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熟悉中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(CBM)和PubMed的概況掌握兩數(shù)據(jù)庫檢索常用途徑重點(diǎn)掌握基本檢索教學(xué)要求第一頁,共81頁。一二三數(shù)據(jù)庫簡介檢索途徑
教學(xué)內(nèi)容
檢索結(jié)果管理
第二頁,共81頁。Sinomed數(shù)據(jù)庫情況(一)第三頁,共81頁。
該系統(tǒng)由中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)信息研究所/圖書館開發(fā)研制。其涵蓋資源豐富,能全面、快速反映國內(nèi)外生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域研究的新進(jìn)展。
1.1Sinomed簡介第四頁,共81頁。第五頁,共81頁。數(shù)據(jù)庫收錄情況第六頁,共81頁。中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫共9120210篇收錄1978年以來1600余種中國生物醫(yī)學(xué)期刊,以及匯編、會議論文的文獻(xiàn)題錄530余萬篇,全部題錄均進(jìn)行主題標(biāo)引和分類標(biāo)引等規(guī)范化加工處理。年增文獻(xiàn)40余萬篇,每月更新。中國醫(yī)學(xué)科普文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫共309790篇收錄2000年以來國內(nèi)出版的醫(yī)學(xué)科普期刊近百種,文獻(xiàn)總量8萬余篇,重點(diǎn)突顯養(yǎng)生保健、心理健康、生殖健康、運(yùn)動健身、醫(yī)學(xué)美容、婚姻家庭、食品營養(yǎng)等與醫(yī)學(xué)健康有關(guān)的內(nèi)容。每月更新。北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院博碩學(xué)位論文庫共11429篇收錄1981年以來協(xié)和醫(yī)學(xué)院培養(yǎng)的博士、碩士研究生學(xué)位論文,學(xué)科范圍涉及醫(yī)學(xué)、藥學(xué)各專業(yè)領(lǐng)域及其他相關(guān)專業(yè),內(nèi)容前沿、豐富。每季更新。第七頁,共81頁。1.2檢索途徑基本檢索主題檢索分類檢索期刊檢索作者檢索CBM主界面第八頁,共81頁。1.2.1基本檢索第九頁,共81頁。1.2.2主題檢索第十頁,共81頁。第十一頁,共81頁。《中圖法》基本大類醫(yī)藥衛(wèi)生的一級類目及分類號R1-R9。1.2.3分類檢索第十二頁,共81頁。1.2.4期刊檢索第十三頁,共81頁。1.2.5作者檢索第十四頁,共81頁。1.2.6限定檢索第十五頁,共81頁。1.3檢索結(jié)果管理第十六頁,共81頁。第十七頁,共81頁。結(jié)果分析第十八頁,共81頁。第十九頁,共81頁。第二十頁,共81頁。PubMed數(shù)據(jù)庫情況(二)第二十一頁,共81頁。2.1PubMed簡介
PubMed是美國國家醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)所屬的國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)于2000年4月開發(fā)的,基于WEB的生物醫(yī)學(xué)信息檢索系統(tǒng),是因特網(wǎng)上使用最廣泛的免費(fèi)MEDLINE。MEDLINE是當(dāng)前國際上最權(quán)威的生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫。PubMed界面提供與綜合分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫的鏈接。內(nèi)容包括:DNA與蛋白質(zhì)序列,基因圖譜數(shù)據(jù)等。PubMed免費(fèi)提供題錄或文摘,包括少量免費(fèi)的全文;同時提供指向全文提供者(付費(fèi)或免費(fèi))的鏈接;提供期刊的出版商網(wǎng)址的鏈接。第二十二頁,共81頁。數(shù)據(jù)庫收錄情況收錄范圍70多個國家地區(qū)、40多個語種、90%左右為英文,70-80%的文獻(xiàn)有摘要數(shù)據(jù)類型
