pichia酵母表達系統(tǒng)使專心得資料pichia酵母表達系統(tǒng)使專心得資料pichia酵母表達系統(tǒng)使專心得資料畢赤酵母表達系統(tǒng)的應(yīng)用意會大綱：外國廣泛應(yīng)用畢赤酵母表達系統(tǒng)基因表達。生物編者按：甲醇酵母表達系統(tǒng)有好多長處長處，此中畢赤酵母表達系統(tǒng)的Invitrogen公司是最有名的，廣泛應(yīng)用于外源蛋白的表達。盡管酵母的表達是簡單和高表達，在實踐中，不是每一個外源基因都被表達因為他們可以順利獲得高表達。好多人會的在操作中遇到這樣那樣那樣的問題。編寫biocom特意采集了一些用戶的數(shù)據(jù)Easyselect畢赤酵母表達系統(tǒng)被稱為最簡單的經(jīng)典的畢赤酵母表達試劑盒。在…之間旭日來自喬治敦倫巴第癌癥中心大學(xué)子用戶來自中國。甲基酵母與其余真核生物的一些優(yōu)勢表達系統(tǒng)和原核表達系統(tǒng)1屬于真核表達系統(tǒng)，擁有必然的生物活性蛋白質(zhì)翻譯后辦理，+有益于真核蛋白的表達2AOX啟動子強，外源基因產(chǎn)物高表達，能達到目的嗎++++表達產(chǎn)物的含量是每升幾克三。介紹了酵母培育、轉(zhuǎn)變和高密度發(fā)酵湊近原核生物，+++=它比真核系統(tǒng)簡單得多，特別適合于大型生物-規(guī)?；I(yè)生產(chǎn)。4它可以被引誘或分泌，以促進細胞的純化產(chǎn)品。=+5甲醇可取代IPTG作為引誘劑，并有必然的應(yīng)用遠景甲醇酵母可作為引誘劑++++以甲醇等工業(yè)產(chǎn)品取代葡萄糖為原料碳源，生產(chǎn)成本低+它意味著比；它的意思是比…更糟；=它的意思是幾乎易選畢赤酵母表達系統(tǒng)產(chǎn)品性能：長處：使用方便，表達量高，易于純化缺點：酵母表達的蛋白質(zhì)有時含有蛋白質(zhì)解理問題全面的產(chǎn)品報告和體驗：畢赤酵母是一種能表達重組蛋白的酵母高效的蛋白質(zhì)。一方面，它屬于真核生物，另一方面另一只手另一方面，畢赤酵母生長迅速，能分泌大批的蛋白質(zhì)將蛋白表達到培育基中，方便卵子生長生產(chǎn)它是從白血中提純出來的。畢赤酵母表達載體pPICZ有his標志和c-mycepopes在MCR的3'端。這些標簽有助于平常檢測其余，α因子（α-factor）被引入到5'停止MCR以增加其表達。表達后，α因子可以自動檢測到切除術(shù)?？寺r，假如選擇EcoRI，只需增加目標蛋白的兩個氨基酸序列。另一個在pPICZ系列中，玉米素類抗生素作為優(yōu)選標志物，而引誘表達載體需要甲醇-甲醇比率平常用于大腸桿菌IPTG是廉價的表達引誘劑。第一步是構(gòu)造向量旭日：pPICZ系列有好多克隆位點可供選擇其余還有三個閱讀框，以滿足用戶的需求。紅葉別墅：關(guān)于選擇pPIC9K還是pPICZ系列？PPIC9K公司屬于穿越質(zhì)粒，也可在原核表達細胞更簡單操作。大腸桿菌和畢赤酵母對玉米赤霉素抗性進行優(yōu)選（pic9k較難判斷）操作。大腸桿菌使用amp抗性，而畢赤酵母（先使用）對陽性克隆進行his缺點（多個）優(yōu)選用G418）優(yōu)選拷貝數(shù)，并測定pPIC9K的產(chǎn)量大小適合的蛋白質(zhì)（30-50kd）無與倫比。萊斯利：要做畢赤酵母表達實驗，第一，我們需要認識這類可愛的酵母（橢圓形，豐滿，很可愛），她和大腸桿菌的生長方式不一樣樣（E。