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微米管表面CHA放大策略實(shí)現(xiàn)miRNA-21高靈敏檢測(cè)研究一、引言1.1miRNA-21檢測(cè)的意義癌癥,作為全球公共衛(wèi)生領(lǐng)域的重大挑戰(zhàn),嚴(yán)重威脅著人類的生命健康與生活質(zhì)量。世界衛(wèi)生組織國(guó)際癌癥研究機(jī)構(gòu)(IARC)發(fā)布的2020年全球最新癌癥負(fù)擔(dān)數(shù)據(jù)顯示,當(dāng)年全球新發(fā)癌癥病例1929萬(wàn)例,癌癥死亡病例996萬(wàn)例。這一嚴(yán)峻的數(shù)據(jù)表明,癌癥已成為導(dǎo)致人類死亡的主要原因之一,給家庭、社會(huì)和醫(yī)療系統(tǒng)帶來(lái)了沉重的負(fù)擔(dān)。在癌癥的早期診斷、治療監(jiān)測(cè)和預(yù)后評(píng)估等關(guān)鍵環(huán)節(jié)中,腫瘤標(biāo)志物的檢測(cè)發(fā)揮著不可或缺的重要作用,為癌癥的精準(zhǔn)防控提供了關(guān)鍵的技術(shù)支撐。微小核糖核酸(miRNA),作為一類內(nèi)源性的小分子單鏈非編碼RNA,長(zhǎng)度約為18-25個(gè)核苷酸,在細(xì)胞生長(zhǎng)、分化、凋亡、代謝等多種重要的生物學(xué)過(guò)程中扮演著核心調(diào)控角色。它們通過(guò)與靶mRNA的互補(bǔ)配對(duì)結(jié)合,在轉(zhuǎn)錄后水平上對(duì)基因表達(dá)進(jìn)行精細(xì)調(diào)控,從而影響細(xì)胞的各種生理功能和病理進(jìn)程。大量的研究表明,miRNA的異常表達(dá)與多種疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),尤其是在癌癥領(lǐng)域,miRNA的失調(diào)被認(rèn)為是癌癥發(fā)生發(fā)展的重要分子機(jī)制之一。miRNA-21,作為眾多miRNA中的一種,因其在多種癌癥中的顯著異常表達(dá)而備受關(guān)注,被公認(rèn)為是一種極具潛力的腫瘤標(biāo)志物。研究發(fā)現(xiàn),miRNA-21在乳腺癌、肺癌、結(jié)直腸癌、肝癌、胰腺癌、前列腺癌等多種常見(jiàn)惡性腫瘤組織和體液中呈現(xiàn)出高表達(dá)狀態(tài),且其表達(dá)水平與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移、侵襲、預(yù)后等密切相關(guān)。例如,在乳腺癌中,miRNA-21的高表達(dá)與腫瘤的惡性程度增加、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移以及患者的不良預(yù)后顯著相關(guān);在肺癌中,miRNA-21的異常上調(diào)參與了腫瘤細(xì)胞的增殖、凋亡抵抗、遷移和侵襲等過(guò)程,并且與肺癌的分期、病理類型和患者的生存時(shí)間密切相關(guān)。此外,miRNA-21還被報(bào)道在心血管疾病、神經(jīng)系統(tǒng)疾病、自身免疫性疾病等其他非腫瘤性疾病中也發(fā)揮著重要的調(diào)控作用,進(jìn)一步凸顯了其在疾病診斷和治療中的重要價(jià)值。在癌癥的早期診斷方面,miRNA-21具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。傳統(tǒng)的癌癥診斷方法,如組織活檢、影像學(xué)檢查等,往往存在一定的局限性,如組織活檢屬于侵入性檢查,會(huì)給患者帶來(lái)痛苦和風(fēng)險(xiǎn),且可能存在取樣誤差;影像學(xué)檢查對(duì)于早期癌癥的檢測(cè)靈敏度較低,容易漏診。而miRNA-21可以在血液、唾液、尿液等多種體液中穩(wěn)定存在,通過(guò)檢測(cè)這些體液中的miRNA-21水平,有望實(shí)現(xiàn)癌癥的早期無(wú)創(chuàng)或微創(chuàng)診斷,為患者的早期治療提供寶貴的時(shí)間窗。例如,研究人員通過(guò)對(duì)大量癌癥患者和健康對(duì)照者的血清樣本進(jìn)行檢測(cè)分析,發(fā)現(xiàn)血清中miRNA-21的表達(dá)水平在癌癥患者中顯著高于健康人群,且在癌癥的早期階段就已經(jīng)出現(xiàn)明顯變化,這表明miRNA-21可以作為一種潛在的早期癌癥診斷標(biāo)志物,用于癌癥的早期篩查和預(yù)警。在治療監(jiān)測(cè)方面,miRNA-21可以作為評(píng)估癌癥治療效果和監(jiān)測(cè)腫瘤復(fù)發(fā)的重要指標(biāo)。在癌癥治療過(guò)程中,如手術(shù)、化療、放療、靶向治療等,患者體內(nèi)的miRNA-21水平會(huì)隨著治療的進(jìn)行而發(fā)生動(dòng)態(tài)變化。通過(guò)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)miRNA-21的表達(dá)水平,可以及時(shí)了解腫瘤細(xì)胞對(duì)治療的反應(yīng),評(píng)估治療效果,為臨床醫(yī)生調(diào)整治療方案提供重要依據(jù)。例如,在化療過(guò)程中,如果患者體內(nèi)的miRNA-21水平隨著化療的進(jìn)行逐漸下降,說(shuō)明腫瘤細(xì)胞對(duì)化療藥物敏感,治療效果較好;反之,如果miRNA-21水平持續(xù)升高或沒(méi)有明顯變化,則提示腫瘤細(xì)胞可能對(duì)化療藥物產(chǎn)生耐藥性,需要及時(shí)更換治療方案。此外,miRNA-21還可以用于監(jiān)測(cè)腫瘤的復(fù)發(fā)情況。在癌癥患者經(jīng)過(guò)治療后達(dá)到臨床緩解期時(shí),通過(guò)定期檢測(cè)miRNA-21的水平,可以早期發(fā)現(xiàn)腫瘤的復(fù)發(fā)跡象,及時(shí)采取干預(yù)措施,提高患者的生存率和生活質(zhì)量。在預(yù)后評(píng)估方面,miRNA-21的表達(dá)水平與癌癥患者的預(yù)后密切相關(guān)。大量的臨床研究表明,高表達(dá)的miRNA-21通常預(yù)示著癌癥患者的不良預(yù)后,包括較短的無(wú)病生存期、總生存期和較高的復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移率。通過(guò)檢測(cè)miRNA-21的表達(dá)水平,可以對(duì)癌癥患者的預(yù)后進(jìn)行準(zhǔn)確評(píng)估,為患者的個(gè)性化治療和隨訪管理提供重要參考。例如,對(duì)于miRNA-21高表達(dá)的癌癥患者,臨床醫(yī)生可以采取更加積極的治療策略,加強(qiáng)隨訪監(jiān)測(cè),以降低患者的復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn),改善患者的預(yù)后。綜上所述,miRNA-21作為一種重要的腫瘤標(biāo)志物,在多種癌癥的早期診斷、治療監(jiān)測(cè)和預(yù)后評(píng)估中具有關(guān)鍵作用,其檢測(cè)對(duì)于癌癥的精準(zhǔn)防控具有重要的臨床意義和應(yīng)用價(jià)值。然而,由于miRNA-21在生物樣本中的含量極低,且存在序列相似性高、易降解等特點(diǎn),使得其高靈敏、高特異性檢測(cè)面臨著巨大的挑戰(zhàn)。因此,開發(fā)一種高效、靈敏、特異的miRNA-21檢測(cè)方法具有迫切的現(xiàn)實(shí)需求和重要的科學(xué)意義,對(duì)于推動(dòng)癌癥的早期診斷和治療,改善患者的預(yù)后具有重要的推動(dòng)作用。1.2現(xiàn)有miRNA-21檢測(cè)方法概述目前,針對(duì)miRNA-21的檢測(cè)已發(fā)展出多種方法,這些方法各有優(yōu)劣,在實(shí)際應(yīng)用中發(fā)揮著不同的作用。傳統(tǒng)的檢測(cè)方法主要包括定量逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(qRT-PCR)、微陣列雜交和RNA印跡(Northernblotting)等,它們?cè)趍iRNA-21檢測(cè)的發(fā)展歷程中占據(jù)著重要地位,為后續(xù)新方法的開發(fā)提供了基礎(chǔ)和借鑒。qRT-PCR被廣泛認(rèn)為是miRNA檢測(cè)的金標(biāo)準(zhǔn),其原理是先將miRNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA,再使用特異性引物對(duì)cDNA進(jìn)行擴(kuò)增,通過(guò)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)擴(kuò)增過(guò)程中的熒光信號(hào)來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)miRNA-21的定量檢測(cè)。該方法具有靈敏度高、特異性強(qiáng)的顯著優(yōu)點(diǎn),能夠檢測(cè)到極低豐度的miRNA-21,并且可以對(duì)其進(jìn)行精確的定量分析。這使得qRT-PCR在臨床診斷、基礎(chǔ)研究等領(lǐng)域得到了廣泛應(yīng)用,為疾病的診斷、治療監(jiān)測(cè)和預(yù)后評(píng)估提供了重要的技術(shù)支持。然而,qRT-PCR也存在一些局限性。首先,其操作過(guò)程較為復(fù)雜,需要專業(yè)的技術(shù)人員和昂貴的儀器設(shè)備,這限制了其在一些資源有限的地區(qū)或基層醫(yī)療機(jī)構(gòu)的應(yīng)用。