期刊論文、綜述、其他數(shù)據(jù)資源鏈接PubMed數(shù)據(jù)來源主要有
MEDLINE1966年以來的記錄
OLDMEDLIN1950-1965年200萬生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)
Recordinproces1996年8月開始由MEDLINE提供的尚未經(jīng)過規(guī)范化處理的數(shù)據(jù)RecordsuppliedbypublisherPubMedcomprisesmorethan23millioncitationsforbiomedicalliteraturefromMEDLINE,lifesciencejournals,andonlinebooks.Citationsmayincludelinkstofull-textcontentfromPubMedCentralandpublisherwebsites.第二十三頁,共81頁。2.2檢索途徑基本檢索主題檢索期刊檢索高級檢索單篇引文匹配檢索第二十四頁,共81頁。主要檢索途徑基本檢索(Search):在檢索框中輸入相應(yīng)的檢索式檢索。(短語檢索)主題檢索(MeSHDatabase):是以規(guī)范化的主題詞、副主題詞檢索文獻(xiàn)。許多情況下也可以以自由詞為入口,該途徑可以提供與該自由詞相關(guān)的主題詞供檢索者選擇期刊檢索(JournalsDatabase):對某種具體期刊刊載的文獻(xiàn)和期刊本身相關(guān)信息進(jìn)行檢索高級檢索(AdvancedSearch):在輸入框中輸檢索詞,選擇相應(yīng)的字段和邏輯算符檢索單篇引文匹配檢索(SingleCitationMatcher):已知某篇文獻(xiàn)的相關(guān)信息(如標(biāo)題、刊名、年、卷期等),可直接檢索出該篇文章第二十五頁,共81頁。也稱作“強(qiáng)迫詞組檢索”即如果要將短語作為一個詞組進(jìn)行檢索,可用雙引號“”將其引起來。作為詞組進(jìn)行檢索的詞,系統(tǒng)不進(jìn)行自動轉(zhuǎn)換匹配,也不進(jìn)行MeSH詞擴(kuò)檢。例如:輸入“l(fā)iverneoplasms”第二十六頁,共81頁。例:輸入liverneoplasms首先將“l(fā)iverneoplasms”作為一個主題詞查找
"liverneoplasms"[MeSHTerms]然后,將“l(fā)iverneoplasms”成“l(fā)iver”和"
neoplasms"兩個詞在全部字段查找。"liver"[AllFields]AND"neoplasms"[AllFields]
最后,將“l(fā)iverneoplasms”作為一個短語,在全部字段查找。
"liverneoplasms"[AllFields]第二十七頁,共81頁。2.2.1基本檢索第二十八頁,共81頁。檢索字段標(biāo)識第二十九頁,共81頁。第三十頁,共81頁。2.2.2主題檢索第三十一頁,共81頁。2.2.3期刊檢索第三十二頁,共81頁。2.2.4高級檢索第三十三頁,共81頁。2.2.5單篇引文匹配檢索第三十四頁,共81頁。2.3檢索結(jié)果管理第三十五頁,共81頁。第三十六頁,共81頁。第三十七頁,共81頁?;緳z索缺?。和瑫r在“中文標(biāo)題、摘要、作者、關(guān)鍵詞、主題詞、刊名”這6個主要字段檢索中檢索。關(guān)鍵詞:關(guān)鍵詞是科技論文固有的欄目,一般是作者抽取的,不規(guī)范,往往不能全面反映文獻(xiàn)的內(nèi)容,容易造成漏檢。主題詞:該字段是主題標(biāo)引生成的。由標(biāo)引人員根據(jù)文獻(xiàn)內(nèi)容,確定若干關(guān)鍵詞,再依據(jù)《中文醫(yī)學(xué)主題詞表》給出相應(yīng)的“主題詞/副主題詞”。