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文檔簡介
ICS07.080
CCSA40DB51
四川省地方標(biāo)準(zhǔn)
DB51/T3184—2024
醫(yī)用供體豬基因鑒定通則
2024-0779發(fā)布2024—08—08實(shí)施
四川省市場(chǎng)監(jiān)督管理局發(fā)布
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本文件按照GB/T1.1-2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定
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本文件由四川省經(jīng)濟(jì)和信息化廳提出、歸口并解釋。
本文件起草單位:中國測(cè)試技術(shù)研究院生物研究所、成都中科奧格生物科技有限公司、四川省醫(yī)學(xué)
科學(xué)院?四川省人民醫(yī)院、四川泰康醫(yī)院、南京醫(yī)科大學(xué)附屬蘇州醫(yī)院、海南醫(yī)學(xué)院第二附屬醫(yī)院、華
中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院附屬同濟(jì)醫(yī)院、空軍軍醫(yī)大學(xué)第一附屬醫(yī)院、成都達(dá)碩實(shí)驗(yàn)動(dòng)物有限公司、成都
愛迪眼科醫(yī)院、四川省機(jī)械研究設(shè)計(jì)院(集團(tuán))有限公司、四川省實(shí)驗(yàn)動(dòng)物學(xué)會(huì)醫(yī)用豬專業(yè)委員會(huì)。
本文件主要起草人:周李華、潘登科、馬麗俠、邢向陽、陳璐、鄧紹平、王佳梅、李巔遠(yuǎn)、張玉蘭、
王毅、杜嘉祥、陳剛、蔣子敬、竇科峰、楊恒鈕、鐘浩、姚曉明、莊瑛、莫玲。
醫(yī)用供體豬基因鑒定通則
1范圍
本文件規(guī)定了醫(yī)用供體豬基因鑒定的總體原則及鑒定方法。
本文件適用于醫(yī)用供體豬的生產(chǎn)、引種、交付過程中基因鑒定。
基因修飾動(dòng)物的基因鑒定可參考本文件。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
GB/T30989高通量基因測(cè)序技術(shù)規(guī)程
GB/T33681.1高通量基因測(cè)序樣本預(yù)處理方法第1部分:動(dòng)物組織樣本預(yù)處理
GB/T35537高通量基因測(cè)序結(jié)果評(píng)價(jià)要求
GB/T38477基因表達(dá)的測(cè)定蛋白印跡法
3術(shù)語和定義
下列術(shù)語和定義適用于本文件。
3.1
醫(yī)用供體豬medicaldonorpigs
通過生物工程技術(shù)獲得,用于提供醫(yī)療用途的活器官或生物材料制備的低免疫原性豬及其群體“
3.2
基因修飾geneticmodification
利用生物化學(xué)方法修改生物遺傳物質(zhì),使生物產(chǎn)生新性狀,修飾方式主要包括轉(zhuǎn)基因、基因編輯介
導(dǎo)的基因定點(diǎn)插入和基因敲除3種。
注:醫(yī)用供體豬常見基因修飾名稱及種類見附錄,
3.3
基因整合geneintegration
將特定基因片段導(dǎo)入宿主基因組內(nèi)的基因修飾方法,包括轉(zhuǎn)基因和基因定點(diǎn)插入。
3.4
基因敲除geneknockout
將特定基因片段從基因組中去除的基因修飾方式。
3.5
遺傳穩(wěn)定性geneticstabiIity
通過連續(xù)檢測(cè)不同代數(shù)基因修飾動(dòng)物基因型、基因表達(dá)情況來評(píng)估基因修飾在動(dòng)物群體中遺傳穩(wěn)定