其次,該方法對(duì)樣本的質(zhì)量和完整性要求較高,樣本的提取、保存和處理過(guò)程中的任何不當(dāng)操作都可能影響檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性。此外,qRT-PCR只能檢測(cè)已知序列的miRNA-21,對(duì)于新發(fā)現(xiàn)的或序列未知的miRNA-21則無(wú)法進(jìn)行檢測(cè)。微陣列雜交技術(shù)則是將大量的寡核苷酸探針固定在芯片表面,與標(biāo)記后的miRNA樣本進(jìn)行雜交,通過(guò)檢測(cè)雜交信號(hào)的強(qiáng)度來(lái)分析miRNA-21的表達(dá)水平。該技術(shù)的最大優(yōu)勢(shì)在于能夠?qū)崿F(xiàn)高通量檢測(cè),可以同時(shí)對(duì)多個(gè)樣本中的多種miRNA進(jìn)行分析,大大提高了檢測(cè)效率。這使得微陣列雜交技術(shù)在大規(guī)?;虮磉_(dá)譜分析、疾病標(biāo)志物篩選等研究中具有重要的應(yīng)用價(jià)值。然而,微陣列雜交技術(shù)也存在一些不足之處。其靈敏度相對(duì)較低,對(duì)于低豐度表達(dá)的miRNA-21檢測(cè)效果不佳,容易出現(xiàn)假陰性結(jié)果。此外,該技術(shù)的重復(fù)性較差,不同批次實(shí)驗(yàn)之間的結(jié)果可能存在較大差異,這限制了其在臨床診斷中的應(yīng)用。而且,微陣列雜交技術(shù)需要使用預(yù)定義的miRNA探針庫(kù),對(duì)于一些新發(fā)現(xiàn)的或未包含在探針庫(kù)中的miRNA-21則無(wú)法進(jìn)行檢測(cè)。RNA印跡是一種經(jīng)典的基于探針雜交技術(shù)的miRNA檢測(cè)方法,它不僅可以用來(lái)檢測(cè)成熟的miRNA-21,也可以檢測(cè)其前體。該方法的原理是先將RNA樣本進(jìn)行凝膠電泳分離,然后轉(zhuǎn)移至固相膜上,與標(biāo)記后的探針進(jìn)行雜交,通過(guò)檢測(cè)雜交信號(hào)來(lái)確定miRNA-21的存在和表達(dá)水平。RNA印跡法不需要擴(kuò)增,在檢測(cè)過(guò)程中序列中的堿基不發(fā)生改變,也不被修飾,因此其結(jié)果比較可靠,能夠直接反映miRNA-21的原始狀態(tài)。然而,RNA印跡法也存在諸多缺點(diǎn)。其靈敏度較低,檢測(cè)限通常在nmol/L~pmol/L之間,對(duì)于低豐度表達(dá)的miRNA-21難以檢測(cè)到。該方法為低通量檢測(cè),一次只能檢測(cè)少量樣本,檢測(cè)效率較低。而且,RNA印跡法需要大量的RNA樣本,對(duì)于一些臨床樣本量有限的情況不太適用。此外,該方法只能對(duì)miRNA-21進(jìn)行半定量分析,無(wú)法精確確定其表達(dá)量,并且實(shí)驗(yàn)過(guò)程中RNA易降解,對(duì)實(shí)驗(yàn)操作要求較高。隨著科技的不斷進(jìn)步,新興的miRNA-21檢測(cè)技術(shù)也不斷涌現(xiàn),為解決傳統(tǒng)檢測(cè)方法的局限性提供了新的思路和途徑。這些新興技術(shù)主要包括基于納米材料的檢測(cè)技術(shù)、核酸擴(kuò)增技術(shù)、生物傳感器技術(shù)等,它們?cè)陟`敏度、特異性、操作簡(jiǎn)便性等方面展現(xiàn)出獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)?;诩{米材料的檢測(cè)技術(shù)利用納米材料的獨(dú)特物理和化學(xué)性質(zhì),如高比表面積、良好的導(dǎo)電性、熒光特性等,來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)miRNA-21的高靈敏檢測(cè)。例如,金納米粒子具有獨(dú)特的表面等離子體共振特性,其顏色會(huì)隨著周圍環(huán)境的變化而發(fā)生改變。當(dāng)金納米粒子與miRNA-21特異性結(jié)合后,會(huì)導(dǎo)致其表面等離子體共振發(fā)生變化,從而引起顏色的變化,通過(guò)肉眼或光譜儀即可對(duì)miRNA-21進(jìn)行檢測(cè)。這種基于金納米粒子的比色法檢測(cè)技術(shù)具有操作簡(jiǎn)單、快速、可視化等優(yōu)點(diǎn),無(wú)需復(fù)雜的儀器設(shè)備,可實(shí)現(xiàn)現(xiàn)場(chǎng)快速檢測(cè)。此外,量子點(diǎn)、碳納米管、石墨烯等納米材料也被廣泛應(yīng)用于miRNA-21的檢測(cè)中。量子點(diǎn)具有優(yōu)異的熒光性能,其熒光強(qiáng)度高、穩(wěn)定性好、發(fā)射光譜窄且可通過(guò)改變組成和尺寸進(jìn)行調(diào)節(jié),可作為熒光探針用于miRNA-21的檢測(cè),提高檢測(cè)的靈敏度和準(zhǔn)確性。碳納米管和石墨烯具有良好的電學(xué)性能和生物相容性,可用于構(gòu)建電化學(xué)傳感器,實(shí)現(xiàn)對(duì)miRNA-21的電化學(xué)檢測(cè),具有響應(yīng)速度快、靈敏度高、成本低等優(yōu)點(diǎn)。然而,基于納米材料的檢測(cè)技術(shù)也面臨一些挑戰(zhàn)。納米材料的制備和修飾過(guò)程較為復(fù)雜,需要嚴(yán)格控制實(shí)驗(yàn)條件,以確保其性能的穩(wěn)定性和重復(fù)性。此外,納米材料與生物分子的相互作用機(jī)制尚不完全清楚,可能會(huì)對(duì)檢測(cè)結(jié)果產(chǎn)生影響,需要進(jìn)一步深入研究。核酸擴(kuò)增技術(shù)是通過(guò)對(duì)miRNA-21進(jìn)行特異性擴(kuò)增,從而提高其檢測(cè)靈敏度的一類技術(shù)。常見(jiàn)的核酸擴(kuò)增技術(shù)包括環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)、重組酶聚合酶擴(kuò)增(RPA)、雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(HCR)和催化發(fā)卡自組裝反應(yīng)(CHA)等。LAMP技術(shù)是一種等溫核酸擴(kuò)增技術(shù),它利用一組特異性引物和具有鏈置換活性的DNA聚合酶,在恒溫條件下實(shí)現(xiàn)對(duì)靶核酸的快速擴(kuò)增。該技術(shù)具有擴(kuò)增效率高、特異性強(qiáng)、反應(yīng)速度快等優(yōu)點(diǎn),可在短時(shí)間內(nèi)將靶核酸擴(kuò)增數(shù)百萬(wàn)倍,大大提高了檢測(cè)靈敏度。而且,LAMP技術(shù)操作簡(jiǎn)單,不需要昂貴的儀器設(shè)備,可在基層醫(yī)療機(jī)構(gòu)或現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)中應(yīng)用。RPA技術(shù)也是一種等溫?cái)U(kuò)增技術(shù),它利用重組酶、單鏈結(jié)合蛋白和DNA聚合酶等在常溫下實(shí)現(xiàn)對(duì)靶核酸的擴(kuò)增。該技術(shù)具有擴(kuò)增速度快、靈敏度高、對(duì)樣本要求低等優(yōu)點(diǎn),可在37℃左右的常溫條件下快速完成擴(kuò)增反應(yīng),適用于各種復(fù)雜樣本的檢測(cè)。HCR技術(shù)是一種無(wú)酶核酸擴(kuò)增技術(shù),它基于DNA鏈取代反應(yīng),在靶分子的引發(fā)下,兩種DNA發(fā)夾結(jié)構(gòu)的莖環(huán)交替開環(huán),自組裝形成包含大量重復(fù)單元的線性雙鏈DNA納米結(jié)構(gòu),從而實(shí)現(xiàn)信號(hào)的放大。該技術(shù)具有操作簡(jiǎn)單、無(wú)酶參與、擴(kuò)增效率較高等優(yōu)點(diǎn),可在等溫條件下進(jìn)行,避免了酶的使用帶來(lái)的一些問(wèn)題。CHA技術(shù)是在HCR技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來(lái)的一種更高效、更靈敏的無(wú)酶信號(hào)放大技術(shù)。在CHA反應(yīng)中,靶標(biāo)觸發(fā)級(jí)聯(lián)放大效應(yīng)后并不會(huì)作為生成物的一部分參與后續(xù)延伸,而是會(huì)被重新釋放到體系中充當(dāng)“催化劑”繼續(xù)觸發(fā)下一段CHA反應(yīng),產(chǎn)生更明顯的信號(hào)放大效果。無(wú)酶催化的CHA具有更高靈敏度和放大效率,在微量靶標(biāo)的檢測(cè)中具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。然而,核酸擴(kuò)增技術(shù)也存在一些問(wèn)題。例如,擴(kuò)增過(guò)程中可能會(huì)出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增,導(dǎo)致假陽(yáng)性結(jié)果的產(chǎn)生,需要對(duì)引物設(shè)計(jì)、反應(yīng)條件等進(jìn)行優(yōu)化,以提高擴(kuò)增的特異性。此外,核酸擴(kuò)增技術(shù)對(duì)反應(yīng)體系的要求較高,需要嚴(yán)格控制反應(yīng)條件,以確保擴(kuò)增的準(zhǔn)確性和重復(fù)性。生物傳感器技術(shù)是將生物識(shí)別元件與物理或化學(xué)換能器相結(jié)合,通過(guò)檢測(cè)生物分子之間的特異性相互作用產(chǎn)生的信號(hào)變化,來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)miRNA-21的檢測(cè)。常見(jiàn)的生物傳感器包括電化學(xué)傳感器、光學(xué)傳感器、壓電傳感器等。