大腸桿菌是桿狀的），也是有必需區(qū)分這兩種細菌的過程中培育，除了氣味、濃度等，除了顏色，樣品也可以拿到顯微鏡下供觀察。當(dāng)你做畢赤酵母表達時，你應(yīng)當(dāng)遇到這類狀況，傳染過程中表達式（即我們實驗室污染了各種顏色和形狀的細菌。它是一個可怕的經(jīng)歷。假如我們在不知情的狀況下連續(xù)這樣做，這是一次可怕的經(jīng)歷這是浪費時間?；臼炝?xí)畢赤酵母后，她的成長偏好（酸性環(huán)境），生長周期等等，自然，還需要更多的能源應(yīng)當(dāng)花在目標蛋白的表達上。我的表達蛋白有點嚇人，100kD。自然，是的應(yīng)當(dāng)在大腸桿菌中表達，但是關(guān)于分泌表達（事實上，我們發(fā)現(xiàn)大腸桿菌pet表達系列也很好）糖基化修飾（主要在這方面，因為因為我的蛋白質(zhì)是人類的，所以它需要完滿的糖基化酵母雜合子表達。這樣，我的DNA片段相對較小所以，克隆時應(yīng)特別當(dāng)心：①限制性位點不可以出此刻靶DNA片段中-假如不可以防范碎片的長度，平端結(jié)扎可以使用；②固然α因子可以自動去除，但在設(shè)計時表達，假如沒有額外的AA（如藥物蛋白）在N-終端應(yīng)特別注意（詳細說明見手冊：P13）；③有三種不一樣樣的閱讀框架（關(guān)于pPICZα系列，它是上部α因子序列），需要確立在設(shè)計克隆時重復(fù)閱讀框架能否正確是一個致命的問題；④pPICZ和pPICZα都有TGA（停止密碼子），但pPICZ序列不存在沒有ATG（初步密碼子）啟動子與受體ATG之間的距離越短外源基因越有益于基因的表達；⑤假如你不想有c-myc和他的標簽，你可以在夜晚做基因在片段尾端加入停止密碼子；⑥畢赤酵母的密碼子與釀酒酵母相似。有些人以為沒有必需改變密碼子基因表達偏好，而其余人以為這是必需的改變基因表達偏好的密碼子我以為生產(chǎn)的主要目的是改變基因密碼子。假如片段太長，會比較麻煩，但是有好多問題真核生物守舊蛋白與酵母密碼子相似；⑦克隆株需要有RecA，Enda，TOP10的試劑盒是特別合用的合用（其余如DH5α都可以），但要注意屏幕用低鹽培育基（半NaCl）優(yōu)選培育基抗生素zeocin，這主假如因為擔(dān)憂會影響皮膚抗生素的作用（zeocin板）避光；⑧測序引物可以是α因子信號引物或5'aox1引物；⑨假如需要高水平的表達，串連基因片段可以被分別用于克隆，或酵母可頻頻轉(zhuǎn)變它不簡單。⑩最好不要含有Pro-Glu-ser-thr序列目標基因，因為這個序列是激活蛋白水解酶，將影響其余，不包含諸如x-phe-x-arg-gln和gln-arg-x-phe-x（x=任何氨基酸），因為這些序列易受攪亂目標蛋白的尾端應(yīng)當(dāng)是氨基酸，比方丙氨酸，ASP、Val和ser。其余，好多基因擁有高a+T含量是常用的因為提前停止，不可以有效轉(zhuǎn)錄，這也需要更多的關(guān)注。第二步，將線性化的DNA轉(zhuǎn)變成畢赤酵母酵母旭日：easyselect試劑盒制備了3株菌株：x33、GS115和GS115km71h。我偏向于選擇x33，因為它是一種可以轉(zhuǎn)變假如你有電穿孔器，你可以試一試。假如不是，請輕松選擇化學(xué)轉(zhuǎn)變試劑easycomp轉(zhuǎn)變也獲得了應(yīng)用已經(jīng)準備好了，但是因為轉(zhuǎn)變率的原由，我建議使用電氣變換儀表。