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第十三章

基因的轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后加工及逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)錄翻譯復(fù)制基因的遺傳:DNA基因的表達(dá):DNA→RNA→Protein復(fù)制轉(zhuǎn)錄翻譯相關(guān)概念模板鏈(templatestrand)反意義鏈(antisensestrand)負(fù)鏈(minusstrand)Watson(W)鏈編碼鏈(codingstrand)有意義鏈(sensestrand)正鏈(plusstrand)Crick(C)鏈5`編碼鏈…AGCTCCAGGTTCCATGGCTAACG…3`3`模板鏈…TCGAGGTCCAAGGTACCGATTGC…5`5`mRNA……CUCCAGGUUCCAUGGCUA

……3`※mRNA與編碼鏈序列基本一致

不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄(asymmetrictranscription)不同基因的模板鏈,并不固定在DNA雙鏈上的某一鏈,但轉(zhuǎn)錄方向總是5`→3`,因此不同基因的轉(zhuǎn)錄方向不同。編碼鏈模板鏈模板鏈編碼鏈5`3`3`5`基因1轉(zhuǎn)錄方向基因2轉(zhuǎn)錄方向5`5`3`3`第一節(jié)參與轉(zhuǎn)錄的酶類(lèi)σ因子

σ

亞基→轉(zhuǎn)錄起始因子以分子量命名e.g.σ

70(分子量70kDa)rpoH基因σ

32熱激狀態(tài)啟動(dòng)子hsp基因5`3`Hsp(heatshockproteins)5`5`3`3`σ54→參與氮源利用基因的轉(zhuǎn)錄

σE→參與細(xì)菌鞭毛生成基因的轉(zhuǎn)錄二、真核生物的RNA聚合酶(RNApol)IIIIII定位轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物對(duì)抑制劑(鵝膏蕈堿)敏感性核仁核質(zhì)核質(zhì)45SrRNAtRNA,5SrRNA,snRNAhnRNA不敏感敏感不同物種敏感性不同RNAPolI→45SrRNA→5.8SrRNA

18SrRNA

28SrRNARNAPolIII→5SrRNAtRNARNAPolII→hnRNA→mRNA原核生物RNAPolRNAPolIRNAPolIII>100KD>100KD19KD40KDRNAPolII>100KD>100KD44KD44KD真核生物RNAPol轉(zhuǎn)錄起始→轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)→轉(zhuǎn)錄終止一、轉(zhuǎn)錄起始1、原核生物轉(zhuǎn)錄起始原核生物啟動(dòng)子特征:-10bp:Pribnow盒5`-TATAAT-3`-35bp:5`-TTGACA-3`5`------------TTGACA------TATAAT-----------------------------3`編碼鏈-35bp-10bp+1bp上游下游調(diào)控序列(啟動(dòng)子)結(jié)構(gòu)基因5`3`啟動(dòng)子的方向性封閉型轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物→開(kāi)放型轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物-35bp-10bp2、真核生物轉(zhuǎn)錄起始蛋白輔助因子→轉(zhuǎn)錄因子TF-I→

RNApolITF-II→RNApolIITF-III→RNApolIII

轉(zhuǎn)錄因子(transcriptionfactor,TF):能直接或間接與結(jié)構(gòu)基因上游的調(diào)控序列(DNA序列)或RNApol結(jié)合,影響轉(zhuǎn)錄的蛋白質(zhì)因子。

TF-IIHTATATF-IIDTF-IIATF-IIBRNApolIITF-IIFTF-IIETF-IIJ解開(kāi)DNA雙螺旋蛋白激酶ATPtase真核生物RNA-polII不直接與DNA分子結(jié)合,需依靠眾多的轉(zhuǎn)錄因子。

各轉(zhuǎn)錄因子TF-II功能TF-IID:與啟動(dòng)子的TATA盒結(jié)合TF-IIA:形成TF-IIA-D復(fù)合物,防止抑制因子結(jié)合TF-IIB:作為其他因子結(jié)合的橋梁TF-IIF:與RNApolII結(jié)合TF-IIE:ATP酶活性,為轉(zhuǎn)錄起始處的局部解鏈提供能量。TF-IIJ:TF-IIH:解開(kāi)DNA雙鏈蛋白激酶活性,使RNApolII的C端多個(gè)絲氨酸殘基磷酸化2)RNApolI催化的轉(zhuǎn)錄起始+1bp核心元件上游調(diào)控元件3`上游結(jié)合因子UBF5`3`核心元件上游調(diào)控元件上游結(jié)合因子UBFTAFTBPTATARNApolI二、轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)1、局部單鏈形成:RNA聚合酶向下游移動(dòng)時(shí),使DNA雙鏈解開(kāi)(10-20bp)2、向下游滑動(dòng):

σ因子(原核生物)TFIIH(真核生物)NTP中焦磷酸(β、γ)水解(原核、真核生物)3、解除局部張力:拓?fù)洚悩?gòu)酶轉(zhuǎn)錄泡:RNA聚合酶-DNA模板-RNA轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物結(jié)合在一起形成的復(fù)合物A:U<A:T三、轉(zhuǎn)錄終止原核生物轉(zhuǎn)錄終止1)ρ因子依賴的轉(zhuǎn)錄終止轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)--RNA上一段富含C的序列ρ因子--六聚體,具ATP酶活性→水解ATP供能解鏈酶→解開(kāi)DNA/RNA雜合鏈,RNA鏈釋放