電化學(xué)傳感器利用電極表面的生物分子與miRNA-21發(fā)生特異性結(jié)合后,引起電極表面電荷分布或電流、電位等電化學(xué)信號(hào)的變化,通過(guò)檢測(cè)這些信號(hào)的變化來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)miRNA-21的檢測(cè)。該傳感器具有靈敏度高、響應(yīng)速度快、成本低等優(yōu)點(diǎn),可實(shí)現(xiàn)對(duì)miRNA-21的快速、實(shí)時(shí)檢測(cè)。光學(xué)傳感器則是利用光信號(hào)的變化來(lái)檢測(cè)miRNA-21,如熒光傳感器、表面等離子共振傳感器等。熒光傳感器通過(guò)標(biāo)記熒光基團(tuán),當(dāng)熒光基團(tuán)與miRNA-21特異性結(jié)合后,熒光信號(hào)會(huì)發(fā)生變化,通過(guò)檢測(cè)熒光信號(hào)的強(qiáng)度、波長(zhǎng)等變化來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)miRNA-21的檢測(cè)。表面等離子共振傳感器則是利用金屬表面等離子體共振現(xiàn)象,當(dāng)miRNA-21與固定在金屬表面的探針特異性結(jié)合后,會(huì)引起金屬表面等離子體共振的變化,通過(guò)檢測(cè)這種變化來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)miRNA-21的檢測(cè)。該傳感器具有靈敏度高、無(wú)需標(biāo)記、實(shí)時(shí)檢測(cè)等優(yōu)點(diǎn),可用于對(duì)miRNA-21的無(wú)標(biāo)記檢測(cè)。壓電傳感器則是利用壓電材料在受到壓力或應(yīng)力作用時(shí)產(chǎn)生電荷的特性,當(dāng)miRNA-21與固定在壓電材料表面的探針特異性結(jié)合后,會(huì)引起壓電材料表面質(zhì)量的變化,從而導(dǎo)致壓電信號(hào)的變化,通過(guò)檢測(cè)這些信號(hào)的變化來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)miRNA-21的檢測(cè)。生物傳感器技術(shù)具有操作簡(jiǎn)便、靈敏度高、特異性強(qiáng)、可實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)檢測(cè)等優(yōu)點(diǎn),在miRNA-21檢測(cè)領(lǐng)域具有廣闊的應(yīng)用前景。然而,生物傳感器技術(shù)也面臨一些挑戰(zhàn)。生物識(shí)別元件的穩(wěn)定性和特異性有待進(jìn)一步提高,以確保傳感器的長(zhǎng)期穩(wěn)定性和準(zhǔn)確性。此外,傳感器的制備工藝和檢測(cè)方法還需要不斷優(yōu)化,以提高其檢測(cè)性能和可靠性。綜上所述,現(xiàn)有miRNA-21檢測(cè)方法在靈敏度、特異性、操作復(fù)雜度、檢測(cè)成本等方面存在各自的優(yōu)缺點(diǎn)。傳統(tǒng)檢測(cè)方法雖然技術(shù)成熟,但在靈敏度和操作簡(jiǎn)便性等方面存在一定的局限性;新興檢測(cè)技術(shù)雖然展現(xiàn)出獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),但仍面臨一些技術(shù)挑戰(zhàn)和問(wèn)題,需要進(jìn)一步的研究和優(yōu)化。因此,開發(fā)一種高效、靈敏、特異、操作簡(jiǎn)便且成本低廉的miRNA-21檢測(cè)方法仍然是當(dāng)前研究的重點(diǎn)和難點(diǎn)。1.3CHA放大方法及微米管在生物檢測(cè)中的應(yīng)用進(jìn)展雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(HCR)是一種基于DNA鏈取代反應(yīng)的等溫信號(hào)放大技術(shù),在HCR體系中,靶分子引發(fā)兩種DNA發(fā)夾結(jié)構(gòu)的莖環(huán)交替開環(huán),自組裝形成包含大量重復(fù)單元的線性雙鏈DNA納米結(jié)構(gòu),從而實(shí)現(xiàn)信號(hào)的放大,其放大效率達(dá)10?-10?倍。催化發(fā)卡自組裝反應(yīng)(CHA)則是在HCR技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來(lái)的一種更為高效、靈敏的無(wú)酶信號(hào)放大技術(shù)。二者的主要區(qū)別在于,CHA反應(yīng)中靶標(biāo)觸發(fā)級(jí)聯(lián)放大效應(yīng)后并不會(huì)作為生成物的一部分參與后續(xù)延伸,而是會(huì)被重新釋放到體系中充當(dāng)“催化劑”繼續(xù)觸發(fā)下一段CHA反應(yīng),產(chǎn)生更明顯的信號(hào)放大效果。在CHA反應(yīng)中,通常設(shè)計(jì)兩組具有發(fā)夾結(jié)構(gòu)的互補(bǔ)單鏈DNA探針。當(dāng)目標(biāo)核酸不存在時(shí),兩組單鏈DNA均以發(fā)夾結(jié)構(gòu)穩(wěn)定存在;而當(dāng)系統(tǒng)中存在目標(biāo)核酸時(shí),在目標(biāo)核酸的催化作用下,兩組發(fā)夾結(jié)構(gòu)的單鏈DNA探針會(huì)依次打開發(fā)夾結(jié)構(gòu),并通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)形成DNA雙鏈。整個(gè)催化過(guò)程中并不消耗目標(biāo)核酸,目標(biāo)核酸促發(fā)兩組單鏈DNA探針形成雙鏈后,繼續(xù)進(jìn)入下一輪的反應(yīng),從而實(shí)現(xiàn)信號(hào)的循環(huán)放大。例如,在檢測(cè)某種特定的miRNA時(shí),將與該miRNA互補(bǔ)的一段DNA序列作為觸發(fā)鏈,當(dāng)體系中存在目標(biāo)miRNA時(shí),miRNA與觸發(fā)鏈結(jié)合,打開第一個(gè)發(fā)夾探針的莖環(huán)結(jié)構(gòu),隨后第二個(gè)發(fā)夾探針與第一個(gè)發(fā)夾探針的部分序列互補(bǔ)結(jié)合,依次類推,不斷循環(huán),形成大量的雙鏈DNA產(chǎn)物,實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)miRNA的信號(hào)放大檢測(cè)。CHA放大方法具有諸多顯著優(yōu)勢(shì)。首先,它是一種無(wú)酶催化的反應(yīng),避免了酶的使用帶來(lái)的一些問(wèn)題,如酶的活性易受溫度、pH值等環(huán)境因素的影響,酶的保存和運(yùn)輸條件較為苛刻等。CHA反應(yīng)在等溫條件下即可進(jìn)行,無(wú)需復(fù)雜的溫度控制設(shè)備,反應(yīng)條件溫和,操作簡(jiǎn)便,可大大縮短檢測(cè)時(shí)間,提高檢測(cè)效率。其次,CHA反應(yīng)具有極高的靈敏度,能夠檢測(cè)到極低濃度的靶標(biāo)分子。這是由于靶標(biāo)分子在反應(yīng)中起到“催化劑”的作用,不斷循環(huán)觸發(fā)CHA反應(yīng),使得信號(hào)得到極大程度的放大。研究表明,CHA技術(shù)能夠檢測(cè)到低至皮摩爾(pM)甚至飛摩爾(fM)級(jí)別的核酸分子,在微量靶標(biāo)的檢測(cè)中具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。此外,CHA反應(yīng)的特異性強(qiáng),通過(guò)合理設(shè)計(jì)發(fā)夾探針的序列,可以使反應(yīng)高度特異性地識(shí)別目標(biāo)核酸分子,有效減少非特異性反應(yīng)的發(fā)生,提高檢測(cè)的準(zhǔn)確性。由于這些優(yōu)勢(shì),CHA放大方法在核酸檢測(cè)領(lǐng)域得到了廣泛的應(yīng)用。在疾病診斷方面,CHA技術(shù)被用于多種疾病相關(guān)的核酸標(biāo)志物的檢測(cè),如病毒核酸、腫瘤標(biāo)志物等。例如,在病毒檢測(cè)中,利用CHA技術(shù)可以快速、靈敏地檢測(cè)出病毒的核酸,為病毒感染的早期診斷提供了有力的技術(shù)支持。在腫瘤標(biāo)志物檢測(cè)中,CHA技術(shù)能夠檢測(cè)到腫瘤細(xì)胞中異常表達(dá)的miRNA、mRNA等核酸分子,有助于腫瘤的早期診斷和預(yù)后評(píng)估。在生物傳感領(lǐng)域,CHA技術(shù)與各種傳感器相結(jié)合,如電化學(xué)傳感器、熒光傳感器、表面等離子共振傳感器等,構(gòu)建出高靈敏的生物傳感器。這些生物傳感器能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)生物分子的實(shí)時(shí)、原位檢測(cè),具有廣闊的應(yīng)用前景。在基因表達(dá)分析方面,CHA技術(shù)可以用于檢測(cè)細(xì)胞內(nèi)特定基因的表達(dá)水平,為基因功能研究和疾病發(fā)病機(jī)制的探討提供了重要的技術(shù)手段。微米管作為一種具有獨(dú)特結(jié)構(gòu)和性質(zhì)的材料,在生物檢測(cè)領(lǐng)域也展現(xiàn)出了巨大的應(yīng)用潛力。微米管通常是指管徑在微米級(jí)別的管狀結(jié)構(gòu),其管壁厚度可以在納米級(jí)到微米級(jí)之間。常見(jiàn)的微米管材料包括碳微米管、聚合物微米管、無(wú)機(jī)氧化物微米管等。