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1、INO80和SWR1復(fù)合體屬于 ATP依賴性染色質(zhì)重構(gòu)復(fù)合體的INO80亞家族,可以和核小體相互作用,通過(guò)使核小體沿著DNA滑動(dòng)或改變核小體內(nèi)部的組蛋白達(dá)到染色質(zhì)重構(gòu)效果。此時(shí),INO80和SWR1復(fù)合體促進(jìn)調(diào)控因子募集到DNA上。與其他染色質(zhì)重構(gòu)復(fù)合體的區(qū)別在于INO80和SWR1含有一個(gè)具有獨(dú)特“裂開(kāi)”ATP酶結(jié)構(gòu)域(split ATPasedomain)的核心 ATP酶(也叫Rvb蛋白),該酶和細(xì)菌 RubB( Holliday 結(jié)DNA解旋酶:Holliday junction DNA helicase)部分同源。INO80和SWR1能夠結(jié)合到組 蛋白H2A變異體H2AX和H2A.Z上
2、,在轉(zhuǎn)錄,復(fù)制和DNA修復(fù)過(guò)程中改變?nèi)旧|(zhì)的結(jié)構(gòu)。 以下部分主要從作用機(jī)理和生物學(xué)功能兩個(gè)方面描述INO80和SWR1復(fù)合體。1、INO80和SWR1復(fù)合體的組成芽殖酵母INO80復(fù)合體由核心 ATP酶,Ino80 (肌醇代謝所需),Rvb1,Bvb2,Act1 (肌 動(dòng)蛋白),Arp4 (肌動(dòng)蛋白相關(guān)蛋白),Arp5,Arp8,Nhp10 (“非組蛋白”蛋白),Taf14(TATA 連接蛋白相關(guān)因子),Ies1( Ino第八亞基),Ies2,Ies3, Ies4, Ies5, Ies6組成芽殖酵母SWR1 復(fù)合體包含 14 條多肽鏈:核心 ATP 酶,Swr1,Rvb1,Rvb2,Act1,
3、Arp4,Arp6,Swc2( Swr 復(fù)合體),Swc3,Swc4,Swc5, Swc6,Swc7, Yaf9 (人白血病蛋白 AF9的酵母同源蛋白) 和 Bdf1 (bromodomain 因子)。2、重構(gòu)作用機(jī)理核小體是染色質(zhì)的基本單位,由 147bpDNA包裹折疊成1.65圈左手超螺旋,超螺旋上 有核心組蛋白(包括 H2A, H2B,H3和H4)之一雙拷貝形成的八聚體。INO80和SWR1復(fù)合體與核小體的相互作用可能與肌動(dòng)蛋白和Arp (肌動(dòng)蛋白相關(guān)蛋白)亞基相關(guān),這種作用在每個(gè)復(fù)合體中可能與核心ATP酶中保守的 HSA( helicase-SANT-associated)結(jié)構(gòu)域有關(guān)。
4、INO80亞家族的染色質(zhì)基質(zhì)包括組蛋白H2A變異體(H2AX and H2A.Z )。值得注意的是,在核小體內(nèi),Nhp10和Arp4調(diào)節(jié)INO80復(fù)合體與磷酸化 H2AX (丫 -H2AX ,酵母中的H2A) 的相互作用(SWR1也許也通過(guò) Arp4調(diào)節(jié)丫 -H2AX ),而SWR1復(fù)合體與 H2A.Z-H2B 的相 互作用則是由Swc2亞基和Swr1亞基的N末端進(jìn)行調(diào)控的。INO80復(fù)合體具有 ATP依賴性DNA解旋酶活性,體外研究中尤其偏好與結(jié)合到“four-way junction ”或“ three-way junction ”的DNA 結(jié)構(gòu)上,這種特點(diǎn)和它在同源重組和DNA復(fù)制中所起
5、作用有關(guān)。體外研究顯示,INO80的重塑作用以ATP依賴的方式使核小體沿著染色質(zhì)模板上滑動(dòng),但是詳細(xì)的重塑步驟以及其與 INO80解旋酶活性的關(guān)系尚未可知。INO80可以讓單個(gè)核小體從染色質(zhì)末端沿著DNA移動(dòng)到中心位置, 這個(gè)功能也許是核小體空間間距形成的原因。此外,INO80在體內(nèi)與核小體的廢棄(nucleosome eviction )有關(guān)。體外實(shí)驗(yàn)證明,在具有 H2A.Z變異體的核小體中,SWR1復(fù)合體利用ATP水解產(chǎn)生的 能量逐步的、間接地替換典型的 H2A。SWR1首先結(jié)合到AA核小體(包括兩個(gè) H2A-H2B 二聚體)和一個(gè)游離的 H2Z/Z-HZB二聚體的一端,介導(dǎo) SWR1 A
6、TP酶活性的超活化,核小 體H2A-H2B的解離和H2A.Z-H2B的凝集。接著,AZ核小體(包括一個(gè) H2Z-H2B二聚體 和一個(gè)H2Z.Z-H2B二聚體)從SWR1上掉落形成一個(gè)中間產(chǎn)物。最后, SWR1又可特異性 的結(jié)合到AZ核小體的A處,導(dǎo)致第二個(gè)組蛋白替代,形成ZZ核小體(包含兩個(gè)H2A.Z-H2B 二聚體)。但此過(guò)程的逆過(guò)程(ZZ到AZ, AZ到AA或ZZ直接到AA )尚未研究清楚。芽殖 酵母中,SWR1復(fù)合體和NuA4復(fù)合體(一個(gè)組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶復(fù)合體)共用四個(gè)亞基(Act1,Arp4, Yaf9, a nd Swc4)。這兩個(gè)復(fù)合體共同調(diào)節(jié) H2A.Z凝集到核小體。目前的研究顯