及表達(dá)穩(wěn)定的手段。
基因組結(jié)構(gòu)變異genomestructuraIvariants
在醫(yī)用供體豬獲得過程中,基因組上發(fā)生長片段(>50bp)的序列變化和位置關(guān)系變化。
注:基因組結(jié)構(gòu)變異包括長片段序列插入或刪除、串聯(lián)重復(fù)、染色體倒位、染色體內(nèi)部或染色體之間的序列易位、
基因拷貝數(shù)變異以及嵌合性變異等。
3.7
脫靶off-target
與靶標(biāo)不同的基因組位置和/或核酸序列。
示例:結(jié)合脫靶、切割脫靶、編輯脫靶、序列改變脫靶,
注:編輯脫靶屬于非預(yù)期編輯。
[來源:ISO5058:1-2021,3.1,4]
3.8
高通量測(cè)序high-throughputsequencing
以一次并行幾十萬到幾百萬條核酸分子序列測(cè)定和一般讀長較短等為標(biāo)志,適用于DNA的測(cè)序技術(shù)。
[來源:GB/T35890-2018,3.1]
4總體原則
基因鑒定是醫(yī)用供體豬制備過程中重要組成環(huán)節(jié),醫(yī)用供體豬制備、篩選、交付等過程應(yīng)對(duì)其進(jìn)行
基因鑒定。因其用途的特殊性,醫(yī)用供體豬基因鑒定應(yīng)同時(shí)考慮安全性和有效性,降低因基因修飾技術(shù)
引入的不可控因素。安全性和有效性評(píng)價(jià)應(yīng)結(jié)合設(shè)計(jì)預(yù)期、基因修飾類型進(jìn)行綜合評(píng)估,鑒定項(xiàng)目可參
考表1。
表1醫(yī)用供體豬基因鑒定評(píng)價(jià)項(xiàng)目
序號(hào)鑒定/檢測(cè)項(xiàng)目評(píng)價(jià)類型
1基因型
有效性評(píng)價(jià)
2基因表達(dá)
3遺傳穩(wěn)定性遺傳穩(wěn)定檢測(cè)
4基因組結(jié)構(gòu)變異
安全性評(píng)價(jià)
5脫靶
5鑒定項(xiàng)目及方法
5.1有效性評(píng)價(jià)
5.1.1基因型鑒定
5.1.1.1鑒定方法
樣本DNA提取可選用符合要求的市售試劑盒進(jìn)行提取,也可由實(shí)驗(yàn)室自配試劑進(jìn)行提取,引物設(shè)
il應(yīng)在日標(biāo)基囚(擬整合基囚做除基囚靶位)J_下游設(shè)〃引物。樣本DNA提取后,符合質(zhì)量要求的DNA
進(jìn)行PCR擴(kuò)增,產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,觀察目標(biāo)條帶判定是否符合預(yù)期。判定基因整合見a)。
判定目標(biāo)基因的是否敲除,應(yīng)將符合預(yù)期的條帶回收.進(jìn)行測(cè)序(見b))。
注:基因整合鑒定示例見附錄B,基因敲除鑒定示例見附錄C。
5.1.1.2結(jié)果判定
a)出現(xiàn)目標(biāo)條帶,則判定基因整合有效。
b)目標(biāo)片段測(cè)序結(jié)果和參考序列比對(duì),靶位產(chǎn)生不為3的倍數(shù)堿基的插入和缺失,則判定基氏敲
除有效。
5.1.2基因表達(dá)
5.1.2.1檢測(cè)方法
選取與目標(biāo)蛋白相結(jié)合的特異抗體對(duì)醫(yī)用供體豬組織、細(xì)胞水平進(jìn)行蛋白檢測(cè)??刹捎玫鞍酌庖哂?/p>
跡法、免疫組化/免疫熒光、酶聯(lián)免疫吸附技術(shù)、流式細(xì)胞術(shù)等方法進(jìn)行檢測(cè)。建議根據(jù)不同生產(chǎn)工藝
選擇合適的檢測(cè)方法,蛋白免疫跡法可作為基礎(chǔ)方法選用,蛋白免疫印跡法檢測(cè)及判定方法可參考