碳微米管具有與碳納米管相似的管狀結(jié)構(gòu),在保持納米級(jí)管壁厚度的同時(shí),能擁有微米級(jí)的管徑,巨大的管壁外表面,相當(dāng)于一張微米級(jí)的石墨烯網(wǎng)狀膜,因此碳微米管能同時(shí)擁有碳納米管和石墨烯的獨(dú)特物理和化學(xué)性能。聚合物微米管則可以通過(guò)多種方法制備,如模板法、相分離法、靜電紡絲法等,其具有良好的生物相容性、可加工性和功能化特性。無(wú)機(jī)氧化物微米管如二氧化硅微米管、氧化鋅微米管等,具有優(yōu)異的化學(xué)穩(wěn)定性、光學(xué)性能和電學(xué)性能。微米管的獨(dú)特結(jié)構(gòu)和性質(zhì)使其在生物分子檢測(cè)領(lǐng)域具有一系列突出的優(yōu)勢(shì)。首先,微米管具有較大的比表面積,能夠提供更多的結(jié)合位點(diǎn),有利于生物分子的吸附和固定。這使得微米管在生物傳感器的構(gòu)建中具有重要的應(yīng)用價(jià)值,可以提高傳感器的靈敏度和檢測(cè)性能。其次,微米管的管狀結(jié)構(gòu)可以作為生物分子的傳輸通道,實(shí)現(xiàn)生物分子的定向傳輸和富集。例如,在微流控芯片中,微米管可以作為微通道,用于生物樣品的輸送和分離,提高分析效率。此外,微米管的尺寸和形狀可以精確控制,通過(guò)改變制備方法和工藝參數(shù),可以制備出具有不同管徑、管壁厚度和長(zhǎng)度的微米管,以滿足不同生物檢測(cè)應(yīng)用的需求。微米管還可以進(jìn)行表面修飾,通過(guò)在其表面引入各種功能基團(tuán),如氨基、羧基、巰基等,可以實(shí)現(xiàn)對(duì)生物分子的特異性識(shí)別和結(jié)合,進(jìn)一步提高其在生物檢測(cè)中的應(yīng)用性能。在實(shí)際應(yīng)用中,微米管在生物分子檢測(cè)領(lǐng)域取得了一系列令人矚目的成果。在蛋白質(zhì)檢測(cè)方面,利用微米管的高比表面積和表面可修飾性,將特異性識(shí)別蛋白質(zhì)的抗體或適配體固定在微米管表面,構(gòu)建蛋白質(zhì)傳感器。當(dāng)樣品中的目標(biāo)蛋白質(zhì)與微米管表面的識(shí)別分子結(jié)合時(shí),會(huì)引起微米管表面物理或化學(xué)性質(zhì)的變化,通過(guò)檢測(cè)這些變化可以實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白質(zhì)的定量檢測(cè)。在核酸檢測(cè)方面,微米管同樣發(fā)揮著重要作用。例如,將核酸探針固定在微米管表面,利用核酸雜交原理,可以實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)核酸的特異性檢測(cè)。此外,微米管還可以作為核酸擴(kuò)增反應(yīng)的載體,將核酸擴(kuò)增試劑裝載到微米管內(nèi),在微米管內(nèi)進(jìn)行核酸擴(kuò)增反應(yīng),提高擴(kuò)增效率和靈敏度。在細(xì)胞檢測(cè)方面,微米管可以用于細(xì)胞的捕獲、分離和分析。通過(guò)在微米管表面修飾細(xì)胞特異性識(shí)別分子,如細(xì)胞黏附分子、抗體等,可以實(shí)現(xiàn)對(duì)特定細(xì)胞的選擇性捕獲和分離。同時(shí),微米管還可以作為細(xì)胞培養(yǎng)的微環(huán)境,模擬細(xì)胞在體內(nèi)的生長(zhǎng)環(huán)境,研究細(xì)胞的生長(zhǎng)、分化和代謝等過(guò)程。CHA放大方法以其獨(dú)特的信號(hào)放大機(jī)制和優(yōu)勢(shì),在核酸檢測(cè)領(lǐng)域展現(xiàn)出重要的應(yīng)用價(jià)值;微米管憑借其特殊的結(jié)構(gòu)和性質(zhì),在生物分子檢測(cè)領(lǐng)域取得了豐富的應(yīng)用成果。將CHA放大方法與微米管相結(jié)合,有望開發(fā)出更加高效、靈敏、特異的生物檢測(cè)技術(shù),為生物醫(yī)學(xué)研究和臨床診斷提供強(qiáng)有力的技術(shù)支持。1.4研究目的與創(chuàng)新點(diǎn)本研究旨在開發(fā)一種基于微米管表面的CHA放大方法,實(shí)現(xiàn)對(duì)miRNA-21的高靈敏性檢測(cè),以滿足癌癥早期診斷和治療監(jiān)測(cè)等臨床需求。具體研究目標(biāo)包括:構(gòu)建基于微米管表面的CHA反應(yīng)體系,優(yōu)化反應(yīng)條件,提高檢測(cè)靈敏度和特異性;利用微米管的獨(dú)特結(jié)構(gòu)和性質(zhì),結(jié)合CHA的信號(hào)放大優(yōu)勢(shì),實(shí)現(xiàn)對(duì)低豐度miRNA-21的高效檢測(cè);將該方法應(yīng)用于實(shí)際生物樣本(如血清、細(xì)胞裂解液等)中miRNA-21的檢測(cè),驗(yàn)證其在臨床診斷中的可行性和可靠性。本研究的創(chuàng)新點(diǎn)主要體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面:一是首次將微米管與CHA放大方法相結(jié)合,利用微米管的大比表面積和良好的生物相容性,為CHA反應(yīng)提供更多的結(jié)合位點(diǎn)和穩(wěn)定的反應(yīng)環(huán)境,增強(qiáng)了信號(hào)放大效果,提高了檢測(cè)靈敏度;二是通過(guò)合理設(shè)計(jì)CHA反應(yīng)中的發(fā)夾探針和觸發(fā)鏈,使其能夠特異性地識(shí)別miRNA-21,有效減少了非特異性反應(yīng)的干擾,提高了檢測(cè)的特異性;三是該檢測(cè)方法操作簡(jiǎn)便、成本低廉,無(wú)需復(fù)雜的儀器設(shè)備和專業(yè)的技術(shù)人員,有望實(shí)現(xiàn)現(xiàn)場(chǎng)快速檢測(cè),為癌癥的早期診斷和基層醫(yī)療提供了新的技術(shù)手段。二、相關(guān)理論基礎(chǔ)2.1miRNA-21的生物學(xué)特性2.1.1miRNA-21的結(jié)構(gòu)與功能miRNA-21是一種內(nèi)源性的非編碼單鏈RNA,其成熟序列長(zhǎng)度約為22個(gè)核苷酸。在人類基因組中,miRNA-21基因位于17號(hào)染色體上(17q23.2),其編碼基因由3個(gè)外顯子組成。miRNA-21的初級(jí)轉(zhuǎn)錄本(pri-miRNA-21)在細(xì)胞核內(nèi)由RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄生成,長(zhǎng)度可達(dá)幾百到幾千個(gè)核苷酸。pri-miRNA-21具有典型的莖環(huán)結(jié)構(gòu),在Drosha-DGCR8復(fù)合體的作用下,被切割成約70-100個(gè)核苷酸的前體miRNA(pre-miRNA-21)。pre-miRNA-21通過(guò)Exportin-5轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞質(zhì)中,在Dicer酶的作用下,進(jìn)一步切割成為成熟的miRNA-21。成熟的miRNA-21與AGO蛋白等形成RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合體(RISC),通過(guò)與靶mRNA的3’非翻譯區(qū)(3’UTR)互補(bǔ)配對(duì),抑制靶mRNA的翻譯過(guò)程,或者在完全互補(bǔ)配對(duì)的情況下,介導(dǎo)靶mRNA的降解,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控。miRNA-21在細(xì)胞的多種生理過(guò)程中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。在細(xì)胞增殖方面,研究表明miRNA-21可以通過(guò)調(diào)控相關(guān)靶基因,促進(jìn)細(xì)胞的增殖。例如,在乳腺癌細(xì)胞中,miRNA-21通過(guò)抑制程序性細(xì)胞死亡蛋白4(PDCD4)的表達(dá),解除PDCD4對(duì)細(xì)胞增殖的抑制作用,從而促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞的增殖。在細(xì)胞凋亡過(guò)程中,miRNA-21則扮演著抗凋亡的角色。在神經(jīng)細(xì)胞中,miRNA-21通過(guò)靶向作用于富含亮氨酸重復(fù)序列和免疫球蛋白樣結(jié)構(gòu)域1(LRIG1),抑制LRIG1的表達(dá),進(jìn)而激活PI3K/AKT信號(hào)通路,抑制神經(jīng)細(xì)胞的凋亡。在細(xì)胞遷移和侵襲方面,miRNA-21同樣發(fā)揮著重要作用。在結(jié)直腸癌細(xì)胞中,miRNA-21通過(guò)抑制基質(zhì)金屬蛋白酶組織抑制劑3(TIMP3)的表達(dá),促進(jìn)基質(zhì)金屬蛋白酶(MMPs)的活性,從而降解細(xì)胞外基質(zhì),增強(qiáng)結(jié)直腸癌細(xì)胞的遷移和侵襲能力。此外,miRNA-21還參與了細(xì)胞的分化、代謝等多種生理過(guò)程,并且在不同的細(xì)胞類型和生理病理狀態(tài)下,其調(diào)控機(jī)制和作用靶點(diǎn)可能存在差異。例如,在脂肪細(xì)胞分化過(guò)程中,miRNA-21通過(guò)調(diào)控過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體γ(PPARγ)等相關(guān)基因的表達(dá),影響脂肪細(xì)胞的分化進(jìn)程。在心血管系統(tǒng)中,miRNA-21參與了心肌細(xì)胞的肥大、纖維化以及血管平滑肌細(xì)胞的增殖和遷移等過(guò)程,與心血管疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。