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文檔簡介
第五章基因工程載體演示文稿1當(dāng)前1頁,總共69頁。優(yōu)選第五章基因工程載體當(dāng)前2頁,總共69頁。3克隆載體與表達(dá)載體克隆載體:攜帶外源DNA進(jìn)入受體細(xì)胞并使外源DNA大量擴(kuò)增。表達(dá)載體:表達(dá)外源基因編碼的蛋白質(zhì),載體克隆位點(diǎn)的上游應(yīng)含有啟動(dòng)子,下游含有轉(zhuǎn)錄終止序列。當(dāng)前3頁,總共69頁。4第一節(jié).質(zhì)粒Plasmid質(zhì)粒是存在于細(xì)菌細(xì)胞染色體外、能自主復(fù)制的小分子環(huán)狀雙鏈DNA分子。又稱為cccDNA(CovalentlyClosedCircularDNA)。當(dāng)前4頁,總共69頁。5野生型質(zhì)粒的大小一般在2-200Kb
基因工程常用質(zhì)粒在2-4Kb之間質(zhì)粒并不是細(xì)菌生長所必須的,但可為宿主執(zhí)行一定的遺傳功能,如抗生素的抗性、重金屬離子的抗性、細(xì)菌毒素的分泌等。當(dāng)前5頁,總共69頁。6質(zhì)粒
(plasmid)當(dāng)前6頁,總共69頁。71.質(zhì)粒類型:
嚴(yán)緊型質(zhì)粒(stringentplasmid) 1-5個(gè)拷貝/細(xì)胞
松弛型質(zhì)粒(relaxedplasmid):
數(shù)十個(gè)/細(xì)胞 質(zhì)粒在細(xì)胞中的拷貝數(shù)有時(shí)與寄主的種類有關(guān)。當(dāng)前7頁,總共69頁。82.質(zhì)粒載體必須具備的條件(1)分子量相對較小,能在細(xì)菌內(nèi)穩(wěn)定存在,有較高的拷貝數(shù)。(2)具有一個(gè)以上的遺傳標(biāo)志,便于對宿主細(xì)胞進(jìn)行選擇,如抗生素的抗性基因,β-半乳糖苷酶基因(LacZ)等。當(dāng)前8頁,總共69頁。9(3)具有多個(gè)限制性內(nèi)切酶的單一切點(diǎn),便于外源基因的插入。如果在這些位點(diǎn)有外源基因的插入,會(huì)導(dǎo)致某種標(biāo)志基因的失活,而便于篩選。當(dāng)前9頁,總共69頁。10質(zhì)粒性質(zhì)不相容性(不親和性)具有相同或相似復(fù)制子結(jié)構(gòu)及特征的兩種不同質(zhì)粒,不能穩(wěn)定的存在于同一受體細(xì)胞內(nèi),這種現(xiàn)象稱作質(zhì)粒的不相容性。
當(dāng)前10頁,總共69頁。113.質(zhì)粒載體的選擇性標(biāo)記抗菌素抗性新陳代謝特性當(dāng)前11頁,總共69頁。12
抗菌素名稱抗菌素作用方式宿主菌抗性機(jī)理氨芐青霉素(Amp)干擾細(xì)菌細(xì)胞壁合成
編碼-內(nèi)酰胺酶,切割A(yù)mp
-內(nèi)酰胺環(huán)氯霉素(Cml)抑菌劑,與50S結(jié)合,干擾編碼乙酰轉(zhuǎn)移酶,使氯霉素蛋白質(zhì)合成乙?;Щ羁敲顾兀↘an)殺菌劑,與70S結(jié)合,mRNA編碼氨基糖苷磷酸轉(zhuǎn)移酶,
發(fā)生錯(cuò)讀修飾Kan失活鏈霉素(Sm)殺菌劑,與30S結(jié)合,mRNA編碼特異修飾酶
發(fā)生錯(cuò)讀四環(huán)素(Tet)抑菌劑,與30S結(jié)合,阻止編碼特異蛋白,修飾細(xì)菌膜蛋白合成結(jié)構(gòu),阻止Tet通過細(xì)胞膜當(dāng)前12頁,總共69頁。13復(fù)制起點(diǎn)氨芐青霉素抗性基因當(dāng)前13頁,總共69頁。14常用的質(zhì)粒載體
1.
