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文檔簡介
ICS65.140
CCSB47
6540
伊犁哈薩克自治州地方標準
DB6540/T029—2023
新疆黑蜂鑒定方法
IdentificationmethodofblackbeeinXinjiang
2023-12-26發(fā)布2024-01-26實施
伊犁哈薩克自治州市場監(jiān)督管理局發(fā)布
DB6540/T029—2023
前言
本文件按照GB/T1.1—2020《標準化工作導則第1部分:標準化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定
起草。
本文件由伊犁哈薩克自治州農(nóng)業(yè)科學研究所提出。
本文件由伊犁哈薩克自治州農(nóng)業(yè)農(nóng)村局歸口。
本文件起草單位:伊犁哈薩克自治州農(nóng)業(yè)科學研究所、新疆大學。
本文件主要起草人:古麗奴爾·吐拉西、胡紅英、師豐豐、巴黑提亞、何茜、阿地娜·卡瑪勒江。
I
DB6540/T029—2023
新疆黑蜂鑒定方法
1范圍
本文件規(guī)定了新疆黑蜂形態(tài)特征測定、基因型測定、分析評估等新疆黑蜂的鑒定方法。
本文件適用于伊犁哈薩克自治州區(qū)域內(nèi)新疆黑蜂的鑒定。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
GB/T40184畜禽基因組選擇育種技術(shù)規(guī)程
GB/T31016樣品采集與處理移動實驗室通用技術(shù)規(guī)范
NY/T1673畜禽微衛(wèi)星DNA遺傳多樣性檢測技術(shù)規(guī)程
NY/T2364蜜蜂種質(zhì)資源評價規(guī)范
3術(shù)語和定義
下列術(shù)語和定義適用于本文件。
新疆黑蜂Xinjiangblackbee
屬于蜜蜂科、蜜蜂屬、西方蜜蜂種(ApismelliferaL.),主要分布于新疆西北部伊犁、塔城、
阿勒泰地區(qū)。該黑蜂體形大、吻長、色黑、繁殖力強、分蜂性弱、耐寒、抗病、善于利用大宗或零星蜜
源。它是一個已為長期生產(chǎn)實踐證明了的適應(yīng)當?shù)貒揽釟夂蚝兔墼刺攸c的優(yōu)良黑蜂品系(生態(tài)型)。
蜂群beescolony
以群體為單位,由蜂王、工蜂、雄蜂組成的能獨立生活的蜜蜂群體。
亞種subspecies
亞種是某個種的表型上相似種群的集群,棲息在該物種分布范圍內(nèi)的次級地理區(qū),而且在分類學
上和該種的其他種群不同。
工蜂workerbee
工蜂是蜜蜂蜂群三個類型的一種。工蜂是蜜蜂中性別上未發(fā)育進化完全的雌蜂,二倍體雌性蜜
蜂,個體較蜂王和雄蜂小。
基因組genome
指生物體所有遺傳物質(zhì)的總和。這些遺傳物質(zhì)包括DNA或RNA(病毒RNA)。
1
DB6540/T029—2023
全基因組重測序技術(shù)wholegenomesequencing
對已知基因組序列的物種進行不同個體的基因組測序,并在此基礎(chǔ)上對個體或群體進行差異性分
析。
單核苷酸多態(tài)性singlenucleotidepolymorphism
指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多樣性。
4形態(tài)特征測定
蜜蜂標本選擇
每一蜂群選擇10只~50只大小形態(tài)相對一致的工蜂,裝入95%的酒精中,帶回實驗室。樣品記錄信
息見附錄A.1。
形態(tài)特征描述
工蜂的主要形態(tài)指標有體色(腹部背板幾丁質(zhì)顏色)、毛色(胸腹部絨毛顏色)、吻長、右前翅面
積(用長×寬表示)、肘脈指數(shù)、跗節(jié)指數(shù)(后足第一跗節(jié)的寬度與長度之比,用右后足測量)、蠟鏡
面積(第四腹節(jié)蠟鏡大小,用長×寬表示)、腹部第三節(jié)背板長度、絨毛指數(shù)、覆毛長度。
形態(tài)鑒定
采用NY/T2364蜜蜂種質(zhì)資源評價規(guī)范工蜂形態(tài)特征指標內(nèi)容,按蜂群隨機挑選5只~10只工蜂,每
個蜂場測定數(shù)量不少于5群。形態(tài)指標信息見附錄A.2。
5基因型測定
樣品準備
樣品采集應(yīng)避免個體間DNA交叉污染,每個個體的采樣工具應(yīng)更換或清洗,按照GB/T31016的規(guī)定
執(zhí)行。
基因組DNA提取
提取的DNA應(yīng)符合基因芯片或測序?qū)悠焚|(zhì)量和數(shù)量的要求。DNA提取方法按照NY/T1673的規(guī)定執(zhí)
行。
基因型測定方法
將通過形態(tài)鑒定的新疆黑蜂樣品采用全基因組重測序技術(shù)中的SNP進行基因分型。按照GB/T40184
的規(guī)定執(zhí)行。
6分析評估
數(shù)據(jù)處理
2
DB6540/T029—2023
將測序得到的原始數(shù)據(jù),通過生信軟件對序列進行過濾,僅保留低質(zhì)量堿基數(shù)目占比不超過50%的
序列;通過生物信息學軟件,與西方蜜蜂參考基因組(ApisMel4.5)及NCBI數(shù)據(jù)庫中其他亞種數(shù)據(jù)進
行比對,比對參數(shù)可使用軟件默認參數(shù)。
多態(tài)性位點檢測分型
對比對后的數(shù)據(jù)排序并進行PCR重復(fù)標記,通過gatk4.1等軟件檢測變異序列。使用默認參數(shù)對SNP
進行質(zhì)量過濾,獲得新疆黑蜂SNP。
評估鑒定結(jié)果
通過基于基因組信息的最佳線性無偏估計模型、貝葉斯方法分析,依據(jù)獲得的單系群評價新疆黑蜂
鑒定結(jié)果。
3
DB6540/T029—2023
附錄A
(資料性)
記錄和表格
A.1樣品信息
樣品信息格式見表A.1。
表A.1樣品信息表
基因組測序
序號采樣數(shù)據(jù)每群數(shù)量海拔經(jīng)度緯度地點時間采集人
數(shù)據(jù)名稱
A.2形態(tài)指標測定
新疆黑蜂形態(tài)指標測定參照見表A.2。
表A.2新疆黑蜂形態(tài)指標測定參照
形態(tài)特征指標
吻長mm5.58±0.45
右前翅長mm10.05±0.21
右前翅寬mm3.38±0.12
肘脈指數(shù)2.169±0.16
腹部第三背板長mm2.35±0.15
絨毛指數(shù)2.12±0.26
覆毛長度mm0.278±2.14
跗節(jié)指數(shù)0.563±0.27
蠟鏡面積mm22.23±0.35
腹部背板幾丁質(zhì)顏色
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