2)ρ因子非依賴的轉(zhuǎn)錄終止GC豐富區(qū)→

莖-環(huán)結(jié)構(gòu)→改變RNA聚合酶構(gòu)象,停止轉(zhuǎn)錄連續(xù)T序列→A=U配對(duì)區(qū),不穩(wěn)定→RNA鏈釋放——————GGCGCCC———GGGCGCC———TTTTTTTT————5`3`5`3`——————CCGCGGG———CCCGCGG———AAAAAAAA———GCGCCGGCCGCGCGUUUUU3`5`第三節(jié)轉(zhuǎn)錄后的加工幾種主要的加工方式1.剪接(splicing)2.剪切(cleavage)3.修飾(modification)4.添加(addition)2、tRNA轉(zhuǎn)錄后加工:剪切、剪接、堿基修飾TGGCNNAGTGCGGTTCGANNCCDNARNApolⅢ前體tRNARNAasePtRNA核苷酸轉(zhuǎn)移酶、連接酶ATPADP堿基修飾(2)還原反應(yīng)如:UDHU(4)脫氨反應(yīng)如:AI如:AAm(1)甲基化(3)核苷內(nèi)的轉(zhuǎn)位反應(yīng)如:Uψ(2)(1)(1)(3)(4)3、mRNA轉(zhuǎn)錄后加工1)5`端加帽(m7GpppGpN—)5pppGpN…5GpppGpN…pppG

ppi鳥(niǎo)苷酰轉(zhuǎn)移酶5

m7GpppGpN…甲基轉(zhuǎn)移酶SAM5ppGpN…磷酸酶Pi帽子結(jié)構(gòu)17G①5

m7GpppGpN③5

m7GpppGmpNm②5

m7GpppGmpN1.保護(hù)mRNA不被核酸外切酶水解2.與帽結(jié)合蛋白結(jié)合,識(shí)別核糖體意義2)3`端加尾(polyA)——————————————

AAAAAAAAA——————————————————TTTTTTTTTT————5`5`3`3`AAAAAAAAA5`3`?————————————AATAAA——GT————————————————TTATTT——CA————AAUAAA——GU——5`3`5`5`3`3`剪切位點(diǎn)AAUAAA——AAAAAAA(A)n—5`3`polyA聚合酶ATPPPi剪切信號(hào)mRNA意義增加mRNA穩(wěn)定性3)mRNA的剪接斷裂基因(splitegene)CABD編碼區(qū)A、B、C、D非編碼區(qū)真核生物結(jié)構(gòu)基因,由若干個(gè)編碼區(qū)和非編碼區(qū)互相間隔但又連續(xù)鑲嵌而成,去除非編碼區(qū)再連接后,可翻譯出由連續(xù)氨基酸組成的完整蛋白質(zhì),這些基因稱為斷裂基因。DNAmRNA5`3`外顯子(exon)和內(nèi)含子(intron)

外顯子在斷裂基因及其初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物上出現(xiàn),并表達(dá)為成熟RNA的核苷酸序列。

——編碼區(qū)內(nèi)含子斷裂基因的線性表達(dá)而在剪接過(guò)程中被除去的核苷酸序列。

——非編碼區(qū)5`5`5`5`3`5`3`3`3`3`外顯子內(nèi)含子外顯子外顯子內(nèi)含子5`5`5`5`3`5`3`3`3`3`外顯子內(nèi)含子外顯子外顯子內(nèi)含子5`GU------------------------UACUAAC-----------AG

3`①5`和3`剪接點(diǎn):GU-AG規(guī)則②分支點(diǎn)③剪接體snRNP(snRNA+蛋白質(zhì))5`3`3`5`剪接體雞卵清蛋白基因及其轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后加工雞卵清蛋白基因hnRNA加帽、加尾修飾hnRNA剪接成熟的mRNA4)mRNA編輯(mRNAediting)

在前體分子中插入、剔除或置換一些核苷酸。人類(lèi)apoB基因

mRNA(14500個(gè)核苷酸)肝臟apoB100(分子量為500000)腸道細(xì)胞apoB48(分子量為240000)mRNA編輯4536a.a2152a.aCAA谷氨酰胺UAA終止密碼子第2153a.a

RNA編輯意義:基因的編碼序列經(jīng)過(guò)轉(zhuǎn)錄后編輯加工,可以分化成多用途的編碼序列,在不增加基因組DNA遺傳信息容量的前提下,大大增加了mRNA信息容量。人類(lèi)基因組計(jì)劃:預(yù)測(cè):5至10萬(wàn)個(gè)基因?qū)嶋H:35000個(gè)基因印證了RNA編輯的存在遺傳信息在水平發(fā)生改變一種結(jié)構(gòu)基因產(chǎn)生不止一種蛋白質(zhì)第四節(jié)逆轉(zhuǎn)錄、逆轉(zhuǎn)錄病毒及癌基因一、轉(zhuǎn)錄與逆轉(zhuǎn)錄DNARNA轉(zhuǎn)錄逆轉(zhuǎn)錄二、逆轉(zhuǎn)錄酶與逆轉(zhuǎn)錄病毒逆轉(zhuǎn)錄酶:RNA依賴的DNA聚合酶逆轉(zhuǎn)錄病毒:RNA病毒

逆轉(zhuǎn)錄酶的活性:①RNA依賴的DNA聚合功能②RNA水解③DNA依賴的DNA聚合功能RNARNADNA(-)DNA(-)DNA(+)DNA(-)①②③三、逆轉(zhuǎn)錄病毒的生活周期逆轉(zhuǎn)錄病

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