GB/T384770蛋白免疫印跡、免疫組化(熒光)、酶聯(lián)免疫吸附技術(shù)檢測(cè)示例見附錄B。流式細(xì)胞術(shù)技
術(shù)檢測(cè)示例見附錄C。
5.1.2.2蛋白免疫印跡法結(jié)果判定
a)成像圖片本底干凈,能觀察到轉(zhuǎn)印膜均勻的輕微背景輪廓,目標(biāo)條帶清晰且不過曝,即可判
定目標(biāo)蛋白表達(dá)。
b)基因整合類應(yīng)有目標(biāo)基因蛋白表達(dá),敲除類應(yīng)無目標(biāo)基因蛋白表達(dá)。
5.2遺傳穩(wěn)定性檢測(cè)
,2.1通用要求
醫(yī)用供體豬自然繁育進(jìn)行擴(kuò)大化培養(yǎng)時(shí)應(yīng)符合封閉群或近交系的育種方式,同時(shí)應(yīng)檢測(cè)基因遺傳穩(wěn)
定性。
5.2.2檢測(cè)方法
醫(yī)用供體豬群體每代個(gè)體均應(yīng)進(jìn)行基因型鑒定和基因表達(dá)檢測(cè),方法見5.1,應(yīng)連續(xù)監(jiān)測(cè)3代以上。
5.2.3結(jié)果分析
醫(yī)用供休豬基因型鑒定及基因表達(dá)檢測(cè)結(jié)果符合基因分離定律卻自由組合定律,則認(rèn)為具有遺傳穩(wěn)
定性。
5.3安全性評(píng)價(jià)
5.3.1染色體結(jié)構(gòu)變異和脫靶檢測(cè)
在基因修飾過程中,存在染色體結(jié)構(gòu)變異和基因修飾脫靶的風(fēng)瞼,應(yīng)對(duì)原代個(gè)體進(jìn)行染色體結(jié)構(gòu)變
異和脫靶檢測(cè),評(píng)價(jià)安全性。
采集醫(yī)用供體豬基因修飾前后的血液或組織進(jìn)行高通量測(cè)序,獲取醫(yī)用供體豬基因組序列信息,進(jìn)
行生物信息學(xué)分析。樣本處理參照GB/T3368I.1的要求執(zhí)行,測(cè)序方法參照GB/T30989進(jìn)行,測(cè)序質(zhì)量
捽制參照GB/T35537執(zhí)行。
5.3.2結(jié)果分析
£3.2.1染色體結(jié)構(gòu)變異
基因修飾前后,除基因修飾位點(diǎn)外,染色體其他區(qū)域基因序列無差異,醫(yī)用供體豬基因組未發(fā)生非
預(yù)期基因片段插入、序列缺失、倒置、異位,則認(rèn)為在醫(yī)用供體豬制備過程中未引入基因安全風(fēng)險(xiǎn)。
5.3.2.2脫靶檢測(cè)
使用Cas-OFFinder(CRISPRRGENTools(rgenom))或類似算法模型工具.在豬基因組參考序
列內(nèi)匹配脫靶風(fēng)險(xiǎn)位點(diǎn),允許sgRNA的靶標(biāo)序列存在I個(gè)?4個(gè)錯(cuò)配,醫(yī)用供體豬脫靶各風(fēng)險(xiǎn)位點(diǎn)序列信
息和基因組參考序列一致,則認(rèn)為沒有脫靶,反之則存在脫靶風(fēng)險(xiǎn)。
附錄A
(資料性)
醫(yī)用供體豬常見基因名及修飾類型
醫(yī)用供體豬常見基因名及修飾類型見表A.1。
表A.1醫(yī)用供體豬常見基因名及修飾類型
GGTAI
B4GALNT2/B4GALNT2L
基因敲除CMAH
PERV
SLAclassIorB2M
humanmembranecofactorproteintransgenic(hCD46-tg)
humandecay-acceleratingfactortransgenic(hCD55-tg)
humanmembraneinhibtorofreactivelysistransgenic(hCD59-tg)
humanconiplement-iegjlatorj,proteinClinhibitortransgenic(hCl-INH-tg)