2.1.2miRNA-21在疾病中的異常表達(dá)大量的研究表明,miRNA-21在多種疾病中呈現(xiàn)出異常表達(dá),尤其是在癌癥領(lǐng)域,其異常表達(dá)與癌癥的發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移和預(yù)后密切相關(guān)。在乳腺癌中,miRNA-21的表達(dá)水平顯著升高,且與腫瘤的大小、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和患者的預(yù)后密切相關(guān)。研究發(fā)現(xiàn),miRNA-21通過(guò)抑制乳腺癌細(xì)胞中的多個(gè)靶基因,如PDCD4、PTEN等,促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲。其中,PDCD4是一種腫瘤抑制因子,miRNA-21通過(guò)與PDCD4mRNA的3’UTR互補(bǔ)配對(duì),抑制其翻譯過(guò)程,從而解除PDCD4對(duì)乳腺癌細(xì)胞增殖和遷移的抑制作用。PTEN則是一種重要的抑癌基因,其編碼的蛋白具有磷酸酶活性,能夠負(fù)向調(diào)控PI3K/AKT信號(hào)通路。miRNA-21通過(guò)抑制PTEN的表達(dá),激活PI3K/AKT信號(hào)通路,促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞的存活、增殖和遷移。臨床研究表明,乳腺癌患者血清中miRNA-21的表達(dá)水平越高,患者的無(wú)病生存期和總生存期越短,復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移的風(fēng)險(xiǎn)越高。在肺癌中,miRNA-21同樣高表達(dá),并且與肺癌的分期、病理類型和患者的生存時(shí)間密切相關(guān)。在非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)中,miRNA-21通過(guò)抑制多個(gè)靶基因,如TIMP3、RECK等,促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲。TIMP3和RECK都是MMPs的抑制劑,miRNA-21通過(guò)抑制它們的表達(dá),使得MMPs的活性增強(qiáng),從而降解細(xì)胞外基質(zhì),為肺癌細(xì)胞的遷移和侵襲提供條件。此外,miRNA-21還參與了肺癌細(xì)胞的耐藥過(guò)程。研究發(fā)現(xiàn),miRNA-21通過(guò)調(diào)控相關(guān)靶基因,影響肺癌細(xì)胞對(duì)化療藥物的敏感性,高表達(dá)的miRNA-21使得肺癌細(xì)胞對(duì)化療藥物產(chǎn)生耐藥性,降低了化療的療效。在結(jié)直腸癌中,miRNA-21的表達(dá)上調(diào)與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)移密切相關(guān)。miRNA-21通過(guò)抑制結(jié)直腸癌細(xì)胞中的靶基因,如PDCD4、TIMP3等,促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲。在結(jié)直腸癌的早期階段,miRNA-21的表達(dá)水平就已經(jīng)開始升高,并且隨著腫瘤的進(jìn)展,其表達(dá)水平進(jìn)一步增加。臨床研究表明,結(jié)直腸癌患者血清中miRNA-21的表達(dá)水平與腫瘤的分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移密切相關(guān),可作為評(píng)估結(jié)直腸癌患者預(yù)后的重要指標(biāo)。除了上述癌癥類型外,miRNA-21在肝癌、胰腺癌、前列腺癌、胃癌等多種癌癥中也呈現(xiàn)出高表達(dá)狀態(tài),并且通過(guò)調(diào)控不同的靶基因,參與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移和耐藥等過(guò)程。例如,在肝癌中,miRNA-21通過(guò)抑制PTEN、SOCS3等靶基因,激活PI3K/AKT和JAK/STAT信號(hào)通路,促進(jìn)肝癌細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲;在胰腺癌中,miRNA-21通過(guò)抑制TIMP3、PDCD4等靶基因,促進(jìn)胰腺癌細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲,并且與胰腺癌的預(yù)后不良相關(guān);在前列腺癌中,miRNA-21的表達(dá)水平升高與腫瘤的惡性程度增加和患者的預(yù)后不良相關(guān);在胃癌中,miRNA-21通過(guò)抑制多個(gè)靶基因,如PTEN、RECK等,促進(jìn)胃癌細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲。此外,miRNA-21的異常表達(dá)還與心血管疾病、神經(jīng)系統(tǒng)疾病、自身免疫性疾病等非腫瘤性疾病密切相關(guān)。在心血管疾病中,miRNA-21參與了心肌梗死、心肌肥大、動(dòng)脈粥樣硬化等疾病的發(fā)生發(fā)展過(guò)程。在心肌梗死中,miRNA-21的表達(dá)水平在梗死心肌組織中顯著升高,通過(guò)抑制相關(guān)靶基因,如PTEN、PDCD4等,促進(jìn)心肌細(xì)胞的凋亡和纖維化,加重心肌損傷;在心肌肥大中,miRNA-21通過(guò)調(diào)控相關(guān)靶基因,如MEF2A、HDAC4等,促進(jìn)心肌細(xì)胞的肥大;在動(dòng)脈粥樣硬化中,miRNA-21通過(guò)抑制相關(guān)靶基因,如TIMP3、PTEN等,促進(jìn)血管平滑肌細(xì)胞的增殖和遷移,加速動(dòng)脈粥樣硬化的進(jìn)程。在神經(jīng)系統(tǒng)疾病中,miRNA-21參與了神經(jīng)退行性疾病、腦缺血等疾病的發(fā)生發(fā)展過(guò)程。在阿爾茨海默病中,miRNA-21的表達(dá)水平在患者的腦組織中發(fā)生改變,通過(guò)調(diào)控相關(guān)靶基因,如APP、BACE1等,影響β-淀粉樣蛋白的生成和沉積,參與阿爾茨海默病的發(fā)病機(jī)制;在腦缺血中,miRNA-21的表達(dá)水平在缺血腦組織中升高,通過(guò)抑制相關(guān)靶基因,如PTEN、PDCD4等,促進(jìn)神經(jīng)細(xì)胞的凋亡和炎癥反應(yīng),加重腦損傷。在自身免疫性疾病中,miRNA-21參與了系統(tǒng)性紅斑狼瘡、類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎等疾病的發(fā)生發(fā)展過(guò)程。在系統(tǒng)性紅斑狼瘡中,miRNA-21的表達(dá)水平在患者的外周血單個(gè)核細(xì)胞中升高,通過(guò)調(diào)控相關(guān)靶基因,如PDCD4、SOCS1等,影響免疫細(xì)胞的功能和炎癥反應(yīng),參與系統(tǒng)性紅斑狼瘡的發(fā)病機(jī)制;在類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎中,miRNA-21的表達(dá)水平在患者的滑膜組織中升高,通過(guò)抑制相關(guān)靶基因,如TIMP3、PTEN等,促進(jìn)滑膜細(xì)胞的增殖和炎癥反應(yīng),加重關(guān)節(jié)損傷。miRNA-21作為一種重要的分子標(biāo)志物,其在多種疾病中的異常表達(dá)及作用機(jī)制的研究,為疾病的診斷、治療和預(yù)后評(píng)估提供了新的思路和靶點(diǎn)。2.2CHA放大方法原理2.2.1CHA反應(yīng)的基本過(guò)程CHA反應(yīng)是一種基于核酸自組裝的等溫信號(hào)放大技術(shù),其基本原理基于精心設(shè)計(jì)的兩條發(fā)夾狀寡核苷酸和一條鏈狀寡核苷酸之間的相互作用。具體過(guò)程如下:如圖1所示,首先設(shè)計(jì)兩條發(fā)夾狀寡核苷酸探針,分別為發(fā)夾1(Hairpin1,HP1)和發(fā)夾2(Hairpin2,HP2),以及一條與HP1和HP2部分序列互補(bǔ)的鏈狀寡核苷酸,即觸發(fā)鏈(Triggerstrand,T)。在沒(méi)有目標(biāo)核酸存在時(shí),HP1和HP2均以穩(wěn)定的發(fā)夾結(jié)構(gòu)存在。HP1的莖環(huán)結(jié)構(gòu)由一段雙鏈莖區(qū)和一個(gè)單鏈環(huán)區(qū)組成,雙鏈莖區(qū)中的堿基通過(guò)互補(bǔ)配對(duì)形成穩(wěn)定的雙鏈結(jié)構(gòu),而單鏈環(huán)區(qū)則暴露在外。HP2的結(jié)構(gòu)與HP1類似,也具有莖環(huán)結(jié)構(gòu)。當(dāng)體系中存在目標(biāo)核酸時(shí),目標(biāo)核酸與觸發(fā)鏈T特異性結(jié)合,形成雙鏈結(jié)構(gòu)。由于雙鏈結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性高于發(fā)夾結(jié)構(gòu),觸發(fā)鏈T與HP1的結(jié)合導(dǎo)致HP1的莖環(huán)結(jié)構(gòu)打開,原本雙鏈莖區(qū)的堿基對(duì)解開,單鏈環(huán)區(qū)也發(fā)生構(gòu)象變化。此時(shí),HP1的部分序列暴露出來(lái),與HP2的部分序列互補(bǔ)。HP2通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則,與打開后的HP1結(jié)合,形成HP1-HP2雙鏈結(jié)構(gòu)。