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醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)科研——數(shù)據(jù)手動錄入編輯導(dǎo)語:如今隨著科技的發(fā)展,醫(yī)院里的很多種方式都使用互聯(lián)網(wǎng)系統(tǒng)的方式進(jìn)行,比如病人病歷的記錄,以前用本子,現(xiàn)在用數(shù)據(jù)庫,查找起來比較方便;本文作者分享了關(guān)于醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)科研中的數(shù)據(jù)手動錄入,我們一起來了解一下。一、背景三甲醫(yī)院由于其具備頂尖的醫(yī)療資源,會吸引疑難雜癥的患者前去就診,該部分患者所患疾病多為稀缺疾病,專病科研數(shù)據(jù)庫由于疾病的稀缺性所以數(shù)據(jù)庫內(nèi)數(shù)據(jù)量較少。在某疾病方向上,截止到2019年全國共有1516家三甲醫(yī)院,現(xiàn)階段約有600W份病例,每年仍將以30萬的速度增長。對于醫(yī)院而言,這些數(shù)據(jù)為本院的醫(yī)學(xué)科研提供了數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。醫(yī)學(xué)科研,一方面可以提升本院的治療水平,進(jìn)而提高本院患者治愈率;另一方面可以增加本院的醫(yī)學(xué)論文數(shù)量。通過醫(yī)學(xué)科研,可以提升醫(yī)院在該疾病領(lǐng)域的業(yè)界地位,提升競爭力,吸引更多的患者前來治療,最終為本院創(chuàng)造更多營收。但是由于歷史原因,目前600W份的病歷數(shù)據(jù)依然是紙質(zhì)數(shù)據(jù)。在數(shù)據(jù)搜索方面,紙質(zhì)形式存儲的數(shù)據(jù),需要人工翻閱紙質(zhì)病歷查找。當(dāng)數(shù)據(jù)量小的時候,數(shù)據(jù)量查找成本較高,但是人力尚可企及。當(dāng)數(shù)據(jù)量大的時候,數(shù)據(jù)查找?guī)缀醭蔀椴豢赡堋k娮踊鎯Φ臄?shù)據(jù),數(shù)據(jù)查找效率縮短至秒級。在數(shù)據(jù)統(tǒng)計方面,紙質(zhì)形式存儲的數(shù)據(jù),一次只能被一個人查閱,并且容易損壞;電子化存儲的數(shù)據(jù)支持多人同時查看,并且不容易損壞。電子數(shù)據(jù)為科研提供了便利。所以需要將紙質(zhì)的病歷數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化成電子的病歷數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)手動錄入是將數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成電子化的一個方法。二、數(shù)據(jù)手動錄入指,由人工將讀取到的數(shù)據(jù),填入可視化的頁面中,并將數(shù)據(jù)保存至數(shù)據(jù)庫,將數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成電子數(shù)據(jù)的方法。包括自定義表單生成器和錄入數(shù)據(jù)兩個部分:自定義表單生成器由于每個科研的研究方向不同,科研所需要的數(shù)據(jù)不同,采集數(shù)據(jù)的電子表單也將不同。如果每個電子表單都由開發(fā)人員手動開發(fā),隨著研究課題的數(shù)量增加,隨之增加的是人工成本、時間成本,降低項目交付的效率,自定義表單生成器是解決該問題的一款工具。自定義表單生成器,是一款用戶可以根據(jù)自己需要自定義電子表單的工具。將生成電子表單的工作由技術(shù)人員轉(zhuǎn)移至現(xiàn)場項目人員,甚至有可能將工具的使用方法教給客戶使用。大大減低了企業(yè)生產(chǎn)電子表單的成本。以表單“手術(shù)情況”為例,演示表單配置的過程,包括三步——第一步:創(chuàng)建表單;第二步:配置表單變量;第三步:選擇控件并配置控件屬性。第一步:創(chuàng)建表單創(chuàng)建表單時,需要根據(jù)表單所代表的業(yè)務(wù)含義設(shè)置“表單名稱”為“手術(shù)情況”。“表單名稱”是表單的中文名稱,命名方式一般是表單的中文名稱,代表該表單的業(yè)務(wù)方向;具有可讀性,不具備唯一性,主要用于用戶在填寫或查看表單時快速了解該表單的內(nèi)容。第二步:配置表單變量及變量控件屬性。假設(shè)“手術(shù)情況”表單有4個字段,手術(shù)執(zhí)行時間、手術(shù)方式、麻醉方式、手術(shù)經(jīng)過。