HLA-Mnimanbeta2-microglobulintransgenic(HLA-E^BZM-tg)
humansignalregulatoryproteinalphatransgenic(hCD47-tg)
humanLEA29Ytransgenic(LEA29Y-tg)
humanCTLA4-Igtransgenic(hCTLA4-lg-tg)
porcineCTLA4-lgtransgenic(pCTLA4-Ig-tg)
年因整合
humandominant-negativemutantclass11transactivatortransgenic(CHTA-DN-tg)
humanthromboniodulintransgenic(hTBM-tg)
humanendothelialproteinCreceptortransgenic(hEPCR-lg)
humantissuefactorpathwayinhibitortransgenic(hTFPI-tg)
humanectonucleosidetriphosphatediphosphohydrolase-1transgenic(hCD39-tg)
humanecto-5-nucleotidasetransgenic(hCD73-tg)
humantumournecrosis(aclora-inducedprolcin3(TNFAIP3)transgenic(A20-lg)
humanhacmeoxygenase1transgenic(hHMOXI-tg)
solublehumanTNFRI-Fctransgenic(shTNFRI-Fc-tg)
附錄B
(資料性)
LEA29Y基因整合有效性檢測(cè)方法
E.1LEA29Y基因型鑒定
E.1.1原理
以LEA29丫基因?yàn)榘形稽c(diǎn),設(shè)計(jì)上下游引物,進(jìn)行PCR檢測(cè)。
E.1.2樣品準(zhǔn)備
E.1.2.1樣品種類
豬耳組織、血液等。
E.1.2.2樣品采集
耳樣采集:采樣前對(duì)采樣工具及采樣部位進(jìn)行消毒,用耳標(biāo)鉗剪下豬耳組織,放入1.5mL離心管中
用于基因組提取。
血液采集:使用紫色采血管,采集豬全血3mL-5mLo
E.1.2.3基因組DNA提取
采用市售基因組DNA提取試劑盒,提取基因組DNA。
E.1.3PCR反應(yīng)
E.1.3.1引物序列
LEA29丫上游引物:5'-GTACCCACCGCCATACTACG-3,;
LEA29丫下游引物:5^GCGATGTCGCTGGGATAGAA-356
E.1.3.2PCR反應(yīng)體系和程序
按照表B.1配置PCR反應(yīng)體系。
表B.1PCR反應(yīng)體系
試劑名稱終濃度組分用量(ML)
2x隨緩沖液KODBufferIX10
上游引物(lOpmol/L)250nmol/L0.5
下游引物(lOpmol/L)250nmol/L0.5
的KOD0.0125uniVpL0.25
模板100ng-500ng2
ddHaO補(bǔ)足至20pL6.75
注:反應(yīng)體系中的各組分可根據(jù)1N同最終反應(yīng)體系進(jìn)行區(qū)分,,旦是需保持所有組分終濃度一致。
PCR反應(yīng)參數(shù):94℃預(yù)變性2min;98℃變性IOs,60℃退火30s,68℃延伸30s,32個(gè)循環(huán);
最后68c延伸5min;反應(yīng)完成后在4c保存。PCR反應(yīng)條件隨不同的PCR儀略有改變。
E.1.3.3PCR擴(kuò)增產(chǎn)物鑒定
制備1%的瓊脂糖凝膠并加入染色劑,在電泳槽中加入電泳緩沖液,使液面剛剛沒過凝膠。將10
>LPCR擴(kuò)增產(chǎn)物和2pL上樣緩沖液混合,點(diǎn)樣,同時(shí)加入合適的DNAMarker,電壓120V,電泳15min?