pBR322
2.pBV220載體是我國預(yù)防醫(yī)學(xué)科學(xué)院病毒研究所自行構(gòu)建的大腸桿菌溫控表達(dá)載體。
3.
pUC系列:如pUC118、pUC119,兩者之間的差別在于多克隆位點(diǎn)不同。當(dāng)前14頁,總共69頁。15當(dāng)前15頁,總共69頁。16當(dāng)前16頁,總共69頁。17當(dāng)前17頁,總共69頁。184.融合表達(dá)載體如GST融合表達(dá)系統(tǒng)。載體中含有細(xì)菌的谷胱甘肽巰基轉(zhuǎn)移酶(GST)基因,外源基因克隆在GST基因的下游。當(dāng)基因表達(dá)時(shí),表達(dá)產(chǎn)物為GST與目的蛋白的融合體。當(dāng)前18頁,總共69頁。19融合表達(dá)載體的優(yōu)點(diǎn)表達(dá)效率高融合蛋白易純化:抗GST的蛋白質(zhì)作為特異性抗體,用親和層析法從細(xì)胞裂解液中純化出融合蛋白;可從融合蛋白中分離出單一的外源蛋白質(zhì)GST與外源蛋白之間克隆上蛋白酶的切割位點(diǎn),可用適當(dāng)?shù)拿盖懈睢?/p>
當(dāng)前19頁,總共69頁。20例如加裝一段編碼Ile-Glu-Gly-Arg寡肽序列的人工接頭片斷,該片斷可被具有蛋白酶活性的凝血因子Ⅹa切割,從Arg后切開。目的蛋白中出現(xiàn)此種序列的可能性極小,因此該方法用途廣泛。當(dāng)前20頁,總共69頁。21QIAexpress6His表達(dá)系統(tǒng)重組蛋白質(zhì)的末端帶有6個(gè)組氨酸殘基,對帶有Ni離子的層析介質(zhì)有高度的親和力,易于純化。6個(gè)組氨酸殘基質(zhì)量小,不影響蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能,無需切除。6個(gè)組氨酸殘基免疫原性差,重組蛋白可以直接用做抗原。當(dāng)前21頁,總共69頁。22
第二節(jié)噬菌體類
噬菌體是一類細(xì)菌病毒的總稱,英文名為Bacteriophage,簡稱phage。噬菌體可以在脫離寄主細(xì)胞的狀態(tài)下保持自己的生命,但必須依賴寄主細(xì)胞才能復(fù)制生長。當(dāng)前22頁,總共69頁。23噬菌體(bacteriophage,phage)噬菌體是感染細(xì)菌、真菌、放線菌或螺旋體等微生物的病毒。病毒的特性:個(gè)體微小,可以通過細(xì)菌濾器沒有完整的細(xì)胞結(jié)構(gòu),由蛋白質(zhì)和核酸組成專性細(xì)胞內(nèi)寄生的微生物可分為12個(gè)科當(dāng)前23頁,總共69頁。24噬菌體的生物學(xué)性狀當(dāng)前24頁,總共69頁。25噬菌體的生物學(xué)性狀形態(tài)個(gè)體小,需用電子顯微鏡觀察蝌蚪形、微球形和絲形Theblackbarsaresizebarsrepresenting100nm.當(dāng)前25頁,總共69頁。26當(dāng)前26頁,總共69頁。27當(dāng)前27頁,總共69頁。28
用作克隆載體的噬菌體有兩類:一類是λ噬菌體,另一類是M13噬菌體。野生型λ噬菌體經(jīng)過改造,已衍生出100多種克隆載體。λ噬菌體載體分為插入型和替換型(置換型)兩類。目前應(yīng)用較廣的是EMBL系列、λgt系列和Charon系列等。
當(dāng)前28頁,總共69頁。29λ噬菌體(lambdaphage)
λ噬菌體是可以感染細(xì)菌的病毒,是大腸桿菌的溫和型噬菌體。由外殼蛋白與一個(gè)48.5kb的雙鏈線狀DNA分子組成。經(jīng)過改造形成的λ噬菌體載體有較高的轉(zhuǎn)化效率。當(dāng)前29頁,總共69頁。30
