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第十八節(jié)蛋白質(zhì)的及轉(zhuǎn)運第三部分分子生物學(xué)-信息途徑By
Dr.Wang2008.08第十八節(jié)蛋白質(zhì)的及轉(zhuǎn)運§18.1
蛋白質(zhì)的分子基礎(chǔ)§18.2
蛋白質(zhì)翻譯的步驟§18.3
蛋白質(zhì)的
及翻譯后修飾第三部分分子生物學(xué)-信息途徑第三部分分子生物學(xué)-信息途徑蛋白質(zhì)
的分子基礎(chǔ):mRNA是蛋白質(zhì)
的模板原核生物mRNA翻譯時,核糖體與mRNA上游的SD序列結(jié)合,開始翻譯;而真核生物中是由mRNA與5’端帽子結(jié)構(gòu)來完成的。tRNA轉(zhuǎn)運活化的氨基酸至mRNA模板上tRNA含有兩個關(guān)鍵的部位:一個是氨基酸結(jié)合部位,另一個是與mRNA的結(jié)合部位。核糖體是蛋白質(zhì)
的工廠核糖體的結(jié)構(gòu):核糖體是rRNA和核糖體蛋白組成的一個巨大的復(fù)合體。不同類型生物中核糖體的結(jié)構(gòu)高度保守,盡管其rRNA和核糖體蛋白的一級結(jié)構(gòu)有所不同,但其三級結(jié)構(gòu)卻驚人的相似。核糖體的大亞基上有兩個重要的位點:P位點是結(jié)合肽酰tRNA的肽?;奈稽c,A位點是結(jié)合氨酰tRNA的氨?;奈稽c。第三部分分子生物學(xué)-信息途徑第三部分分子生物學(xué)-信息途徑細(xì)菌核糖體:50S+30S真核生物:60S+40S第十八節(jié)蛋白質(zhì)的
及轉(zhuǎn)運§18.1
蛋白質(zhì)
的分子基礎(chǔ)§18.2
蛋白質(zhì)翻譯的步驟§18.3
蛋白質(zhì)的
及翻譯后修飾第三部分分子生物學(xué)-信息途徑第三部分分子生物學(xué)-信息途徑原核生物的翻譯起始:tRNA裝載在氨酰tRNA
酶的作用下,使氨基酸連接到tRNA
3’端的腺苷酸上,形成氨酰tRNA。tRNA識別氨酰tRNA
酶的專一性很高,共有20種,每一種只用于單一種氨基酸與相應(yīng)tRNA的結(jié)合。tRNA上的某些結(jié)構(gòu)特征能使它在氨酰tRNA酶的催化下,與特定的氨基酸結(jié)合;這些結(jié)構(gòu)特征就是“第二遺傳”?!暗诙z傳”常在tRNA的受體,但在其他區(qū)域的也有不少。氨酰tRNA酶催化氨酰-tRNA的組裝第三部分分子生物學(xué)-信息途徑第三部分分子生物學(xué)-信息途徑原核生物的翻譯起始:基上組裝起基必須解離,以核糖體解離翻譯起始復(fù)合物首先是在核糖體來。每一次翻譯后,核糖體的大讓新的翻譯起始復(fù)合物形成核糖體解離需要起始因子(IF)的協(xié)助IF-1促進(jìn)核糖體大基的解離;IF-3則通過與結(jié)合,基其與大亞基重新結(jié)合第三部分分子生物學(xué)-信息途徑第三部分分子生物學(xué)-信息途徑原核生物的翻譯起始:起始tRNA攜帶甲酰甲硫氨酸的tRNA(tRNA
),識別密碼子AUG、GUG和UUG。(tRNA
)稍有不同,后者只識別AUG。mRNA與核糖體基的結(jié)合在起始
子的上游(數(shù)個核苷酸),有一共同序列AGGAGGU,與16S
rRNA
3’端的序列(3’HO-AUUCCUCCAC
5’)互補(bǔ)配對,是核糖體的結(jié)合位點;這一序列又稱SD序列。tRNAMe與t
攜帶甲硫氨酸到蛋白質(zhì)鏈
的tRNAMetffMetm第三部分分子生物學(xué)-信息途徑原核生物的翻譯起始:甲酰甲硫氨酰tRNA與30S起始復(fù)合物的結(jié)合主要由IF-2負(fù)責(zé),IF-1和IF-3輔助,此外還需要GTP(GTP的作用是使IF-2能順利地結(jié)合到核糖體基上)。70S起始復(fù)合物的形成30S起始復(fù)合物加上核糖體大亞基(50S),就形成70S起始復(fù)合物在這一過程中,IF-1和IF-3先從復(fù)合物中解離,接著IF-2解離,同時GTP水解成GDP和磷酸(促進(jìn)IF-2解離)IF-2的解離是形成具活性的70S復(fù)合物所必需的第三部分分子生物學(xué)-信息途徑第三部分分子生物學(xué)-信息途徑真核生物的翻譯起始:與原核生物的翻譯起始的差異起始氨基酸不是甲酰甲硫氨酸,而是甲硫氨酸;起始tRNA則為tRNAMe。ti真核mRNA不含SD序列,但有5’帽子,有助于起始復(fù)合體的形成。通過掃描尋找起始
子。掃描找到起始
子后,再加上核糖體大亞基,就可開始翻譯。第三部分分子生物學(xué)-信息途徑第三部分分子生物學(xué)-信息途徑真核生物的翻譯起始:mRNA二級結(jié)構(gòu)與翻譯起始的關(guān)系mRNA5’端附近的二級結(jié)構(gòu)對翻譯起始既可有正效應(yīng),也可有負(fù)效應(yīng)。緊接AUG后(AUG后12