20min,電泳至溟酚藍(lán)指示劑遷移至凝膠2/3以后,但不能跑過膠”凝膠成像儀下觀察電泳結(jié)果并記錄。
E.1.4實(shí)驗(yàn)對(duì)照
檢驗(yàn)過程中分別設(shè)陽性對(duì)照、陰性對(duì)照、空白對(duì)照。采用含有LEA29Y基因的質(zhì)粒作為陽性對(duì)照,
WT豬的DNA作為陰性對(duì)照,采用與模板等體積的無菌去離子水作為空白對(duì)照。
E.1.5質(zhì)量控制
以下條件有一條不滿足時(shí),試驗(yàn)視為無效:
a)空白對(duì)照:無PCR擴(kuò)增產(chǎn)物條帶;
b)陰性對(duì)照:在573bp大小處未見PCR擴(kuò)增條帶;
c)陽性對(duì)照:在573bp大小處可見PCR擴(kuò)增條帶。
E.1.6結(jié)果判定
在符合B.1.5的情況下,被檢樣品在573bp大小處可見PCR擴(kuò)增條帶則判為陽性,LEA29Y基因整合
至豬基因組上;在573bp大小處木見PCR擴(kuò)增條帶則判為陰性。
E.2LEA29Y基因型表達(dá)鑒定
B.2.1原理
利用LEA29Y蛋白與LEA29丫抗體的特異性結(jié)合,檢測(cè)抗體酶標(biāo)物或標(biāo)記熒光來間接鑒定LEA29丫
的表達(dá)。
E.2.2WesternBlot基因表達(dá)鑒定。
E.2.2.1樣品準(zhǔn)備
取適量豬胰腺組織,加入10()11RIPA裂解液,冰上裂解30min,獲得胰腺組織蛋白液,取少量細(xì)
胞裂解液測(cè)定蛋白濃度(可用BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒檢測(cè))。
E.2.2.2WesternBlot實(shí)驗(yàn)步驟
E.2.2.2.1SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳
使用商品化預(yù)制膠進(jìn)行SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳,組裝電泳槽,使用4x上樣緩沖液稀釋蛋白樣品,
使稀釋后緩沖液終濃度為lx,將蛋白樣品和Maker上樣后進(jìn)行電泳,電泳完成后取出SDS-凝膠用于轉(zhuǎn)膜。
E.2.2.2.2蛋白轉(zhuǎn)膜
將PVDF膜浸泡到甲馨中進(jìn)行活化Imin;將3張轉(zhuǎn)膜用流紙十轉(zhuǎn)移緩沖液中浸泡5min;將轉(zhuǎn)膜夾放
干盛有l(wèi)x轉(zhuǎn)膜緩沖液的盤中,白板(陽極)在上,黑板(陰極)在下,由下向上依次放置1塊海綿、2
層濾紙、SDS-凝膠、PVDF膜、I層濾紙,注意PVDF膜和SDS-凝膠之間不應(yīng)有氣泡,最后合上轉(zhuǎn)膜夾,
將其放置于轉(zhuǎn)膜槽中。轉(zhuǎn)膜槽中加入4c冰箱預(yù)冷30min的lx轉(zhuǎn)膜液,加入冰袋,蓋上轉(zhuǎn)膜蓋。然后將
轉(zhuǎn)膜槽放置于泡沫箱中,加入冰水混合物,以防止轉(zhuǎn)膜過程中產(chǎn)生的熱量,檢查電極方向并接通電源。
在180mA恒流(或90V恒壓)條件下,轉(zhuǎn)移時(shí)間為1.5h。轉(zhuǎn)膜結(jié)束后,若Marker清晰可見,證明轉(zhuǎn)膜
成功。
E.2.2.2.3封閉
將PVDF膜浸入封閉液(含5%脫脂奶粉的TBST)于平板搖床上搖動(dòng)封閉II】。
B.2.2.2.4第一抗體結(jié)合
將PVDF膜浸入含適當(dāng)比例一抗的稀釋液中,在室溫下孵育I%
取出PVDF膜,浸入TBST在搖床上洗滌4次,每次5min。
E.2.2.2.5第二抗體結(jié)合
將PVDF膜浸入含適當(dāng)比例二抗的稀釋液中,在室溫下孵育Ihe