在λ噬菌體DNA分子雙鏈的5’端,各有一段由12個(gè)核苷酸組成的互補(bǔ)的單鏈凸出序列,即通常所說的黏性末端。在寄主細(xì)胞內(nèi),會(huì)通過黏性末端的互補(bǔ)作用,形成環(huán)型雙鏈DNA分子。這種由黏性末端結(jié)合形成的雙鏈區(qū)段稱為cos位點(diǎn)。(cos:cohensiveendsite)當(dāng)前30頁,總共69頁。313‘CCCGCCGCTGGAGGGCGGCGACCT3’
在黏性末端的12個(gè)堿基中,有10個(gè)是GC。通過堿基配對線性分子環(huán)化起來,由此形成的雙鏈區(qū),叫做cos位點(diǎn)。當(dāng)前31頁,總共69頁。32
λ噬菌體基因組含50余個(gè)基因,功能相近的基因聚集成簇。有些基因?qū)Ζ耸删w的生長不是必須的,可以被外源DNA片段取代。
λ噬菌體上有56種限制性內(nèi)切酶的識別位點(diǎn),約300余切點(diǎn)。比如BamHI分別在第5505、22346、27972、34499和41732處有識別位點(diǎn)。
當(dāng)前32頁,總共69頁。33λ噬菌體的生長途徑
λ噬菌體有溶原和溶菌兩種生長途徑。溶原生長途徑是指λ噬菌體的DNA整合在宿主染色體上,隨宿主染色體的復(fù)制而復(fù)制。以原噬菌體的形式潛伏起來。一旦宿主細(xì)胞處于某種條件下時(shí),λ噬菌體的DNA脫離染色體,重新進(jìn)入溶菌生長途徑。當(dāng)前33頁,總共69頁。34溶菌生長是指λ噬菌體在宿主細(xì)胞中黏性末端連接,成為環(huán)形DNA分子,借用宿主細(xì)胞的體系,合成病毒包裝所需的外殼蛋白,新復(fù)制的λDNA與外殼蛋白包裝成新的病毒顆粒。宿主細(xì)胞膜在R蛋白和S蛋白的作用下破裂,釋放出大量子代λ噬菌體顆粒,感染新的細(xì)胞。當(dāng)前34頁,總共69頁。35λ噬菌體的生活史溶菌生長途徑(lysispathway)溶源菌生長途徑(lysogenicpathway)當(dāng)前35頁,總共69頁。36M13噬菌體單鏈DNA,基因組含6407個(gè)堿基.經(jīng)過基因改造后,形成M13mp系列。可容納遠(yuǎn)大于自身基因組的外源DNA,(7倍).M13噬菌體感染細(xì)胞后,不裂解宿主細(xì)胞,但妨礙宿主細(xì)胞的生長,因此可見培養(yǎng)平板上的混濁噬菌斑.當(dāng)前36頁,總共69頁。37噬斑當(dāng)前37頁,總共69頁。38單鏈的M13噬菌體(+)進(jìn)入受體菌后,以自身為模板,復(fù)制出互補(bǔ)鏈(-),成為雙鏈的結(jié)構(gòu),稱為復(fù)制型DNA。復(fù)制型DNA在細(xì)胞內(nèi)可達(dá)200個(gè)拷貝。此時(shí),(+)鏈被特異的蛋白質(zhì)阻斷,不再生成新的(-)鏈。只能生成新的(+)鏈。(+)鏈DNA被殼蛋白包裝組成病毒顆粒,擠出宿主細(xì)胞。當(dāng)前38頁,總共69頁。39科斯質(zhì)粒載體(cosmid)
又稱粘粒載體,簡稱粘粒。環(huán)形雙鏈DNA分子,一般為4~6Kb。 該載體含有λDNA的cos序列(不少于280個(gè)bp)和pBR322質(zhì)粒的序列。該載體轉(zhuǎn)化效率高??扇菁{高達(dá)45kb的外源DNA。以感染方式進(jìn)入宿主細(xì)胞,在宿主體內(nèi)象質(zhì)粒那樣復(fù)制.當(dāng)前39頁,總共69頁。40粘粒載體可像質(zhì)粒一樣在細(xì)菌中繁殖,有的(pWE15/16)可以在哺乳動(dòng)物中繁殖。又能像λDNA一樣體外包裝,并高效導(dǎo)入受體細(xì)胞。屬松弛型質(zhì)粒,拷貝數(shù)較多。當(dāng)前40頁,總共69頁。41當(dāng)前41頁,總共69頁。42農(nóng)桿菌Ti質(zhì)粒根癌農(nóng)桿菌含有一種內(nèi)源質(zhì)粒,當(dāng)農(nóng)桿菌與植物接觸時(shí),這種質(zhì)粒會(huì)引發(fā)植物產(chǎn)生腫瘤,故名Ti質(zhì)粒(tumorinducingplasmid)。