萊斯利：在獲得正確的序列今后，我們準備好了轉(zhuǎn)變畢赤酵母。該套件攜帶X-33、GS115和km71h畢赤酵母有三種（smd1168也是常有的）使用）。每種酵母的特色都有些不一樣樣不一樣樣的（在手冊中清楚地寫明），此中X-33因為它是野生型，所以有很好的耐受性。假如你擔(dān)憂關(guān)于轉(zhuǎn)變率，你可以考慮這類酵母。GS115和x33屬于同一屬在mut+表型中，也就是說，它可以在細胞中迅速生長含有甲醇的介質(zhì)，但聽聞它會影響外源基因km71的表達是mut型酵母，在甲醇培育基中生長緩慢，但也有益于翻譯后的辦理，如二硫鍵形成、糖基化等Smd1168是pep4基因在基因組中的突變，以致蛋白水解酶活性的喪失，可以保護表達的蛋白質(zhì)降解產(chǎn)物，提高表達水平。一般來說，若有必需，應(yīng)盡量使用mut細胞在細胞中表達。這樣，酒精氧化酶的量所獲得的蛋白質(zhì)產(chǎn)物中的蛋白質(zhì)少于所獲得的蛋白質(zhì)產(chǎn)物中的蛋白質(zhì)靶卵比方，人乙酰膽堿酯酶B變種的含量鏈長90%，便于下游凈化這很簡單做到。關(guān)于分泌蛋白的表達，mutmut+細胞也可以被使用，比方在人類身上兩各種類的細胞在細胞中沒有顯然的差異HSA（分泌蛋白）的表達。所以，通用手冊建議同時這些菌株的轉(zhuǎn)變，主假如因為不一樣樣的基因可能在不一樣樣的酵母中表達酵母菌的用量相差很大，建議使用更多的酵母實驗開始。其余，還有保存問題。原始酵母必然穩(wěn)定保存，因為酵母會影響其轉(zhuǎn)變幾代后的表達率和表達水平，所以我們的一面原始酵母必然保存圓滿另一方面，倘若有轉(zhuǎn)型或在-80℃下保存，其余條件下無誤方面為了考慮再次拿出新的細菌溶液（每次都要涂抹在培育皿上以挑出細菌）。在酵母的制備中，質(zhì)粒的制備應(yīng)同時進行時間。因為對酵母轉(zhuǎn)變的要求很高質(zhì)粒，質(zhì)粒的量也很大（5-10微克）大多數(shù)時候，我們會用peg來提取質(zhì)粒，也許用a大型提取工具包?？傊?，我們應(yīng)當(dāng)準備足夠的質(zhì)粒，別忘了做相同的事空的身體準備好控制。改造前，這個質(zhì)粒需要線性化，這主假如為了增加重組率（easyselectKIT表達）高表達率的一個重要原由是原理是把目標碎片整合到載體中，這大大增加了目標片段的表達。線性化位點我想這也會影響表達水平。關(guān)于含有小的基因片段，幾個線性化位點可以考慮同時進行轉(zhuǎn)變優(yōu)選假如碎片很大，那么選擇，可能沒有適合的線性化位點聽聞這個表達是不可以實現(xiàn)的，但是制備的質(zhì)粒將增加10倍。其余，部分也可以進行消化（即進行預(yù)試驗先出去，設(shè)準時間和時間酶的量足以保證質(zhì)粒的一部分被激活在線性化位點切割，基因片段表達優(yōu)異保存。線性化后，可以用酒精回收質(zhì)粒積淀-中間步驟需要鈍化酶，說明書建議熱滅活或乙二胺四乙酸，我感覺前者比較好，主假如受EDTA對轉(zhuǎn)變率、失活溫度的影響三種酶65℃/20min積淀痊愈后，離心10分鐘，用80%沖洗酒精，此后烘干。應(yīng)更加注意保證在這一步中空氣是完滿干燥的，因為它被證明經(jīng)過實驗發(fā)現(xiàn)有殘留物酒精對轉(zhuǎn)變的影響很大。下一步是酵母轉(zhuǎn)變，這是好多人頭疼的問題人，也是影響實驗決策的要點一步表情。