點對大連金州黑的針毛直徑的影響均不顯著（ P, 即不存在顯著相關(guān)，而且最小二乘均數(shù)和多重比較結(jié)果也表明了各個位點的基因型之間也沒有顯著差異。 通過各多態(tài)蛋白位點與美國短毛黑針毛直徑之間的方差分析，逐個剔除方差分析中影響較小 的位點，最后篩選出對針毛直徑影響較大的多態(tài)蛋白位點。 1、方差分析過程見表 3 表 3態(tài)蛋白位點與美國短毛黑針毛直徑的方差分析 F S rF 差分析結(jié)果，對于 F=P=明 于 F=P=明 于 F=P=國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文 結(jié)果 30 表明 于 F=明 于F=P=明 因此，這五個位點與美國短毛黑針毛直徑之間不存在顯著相關(guān)，也沒有一個位點有較大影響，而且最小二乘均數(shù)和多重比較結(jié)果也表明了各個位點的基因型之間也沒有顯著差異。 態(tài)蛋白位點與水貂絨毛直徑的關(guān)系 態(tài)蛋白位點與大連金州黑絨毛直徑的關(guān)系 通過各多態(tài)蛋白位點與大連金州黑絨毛直徑之間 的方差分析，逐個剔除方差分析中影響較小的位點，最后篩選出對絨毛直徑影響較大的多態(tài)蛋白位點。 1、方差分析過程見表 3 方差分析結(jié)果，對于 言， F=P=明 同基因型對金州黑絨毛直徑無顯著影響；對于 言， F=P=明 同基因型對金州黑絨毛直徑無顯著影響；對于 言， F=P=明 同基因型對金州黑絨毛直徑無顯著影響 ; 對于 言， F=明 同基因型對金州黑絨毛直徑無顯著影響；對于 言， F=P=明 同基因型對金州黑絨毛直徑也無顯著影響。 表 3 多態(tài)蛋白位點與大連金州黑絨毛直徑的關(guān)系 F S rF O 2 此這五個蛋白位點對大連金州黑的絨毛直徑不存在顯著相關(guān)（ P,也沒有一個位點有較大影響，而且最小二乘均數(shù)和多重比較結(jié)果也表明了各個位點的基因型之間也沒有顯著差異。 通過各多態(tài)蛋白位點與美國短毛黑絨毛直徑之間的方差分析，逐個 剔除方差分析中影響較小的位點，最后篩選出對絨毛直徑影響較大的多態(tài)蛋白位點。 1、 方差分析過程表 3 方差分析結(jié)果，對于 F=P=明 于 F=P=明 同基因型對美國短毛黑絨毛直徑無顯著影響；對于 F=P=明 于 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文 結(jié)果 31 表 3多態(tài)蛋白位點與美國短毛黑絨 毛直徑的方差分析 F S rF =明 于F=P=明 因此，這五個位點與美國短毛黑絨毛直徑之間不存在顯著相關(guān)（ P,也沒有一個位點有較大影響，而且最小二乘均數(shù)和多重比較結(jié)果也表明了各個位點的基因型之間也沒有顯著差異。 態(tài)蛋白位點與水貂體長的關(guān)系 通過各多態(tài)蛋白位點與大連 金州黑體長之間的方差分析，逐個剔除方差分析中影響較小的位點，最后篩選出對體長影響較大的多態(tài)蛋白位點 1、方差分析過程見表 3 3多態(tài)蛋白位點與大連金州黑體長的方差分析 F S rf O 2 差分析結(jié)果，對于 F=P=明 于 言， F=P=明 同基因型對金州黑體長無顯著影響；對于 F=P=明 對于 言， F=明 于 F=P=明 因此這五個蛋白位點對大連金州黑的體長的影響均不顯著（ P, 即不存在顯著相關(guān)。 但最小二乘均數(shù)及多重比較結(jié)果表明 ： A、 結(jié)果 32 均數(shù)（標(biāo)準(zhǔn)誤）分別為 、 P=,即 P= 統(tǒng)計結(jié)果見表 3 3小二乘均數(shù)及多重比較 小二乘均數(shù) 標(biāo)準(zhǔn)誤 概率 A . . B . 通過各多態(tài)蛋白位點與美國短毛黑體長之間的方差分析，逐個剔除方差分析中影響較小的位點，最 后篩選出