標(biāo)準(zhǔn)解讀

《GB/T 46935-2025 單細(xì)胞測(cè)序 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集》是一項(xiàng)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn),旨在規(guī)范單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的生成、處理及共享過(guò)程。該標(biāo)準(zhǔn)詳細(xì)規(guī)定了從樣本采集到數(shù)據(jù)分析的整個(gè)流程中應(yīng)遵循的原則和技術(shù)要求,確保數(shù)據(jù)的質(zhì)量和可重復(fù)性。

在樣本準(zhǔn)備階段,標(biāo)準(zhǔn)明確了樣本來(lái)源、保存條件以及質(zhì)量控制的要求,保證實(shí)驗(yàn)材料符合后續(xù)分析需求。對(duì)于文庫(kù)構(gòu)建部分,則具體描述了推薦使用的試劑盒類型、操作步驟等信息,同時(shí)強(qiáng)調(diào)了實(shí)驗(yàn)過(guò)程中需要注意的關(guān)鍵點(diǎn),以減少批次效應(yīng)和其他潛在的技術(shù)偏差。

關(guān)于測(cè)序環(huán)節(jié),《GB/T 46935-2025》指出了選擇合適測(cè)序平臺(tái)的重要性,并提供了不同平臺(tái)上最佳實(shí)踐指南。此外,還對(duì)測(cè)序深度、讀長(zhǎng)等因素進(jìn)行了說(shuō)明,以確保獲得高質(zhì)量的數(shù)據(jù)輸出。

在數(shù)據(jù)分析方面,該標(biāo)準(zhǔn)涵蓋了從原始數(shù)據(jù)預(yù)處理到高級(jí)生物信息學(xué)分析的全流程指導(dǎo)。它不僅介紹了常用軟件工具及其參數(shù)設(shè)置建議,也討論了如何進(jìn)行差異表達(dá)分析、細(xì)胞類型注釋等核心任務(wù)。更重要的是,針對(duì)當(dāng)前領(lǐng)域內(nèi)存在的挑戰(zhàn),如稀有細(xì)胞類型的識(shí)別、時(shí)空轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究等,提出了相應(yīng)的解決方案或思路。


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  • 即將實(shí)施
  • 暫未開(kāi)始實(shí)施
  • 2025-12-31 頒布
  • 2026-07-01 實(shí)施
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文檔簡(jiǎn)介

ICS07080

CCSA.40

中華人民共和國(guó)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)

GB/T46935—2025

單細(xì)胞測(cè)序單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集

Single-cellsequencing—Datasetofsinglecelltranscriptome

2025-12-31發(fā)布2026-07-01實(shí)施

國(guó)家市場(chǎng)監(jiān)督管理總局發(fā)布

國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)化管理委員會(huì)

GB/T46935—2025

目次

前言

…………………………Ⅲ

范圍

1………………………1

規(guī)范性引用文件

2…………………………1

術(shù)語(yǔ)和定義

3………………1

符號(hào)和縮略語(yǔ)

4……………2

符號(hào)

4.1…………………2

縮略語(yǔ)

4.2………………2

數(shù)據(jù)及數(shù)據(jù)文件要求

5……………………3

數(shù)據(jù)文件組成

5.1………………………3

數(shù)據(jù)文件要求

5.2………………………3

數(shù)據(jù)元目錄

6………………5

屬性

6.1…………………5

數(shù)據(jù)元目錄公用屬性

6.2………………5

數(shù)據(jù)元目錄專用屬性

6.3………………5

數(shù)據(jù)歸檔目錄

7……………6

數(shù)據(jù)歸檔目錄結(jié)構(gòu)

7.1…………………6

單細(xì)胞數(shù)據(jù)歸檔目錄要求

7.2…………6

數(shù)據(jù)安全管理

8……………7

基本要求

8.1……………7

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分級(jí)分類原則

8.2…………………7

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集的分級(jí)分類方式

8.3……………7

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集的管理方式和完整性分級(jí)關(guān)系

8.4……………8

附錄資料性數(shù)據(jù)元目錄

A()……………9

簡(jiǎn)介

A.1…………………9

實(shí)驗(yàn)信息

A.2……………9

建庫(kù)測(cè)序信息

A.3……………………10

生物信息分析

A.4……………………11

質(zhì)控信息

A.5…………………………13

附錄資料性數(shù)據(jù)元值的范圍代碼表

B()………………16

文庫(kù)構(gòu)建策略代碼

B.1…………………16

分子類型代碼

B.2………………………17

是否代碼

B.3……………18

文件類型代碼

B.4………………………18

文庫(kù)設(shè)置代碼

B.5………………………18

GB/T46935—2025

文庫(kù)來(lái)源代碼

B.6………………………18

參考文獻(xiàn)

……………………20

GB/T46935—2025

前言

本文件按照標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第部分標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則的規(guī)定

GB/T1.1—2020《1:》

起草

。

請(qǐng)注意本文件的某些內(nèi)容可能涉及專利本文件的發(fā)布機(jī)構(gòu)不承擔(dān)識(shí)別專利的責(zé)任

。。

本文件由全國(guó)生化檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)提出并歸口

(SAC/TC387)。

本文件起草單位深圳華大生命科學(xué)研究院中國(guó)測(cè)試技術(shù)研究院生物研究所杭州華大生命科學(xué)

:、、

研究院中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所國(guó)家生物信息中心中山大學(xué)武漢華大生命科學(xué)研究院青島

、()、、、

華大智造科技有限責(zé)任公司廣州基迪奧生物科技有限公司西北農(nóng)林科技大學(xué)中國(guó)科學(xué)院武漢植物

、、、

園深圳裕策生物科技有限公司菁良科技深圳有限公司上海百英生物科技股份有限公司蘇州繪真

、、()、、

醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)有限公司江西烈冰生物科技有限公司杭州聯(lián)川生物技術(shù)股份有限公司蘇州百源基因技術(shù)

、、、

有限公司圣湘生物科技股份有限公司利德健康科技廣州有限公司

、、()。

本文件主要起草人麻凱龍魏曉鋒徐志成周李華游麗金王偉文劉石平王博謝志鮑一明

:、、、、、、、、、、

宋述慧劉姍姍張少橋李濤周煌凱姜雨石濤高志博李小強(qiáng)李玲徐曉凱楊濤華聰王志杰

、、、、、、、、、、、、、、

楊帆吳靜靜吳昊李倩一李菁華林木飛盧海松宗杰張惠丹韓斐然楊麗車團(tuán)結(jié)車妍張峰

、、、、、、、、、、、、、。

GB/T46935—2025

單細(xì)胞測(cè)序單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集

1范圍

本文件規(guī)定了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)及數(shù)據(jù)文件要求數(shù)據(jù)元目錄數(shù)據(jù)歸檔目錄和數(shù)據(jù)安全管理的

、、

要求

。

本文件適用于組學(xué)數(shù)據(jù)中有關(guān)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)管理交換和共享

、、。

2規(guī)范性引用文件

下列文件中的內(nèi)容通過(guò)文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款其中注日期的引用文

。,

件僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件不注日期的引用文件其最新版本包括所有的修改單適用于

,;,()

本文件

科學(xué)數(shù)據(jù)安全分類分級(jí)指南

GB/T43705

科學(xué)數(shù)據(jù)安全要求通則

GB/T43708

科學(xué)數(shù)據(jù)安全審計(jì)要求

GB/T43710

3術(shù)語(yǔ)和定義

下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本文件

。

31

.

FASTQ格式FASTQformat

是基于文本的保存生物序列通常是核酸序列和其測(cè)序質(zhì)量信息的

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