轉(zhuǎn)變的方式有好多，比方，學(xué)習(xí)的難度和轉(zhuǎn)變率電轉(zhuǎn)變、化學(xué)轉(zhuǎn)變和原生質(zhì)體轉(zhuǎn)變率呈反比減小，也就是說，電轉(zhuǎn)變是最簡單的，原生質(zhì)體是最麻煩的，并且見效不好（比較傳統(tǒng)），所以不是建議使用easyselect說明書中有建議，電轉(zhuǎn)變過程詳細介紹了化學(xué)轉(zhuǎn)變法（easycomp和LiCl），可以一步一步地進行。需要注意的是意思是：（電動旋轉(zhuǎn)過程）①最好每次都從盤子里優(yōu)選酵母，并保持原汁原味酵母培育不超出一周；②擴大培育的濃度必然控制好。我不要以為OD600有必需達到1.3-1.5，1.0-1.3。在此次，酵母比較新鮮轉(zhuǎn)變率較高；③接受狀態(tài)的整個生產(chǎn)過程必然操作在冰上，最好使用冷凍離心計離心，這是影響轉(zhuǎn)變的要點無菌水可以是冰和水的混雜物。其余，山梨醇和電動旋轉(zhuǎn)杯需要預(yù)冷。④那個電動旋轉(zhuǎn)儀表需要預(yù)熱，所以準備好感覺，它可以冷卻儀器已打開。接通電源后山梨醇的增加應(yīng)當(dāng)更快。以前有人做過確認明晚一秒鐘可以減少變換的幅度，固然不用然可信的，但我個人以為這個過程應(yīng)當(dāng)很快，你可以在斷電后看到它假如時間很短（如〈4），則可能表示雜質(zhì)多，影響轉(zhuǎn)變率；⑤轉(zhuǎn)變后，孵化是一個增加的過程同源重組和存活率。我們應(yīng)當(dāng)注意不要傳染大腸桿菌，此后加入培育基在30℃下?lián)u勻一段時間，一些涂層板（不一樣樣濃度的抗生素）也許細菌可以在短時間內(nèi)離心，上清液可以扔掉，剩下的涂板可以用來保證轉(zhuǎn)變率。（化學(xué)轉(zhuǎn)變）假如沒有電變換器，氯化鋰變換是另一種選擇方法，轉(zhuǎn)變率為102～103cfu/UG。其主要過程以下：接種過夜活化劑在15ml新鮮YPD液體培育基中以1:1000培育肉湯，并30℃培育至OD600在4℃、4500rpm下離心5分鐘后，細菌開始生長用8ml冰預(yù)冷無菌水沖洗，沖洗達成倒出溶液，用1ml沖洗4℃冰預(yù)冷無菌水，4500轉(zhuǎn)/分離心5分鐘后，積淀物懸浮用50μL冰預(yù)冷100mmol/L氯化鋰，最后體積為80-90毫升。氯化鋰轉(zhuǎn)變后，加入適合的單鏈三文魚將精子DNA（2mg/ml）煮沸5min后馬上擱置于培育基上冰備用。獲得12個活性細胞000rpm，離心15s，吸棄氯化鋰解決方案，挨次次增加50%聚乙二醇240ml1mmol/L氯化鋰36毫升單鏈鮭魚精子DNA25ml線性化質(zhì)粒DNA10ml（約10mg）細胞積淀物與增加的溶液混雜。解決方案在30℃下孵育30分鐘，此后在42℃下加熱20-25分鐘最小，4500rpm離心轉(zhuǎn)變液被汲取并扔掉，并且細胞積淀培育，取轉(zhuǎn)變混雜物10min，1mlYPD，30℃，200轉(zhuǎn)/分，2-4小時，100毫升涂層Ypds平板100μg/mlzeocintm，30℃培育2-3天天。，第三步是克隆選擇旭日：我在協(xié)議上花了好多篇幅來指導(dǎo)這個步驟，包含如何經(jīng)過平板優(yōu)選，觀察生長速率以確立mut表型等。這個過程需要三到五天，我平常PCR（AOX引物）優(yōu)選只需4小時。