醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座_第1頁
醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座_第2頁
醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座_第3頁
醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座_第4頁
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文檔簡(jiǎn)介

醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處理及SAS軟件應(yīng)用主講人:董光芒副教授中國(guó)醫(yī)科大學(xué)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)教研室醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第1頁SAS軟件介紹

SAS是美國(guó)與西歐使用最為廣泛三大著名統(tǒng)計(jì)分析軟件(SAS,SPSS和SYSTAT)之一,是當(dāng)前國(guó)際上最為流行一個(gè)大型統(tǒng)計(jì)分析系統(tǒng),被譽(yù)為統(tǒng)計(jì)分析標(biāo)準(zhǔn)軟件。是國(guó)際上公認(rèn)最權(quán)威統(tǒng)計(jì)軟件。以苛刻嚴(yán)格著稱于世美國(guó)FDA新藥審批程序中,新藥試驗(yàn)結(jié)果統(tǒng)計(jì)分析要求只能用SAS進(jìn)行,其它軟件計(jì)算結(jié)果一律無效!哪怕只是簡(jiǎn)單均數(shù)和標(biāo)準(zhǔn)差也不行!由此可見SAS權(quán)威地位。年開始中國(guó)新藥臨床試驗(yàn)結(jié)果要求應(yīng)用SAS軟件分析。醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第2頁SAS與SPSS比較作為統(tǒng)計(jì)軟件大家族里“傻瓜相機(jī)”,SPSS功效是最弱,但易用性排在全部統(tǒng)計(jì)軟件之首。不過SPSS易用性也極大限制了它功效和可擴(kuò)展性。除了SPSS本身菜單提供功效,用戶無法經(jīng)過編程或者插件來擴(kuò)展它功效,而且SPSS提供都只是最基本慣用方法。醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第3頁SAS全球?qū)I(yè)認(rèn)證SAS專業(yè)認(rèn)證是一項(xiàng)擁有極高國(guó)際聲譽(yù)專業(yè)認(rèn)證,在歐美等國(guó)職場(chǎng)上流行一句話“IfyouhaveaSAScertification,Youwillneverloseyourjob”。銷售模式:只租不售(每5年一個(gè)周期)財(cái)富500強(qiáng)中97%企業(yè)都在使用SAS商業(yè)智能處理方案

醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第4頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第5頁年(301醫(yī)院與軍事醫(yī)科院博士生)各統(tǒng)計(jì)軟件使用情況醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第6頁P(yáng)ubmed檢索SCI英文文件各統(tǒng)計(jì)軟件使用情況醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第7頁SAS軟件功效進(jìn)行數(shù)據(jù)管理數(shù)據(jù)輸入、建庫、保留……進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析t檢驗(yàn)方差分析卡方檢驗(yàn)相關(guān)、回歸秩和檢驗(yàn)……醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第8頁SAS安裝SAS8.12版本是windows操作系統(tǒng)下32位軟件,和其它windows系統(tǒng)下軟件安裝方法類似。用鼠標(biāo)左鍵雙擊光盤根目錄下setup圖標(biāo),然后按照提醒安裝。醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第9頁SAS開啟單擊開始菜單“程序”項(xiàng)。桌面上雙擊此快捷方式也可開啟SAS。醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第10頁執(zhí)行開始菜單中程序單項(xiàng)【程序】-【TheSASSystem】-【TheSASSystemforWindows】醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第11頁SAS退出方式1:選擇關(guān)閉按鈕方式2:執(zhí)行菜單命令【File】→【Exit】方式3:在命令框執(zhí)行BYE或ENDSAS命令醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第12頁SAS窗口PGM窗口(ProgramEditor):提供編寫SAS程序文本編輯器LOG窗口:顯示執(zhí)行程序過程中相關(guān)信息OUTPUT窗口:顯示程序運(yùn)行結(jié)果命令窗口與探索者窗口醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第13頁程序編輯窗口日志窗口結(jié)果輸出窗口探索者窗口命令窗口醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第14頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第15頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第16頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第17頁SAS程序編寫一個(gè)完整SAS程序普通由數(shù)據(jù)步(DATA步)和過程步(PROC步)兩部分組成。DATA步以DATA語句開始,經(jīng)過指定數(shù)據(jù)集名稱、定義變量名及類型和讀入數(shù)據(jù)等建立SAS數(shù)據(jù)集。過程步以PROC語句開始,經(jīng)過調(diào)用不一樣分析模塊來分析SAS數(shù)據(jù)集。醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第18頁其它格式數(shù)據(jù)庫直接導(dǎo)入轉(zhuǎn)換:excel(.xls);dbase(.dbf);lotus(.wk)等將數(shù)據(jù)讀入系統(tǒng),建立數(shù)據(jù)集(直接輸入Editor窗口)。SAS數(shù)據(jù)集建立醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第19頁外部數(shù)據(jù)導(dǎo)入例:有一批體檢數(shù)據(jù),包含受檢者姓名、性別、年紀(jì)、身高、體重信息。要求按性別分別計(jì)算身高、體重描述性統(tǒng)計(jì)量:均值、標(biāo)準(zhǔn)差、最大值、最小值。該數(shù)據(jù)以Excel.xls文件形式儲(chǔ)存。文件名稱:tijiandata.xls醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第20頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第21頁ImportData醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第22頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第23頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第24頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第25頁庫標(biāo)識(shí)導(dǎo)入SAS數(shù)據(jù)庫文件名醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第26頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第27頁探索者窗口醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第28頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第29頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第30頁在Editor程序編輯窗口輸入源程序數(shù)據(jù)步:將數(shù)據(jù)讀入系統(tǒng),建立數(shù)據(jù)集:DATA語句開始,后面加上數(shù)據(jù)庫名字。INPUT語句描述數(shù)據(jù)變量,用$表示變量是字符型CARDS語句指示后面是數(shù)據(jù),每行為一個(gè)觀察數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)間無分號(hào)。數(shù)據(jù)最終以“;”開頭空行結(jié)束。每個(gè)語句都以“;”結(jié)束。醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第31頁SAS程序數(shù)據(jù)步格式Data<數(shù)據(jù)庫名稱>;Input<變量名1>$<變量名2>….<變量名K>@@;Cards;..............................;醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第32頁數(shù)據(jù)步

過程步醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第33頁SAS過程步對(duì)數(shù)據(jù)集中數(shù)據(jù)進(jìn)行分析、處理。以PROC語句開始,調(diào)用SAS過程。每個(gè)語句都以“;”結(jié)束。整個(gè)程序最終要有RUN語句。醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第34頁過程步醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第35頁SAS程序書寫格式不分大小寫單個(gè)名稱中不能空格,不一樣名稱間必須空格一行可寫多條語句,用分號(hào)分割一條語句可寫多行數(shù)據(jù)行后不加分號(hào),數(shù)據(jù)最終單獨(dú)加分號(hào)行程序用“RUN;”語句結(jié)束醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第36頁運(yùn)行SAS程序方式一:鼠標(biāo)點(diǎn)擊執(zhí)行按鈕方式二:按功效鍵“F8”方式三:執(zhí)行菜單命令Run→Submit方式四:在命令框輸入SUBMIT命令并執(zhí)行醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第37頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第38頁SAS程序?qū)嵗?/p>

某學(xué)生上學(xué)期8門課程分?jǐn)?shù)分別為88,90,87,76,92,78,80,86。試用SAS編程求其平均分?jǐn)?shù)。(1)

在PGM窗口鍵入以下程序

datafenshu;inputchengji@@;cards;88

90

87

76

92

78

80

86;procmeans;varchengji;run;

過程步數(shù)據(jù)步醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第39頁查看結(jié)果(output窗口)AnalysisVariable:chengji

N

Mean

StdDev

Minimum

Maximum

-----------------------------------------------------------------------

8

84.6250000

5.8782286

76.0000000

92.0000000

-----------------------------------------------------------------------

從結(jié)果看出,該學(xué)生上學(xué)期8門課程平均成績(jī)?yōu)?4.625。醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第40頁查看運(yùn)行過程及犯錯(cuò)信息激活LOG窗口(F6)

