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基因表達量實時熒光定量PCR檢測步驟1材料(試劑和耗材)1.1樣本(小鼠組織)-2個引物(lifetechnology公司合成)BestarTMjPCRRTKit(德國DBI貨號:DBI-2220)Bestar?SybrGreenqPCRmastermix(德國DBI貨號:DBI-2043)96孔板(美國lifetechnology)2材料(儀器)ABI7500熒光定量PCR儀(lifetechnology公司)TGL-16M低溫冷凍離心機(湘儀)SW-CJ-1D單人凈化工作臺(瀘凈凈化)HR40-IIA2生物安全柜(Haier)3實驗步驟3.1RNA的抽提RNA的提取按lifetechnology公司提供的TriozolRNA提取試劑盒的使用說明進行。程序如下:(1)將組織在液氮中磨碎,每50-100mg組織加入1mlTRIzol;(2)加入0.2mL氯仿,蓋緊離心管管蓋,上下顛倒混勻60s(請勿渦漩激烈振蕩),室溫靜置3min,12,000g,4^離心15min,置于冰上;(3)溶液分為三層,RNA溶解在水相中,小心吸取500叫水相至另一個新的RNasefree的EP管中;(4)加入500^1異丙醇,-20度放置1h,12,000g,4^離心10min,離心后管底出現(xiàn)RNA沉淀,棄上清;加入1ml75%乙醇,用手輕輕顛倒,12,000g離心5min,去上清;超凈工作臺上吹干樣品10min,加入適量DEPC水溶解RNAj^A40叫DEPC水溶解沉淀。3.2RNA質(zhì)量檢測紫外分光光度計測定RNA濃度:sampleIDconcentration(ng/同260/280a9981.87b10241.973.3去基因組DNA和cDNA的合成將RNA加入到gDNA吸附柱,室溫10,000g離心1min,收集濾液即為去除基因組DNA的RNA。把RNA在65°C條件下熱變性5分鐘后,立即置于冰上冷卻。逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng):TOC\o"1-5"\h\z\o"CurrentDocument"5XRTBuffer2gL\o"CurrentDocument"RTEnzymeMix0.5gLPrimerMix0.5gLRNA6gL\o"CurrentDocument"RNase-freeWater1gLToal10gL反應(yīng)條件:37°C,15min98°C,5min4°C,hold反應(yīng)結(jié)束后,-20°C保存。3.4cDNA的實時熒光定量PCR3.4.1實驗步驟每個樣本分別設(shè)置3個目的基因和3個內(nèi)參基因的平行實驗。PCR反應(yīng)體系為20四L,根據(jù)表1.配置。反應(yīng)條件為:95°C2min95°C10s、60°C34s(采集熒光信號)*45個循環(huán)72°C30sJ循環(huán)結(jié)束后從60°C升高到98°C獲取熔解曲線。表120"熒光定量PCR反應(yīng)體系試劑體積(gL)終濃度滅菌蒸餾水4.46/Bestar?SybrGreenqPCRmastermix101xForwardPrimer(20pM)0.250.25gMReversePrimer(20pM)0.250.25gM50XRQX0.040.1X模板5/Total20/表2使用的引物基因名稱GenebankID引物序列擴增長度(bp)Mus-GAPDHNM_001289726.1Forward:TCCACTCACGGCAAATTCAAC146Reverse:GTAGACTCCACGACATACTCAGCxNM_*****Forward:Reverse:yNM_*****Forward:Reverse:3.4.2實驗結(jié)果的分析方法本實驗采用2-△&法進行分析,計算公式為:_「(待測組目的基因待測組管家基因)_(對照組目的基因?qū)φ战M管家基因]F=2t平均ct值平均ct值平均ct值平均ct值F為相對表達量,根據(jù)此次試驗的設(shè)計,對照組中的目的基因表達量為1。4結(jié)果4.1擴增曲線dry基因擴增曲線4.2熔解曲線GAPDH基因熔解曲線y基因熔解曲線-24.3實驗數(shù)據(jù)見EXCE
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