生物信息學(xué)第二講序列檢索_第1頁
生物信息學(xué)第二講序列檢索_第2頁
生物信息學(xué)第二講序列檢索_第3頁
生物信息學(xué)第二講序列檢索_第4頁
生物信息學(xué)第二講序列檢索_第5頁
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生物信息學(xué)第二講序列檢索第1頁,課件共19頁,創(chuàng)作于2023年2月(一)NCBI簡介NCBI即美國國立生物技術(shù)信息中心(),于1988年11月4日立法建立,NCBI的主要任務(wù)是發(fā)展新的生物資訊技術(shù),以增進(jìn)對于健康和疾病相關(guān)的基本遺傳分子的理解。第2頁,課件共19頁,創(chuàng)作于2023年2月(二)NCBI數(shù)據(jù)檢索

例子1:下載水稻waxy基因打開NCBI網(wǎng)址:選擇目標(biāo)數(shù)據(jù)庫Nucleotide輸入檢索詞檢索基因序列第3頁,課件共19頁,創(chuàng)作于2023年2月第4頁,課件共19頁,創(chuàng)作于2023年2月第5頁,課件共19頁,創(chuàng)作于2023年2月第6頁,課件共19頁,創(chuàng)作于2023年2月第7頁,課件共19頁,創(chuàng)作于2023年2月第8頁,課件共19頁,創(chuàng)作于2023年2月第9頁,課件共19頁,創(chuàng)作于2023年2月

例子2:下載2002年3月至12月提交的水稻mRNA序列打開NCBI網(wǎng)址:選擇目標(biāo)數(shù)據(jù)庫Nucleotide輸入檢索詞及限制條件檢索基因序列第10頁,課件共19頁,創(chuàng)作于2023年2月第11頁,課件共19頁,創(chuàng)作于2023年2月第12頁,課件共19頁,創(chuàng)作于2023年2月

例子3:下載玉米(Zeamays)的PEP羧化酶(PEPcarboxylase)蛋白質(zhì)序列打開NCBI網(wǎng)址:選擇目標(biāo)數(shù)據(jù)庫Protein輸入檢索詞檢索蛋白質(zhì)序列第13頁,課件共19頁,創(chuàng)作于2023年2月第14頁,課件共19頁,創(chuàng)作于2023年2月第15頁,課件共19頁,創(chuàng)作于2023年2月第16頁,課件共19頁,創(chuàng)作于2023年2月第17頁,課件共19頁,創(chuàng)作于2023年2月第18頁,課件共19頁,創(chuàng)作于2023年2月2.檢索長度為501個氨基酸的乙醛脫氫酶

(acetaldehydedehydrogenase)的蛋白質(zhì)

序列。作業(yè)1.檢索迄今為止發(fā)表在Nature上的人類基

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