孵育完成后取出PVDF膜,浸入TBST在搖床上洗滌4次,每次5min。
E.2.2.2.6顯色
使用市售ECL化學(xué)發(fā)光顯色試劑盒進(jìn)行顯色。
使用化學(xué)發(fā)光成像儀獲取顯色結(jié)果。
E.2.2.3結(jié)果判定
若實(shí)驗(yàn)組在預(yù)期蛋白大小的位置出現(xiàn)了明顯條帶,而野生型對(duì)照組在該位置無條帶,則說明蛋白表
達(dá);若實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組均無目的條帶,則蛋白未表達(dá)。
E.2.3免疫組化和免疫熒光方法基因表達(dá)鑒定
B-2.3.1樣品準(zhǔn)備
將采集的轉(zhuǎn)基因豬的胰腺組織在OCT(ElectronMicroscopySciences,Hatfield,PA,USA)中包埋
并冷凍,并儲(chǔ)存在-70°C。用冰凍切片機(jī)作冷凍切片(6Fim)用于免疫組化和免疫熒光染色。
02.3.2免疫組化實(shí)險(xiǎn)步驟
E.2.3.2.1固定
冰凍切片風(fēng)干后用丙酮固定10min?15min。
E.2.3.2.2去內(nèi)源酶
用0.3%過氧化氫甲醇溶液或1%鹽酸酒精37C作用30min。
E.2.3.2.3胰蛋白酶消化
需要時(shí)用胰蛋白酶消化處理,以便充分暴露抗原。
B.2.3.2.4漂洗
PBS漂洗3次,每次5min。
E.2.3.2.5封閉
5%小牛血清或I:10稀釋的正常馬血清,37。。濕盒中作用30min。
E.2.3.2.6孵育一體
加適當(dāng)稀釋的已知單抗或抗血清,37c濕盒中作用1h后4c過夜。
E.2.3.2.7漂洗
PBS洗3次,每次5min。
E.2.3.2.8孵育二抗
加適當(dāng)稀釋的第二抗體酶結(jié)合物,37°C盒作用lh。
E.2.3.2.9漂洗
PBS洗3次,每次5min。
E.2.3.2.10底物顯色
新鮮配制的DAB溶液顯色5min-10min后用PBS漂洗3次,每次5min。
E.2.3.2.11襯染
蘇木素或甲基綠襯染細(xì)胞核或細(xì)胞質(zhì)。
E.2.3.2.12觀察
常規(guī)脫水、透明、封片、顯微鏡觀察。
E.2.3.2.13結(jié)果判定
對(duì)照片本底清晰,背景無非特異著染,被檢物呈黃至棕褐色著染即可判為陽性。
B.2.3.3免疫熒光實(shí)驗(yàn)步驟
E.2.3.3.1固定
冰凍切片取出,室溫放置使其干燥后,用冷丙酮于49固定10min。
E.2.3.3.2去非特異著色
切片用0.01m。1/1^1^清洗后加入1.2%雙氯水作用3011]而,以除去非特異染色。
B.2.3.3.3漂洗
0.01mol/LPBS清洗,洗3次每次10min。
E.2.3.3.4透膜
0.3%TritonX-100作用30min。
E.2.3.3.5孵育一抗
加入以抗體稀釋液(含l%BSA的0.01mol/LPBS,pH7.4)稀釋至作濃度的一抗,4c過夜。
B.2.3.3.6漂洗
OOImol/LPBS清洗,洗3次,每次lOmin。
E.2.3.3.7孵育二抗
加入熒光抗體IgG,室溫育2h。
E.2.3.3.8漂洗
0.01mol/LPBS清洗,洗3次,每次lOmin。
E.2.3.3.9封片
緩沖甘油封片,熒光顯微鏡下觀察。
E.2.3.4結(jié)果判定
如果實(shí)驗(yàn)組視野中出現(xiàn)目的熒光而對(duì)照組未見目的熒光,則判斷該基因表達(dá)免疫熒光鑒定陽性;若
實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組均未見目的熒光,則判斷該基因表達(dá)免疫熒光鑒定陰性;若對(duì)照組出現(xiàn)目的熒光,點(diǎn)照
不成立,結(jié)果無意義。
E.2.4ELISA方法鑒定基因表達(dá)