~15nt)的發(fā)夾結(jié)構(gòu)能使核糖體停頓,因而使該AUG更有可能成為起始位點。起始因子(eIF)要比原核生物的復(fù)雜,但也有相應(yīng)的因子。主要的起始因子有6種(類)eIF1、eIF2、eIF3、eIF4、eIF5、eIF6第三部分分子生物學(xué)-信息途徑真核生物的翻譯起始第三部分分子生物學(xué)-信息途徑翻譯起始的控制:原核生物的起始控制mRNA二級結(jié)構(gòu)對翻譯起始的影響。反饋抑制。真核生物的起始控制最常見的起始控制是對起始因子磷酸化。起始因子的磷酸化在一些情況下對翻譯起始起抑制作用,而在另一些情況下,卻可起到促進(jìn)作用。第三部分分子生物學(xué)-信息途徑延伸:基本過程Step1:一個新的氨酰tRNA結(jié)合到核糖體的A位。Step
2:形成肽鍵。Step
3:移位。第三部分分子生物學(xué)-信息途徑第三部分分子生物學(xué)-信息途徑延伸的具體過程(1):氨酰tRNA結(jié)合到核糖體的A位需延伸因子EF-Tu及GTP,另還需EF-Ts。校對:如錯誤的氨酰tRNA進(jìn)入了A位(反子與
子不能很好配對),可進(jìn)行校正。肽鍵的形成通過肽基轉(zhuǎn)移酶,把P位的肽鏈(或起始氨基酸)與A位的氨酰tRNA中的氨基酸以肽鍵連結(jié)起來肽基轉(zhuǎn)移酶是核糖體的組成部分,且存于核糖體大亞基中。rRNA在催化肽鍵形成中起主要作用,具肽基轉(zhuǎn)移酶活性。第三部分分子生物學(xué)-信息途徑延伸的具體過程(2):移位mRNA與肽基tRNA移動1個子的距離,使肽基tRNA進(jìn)入P位,而原在P位的tRNA離開核糖體。移位需EF-G及GTP
。終止子子子
終止
子:UAG:琥珀UAA:赭石UGA:乳白終止過程需要因子,這一過程需GTP水解。第三部分分子生物學(xué)-信息途徑GTPase與翻譯:IF-2、EF-Tu、EF-G、RF3等因子都需要與GTP結(jié)合,并通過GTP水解而發(fā)揮作用。它們是G蛋白(G
proteins),具有內(nèi)在的
GTPase活性。抗生素與翻譯:嘌呤霉素的結(jié)構(gòu)與氨酸-tRNA結(jié)構(gòu)相似,當(dāng)它接合到核糖體上進(jìn)行反應(yīng)后,很容易從核糖體上脫落。從而使蛋白質(zhì)中斷。氯霉素與50S亞基結(jié)合,抑制原核肽轉(zhuǎn)移酶。對人的毒性是因為它抑制了線粒體蛋白質(zhì)的。亞胺環(huán)己酮,只抑制真核細(xì)胞翻譯。白喉毒素可以與EF-2結(jié)合,抑制肽鏈的移位作用。四環(huán)素:能夠封閉A位點,干擾氨酰tRNA的結(jié)合。鏈霉素:結(jié)合到30S亞基,低濃度引起
子的錯讀,高濃度抑制翻譯的起始。第三部分分子生物學(xué)-信息途徑第十八節(jié)蛋白質(zhì)的
及轉(zhuǎn)運§18.1
蛋白質(zhì)
的分子基礎(chǔ)§18.2
蛋白質(zhì)翻譯的步驟§18.3
蛋白質(zhì)的及翻譯后修飾第三部分分子生物學(xué)-信息途徑蛋白質(zhì)的
:轉(zhuǎn)運的研究是從
蛋白開始的。真核細(xì)胞多肽的轉(zhuǎn)運有兩種機(jī)制:翻譯轉(zhuǎn)運同步機(jī)制(共轉(zhuǎn)譯)蛋白、質(zhì)膜蛋白、溶酶體蛋白、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和高爾基體滯留蛋白,首先在游離核糖體上
含信號肽的部分肽段后就結(jié)合到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上,然后邊
邊進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔,經(jīng)初步加工和修飾后,部分多肽以芽泡形式被運往高爾基體,再經(jīng)進(jìn)一步的加工和修飾后被運往質(zhì)膜、溶酶體或被
到胞外。翻譯后轉(zhuǎn)運機(jī)制葉綠體蛋白和線粒體蛋白是在細(xì)胞質(zhì)游離核糖體上被完全后通過新生肽的信號序列(引導(dǎo)肽)直接運往目的地并被加工。第三部分分子生物學(xué)-信息途徑信號肽:含有10-15個疏水氨基酸殘基。在疏水序列前有一個或幾個帶正電荷的殘基。羧基端(靠近切割部位)有一個比較短的極性的短序列,含有側(cè)鏈比較短的氨基酸,如Ala。蛋白質(zhì)定位內(nèi)質(zhì)網(wǎng)后,信號肽被切除。核定位的信號肽(NLS)并不被切除。原核生物蛋白也有信號肽,一般定位到周質(zhì)空間。第三部分分子生物學(xué)-信息
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