主要主題詞標(biāo)記“*”,即“加權(quán)主題詞”。該字段檢索不能滿足主題詞的擴(kuò)展檢索,主題詞檢索必須從“主題檢索”入口。分類號:該字段是分類標(biāo)引生成的。由標(biāo)引人員根據(jù)文獻(xiàn)內(nèi)容,確定若干關(guān)鍵詞,再依據(jù)《中國圖書館分類法·醫(yī)學(xué)專業(yè)分類表》,給出最專指的分類號。參考文獻(xiàn):該字段可以檢索被引文獻(xiàn)的作者、題名、書名或刊名。檢索結(jié)果提供參考文獻(xiàn)的鏈接。例如:查找“徐叔云教授撰寫的《藥理實(shí)驗(yàn)方法學(xué)》一書被引用情況”。作者:該字段可以檢索某作者發(fā)表的文獻(xiàn)。只能輸入作者姓名,不能加頭銜等稱號?;穑涸撟侄问俏墨I(xiàn)所獲基金資助項(xiàng)目的名稱和項(xiàng)目編號,國家基金一般冠有“國家”,省級基金一般冠有省名,市級基金一般冠有市名,單位基金冠有單位的名稱。自動實(shí)現(xiàn)檢索詞,檢索詞對應(yīng)主題詞及該主題詞所含下位詞的同步檢索。第三十八頁,共81頁。具體實(shí)例——基本檢索實(shí)例1檢索艾滋病治療的相關(guān)文獻(xiàn)。(1)艾滋病中文:艾滋病or
愛滋病orAIDSor獲得性免疫缺陷綜合征英文:AidsORAcquiredImmunodeficiencySyndrome(2)治療中文:治療or
療法英文:TreatmentORTherapy第三十九頁,共81頁。實(shí)例1——檢索式第四十頁,共81頁。實(shí)例1——檢索式第四十一頁,共81頁。實(shí)例1——檢索結(jié)果第四十二頁,共81頁。實(shí)例1——方法二第四十三頁,共81頁。第四十四頁,共81頁。第四十五頁,共81頁。實(shí)例2——方法二檢索結(jié)果第四十六頁,共81頁。
實(shí)例2
檢索安徽醫(yī)科大學(xué)曹云霞教授近五年來發(fā)表的文獻(xiàn)。
檢索詞1安徽醫(yī)科大學(xué)檢索式
作者單位:安徽醫(yī)科大學(xué)or安醫(yī)大檢索詞2曹云霞檢索式作者=曹云霞檢索詞3近五年
檢索式2011-2015(限定中選擇)第四十七頁,共81頁。CBM—實(shí)例2第四十八頁,共81頁。實(shí)例2——檢索式第四十九頁,共81頁。實(shí)例2——檢索式第五十頁,共81頁。實(shí)例2——檢索結(jié)果第五十一頁,共81頁。檢索歷史第五十二頁,共81頁。Pubmed–基本檢索第五十三頁,共81頁。具體實(shí)例——基本檢索實(shí)例1檢索艾滋病治療的相關(guān)文獻(xiàn)。(1)艾滋病英文:AidsORAcquiredImmunodeficiencySyndrome(2)治療英文:TreatmentORTherapy第五十四頁,共81頁。實(shí)例1——檢索式第五十五頁,共81頁。實(shí)例1——檢索結(jié)果第五十六頁,共81頁。
實(shí)例2檢索安徽醫(yī)科大學(xué)曹云霞教授近五年來發(fā)表的文獻(xiàn)。
檢索詞1安徽醫(yī)科大學(xué)檢索式anhuimedicaluniversity[ad]檢索詞2曹云霞檢索式caoyx[au]檢索詞3近五年
檢索式5years(限定中選擇)第五十七頁,共81頁。實(shí)例2——檢索式Caoyx[au]第五十八頁,共81頁。第五十九頁,共81頁。實(shí)例2——檢索式第六十頁,共81頁。第六十一頁,共81頁。第六十二頁,共81頁。第六十三頁,共81頁。第六十四頁,共81頁。實(shí)例2——檢索結(jié)果第六十五頁,共81頁。具體實(shí)例——主題檢索艾滋病的治療(1)主題概念:艾滋病主題詞:獲得性免疫缺陷綜合征(2)副主題概念:治療副主題詞:治療第六十六頁,共81頁。CBM-主題檢索第六十七頁,共81頁。第六十八頁,共81頁。第六十九頁,共81頁。第七十頁,共81頁。第七十一頁,共81頁。PUBMED-主題檢索第七十二頁,共81頁。第七十三頁,共81頁。第七十四頁,共81
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