萊斯利：改造今后，就是克隆的過程判斷包含高拷貝優(yōu)選、PCR判斷表型判斷大多數(shù)是PCR判斷（因為它比較快）。詳細過程在議定書中特別明確。事實上，它是也很簡單，就是凍融破細菌關(guān)于菌落PCR，但是，好多詳細細節(jié)也讓人頭疼。第一個是破壁的問題。好多人沒法經(jīng)過考試獲得成績聚合酶鏈反響，此中一個主要原由是酵母基因組不可以被開釋正常狀況下，一般來說，經(jīng)過培育細菌此后循環(huán)開水-20℃冷凍可實現(xiàn)細胞裂解在目標蛋白片段的適合范圍內(nèi)見效不錯，但有時碎片太長，并且發(fā)霉墻壁會阻截擴增，所以我們實驗室將使用蝸牛酶（一種特別廉價的酶）幫助幫助溶解細菌，我想好多實驗室都會這么做相同，但增加時間不一樣樣。第二，有豪華裝備。第二是模板量。我建議模板不該當(dāng)加太多。依據(jù)手冊中的5ul，我感覺還是太多了，總量不介紹自然，模板的增加量也與培育的細菌濃度和使用的細菌數(shù)目用于冷凍和解凍。第二種是假陽性和假陽性悲觀的mut-和mut+的假陰性結(jié)果不一樣樣。假如5'aox使用引物，km71h將有一個3.6kb的片段，而mut++假如AOX1基因的長度相似，應(yīng)當(dāng)是的敬愛的。建議PCR在使用多對引物進行反響的過程中，包含他們自己的基因，α因子，5'aox，無論如何，可以是多種控制更有益于比較一下-假如你沒有頭暈，自然。迷路的鴕鳥：畢赤酵母含有轉(zhuǎn)錄停止子（5'aox1'和其余，該載體含有組氨酸脫氫酶基因（HIS4）選擇性標志（HIS4地域整合）整合后，組氨酸缺少宿主（HIS4）恢復(fù)到正常野生型。HIS4區(qū)或AOX1區(qū)轉(zhuǎn)變成野生型定位點的整合使轉(zhuǎn)變子擁有HIS4基因，利用表型差異進行優(yōu)選。酵母GS115缺少組氨酸脫氫酶HIS4基因可以接受含有HIS4的載體，并擁有his功能+表型優(yōu)選轉(zhuǎn)變子。）在感覺態(tài)細胞中，his的5′aox1和3′aox1可以與dna重組染色體上的同源基因，使整個載體和外源基因可以插入到受體細菌中在染色體上，以甲醇為獨一碳源的培育基中本源：外源基因在5'aox1調(diào)控下表達提議人抗G418的Tn903kanr基因有助于優(yōu)選高拷貝基因轉(zhuǎn)變體，轉(zhuǎn)變子的拷貝數(shù)與轉(zhuǎn)變能力有關(guān)抗G418從強酵母中可以獲得高拷貝轉(zhuǎn)變子。外國基因經(jīng)過同源基因插入酵母染色體重組，所以它們不簡單扔掉，也簡單被復(fù)制轉(zhuǎn)變傳代后的酵母還可以堅固表達外源基因蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)擁有優(yōu)異的遺傳堅固性第4步-表達旭日：在YPD培育基中培育你的克隆直到OD600值達到6.0，此后你可以經(jīng)過離心采集細菌。使用表達介質(zhì)（如BMMY）將懸浮液積淀并在30℃下培育過夜。萊斯利：優(yōu)選和判斷你自己的重組子是不可以能的證明全部。這取決于這個階段酵母的表達。有好多人在酵母中表達做這件事需要好多時間——不一樣樣于兩天的工作大腸桿菌的結(jié)果，一個畢赤酵母最少需要一周pastoris表達式到屏幕不計其數(shù)的克隆人已經(jīng)被克隆了，但它們的確是還是空費。