7、示 SWR1 能夠被招募到染色質(zhì)主要得益于和NuA4復(fù)合體之間共用的亞基。除此之外,SWR1的招募也依賴于Bdf1 , Bdf1能夠識(shí)別被NuA4乙?;揎椀慕M蛋白H4。一旦招募發(fā)生,SWR1復(fù) 合體將會(huì)用H2A.Z變異體來(lái)替代組蛋白 H2A去經(jīng)受NuA4的乙?;饔?。3、INO80復(fù)合體的生物學(xué)功能大約20%的酵母基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控(不論是負(fù)調(diào)控還是正調(diào)控)受到INO80家族復(fù)合體的調(diào)節(jié)。例如,轉(zhuǎn)錄因子 Pho4結(jié)合到PHO5啟動(dòng)子上啟動(dòng)了 INO80,SWI/SNF (全稱 switch/sucrose nonfermentable,也是一個(gè)核小體重構(gòu)復(fù)合體)和 SAGA(Spt/Ada/Gc
8、n5/acetyltransferase的簡(jiǎn)寫(xiě),是一個(gè)組蛋白乙?;D(zhuǎn)移酶復(fù)合體)的招募。三個(gè)復(fù)合體聚合后再啟動(dòng)子區(qū)域發(fā)揮核小體重構(gòu)作用,增加了轉(zhuǎn)錄裝置的DNA親和性。酵母INO80通過(guò)和丫 -H2AX的相互作用而結(jié)合到 DNA雙鏈斷裂位點(diǎn)。該舉動(dòng)促進(jìn)了 斷裂位點(diǎn)周圍核小體的釋放,有利于高效率的招募DNA修復(fù)裝置,例如 MRX(Mre11-Rad50-Xrs2 )和Mec1 (個(gè)細(xì)胞周期監(jiān)測(cè)點(diǎn)激酶)復(fù)合體。INO80在紫外損傷修復(fù)中也起著作用。正常條件下,酵母INO80可能通過(guò)驅(qū)使核小體滑動(dòng)或釋放使復(fù)制叉(replication fork)高速前進(jìn)。在復(fù)制壓力時(shí),INO80復(fù)合體可能在受壓復(fù)制叉
9、處重構(gòu)核小體,從而促進(jìn)復(fù)制叉的穩(wěn)定,重啟 DNA合成,越過(guò)DNA損傷。INO80的Ies4亞基磷酸化調(diào)控著復(fù)制檢測(cè)點(diǎn) (replication checkpoint )。INO80復(fù)合體也在端粒調(diào)控,著絲點(diǎn)穩(wěn)定性調(diào)控和染色體分離中 起著作用。4、SWR1復(fù)合體的生物學(xué)功能SWR1促使H2A.Z在啟動(dòng)子周圍的非核小體區(qū)域(nucleosome-free region)沉積進(jìn)入核小體(SWR1 deposits H2A.Z into nucleosomesflanking the nucleosome-free region around promoters) o H2A.Z沉積進(jìn)入核小體之后,可
10、能會(huì)改變核小體的穩(wěn)定性和動(dòng)力學(xué)性質(zhì),也可 能易化或抑制其他因子的招募。故而,H2A.Z進(jìn)入核小體可對(duì)轉(zhuǎn)錄進(jìn)行正調(diào)控和負(fù)調(diào)控。已有研究表明,SWR1復(fù)合體在雙鏈斷裂損傷位點(diǎn)和NuA4復(fù)合體協(xié)作發(fā)揮作用,用H2A.Z替換丫 -H2AX,這個(gè)措施也許進(jìn)一步的易化了損傷因子和檢測(cè)點(diǎn)因子集團(tuán)的招募。SWRI在亞端粒區(qū)域?qū)?H2A.Z交換進(jìn)入基因內(nèi),能夠抑制異染色質(zhì)向常染色質(zhì)區(qū)域的 延伸。因此,H2Z.Z的沉積也許能保護(hù)基因免于沉默信息調(diào)控因子(SIR)依賴的端粒沉默作用的傷害。而在高等真核細(xì)胞中,H2A.Z也在基因沉默和異染色質(zhì)形成中發(fā)揮作用。Ino60Swr1Nuckosome slidinc0Swc
11、23屮Fir«t H2A.Z-H2B damw Kchang*ATA AOOK、於H2AJZ H2BSeord H2A.Z-H2Bdimer ox«lianf«INQ80 b ologlcal functionsTanker plion wpg&cn &nd acuvatonSWR1 biological functionsH2KZ Oepo&iton fldakly nucleobonie4re« reykMarcxMia trantcnption siteSH28(t4MKUi=UM>TramcrwonftetersDIM rcpar and ctiecMpoint
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