以手術(shù)執(zhí)行時間舉例說明,配置表單的過程。配置字段的變量名稱:手術(shù)執(zhí)行時間;設(shè)置字段的變量ID:operate_data?!白兞棵Q”是變量的中文名稱,具備可讀性,不具備唯一性,主要用于用戶在填寫數(shù)據(jù)時快速了解該變量的含義。命名方式一般是變量的中文名稱?!白兞縄D”是變量的英文名稱,具備唯一性,可讀性較差。主要用于系統(tǒng)識別字段。命名方式一般是變量的英文名稱。第三步:選擇控件并配置控件屬性為變量“手術(shù)執(zhí)行時間”設(shè)置日期型控件。并配置控件的屬性,不同的控件需要配置不同的控件屬性。日期型控件關(guān)鍵屬性包括日期類型?!翱丶愋汀敝傅氖窃撟兞窟m合使用的控件展示。該控件用于用戶在前端頁面準(zhǔn)確且快速的錄入數(shù)據(jù)庫需要存儲的數(shù)據(jù)。“日期類型”指的是日期的精確度。有三種日期類型,年月日、年月日時分、年月日時分秒。通過上述的配置過程,可以抽象出來表單配置的三個步驟:創(chuàng)建表單創(chuàng)建變量選擇控件創(chuàng)建表單:根據(jù)業(yè)務(wù)情況,設(shè)置表單名稱和表單ID。創(chuàng)建變量:為該表單創(chuàng)建變量,設(shè)置變量名稱和變量ID。選擇控件:為變量設(shè)置合適的控件,并填寫控件的相關(guān)屬性,不同類型的控件,需要配置不同的屬性。通過上述步驟完成其余變量的配置,完成整張表單“手術(shù)情況”的配置,最終前端頁面效果如下圖:自定義表單發(fā)布上線配置完畢表單以后,表單處于一種草稿狀態(tài)。而科研數(shù)據(jù)由于其科研的嚴(yán)謹(jǐn)性,科研數(shù)據(jù)無法經(jīng)常變化,需要建立在一種相對確定的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)上。所以需要把配置完成的表單發(fā)布上線。在系統(tǒng)首次部署時,發(fā)布成功以后,所有數(shù)據(jù)直接使用該表單錄入數(shù)據(jù)。系統(tǒng)在運(yùn)行過程中,隨著系統(tǒng)的使用,用戶對表單的需求存在發(fā)生變動的可能性。此時,需要對線上表單重新編輯,然后發(fā)布上線。由于歷史數(shù)據(jù)擁有很高的研究價值,需要根據(jù)新的表單將歷史數(shù)據(jù)進(jìn)行清洗,以保證舊數(shù)據(jù)在新的表單結(jié)構(gòu)下可以被使用。創(chuàng)建患者并錄入數(shù)據(jù)錄入數(shù)據(jù)指的是,用戶在前端頁面以電子表單的形式將紙質(zhì)數(shù)據(jù)錄入到系統(tǒng)中,形成電子化的過程。由兩個步驟組成,創(chuàng)建患者、錄入患者數(shù)據(jù)。1)創(chuàng)建患者指,在系統(tǒng)中增加一個新的患者。將新增患者的操作由用戶直接在頁面上完成,使得沒有編程能力的人也可以將數(shù)據(jù)插入到系統(tǒng)中,降低了用戶往數(shù)據(jù)庫中新增數(shù)據(jù)的操作成本。對于創(chuàng)建患者所使用的字段,不同病種數(shù)據(jù)庫,因為數(shù)據(jù)質(zhì)量不一致和對數(shù)據(jù)安全要求不同,所以在創(chuàng)建患者時填寫的字段也不相同。所以需要配置創(chuàng)建患者所使用的變量。對于患者唯一標(biāo)示,創(chuàng)建患者時,系統(tǒng)會自動生成患者唯一標(biāo)識。但是為了再次創(chuàng)建患者時,能夠識別出來患者是否存在。所以需要根據(jù)創(chuàng)建患者時使用的字段生成患者ID。如果患者ID的生成規(guī)則發(fā)生變化,需要對歷史數(shù)據(jù)進(jìn)行清洗。2)錄入數(shù)據(jù)指,在系統(tǒng)中完善患者信息。用戶在前端頁面以電子表單的形式,完善患者信息。使得沒有編程能力的人也可以將數(shù)據(jù)插入到系統(tǒng)中,降低了用戶往數(shù)據(jù)庫中錄入數(shù)據(jù)的操作成本??蒲兴璧臄?shù)據(jù)質(zhì)量高,只有經(jīng)過審核,確認(rèn)數(shù)據(jù)達(dá)到使用要求,才可以被科研所使用。需要對表單數(shù)據(jù)設(shè)置狀態(tài)來表示數(shù)據(jù)是否可用,包括暫存、提交待審核、審核通過、審核駁回等。手動錄入的數(shù)據(jù)量較大,需要提高數(shù)據(jù)錄入的效率。例如在設(shè)計表單時將數(shù)據(jù)分組分類;通過鍵盤快捷鍵快速切換變量;快速切換到下一頁等快捷操作。三、總結(jié)紙質(zhì)數(shù)據(jù)通過手動錄入的方式進(jìn)入
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