我個人建議假如超出三批對酵母菌進行了優(yōu)選，該批轉(zhuǎn)變酵母菌可用于生產(chǎn)被遺棄的，其余，進行調(diào)整以進行再改造。其余，它可以在開始時用少許表示，5ml：慢生長型，快生長型，陰性比較（空質(zhì)粒），陽性比較（可選）所以，成功表達的酵母克隆擁有較高的生物學(xué)活性未轉(zhuǎn)變的細胞在OD值為2-6的bmgy培育基中培育經(jīng)過離心采集（比方假如你懼怕污染或麻煩，你可以擱置酵母一段時間一段時間，一半20-30分鐘，讓細菌積淀倒下，當(dāng)心地倒出上清液這些步驟需要在超凈工作臺上執(zhí)行。假如你想?yún)^(qū)分細菌能否被傳染，你可以采納一些是在顯微鏡下觀察，或氣味（糖醋味）酵母），觀察顏色（乳白色為酵母）。其余，假如表情很小，培育基有可能在4小時內(nèi)變干天，所以可以適合增補，并深口可將裝有無菌水的容器放入搖動器中用來保持震動器內(nèi)濕度的瓶子。引誘劑甲醇應(yīng)在超凈工作臺中打開，并且可以分裝到消毒瓶里。自然，甲醇不可以消毒，也應(yīng)當(dāng)使用當(dāng)酒精燈穿過酒杯口時要當(dāng)心甲醇瓶。假如真的引起爆炸，就會引起爆炸損失深重。其余，假如你感覺每天都要加甲醇麻有些人用一次性注射器經(jīng)過紗布加入甲醇。這類方法可能以致細菌污染。當(dāng)心。當(dāng)它說到紗布，我想到了通風(fēng)的問題酵母可以在厭氧平易氧條件下存活，但是在甲醇引誘的狀況下，畢赤酵母使用酒精氧化酶，天然的氧胸襟它對這個基因的表達有很大的影響，但是因為怕大腸桿菌傳染，紗布不可以太少，所以最好制作一個特其余搖動盒這樣，紗布可以減少到3-5層。同時時間，應(yīng)注意細菌溶液的體積搖瓶內(nèi)溫度不該超出30℃10-30%。最好每天取樣進行SDS電泳判斷，但要做凝膠運轉(zhuǎn)和每天染色。你可以采集一批相同的樣品但是，樣品必然煮沸并冷凍，不得冷凍每次都要頻頻解凍。最好把他們關(guān)在家里分開包裝，因為蛋白質(zhì)不會變性煮沸后的變化堅固性好，易降解。其余，為了防范蛋白質(zhì)（特別是小分子蛋白質(zhì)）在蛋白質(zhì)中的降解分泌過程，也可以經(jīng)過調(diào)理溫度來種植堿性pH值控制蛋白水解酶的活性方面在手冊中有詳細說明）。保護物質(zhì)如酪蛋白氨基酸也可以加入競爭它能控制蛋白水解酶的活性，從而防范細胞凋亡表達產(chǎn)物的降解。假如使用分泌培育基，培育基的上清液可以依據(jù)采集原則進行進一步剖析聚丙烯酰胺凝膠的濃度平常是沒法檢測的-除非你有大批的表達蛋白。所以，有一個硫酸濃縮法氨鹽析，聚乙二醇積淀，透析，超濾等等，自然，最簡單的是煮沸蒸發(fā)，水專注。其余，運轉(zhuǎn)膠水時，控制發(fā)酵同時母細胞中的蛋白質(zhì)不分泌。見分子SDS配置克隆。注意你的蛋白質(zhì)的大小和蛋白質(zhì)的大小之間的對應(yīng)關(guān)系凝膠濃度，假如小于20kD，可以考慮使用Tricine膠水，但它是一種需要完滿重新準備的過程，所以應(yīng)當(dāng)考慮清楚。假如你愿意載體含有信號肽。固然可以用分泌表達和純化，畢赤酵母仍有背景表達，有時能產(chǎn)生信號肽假陽性，所以，最后的表達過程需要使用Western-blot或elasa，平常是WB，詳細細節(jié)見西文吸墨紙前傳：想成為大師？其余，假如沒有適合的蛋白質(zhì)自己的抗體（假如它是從大的腸）這類蛋白質(zhì)產(chǎn)生