Ti質(zhì)粒為雙鏈環(huán)狀DNA分子,200~250Kb之間。Ti質(zhì)粒進(jìn)入植物細(xì)胞的只是一小部分,約25kb,稱為T-DNA(transferDNA)。當(dāng)前42頁,總共69頁。43T-DNA兩端各有一個(gè)25bp的正向重復(fù)序列,在不同的Ti質(zhì)粒中是高度保守的,該序列對于T-DNA的轉(zhuǎn)移和整合是不可缺少的。利用大腸桿菌質(zhì)粒與T-DNA的部分序列重組,構(gòu)建Ti質(zhì)粒克隆載體,可用于植物細(xì)胞的基因轉(zhuǎn)移。當(dāng)前43頁,總共69頁。44
第三節(jié)酵母細(xì)胞基因工程載體酵母是最簡單的單細(xì)胞真核生物。酵母可對表達(dá)的多肽鏈進(jìn)行加工和修飾,如二硫鍵的正確形成、糖基化、除去N-端的甲硫氨酸等。當(dāng)前44頁,總共69頁。45酵母菌的克隆載體YIP酵母整合型質(zhì)粒YRP酵母復(fù)制型質(zhì)粒YEP酵母附加子型載體CIP酵母菌著絲粒型質(zhì)粒當(dāng)前45頁,總共69頁。46上述質(zhì)粒均可在大腸桿菌和酵母菌中穩(wěn)定存在,即所謂的穿梭質(zhì)粒。這些質(zhì)粒含有兩種可供篩選的選擇性標(biāo)記。當(dāng)前46頁,總共69頁。47YIp載體URA3乳清苷酸脫羧酶當(dāng)前47頁,總共69頁。48
酵母菌表達(dá)載體
1.選擇性標(biāo)志
當(dāng)使用大腸桿菌做為宿主細(xì)胞時(shí),多使用抗生素抗性作為篩選標(biāo)志。由于酵母菌對許多抗生素不敏感,故需要其他的篩選標(biāo)志。
野生型基因:URA3(尿嘧啶)、LEU2、HIS3、TRP1(色氨酸)
這些基因可補(bǔ)償酵母菌細(xì)胞中某一種特定的代謝缺陷(營養(yǎng)缺陷)
當(dāng)前48頁,總共69頁。492.啟動(dòng)子含有可被RNA聚合酶II識別的酵母啟動(dòng)子
GAL、GAL10(半乳糖激酶)
PHO5(堿性磷酸酶)
ADH(醇脫氫酶)
TP1(丙糖磷酸異構(gòu)酶)
PGK(磷酸甘油酸激酶)
GAP(磷酸甘油醛脫氫酶)
SUC(蔗糖酶)當(dāng)前49頁,總共69頁。50注釋:細(xì)胞內(nèi)某些蛋白質(zhì)豐度較高,如PGK(磷酸甘油酸激酶)、GAP(磷酸甘油醛脫氫酶),各占細(xì)胞總蛋白的5%,屬于高含量的蛋白質(zhì),它們的啟動(dòng)子為強(qiáng)啟動(dòng)子。當(dāng)前50頁,總共69頁。51酵母分泌型表達(dá)載體這類載體可以使目的蛋白分泌到細(xì)胞外。載體內(nèi)除含有一般表達(dá)質(zhì)粒的必要成分外,還需有一個(gè)控制蛋白質(zhì)分泌的信號序列。其編碼的多肽鏈叫做信號肽。信號肽內(nèi)多含疏水性氨基酸。當(dāng)前51頁,總共69頁。52第四節(jié)哺乳動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)載體當(dāng)前52頁,總共69頁。53病毒侵入動(dòng)物細(xì)胞后,有兩種生長狀態(tài)
①溶細(xì)胞感染病毒在宿主細(xì)胞內(nèi)合成自身的核酸和結(jié)構(gòu)蛋白,裝配成完整的子代病毒顆粒,釋放到細(xì)胞外,擴(kuò)大感染,宿主細(xì)胞因?yàn)榇x障礙而死亡。②整合性感染病毒核酸整合到宿主細(xì)胞的染色體中,隨細(xì)胞DNA的復(fù)制而擴(kuò)增。當(dāng)前53頁,總共69頁。54病毒載體:(1)含有能夠被真核細(xì)胞識別的有效啟動(dòng)子(2)在感染周期中能夠持續(xù)復(fù)制,達(dá)到很高的拷貝數(shù)。(3)控制自己復(fù)制的元件(4)有些載體可高效穩(wěn)定地整合到寄主基 因組上(5)外殼蛋白識別細(xì)胞受體,可將外源基 因高效導(dǎo)入受體細(xì)胞。當(dāng)前54頁,總共69頁。551.SV40病毒載體SV40:猿猴空泡病毒(Simianvacuolating virus40)