E.2,4.1樣品準(zhǔn)備
用10mL注射器從豬的前腔靜脈采集8mL全血。取6mL保存在促凝采血管內(nèi),3000rpm離心10min,
分離血清,用于ELISA實(shí)驗(yàn)。
E.2.4.2ELISA實(shí)驗(yàn)步驟
E.2.4.2.1測(cè)定
按照酶聯(lián)免疫試劑盒所述操作步驟對(duì)待測(cè)試樣(液)進(jìn)行定量檢測(cè)。
E.2.4.2.2平行試驗(yàn)
按B.2.421所述步驟,對(duì)同一標(biāo)準(zhǔn)溶液、同一樣品溶液均應(yīng)進(jìn)行3次平行試驗(yàn)測(cè)定。
0.2.4.2.3空白試驗(yàn)
除不稱取試樣外,均按B24.2.I所述步驟進(jìn)行。
E.2.4.2.4陽性質(zhì)控
根據(jù)待測(cè)樣本中目的蛋白的含量,選擇一個(gè)合適的質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn),以確定試驗(yàn)過程的操作準(zhǔn)確性。
E.2.4.3試驗(yàn)數(shù)據(jù)處理
E.2.4.3.1標(biāo)準(zhǔn)曲線繪制
按照試劑盒說明書提供的計(jì)算方法,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)品質(zhì)量濃度與吸注度變化關(guān)系繪制標(biāo)準(zhǔn)工作曲線。
E.2.4.3.2待測(cè)液質(zhì)量濃度計(jì)算
按照試劑盒說明書提供的計(jì)篁方法,將待測(cè)樣品吸光度代入B24.3.1所獲得標(biāo)準(zhǔn)工作曲線,計(jì)算待測(cè)
液質(zhì)量濃度(p)。
附錄C
(資料性)
GGTA1基因敲除及表達(dá)有效性檢測(cè)
C.1GGTA1基因型鑒定
C.1.1原理
以GGTA1基因?yàn)榘行蛄?,建立PCR檢測(cè)方法,并結(jié)合PCR產(chǎn)物sangcr測(cè)序結(jié)果,判斷GGTA1基因敲
除類型。
C-1.2樣品準(zhǔn)備
C.1.2.1樣品種類
豬耳組織、血液等
C.1.2.2樣品采集
耳樣采集:采樣前對(duì)采樣工具及采樣部位進(jìn)行消毒,用耳標(biāo)鉗剪下豬耳組織,放入L5mL離心管中
用于基因組提取。
血液采集:使用紫色采血管,采集豬全血3mL~5mL0
C.1.2.3基因組DNA提取
采用市售基因組DNA提取試劑盒,提取基因組DNA。
C.1.3PCR反應(yīng)
C.1.3.1引物序列
GGTAI上游引物:5'-AGGGACAGTAGACCTAGGAAAC-3,;
,,
GGTAI下游弓|物:5-GATCCTAATTGGGTTTGCTGCC-3o
C.1.3.2PCR反應(yīng)體系和程序
按照表C.1配置PCR反應(yīng)體系。
表C.1PCR反應(yīng)體系
組分名稱終濃度組分用量SU
2x酶緩沖液KODBufferIX10
上游引物(10pmol/L)250nmol/L0.5
下游引物(10卜imol/L)250nmol/L0.5
誨KOD0.0125unit/jiL0.25
模板100ng-500ng2
ddHzO補(bǔ)足至20gL6.75
PCR反應(yīng)程序:94℃預(yù)變性2min;98C變性10s,60℃退火30s,68C延伸30s,32個(gè)循環(huán);
最后68c延伸5min;反應(yīng)完成后在4℃保存。PCR反應(yīng)條件隨不同的PCR儀略有改變。
C.1.3.3PCR擴(kuò)增產(chǎn)物鑒定
制備1%的瓊脂糖凝膠并加入染色劑,在電泳槽中加入電泳緩沖液,使液面剛剛沒過凝膠。將
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