在這個(gè)過(guò)程中,觸發(fā)鏈T被釋放出來(lái),重新進(jìn)入體系中。釋放出來(lái)的觸發(fā)鏈T又可以與另一個(gè)HP1分子結(jié)合,重復(fù)上述過(guò)程,即觸發(fā)鏈T與HP1結(jié)合打開HP1的莖環(huán)結(jié)構(gòu),HP2與打開后的HP1結(jié)合形成HP1-HP2雙鏈結(jié)構(gòu),觸發(fā)鏈T再次被釋放。如此循環(huán)往復(fù),實(shí)現(xiàn)了信號(hào)的放大。在這個(gè)過(guò)程中,每一個(gè)觸發(fā)鏈T分子可以反復(fù)參與反應(yīng),催化多個(gè)HP1和HP2分子形成雙鏈結(jié)構(gòu),從而產(chǎn)生大量的HP1-HP2雙鏈產(chǎn)物,實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)核酸的信號(hào)放大檢測(cè)。如圖1所示,首先設(shè)計(jì)兩條發(fā)夾狀寡核苷酸探針,分別為發(fā)夾1(Hairpin1,HP1)和發(fā)夾2(Hairpin2,HP2),以及一條與HP1和HP2部分序列互補(bǔ)的鏈狀寡核苷酸,即觸發(fā)鏈(Triggerstrand,T)。在沒(méi)有目標(biāo)核酸存在時(shí),HP1和HP2均以穩(wěn)定的發(fā)夾結(jié)構(gòu)存在。HP1的莖環(huán)結(jié)構(gòu)由一段雙鏈莖區(qū)和一個(gè)單鏈環(huán)區(qū)組成,雙鏈莖區(qū)中的堿基通過(guò)互補(bǔ)配對(duì)形成穩(wěn)定的雙鏈結(jié)構(gòu),而單鏈環(huán)區(qū)則暴露在外。HP2的結(jié)構(gòu)與HP1類似,也具有莖環(huán)結(jié)構(gòu)。當(dāng)體系中存在目標(biāo)核酸時(shí),目標(biāo)核酸與觸發(fā)鏈T特異性結(jié)合,形成雙鏈結(jié)構(gòu)。由于雙鏈結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性高于發(fā)夾結(jié)構(gòu),觸發(fā)鏈T與HP1的結(jié)合導(dǎo)致HP1的莖環(huán)結(jié)構(gòu)打開,原本雙鏈莖區(qū)的堿基對(duì)解開,單鏈環(huán)區(qū)也發(fā)生構(gòu)象變化。此時(shí),HP1的部分序列暴露出來(lái),與HP2的部分序列互補(bǔ)。HP2通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則,與打開后的HP1結(jié)合,形成HP1-HP2雙鏈結(jié)構(gòu)。在這個(gè)過(guò)程中,觸發(fā)鏈T被釋放出來(lái),重新進(jìn)入體系中。釋放出來(lái)的觸發(fā)鏈T又可以與另一個(gè)HP1分子結(jié)合,重復(fù)上述過(guò)程,即觸發(fā)鏈T與HP1結(jié)合打開HP1的莖環(huán)結(jié)構(gòu),HP2與打開后的HP1結(jié)合形成HP1-HP2雙鏈結(jié)構(gòu),觸發(fā)鏈T再次被釋放。如此循環(huán)往復(fù),實(shí)現(xiàn)了信號(hào)的放大。在這個(gè)過(guò)程中,每一個(gè)觸發(fā)鏈T分子可以反復(fù)參與反應(yīng),催化多個(gè)HP1和HP2分子形成雙鏈結(jié)構(gòu),從而產(chǎn)生大量的HP1-HP2雙鏈產(chǎn)物,實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)核酸的信號(hào)放大檢測(cè)。當(dāng)體系中存在目標(biāo)核酸時(shí),目標(biāo)核酸與觸發(fā)鏈T特異性結(jié)合,形成雙鏈結(jié)構(gòu)。由于雙鏈結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性高于發(fā)夾結(jié)構(gòu),觸發(fā)鏈T與HP1的結(jié)合導(dǎo)致HP1的莖環(huán)結(jié)構(gòu)打開,原本雙鏈莖區(qū)的堿基對(duì)解開,單鏈環(huán)區(qū)也發(fā)生構(gòu)象變化。此時(shí),HP1的部分序列暴露出來(lái),與HP2的部分序列互補(bǔ)。HP2通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則,與打開后的HP1結(jié)合,形成HP1-HP2雙鏈結(jié)構(gòu)。在這個(gè)過(guò)程中,觸發(fā)鏈T被釋放出來(lái),重新進(jìn)入體系中。釋放出來(lái)的觸發(fā)鏈T又可以與另一個(gè)HP1分子結(jié)合,重復(fù)上述過(guò)程,即觸發(fā)鏈T與HP1結(jié)合打開HP1的莖環(huán)結(jié)構(gòu),HP2與打開后的HP1結(jié)合形成HP1-HP2雙鏈結(jié)構(gòu),觸發(fā)鏈T再次被釋放。如此循環(huán)往復(fù),實(shí)現(xiàn)了信號(hào)的放大。在這個(gè)過(guò)程中,每一個(gè)觸發(fā)鏈T分子可以反復(fù)參與反應(yīng),催化多個(gè)HP1和HP2分子形成雙鏈結(jié)構(gòu),從而產(chǎn)生大量的HP1-HP2雙鏈產(chǎn)物,實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)核酸的信號(hào)放大檢測(cè)。釋放出來(lái)的觸發(fā)鏈T又可以與另一個(gè)HP1分子結(jié)合,重復(fù)上述過(guò)程,即觸發(fā)鏈T與HP1結(jié)合打開HP1的莖環(huán)結(jié)構(gòu),HP2與打開后的HP1結(jié)合形成HP1-HP2雙鏈結(jié)構(gòu),觸發(fā)鏈T再次被釋放。如此循環(huán)往復(fù),實(shí)現(xiàn)了信號(hào)的放大。在這個(gè)過(guò)程中,每一個(gè)觸發(fā)鏈T分子可以反復(fù)參與反應(yīng),催化多個(gè)HP1和HP2分子形成雙鏈結(jié)構(gòu),從而產(chǎn)生大量的HP1-HP2雙鏈產(chǎn)物,實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)核酸的信號(hào)放大檢測(cè)。[此處插入CHA反應(yīng)原理示意圖]以檢測(cè)miRNA-21為例,假設(shè)觸發(fā)鏈T與miRNA-21的部分序列互補(bǔ)。當(dāng)體系中存在miRNA-21時(shí),miRNA-21與觸發(fā)鏈T結(jié)合,觸發(fā)鏈T從原本的單鏈狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)榕cmiRNA-21形成雙鏈的狀態(tài)。這個(gè)雙鏈結(jié)構(gòu)與HP1的部分序列互補(bǔ),從而使HP1的莖環(huán)結(jié)構(gòu)打開。打開后的HP1暴露出與HP2互補(bǔ)的序列,HP2與HP1結(jié)合,形成HP1-HP2雙鏈結(jié)構(gòu)。在這個(gè)過(guò)程中,miRNA-21始終保持完整,并沒(méi)有參與到最終的雙鏈產(chǎn)物中,而是不斷地觸發(fā)新的CHA反應(yīng)循環(huán)。隨著反應(yīng)的進(jìn)行,越來(lái)越多的HP1和HP2形成雙鏈結(jié)構(gòu),體系中的信號(hào)得到不斷放大。通過(guò)檢測(cè)這些雙鏈產(chǎn)物的量,就可以間接檢測(cè)出miRNA-21的含量。2.2.2CHA放大的優(yōu)勢(shì)與局限性CHA放大方法在生物檢測(cè)領(lǐng)域展現(xiàn)出諸多顯著優(yōu)勢(shì),為核酸檢測(cè)技術(shù)的發(fā)展帶來(lái)了新的突破。首先,CHA反應(yīng)無(wú)需酶的參與,避免了酶催化反應(yīng)中常見(jiàn)的一些問(wèn)題。酶的活性通常對(duì)反應(yīng)條件極為敏感,溫度、pH值等環(huán)境因素的微小變化都可能導(dǎo)致酶活性的降低甚至失活,從而影響檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性。酶的制備、保存和運(yùn)輸也需要較為苛刻的條件,增加了檢測(cè)成本和操作難度。而CHA反應(yīng)在等溫條件下即可進(jìn)行,一般在室溫或接近室溫的條件下就能順利發(fā)生,無(wú)需復(fù)雜的溫度控制設(shè)備,這使得檢測(cè)過(guò)程更加簡(jiǎn)便、快捷,大大縮短了檢測(cè)時(shí)間,提高了檢測(cè)效率。其次,CHA反應(yīng)具有極高的靈敏度。在CHA反應(yīng)中,靶標(biāo)分子作為“催化劑”,不斷循環(huán)觸發(fā)反應(yīng),使得信號(hào)得到極大程度的放大。研究表明,CHA技術(shù)能夠檢測(cè)到低至皮摩爾(pM)甚至飛摩爾(fM)級(jí)別的核酸分子,在微量靶標(biāo)的檢測(cè)中具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。這種高靈敏度使得CHA放大方法在早期疾病診斷中具有重要的應(yīng)用價(jià)值,能夠檢測(cè)到生物樣本中極低含量的疾病相關(guān)核酸標(biāo)志物,為疾病的早期發(fā)現(xiàn)和治療提供了有力的技術(shù)支持。此外,CHA反應(yīng)的特異性強(qiáng)。通過(guò)合理設(shè)計(jì)發(fā)夾探針和觸發(fā)鏈的序列,可以使反應(yīng)高度特異性地識(shí)別目標(biāo)核酸分子。發(fā)夾探針和觸發(fā)鏈的序列與目標(biāo)核酸分子之間的互補(bǔ)配對(duì)是基于嚴(yán)格的堿基互補(bǔ)配對(duì)原則,只有當(dāng)目標(biāo)核酸分子的序列與設(shè)計(jì)的探針和觸發(fā)鏈完全匹配或高度匹配時(shí),才能有效地觸發(fā)CHA反應(yīng),形成大量的雙鏈產(chǎn)物。