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文檔簡介
生存分析生存分析生存分析:在臨床診療工作的評價中,慢性疾病的預后一般不適用于治愈率、病死率等指標來考核,因為其無法在短時間內(nèi)明確判斷預后情況,為此,只能對患者進行長期隨訪,統(tǒng)計一定時期后的生存或死亡情況以判斷診療效果。生存分析還適用于現(xiàn)場追蹤研究(發(fā)病為陽性)、臨床療效試驗(痊愈或顯效為陽性)、動物試驗(發(fā)病或死亡)等?;靖拍钌鏁r間(SurvivalTime):從狹義的角度來說:生存時間是患某病的病人從發(fā)病到死亡所經(jīng)歷的時間跨度。
開始發(fā)病病人死亡
從廣義的角度:從某種起始事件到達某種終點時間所經(jīng)歷的時間跨度。
起始事件終點事件生存時間生存時間生存時間的數(shù)據(jù)類型2.截尾數(shù)據(jù)(CensoredData):由于某種原因未能觀察到觀察對象的明確的結(jié)局,所以不知道該觀察對象的確切的生存時間,就象該觀察對象的生存時間在未到達規(guī)定的終點之前就被截尾了。截尾數(shù)據(jù)提供了部分關(guān)于生存時間的信息,使研究者知道該觀察對象至少在已經(jīng)經(jīng)歷的這個時間長度內(nèi)沒有發(fā)生終點事件,其真實的生存時間只能長于我們現(xiàn)在觀察到的時間而不會短于這個時間。(符號t+)1.完全數(shù)據(jù)(CompleteData)指達到了明確結(jié)局的觀察對象的生存時間數(shù)據(jù)。某個觀察對象具有明確的結(jié)局時,該觀察對象所提供的關(guān)于生存時間的信息是完整的。生存時間資料的特點
有2個效應變量:一是生存時間(天數(shù)),二是結(jié)局(死亡與否、是否陽性等)。
存在截尾數(shù)據(jù):由于某種原因未能明確觀察到隨訪對象發(fā)生事先定義的終終事件。
分布類型復雜:生存時間資料常通過隨訪獲得,因觀察時間長且難以控制混雜因素,故其分布常呈偏態(tài),影響因素較多,規(guī)律難以估測。生存分析方法Kaplan-meier過程這是一種非參數(shù)法,主要用于小樣本,適用于能夠準確記錄事件和刪失發(fā)生時點的數(shù)據(jù)。LifeTables過程也叫壽命表法,適用于樣本量大,且不太可能準確記載每個觀察對象的死亡或刪失發(fā)生時間的數(shù)據(jù)。Cox回歸模型分析法用于描述多個變量對生存時間的影響Kaplan-meier過程Kaplan-meier法用于:估計某因素不同水平的中位生存時間比較研究因素不同水平的生存時間有無差異控制一分層因素后對研究因素不同水平的生存時間比較例1:3種療法治療66例白血病患者緩解時間(天),數(shù)據(jù)(kaplanm.sav)如下A療法:4,5,9,10,11,12,13,28,28,28,29,31,32,37,41,41,57,62,74,100,139,20+,258+,269B療法:8,10,10,12,14,20,48,70,75,99,103,162,169,195,220,161+,199+,217+,245+C療法:8,10,11,23,25,28,28,31,31,40,48,89,124,143,12+,159+,190+,196+,197+,205+,219+Kaplan-meier過程Kaplan-meier過程Kaplan-meier過程時間變量結(jié)局變量分組變量
當變量為二分類變量時,一般以死亡、復發(fā)、惡化等為終結(jié)事件,如本例就是以惡化為終結(jié)事件,標記值為1,所以在Singlevalue框中輸入1;如果生存狀態(tài)變量取值為連續(xù)變量時,則在Rangeofvalues框分別輸入下限值和上限值。Kaplan-meier過程LogRank法和Breslow法較為常用Kaplan-meier過程對組間生存函數(shù)的差異進行檢驗的方法Kaplan-meier過程Survival:累積生存率估計,選中,表明要求將各觀察樣本的生存率存入原始數(shù)據(jù)庫中Standarderrorofsurvival:累積生存率估計的標準誤Hazard:累積風險函數(shù)估計Cumulativeevents:終結(jié)事件的累積頻數(shù)生存分析表平均生存時間和中位生存時間及其標準誤和可信區(qū)間累積生存函數(shù)曲線Kaplan-meier過程Ka綿pl熔an嘴-m桑ei繼er過程分析梯結(jié)果…1.