環(huán)型雙鏈DNA分子,含5243bp。優(yōu)點(diǎn):1.感染率高;2.拷貝數(shù)高;3.轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物 高;缺點(diǎn):1.宿主范圍窄;2.最終導(dǎo)致感染細(xì)胞死 亡; 3.制備耗時(shí),成本較高。當(dāng)前55頁,總共69頁。56SV40病毒載體的改建病毒的部分序列+質(zhì)粒的部分序列如PSV2包括病毒的復(fù)制起始區(qū)、早期啟動(dòng)子、 增強(qiáng)子序列、部分t抗原基因
pBR322的復(fù)制起始區(qū)、氨芐青霉素 抗性基因當(dāng)前56頁,總共69頁。57
病毒-質(zhì)粒載體病毒的早期區(qū)段和復(fù)制起點(diǎn)+大腸桿菌的質(zhì)粒分子重組而成。例如:pC10=早期區(qū)段和復(fù)制起點(diǎn)(多瘤病毒)+質(zhì)粒pBR322的部分區(qū)段這種載體既可在大腸桿菌中復(fù)制,也可在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中復(fù)制,稱之為穿梭載體。當(dāng)前57頁,總共69頁。58改造后的病毒優(yōu)缺點(diǎn)
優(yōu)點(diǎn):1.不需病毒顆粒的包裝過程,故可插入較大長度的DNA片段。2.不引起宿主細(xì)胞的裂解,可建立穩(wěn)定傳代的細(xì)胞株。3.整合到宿主細(xì)胞的染色體中,重組基因不會(huì)丟失。缺點(diǎn):轉(zhuǎn)染效率低于萬分之一。當(dāng)前58頁,總共69頁。59受納細(xì)胞:SV40感染CV-1或AGMK猿猴細(xì)胞后,產(chǎn)生感染性病毒顆粒,并使宿主細(xì)胞裂解,這種感染稱為裂解感染,而猿猴細(xì)胞則稱為受納細(xì)胞。當(dāng)前59頁,總共69頁。60非受納細(xì)胞:SV40感染倉鼠細(xì)胞后,不產(chǎn)生感染顆粒,病毒基因組整合到宿主細(xì)胞染色體上,細(xì)胞被轉(zhuǎn)化(癌變),這種嚙齒類動(dòng)物細(xì)胞為SV40病毒的非受納細(xì)胞。當(dāng)前60頁,總共69頁。61逆轉(zhuǎn)錄病毒載體逆轉(zhuǎn)錄病毒是一類單鏈RNA病毒。宿主范圍廣,感染動(dòng)物或人的細(xì)胞。感染效率高,理論上可達(dá)100%。具有強(qiáng)啟動(dòng)子。不引起宿主細(xì)胞的死亡,可以維持許多代存在問題:1.容量小,低于10kb。
2.可能引起細(xì)胞癌變。當(dāng)前61頁,總共69頁。62腺病毒載體(AV)
線性雙鏈DNA病毒,經(jīng)過改造的腺病毒載體,缺失了大部分的病毒基因,更加安全。
當(dāng)前62頁,總共69頁。63優(yōu)點(diǎn):①基因組大,可插入大片段的外源基因,最多可達(dá)35kb;②可高效的感染不同類型的人體組織細(xì)胞;③進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)不整合進(jìn)宿主的基因組,僅瞬間表達(dá)。缺點(diǎn)①免疫原性強(qiáng),可刺激機(jī)體產(chǎn)生免疫反應(yīng);
②幾乎可感染所有的細(xì)胞,缺乏特異性。當(dāng)前63頁,總共69頁。64腺相關(guān)病毒載體(AAV):屬于非致病的微小
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