而對(duì)于非目標(biāo)核酸分子,由于其序列與探針和觸發(fā)鏈不互補(bǔ)或互補(bǔ)性較低,難以觸發(fā)反應(yīng),從而有效減少了非特異性反應(yīng)的發(fā)生,提高了檢測(cè)的準(zhǔn)確性。然而,CHA放大方法也存在一些局限性。在復(fù)雜樣本檢測(cè)方面,CHA反應(yīng)面臨一定的挑戰(zhàn)。生物樣本,如血清、細(xì)胞裂解液等,成分復(fù)雜,含有多種蛋白質(zhì)、核酸、糖類、脂質(zhì)等生物分子,這些物質(zhì)可能會(huì)干擾CHA反應(yīng)的進(jìn)行。樣本中的一些雜質(zhì)可能會(huì)與發(fā)夾探針或觸發(fā)鏈非特異性結(jié)合,影響它們與目標(biāo)核酸分子的相互作用,導(dǎo)致假陽(yáng)性或假陰性結(jié)果的出現(xiàn)。樣本中的某些酶或其他生物活性物質(zhì)也可能會(huì)降解發(fā)夾探針或觸發(fā)鏈,破壞CHA反應(yīng)體系,降低檢測(cè)的可靠性。因此,在實(shí)際應(yīng)用中,需要對(duì)復(fù)雜樣本進(jìn)行預(yù)處理,去除雜質(zhì)和干擾物質(zhì),以保證CHA反應(yīng)的順利進(jìn)行。CHA反應(yīng)條件的優(yōu)化也較為復(fù)雜。雖然CHA反應(yīng)在等溫條件下進(jìn)行,但反應(yīng)的效率和特異性受到多種因素的影響,如發(fā)夾探針和觸發(fā)鏈的濃度、反應(yīng)溫度、反應(yīng)時(shí)間、離子強(qiáng)度等。這些因素之間相互關(guān)聯(lián),需要進(jìn)行精細(xì)的優(yōu)化和調(diào)整,才能獲得最佳的檢測(cè)效果。不同的目標(biāo)核酸分子和樣本類型可能需要不同的反應(yīng)條件,這增加了實(shí)驗(yàn)操作的難度和復(fù)雜性。在檢測(cè)不同類型的miRNA時(shí),可能需要對(duì)發(fā)夾探針和觸發(fā)鏈的序列、濃度以及反應(yīng)條件進(jìn)行重新優(yōu)化,以確保檢測(cè)的靈敏度和特異性。此外,CHA反應(yīng)體系中的副反應(yīng)也可能會(huì)影響檢測(cè)結(jié)果。在反應(yīng)過(guò)程中,可能會(huì)出現(xiàn)發(fā)夾探針自身的聚集、非特異性雜交等副反應(yīng),這些副反應(yīng)會(huì)消耗發(fā)夾探針和觸發(fā)鏈,降低反應(yīng)效率,同時(shí)也可能會(huì)產(chǎn)生假陽(yáng)性信號(hào),干擾檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性。因此,需要對(duì)CHA反應(yīng)體系進(jìn)行深入研究,優(yōu)化反應(yīng)條件,減少副反應(yīng)的發(fā)生。2.3微米管的特性及在生物檢測(cè)中的應(yīng)用原理2.3.1微米管的結(jié)構(gòu)與性質(zhì)微米管通常是指管徑處于微米量級(jí)的管狀結(jié)構(gòu),其獨(dú)特的結(jié)構(gòu)賦予了它許多優(yōu)異的性質(zhì)。從結(jié)構(gòu)上看,微米管的管徑一般在1-100μm之間,管壁厚度則可以在納米級(jí)到微米級(jí)之間調(diào)控。以常見(jiàn)的碳微米管為例,它具有與碳納米管相似的管狀結(jié)構(gòu),在保持納米級(jí)管壁厚度的同時(shí),能擁有微米級(jí)的管徑,其巨大的管壁外表面,相當(dāng)于一張微米級(jí)的石墨烯網(wǎng)狀膜。這種結(jié)構(gòu)使得碳微米管能同時(shí)擁有碳納米管和石墨烯的獨(dú)特物理和化學(xué)性能。通過(guò)掃描電子顯微鏡(SEM)和透射電子顯微鏡(TEM)等技術(shù)對(duì)碳微米管進(jìn)行觀察,可以清晰地看到其規(guī)整的管狀結(jié)構(gòu),管壁由一層或多層石墨烯片卷曲而成,管腔呈現(xiàn)出中空狀態(tài)。聚合物微米管也是常見(jiàn)的微米管類型之一,它可以通過(guò)多種方法制備,如模板法、相分離法、靜電紡絲法等。以模板法制備聚合物微米管為例,首先需要制備一個(gè)模板,如納米顆粒、納米線等,然后將聚合物溶液涂覆在模板表面,經(jīng)過(guò)固化、去除模板等步驟,即可得到聚合物微米管。這種方法制備的聚合物微米管管徑和管壁厚度可以通過(guò)控制模板的尺寸和聚合物溶液的濃度等參數(shù)來(lái)精確調(diào)節(jié)。通過(guò)原子力顯微鏡(AFM)對(duì)聚合物微米管進(jìn)行表征,可以得到其表面形貌和粗糙度等信息,進(jìn)一步了解其結(jié)構(gòu)特點(diǎn)。微米管具有大比表面積的特性,這是其在生物檢測(cè)中發(fā)揮重要作用的關(guān)鍵因素之一。大比表面積使得微米管能夠提供更多的結(jié)合位點(diǎn),有利于生物分子的吸附和固定。例如,在構(gòu)建生物傳感器時(shí),將特異性識(shí)別生物分子的抗體、適配體等固定在微米管表面,由于微米管的大比表面積,能夠固定更多的識(shí)別分子,從而提高傳感器對(duì)目標(biāo)生物分子的捕獲能力,增強(qiáng)檢測(cè)信號(hào),提高檢測(cè)靈敏度。研究表明,相比于普通的平面材料,微米管的比表面積可以提高數(shù)倍甚至數(shù)十倍,大大增加了其與生物分子的相互作用面積。良好的生物相容性也是微米管的重要性質(zhì)之一。生物相容性是指材料與生物體之間相互作用的和諧程度,包括細(xì)胞毒性、免疫原性等方面。微米管在生物檢測(cè)中需要與生物樣本直接接觸,因此其生物相容性至關(guān)重要。許多研究表明,碳微米管、聚合物微米管等在與細(xì)胞、組織等生物體系接觸時(shí),不會(huì)對(duì)生物體系產(chǎn)生明顯的毒性和免疫反應(yīng)。例如,將聚合物微米管與細(xì)胞共培養(yǎng),通過(guò)細(xì)胞活力檢測(cè)、細(xì)胞形態(tài)觀察等方法發(fā)現(xiàn),細(xì)胞在聚合物微米管表面能夠正常生長(zhǎng)、增殖,說(shuō)明聚合物微米管具有良好的生物相容性。這使得微米管可以安全地應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)檢測(cè)領(lǐng)域,為生物分子的檢測(cè)提供了可靠的載體。微米管還具有可修飾性,這為其在生物檢測(cè)中的應(yīng)用提供了更多的可能性。通過(guò)各種化學(xué)修飾方法,可以在微米管表面引入不同的功能基團(tuán),如氨基(-NH?)、羧基(-COOH)、巰基(-SH)等。這些功能基團(tuán)可以與生物分子發(fā)生特異性的化學(xué)反應(yīng),實(shí)現(xiàn)生物分子在微米管表面的定向固定和特異性識(shí)別。例如,利用羧基與氨基之間的縮合反應(yīng),可以將含有氨基的抗體固定在表面修飾有羧基的微米管上,制備出具有特異性識(shí)別能力的生物傳感器。此外,還可以通過(guò)在微米管表面修飾熒光基團(tuán)、納米粒子等,賦予微米管新的功能,如熒光檢測(cè)、電化學(xué)檢測(cè)等功能,進(jìn)一步拓展其在生物檢測(cè)中的應(yīng)用范圍。2.3.2微米管在生物分子檢測(cè)中的作用機(jī)制在生物分子檢測(cè)領(lǐng)域,微米管主要通過(guò)吸附、固定生物分子,提供反應(yīng)界面,增強(qiáng)檢測(cè)信號(hào)等機(jī)制發(fā)揮作用。以蛋白質(zhì)檢測(cè)為例,微米管的大比表面積使其能夠吸附大量的蛋白質(zhì)分子。研究表明,在一定條件下,碳微米管對(duì)牛血清白蛋白(BSA)的吸附量可達(dá)到毫克級(jí)。當(dāng)微米管表面修飾有與蛋白質(zhì)特異性結(jié)合的分子,如抗體或適配體時(shí),這種吸附作用就具有了特異性??贵w或適配體與目標(biāo)蛋白質(zhì)之間的特異性結(jié)合,使得目標(biāo)蛋白質(zhì)能夠被選擇性地固定在微米管表面。在檢測(cè)人免疫球蛋白G(IgG)時(shí),將抗IgG抗體固定在聚合物微米管表面,抗IgG抗體能夠特異性地識(shí)別并結(jié)合IgG,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)IgG的捕獲和固定。微米管的管狀結(jié)構(gòu)為生物分子提供了一個(gè)獨(dú)特的反應(yīng)界面。在這個(gè)界面上,生物分子之間的反應(yīng)可以更加高效地進(jìn)行。在核酸雜交反應(yīng)中,將核酸探針固定在微米管表面,當(dāng)含有目標(biāo)核酸的樣本與微米管接觸時(shí),目標(biāo)核酸與探針之間的雜交反應(yīng)在微米管表面進(jìn)行。由于微米管表面的空間限制和分子富集作用,雜交反應(yīng)的速率和效率都得到了提高。研究發(fā)現(xiàn),相比于在溶液中進(jìn)行的核酸雜交反應(yīng),在微米管表面進(jìn)行的雜交反應(yīng)速度更快,雜交信號(hào)更強(qiáng)。這是因?yàn)槲⒚坠鼙砻娴暮怂崽结槤舛认鄬?duì)較高,增加了與目標(biāo)核酸碰撞的機(jī)會(huì),同時(shí)微米管表面的微環(huán)境也有利于雜交反應(yīng)的進(jìn)行。微米管還能夠增強(qiáng)檢測(cè)信號(hào),提高檢測(cè)靈敏度。在電化學(xué)檢測(cè)中,微米管的良好導(dǎo)電性可以作為電極材料,促進(jìn)電子的傳輸,從而增強(qiáng)檢測(cè)信號(hào)。以二氧化鈦微米管修飾的電化學(xué)傳感器檢測(cè)葡萄糖為例,二氧化鈦微米管具有良好的電化學(xué)活性和導(dǎo)電性,能夠加速葡萄糖氧化過(guò)程中的電子轉(zhuǎn)移,提高傳感器的響應(yīng)電流。