觀察料時間2.生存像狀態(tài)3.累積體生存墨率4.累積饅生存劈燕率的抗標準臉差5.累積臭死亡巖數(shù)6.組中弟剩余常人數(shù)123456(1)生牢存表寧分析Me幫an是生征存時辛間的齊算術(shù)爽均數(shù)挖,Me掉di撲an為中旺位生態(tài)存時廈間,搬同時另表格詢中也噴給出掩它們唱的95須%的可分信區(qū)六間。Ka塵pl掘an蹄-m吊ei岔er過程分析口結(jié)果(2)生擊存時您間估率計Lo益g個Ra再nk、Br躲es憂lo筐w和Ta風ro伏ne宰-W屈ar答e三種柜檢驗愈方法踩的檢盜驗統(tǒng)遞計量露分別防為3.狹28仇2、2.距86載1和3.駕36復0,它糕們的p值分熔別為0.薯19胸4、0.扣23立9和0.況18膊6,說司明三裝組療綢法之陵間生店存時仿間的迎差異將無顯筋著性Ka太pl冒an冤-m紫ei過er過程分析述結(jié)果(3)水揮平間賭的整件體比腔較分析脾結(jié)果(4)生授存曲悉線Ka伴pl干an杰-m端ei戶er過程Li廳fe夏T艱ab撈le珠s過程突用于甩:制作宅壽命嫩表繪制古各做亂曲線勿如生探存函刷數(shù)、住風險論函數(shù)象曲線府等。對某仰一研佳究因奧素的搏不同螺水平虹的生港存時臭間分斤布進啄行比狡較,襯控制轎另一隸個因望素后輝對研堂究因繁素不川同水鹽平的佩生存閉時間臟分布適進行急比較婚,包勻括從繼總體懂上比拆較和嫌不同哄水平哥間進請行兩匹兩比固較。Li嘴fe猜-T案ab仔l(wèi)e禍s過程例2:某故醫(yī)院孤對11繩4名男濁性胃慶癌患仔者接您受手磚術(shù)后快的生價存情逝況進劉行了11年的絲式隨訪競,得桐到數(shù)陶據(jù)(li學fe蕩tb英.s碼av)如西下Li逮fe濟-T售ab租le抵s過程Li寄fe行-T閑ab弱le尚s過程輸出僚生存響時間脹范圍鼻及組倡距:兵前一端個框鑰輸入問生存秒時間鵲上限乓,后譜一個筒框輸頓入生爬存時煉間的儉組距Li溜fe加-T書ab強le紹s過程Li斜fe晝-T誤ab華le陸s過程生存俗曲線風險錦函數(shù)撒曲線壽命巾表Li促fe炎-T程ab血le蟲s過程分析恭結(jié)果(1)壽扛命表設(分環(huán)三部株分講藏解)1.生存銜時間嚷的組扛段下陸限2.進入慘該組市段的韻觀察分例數(shù)3.該組紡段的芒刪失霞例數(shù)4.暴露炒于危效險因它素的霉例數(shù)5.所關(guān)脫心的建事件豈的例夠數(shù),鞏即死陳亡例罪數(shù)Li納fe律-T注ab飲le首s過程分析截結(jié)果(1)壽毯命表Ⅰ123451.所關(guān)杠心事僑件的朗觀察睜單位患數(shù)的呢比,割即各鄙組的躲死亡宴概率2.各組印的生遺存概數(shù)率3.至本釣組段落上限坐的生功存函奸數(shù)估示計值譜,由超各組臂的生除存概疏率累薦積相蛇乘所格得。4.概率磚密度私,所御有個姥體在校時點t后單己位時違間內(nèi)后死亡聾概率尊估計熄值。Li險fe綿-T某ab烈le狀s過程分析滋結(jié)果(1)壽姐命表Ⅱ12341.風險凝率。侄活過醋時點t個體占在時鏟點t后單蔑位時遮間內(nèi)委死亡狗概率欣的估咱計值2.生存躲函數(shù)某估計勾的標頸準誤磁。3.概率鼻密度研的標倚準誤4.風險漫率的悉標準他誤。1234Li坡fe野-T忽ab議le真s過程分析渠結(jié)果(1)壽爭命表ⅢLi得fe臉-T藝ab魂le昆s過程分析學結(jié)果(2)累耽積生粱存函綿數(shù)曲幟線基本抖思想加不同:Li蕩fe涂T姿ab滑le否s過程弱是將壇生存川時間外分成披許多汽小的原時間區(qū)段,傅計算騾該段監(jiān)內(nèi)生州存率揮的變囑化情繩況,毫分析孟的重馬點是陳研究皮總體飄生存越規(guī)律蚊;而Ka氧pl敞an盯-M井ei謹er過程鎮(zhèn)則是敘計算團每一嗽“結(jié)爛果”先事件途發(fā)生診時點針的生披存率打,分崖析的構(gòu)重點帥除了屯研究尿總體食生存揚規(guī)律土外,店還熱學心于戴尋找需相關(guān)嫁影響村因素旨。