黑色文字:源程序及運(yùn)行情況藍(lán)色文字:程序運(yùn)行情況說明信息紅色文字:犯錯(cuò)信息綠色文字:警告信息醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第41頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第42頁保留SAS程序及其它窗口內(nèi)容激活對(duì)應(yīng)窗口,然后選擇:方式一:鼠標(biāo)點(diǎn)擊“存盤”工具按鈕方式二:執(zhí)行菜單命令【File】→【Save】/【Saveas】可保留程序、數(shù)據(jù)文件、運(yùn)行結(jié)果、日志等。SAS保留成純文本格式文件(.txt)。醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第43頁保留文件名醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第44頁在SAS系統(tǒng)內(nèi)打開已保留文件只能在ProgramEdit窗口打開文件,選擇:方式一:鼠標(biāo)點(diǎn)擊“打開”工具按鈕方式二:執(zhí)行菜單命令【File】→【Open】可打開以前保留程序、數(shù)據(jù)文件、運(yùn)行結(jié)果、日志等文件及其它文本格式文件。醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第45頁SAS程序主要關(guān)鍵詞means;(n,mean,std,Q1,Q3,CV,median,clm…)

univariatenormal;(正態(tài)性檢驗(yàn),均數(shù)是否為0假設(shè)檢驗(yàn):參數(shù)與非參數(shù)檢驗(yàn))ttest;(兩個(gè)樣本均數(shù)比較t檢驗(yàn))anova;(各樣本含量相等方差分析)

glm;(各樣本含量不等方差分析)npar1way;(非參數(shù)檢驗(yàn))

reg;(線性回歸方程:?jiǎn)卧蚨嘣ヽorr;(線性相關(guān):線性相關(guān)或秩相關(guān))freq;(卡方、Fisher檢驗(yàn))logistic;(非線性回歸)

lifetest;(生存分析)proc醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第46頁定量資料描述性分析醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第47頁分析結(jié)果醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第48頁定量資料正態(tài)性檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第49頁正態(tài)性檢驗(yàn)結(jié)果醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第50頁配對(duì)設(shè)計(jì)t-test為了比較兩種方法對(duì)乳酸飲料中脂肪含量測(cè)定結(jié)果是否不一樣,隨機(jī)抽取了10份乳酸飲料制品,分別采取哥特里-羅紫法和脂肪酸水解法測(cè)定其結(jié)果,問兩種方法檢測(cè)結(jié)果是否不一樣?編號(hào)哥特里-羅紫法脂肪酸水解法10.8400.58020.5910.50930.6740.50040.6320.31650.6870.33760.9780.51770.7500.45480.7300.51291.2000.997100.8700.506醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第51頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第52頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第53頁成組設(shè)計(jì)資料t-test國(guó)產(chǎn)藥進(jìn)口藥-5-176448634777607458-2-14897277486361705436228266-14采取國(guó)產(chǎn)藥品和進(jìn)口藥品治療絕經(jīng)后婦女骨質(zhì)疏松癥,試比較兩種藥品療效是否有差異醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第54頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第55頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第56頁完全隨機(jī)設(shè)計(jì)資料方差分析(教科書73頁)撫慰劑組2.4g組4.8g組7.2g組3.532.422.860.894.593.362.281.064.344.322.391.082.662.342.281.273.592.682.481.633.132.952.281.894.042.632.321.743.532.862.612.163.652.933.643.373.852.172.582.974.072.723.651.693.932.223.682.114.192.902.652.812.962.973.022.52醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第57頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第58頁方差齊性檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第59頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第60頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第61頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第62頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第63頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第64頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第65頁四格表資料χ2-test組別有效無效累計(jì)有效率胞磷膽堿4665288.5%神經(jīng)節(jié)苷脂1882669.2%累計(jì)64147882.1%某醫(yī)師欲比較胞磷膽堿與神經(jīng)節(jié)苷脂治療腦血管疾病療效,將78例腦血管疾病患者隨機(jī)分為兩組,試比較兩種藥品療效醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第66頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第67頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第68頁醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)處置和SAS軟件的應(yīng)用專家講座第69頁配對(duì)四格表

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