對于陵分層晴變量認的處稅理不蘿同:Li剛fe客T訴ab長le送s過程虛僅按鮮該分罩層變歲量進奪行分鉆層,福沒有夠考慮吳其對豈生存場時間悟的影奪響,尺即沒磨有提明供控傘制該易分層蜂變量羨的情協(xié)況下儉對研女究因沒素對羞生存典時間鵝的影壓響進境行統(tǒng)賴計分媽析的靠能力拔;Ka別pl休an個-M校ei抹er過程端則是暑在控需制該廣分層則變量寇的情寶況下刷對研龍究因豎素對籍生存繡時間漫的影醫(yī)響進公行統(tǒng)兩計分欣析。做出矛的生擔存曲堪線不宅同統(tǒng)計兇學檢兆驗方痕法不碰同:Li神fe覆T桌ab認le見s過程凈采用Wi逆lc薦ox部on法,K在ap濾la跳n-好Me界ie隊r過程摘用Lo暮g員ra續(xù)nk法、Br茫es察lo新w法、Ta喇ro險ne判-a蘆re法Ka狼pl曲an投-M亭el盆er法和穩(wěn)壽命朵表法尿的比懸較Co侄x回歸啊模型上面忌介紹曉的兩娘種生煤存分嫁析方翁法只倍能研仁究一訊至兩甜個因叨素對宣生存咐時間凳的影做響,能當生榴存時兔間的海影響蘭因素械有多繪個時簡,它劉們就兵無能常為力偷了,善下面響介紹Co半x族Re柔gr媽es基si躲on過程伍,這盆是一垂種專誦門用仔于生覺存時棍間多難變量宴分析青的統(tǒng)鐵計方艘法。模型嫁結(jié)構(gòu):設煮有n名病續(xù)人,抵第i名病項人的繪生存候時間啄為ti,同淡時該拋病人地具有闖一組歷伴隨撿變量xi1,xi2…溉xip。該爭病人桃生存換到時鏟間ti的風胃險函交數(shù)hi(t)是忙其基誓礎風夸險函緊數(shù)ho(t賄)與相清應伴爸隨變侮量的座函數(shù)亮的乘膠積,灶其數(shù)摔學表緊達式達為:hi(t)=戒h0(t)f(β1xi1+青….疏+βpxip)Co底x建議里伴隨拾變量襖的函詠數(shù)為輔指數(shù)困形式恨,故Co珠x比例偏風險往回歸遭可寫能為:hi(t)=網(wǎng)h0(t)ex訓p(β1xi1+才….膊+βpxip)式中諸的h0(t)是腹當所撞有伴度隨變尖量xi1,xi2,…xip都處命于0或標次準狀身態(tài)下女的風捉險函焰數(shù),陸是一強個不察確定洲的值啊,β1,β2…,βp為回壩歸系桶數(shù),音須用罷實際挽資料章來估欣計。Co府x回歸運模型將h0(t)移耗至等震式左農(nóng)邊并親去自姐然對跡數(shù)得耽:ln剖[hi(t淘)/氏h0(t門)]揉=β1xi1+依….奶+βpxip等式陶左邊梳的部喂分為膚相對策風險明度的折自然顯對數(shù)占值,豆等式汁右邊吵部分雁為伴誕隨變仗量與錄相應囑回歸澆系術(shù)傲的線隙性組紀合。βj(j=1,2,…,p)的印實際閑意義味是:貴在p-誼1個伴淋隨變膚量為鵲一定駁值時米,當免伴隨斤變量xj每改膝變一章個測妻定單徐位時浩所引虹起的患相對屈風險從度自災然對甩數(shù)值吐的改寨變量蠻。Co魔x模型沈假定涉各自儲變量xj的回受歸系血數(shù)βj與危惰險度漿間呈蠢指數(shù)誰函數(shù)抬關(guān)系靈。當βj=0時,便說明xj對危葬險度切不起唐作用朵;βj為正困值時xj為危投險因懷子,播增大點了危塔險度身;βj為負徑值時xj=1與xj=0的兩爹個危職險度敞相比熱,則乓得到陣一個坡與h0(t贏)無關(guān)凡的比舟值,石稱為傭相對桌危險冰度。Co別x回歸雖模型例3數(shù)據(jù)pa綠nc狐er梯.s霉av是關(guān)條于胰鑒臟癌好術(shù)中披接受撕放療析會否狡延長斃病人乒生存爺時間哨的研搖究。洽該研王究的灰終點伍為死睡亡,遲接受蹤蝶手術(shù)逐被定雙義為錦計算炊生存躍時間懼的起帥點。索由于最該研處究是艦一項番未經(jīng)蟻隨機疊化的稈觀察萬研究撥,要恰正確墊估計射術(shù)中承接受漿放療途提高鈴患者抖生存甩時間處的效溫果,紗還需恥考慮霸對其遍他因境子的撓效果挨進行餅調(diào)整魚。Co借x回歸勤模型Co垂x回歸傘模型Co觸x回歸煮模型ch為有單序多秩分類最,將涉其指債定為恭啞變輸量進碌行分婚析Co翠x回歸淚模型累積狗生存弦函數(shù)搜曲線Co洞x回歸污模型Co旱x回歸攝模型相關(guān)榨性估旁計上表慮輸
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