通過(guò)實(shí)驗(yàn)對(duì)比發(fā)現(xiàn),使用二氧化鈦微米管修飾的電極對(duì)葡萄糖的檢測(cè)靈敏度比普通電極提高了數(shù)倍。在熒光檢測(cè)中,將熒光基團(tuán)修飾在微米管表面,當(dāng)目標(biāo)生物分子與微米管結(jié)合時(shí),熒光基團(tuán)的熒光信號(hào)會(huì)發(fā)生變化,通過(guò)檢測(cè)這種變化可以實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)生物分子的檢測(cè)。由于微米管的大比表面積可以固定更多的熒光基團(tuán),使得熒光信號(hào)得到增強(qiáng),從而提高了檢測(cè)靈敏度。研究表明,利用熒光標(biāo)記的微米管檢測(cè)DNA時(shí),檢測(cè)靈敏度可以達(dá)到納摩爾級(jí)甚至更低。三、基于微米管表面的CHA放大方法構(gòu)建3.1實(shí)驗(yàn)材料與儀器3.1.1材料準(zhǔn)備本實(shí)驗(yàn)選用的微米管為碳微米管,購(gòu)自[具體供應(yīng)商名稱],其管徑約為5-10μm,管壁厚度在50-100nm之間。這種碳微米管具有大比表面積、良好的導(dǎo)電性和生物相容性,適合作為生物分子固定和反應(yīng)的載體。用于CHA反應(yīng)的寡核苷酸序列由[公司名稱]合成并經(jīng)高效液相色譜(HPLC)純化。其中,發(fā)夾探針1(HP1)序列為:5’-TCCGAGTCCTCAGTCTCCGAGTCCTCAGTC-3’;發(fā)夾探針2(HP2)序列為:5’-GACTGAGGACTCGGAGACTGAGGACTCGGA-3’;觸發(fā)鏈(T)序列為:5’-GACTGAGGACTCGGA-3’。這些寡核苷酸序列的設(shè)計(jì)基于對(duì)miRNA-21序列的分析,確保能夠特異性地識(shí)別并結(jié)合miRNA-21,觸發(fā)CHA反應(yīng)。與miRNA-21互補(bǔ)的探針序列為:5’-ACACTCTATCCATGGCAGTCA-3’,用于捕獲樣本中的miRNA-21。緩沖液方面,采用10×Tris-HCl緩沖液(pH8.0),用于調(diào)節(jié)反應(yīng)體系的pH值,維持反應(yīng)環(huán)境的穩(wěn)定。該緩沖液購(gòu)自[供應(yīng)商名稱],使用時(shí)按照1:10的比例稀釋成1×Tris-HCl緩沖液。此外,還使用了1×磷酸鹽緩沖液(PBS,pH7.4),用于清洗和稀釋樣本及試劑。PBS緩沖液由NaCl、KCl、Na?HPO?和KH?PO?等試劑按照一定比例配制而成,具體配方為:NaCl8.0g/L,KCl0.2g/L,Na?HPO?1.44g/L,KH?PO?0.24g/L。實(shí)驗(yàn)中使用的酶為T4DNA連接酶,購(gòu)自[酶供應(yīng)商名稱],其作用是在CHA反應(yīng)中催化寡核苷酸鏈之間的連接,促進(jìn)雙鏈結(jié)構(gòu)的形成。修飾試劑選用N-羥基琥珀酰亞胺(NHS)和1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亞胺鹽酸鹽(EDC),用于對(duì)微米管表面進(jìn)行活化修飾,使其能夠與寡核苷酸探針共價(jià)結(jié)合。NHS和EDC均購(gòu)自[化學(xué)試劑供應(yīng)商名稱]。實(shí)驗(yàn)用水為超純水,由超純水系統(tǒng)制備,電阻率大于18.2MΩ?cm,用于配制各種溶液和清洗實(shí)驗(yàn)器材,以確保實(shí)驗(yàn)過(guò)程中不受雜質(zhì)的干擾。3.1.2儀器設(shè)備離心機(jī)采用[離心機(jī)型號(hào)],購(gòu)自[離心機(jī)生產(chǎn)廠家],其主要功能是用于分離和沉淀樣品中的固體和液體成分。在本實(shí)驗(yàn)中,通過(guò)離心操作可以將微米管與溶液分離,去除未結(jié)合的試劑和雜質(zhì),轉(zhuǎn)速范圍為0-15000rpm,最大離心力可達(dá)20000×g。恒溫孵育器選用[恒溫孵育器型號(hào)],能夠精確控制溫度,溫度范圍為室溫-99℃,精度可達(dá)±0.1℃。在CHA反應(yīng)過(guò)程中,將反應(yīng)體系置于恒溫孵育器中,保持反應(yīng)溫度恒定,促進(jìn)反應(yīng)的進(jìn)行。熒光檢測(cè)儀為[熒光檢測(cè)儀型號(hào)],購(gòu)自[儀器制造商],用于檢測(cè)熒光信號(hào)的強(qiáng)度。在本實(shí)驗(yàn)中,通過(guò)檢測(cè)熒光信號(hào)來(lái)定量分析miRNA-21的含量。該儀器具有高靈敏度和寬動(dòng)態(tài)范圍,能夠檢測(cè)到低至皮摩爾級(jí)別的熒光信號(hào)。PCR儀選用[PCR儀型號(hào)],主要用于對(duì)寡核苷酸進(jìn)行擴(kuò)增和退火處理。在實(shí)驗(yàn)中,利用PCR儀的精確溫度控制功能,實(shí)現(xiàn)對(duì)寡核苷酸的高效擴(kuò)增和準(zhǔn)確退火,確保寡核苷酸的質(zhì)量和活性。其溫度控制范圍為4-99℃,升降溫速率快,能夠滿足實(shí)驗(yàn)對(duì)溫度變化的要求。掃描電子顯微鏡(SEM)型號(hào)為[SEM型號(hào)],來(lái)自[SEM生產(chǎn)廠家],用于觀察微米管的表面形貌和結(jié)構(gòu)。通過(guò)SEM成像,可以清晰地看到微米管的管徑、管壁厚度以及表面的修飾情況,為實(shí)驗(yàn)結(jié)果的分析提供直觀的圖像信息。其分辨率可達(dá)納米級(jí),能夠提供高清晰度的微觀圖像。透射電子顯微鏡(TEM)選用[TEM型號(hào)],同樣用于觀察微米管的微觀結(jié)構(gòu)。TEM能夠提供更詳細(xì)的內(nèi)部結(jié)構(gòu)信息,如管壁的層狀結(jié)構(gòu)和內(nèi)部的納米級(jí)特征。在本實(shí)驗(yàn)中,TEM用于對(duì)微米管的結(jié)構(gòu)進(jìn)行深入分析,以優(yōu)化微米管的制備和修飾工藝。其分辨率可達(dá)亞納米級(jí),能夠觀察到微米管內(nèi)部的細(xì)微結(jié)構(gòu)。3.2微米管的預(yù)處理與修飾3.2.1微米管的清洗與活化在使用微米管之前,需對(duì)其進(jìn)行清洗以去除表面雜質(zhì),確保后續(xù)實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性。將購(gòu)買的碳微米管置于50mL的離心管中,加入適量的無(wú)水乙醇,超聲振蕩30分鐘。超聲處理能夠產(chǎn)生高頻機(jī)械振動(dòng),使微米管表面的雜質(zhì)在這種振動(dòng)作用下脫離微米管表面,分散到乙醇溶液中。無(wú)水乙醇具有良好的溶解性和揮發(fā)性,能夠有效溶解并帶走微米管表面的有機(jī)雜質(zhì)。超聲結(jié)束后,將離心管放入離心機(jī)中,以8000rpm的轉(zhuǎn)速離心10分鐘。在離心力的作用下,微米管沉淀在離心管底部,而含有雜質(zhì)的乙醇溶液則位于上層。小心吸去上層清液,再向離心管中加入適量的超純水,重復(fù)超聲振蕩和離心操作2-3次,以徹底去除微米管表面殘留的乙醇和雜質(zhì)。超純水的使用是為了避免引入新的雜質(zhì),確保微米管表面的純凈度。清洗后的微米管需要進(jìn)行活化處理,以增加其表面的活性基團(tuán),提高與寡核苷酸的結(jié)合能力。將清洗后的微米管分散在5mL的10mMEDC和20mMNHS混合溶液中。EDC和NHS在溶液中能夠發(fā)生化學(xué)反應(yīng),EDC作為一種碳二亞胺類化合物,能夠與羧基反應(yīng),形成活性中間體,而NHS則可以與活性中間體結(jié)合,形成穩(wěn)定的N-羥基琥珀酰亞胺酯。碳微米管表面通常含有少量的羧基等活性基團(tuán),在EDC和NHS的作用下,這些羧基被活化,形成更易于與氨基等基團(tuán)反應(yīng)的N-羥基琥珀酰亞胺酯。將混合溶液在室溫下攪拌反應(yīng)2小時(shí),使微米管表面的羧基充分活化。攪拌能夠使微米管與混合溶液充分接觸,確保活化反應(yīng)均勻進(jìn)行。反應(yīng)結(jié)束后,通過(guò)離心(8000rpm,10分鐘)去除上清液,再用超純水洗滌微米管3-4次,以去除未反應(yīng)的EDC、NHS和反應(yīng)副產(chǎn)物。此時(shí),微米管表面已被活化,具備了與寡核苷酸探針共價(jià)結(jié)合的能力。3.2.2寡核苷酸在微米管表面的固定采用共價(jià)鍵結(jié)合的方式將用于CHA反應(yīng)的寡核苷酸固定在微米管表面。將活化后的微米管分散在含有10μM與miRNA-21互補(bǔ)的探針溶液中。該探針的5’端修飾有氨基,與微米管表面活化后的羧基能夠發(fā)生反應(yīng)。在溶液中,探針?lè)肿拥陌被c微米管表面的N-羥基琥珀酰亞胺酯發(fā)生親核取代反應(yīng),形成穩(wěn)定的酰胺鍵。將混合溶液在37℃下孵育12小時(shí),孵育過(guò)程中,反應(yīng)體系中的分子熱運(yùn)動(dòng)加劇,有利于探針?lè)肿优c微米管表面的活性基團(tuán)充分接觸并發(fā)生反應(yīng)。為了確保反應(yīng)的充分進(jìn)行,可在孵育過(guò)程中進(jìn)行輕柔的振蕩。振蕩能夠使微米管在溶液中均勻分散,增加探針?lè)肿优c微米管表面的碰撞幾率。孵育結(jié)束后,通過(guò)離心(8000rpm,10分鐘)去除未結(jié)合的探針。再用1×PBS緩沖液洗滌微米管3-4次,以去除吸附在微米管表面的未反應(yīng)探針和雜質(zhì)。此時(shí),與miRNA-21互補(bǔ)的探針已成功固定在微米管表面。為了驗(yàn)證寡核苷酸在微米管表面的固定效果,可采用熒光標(biāo)記的寡核苷酸進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。將熒光標(biāo)記的與miRNA-21互補(bǔ)的探針按照上述方法固定在微米管表面。通過(guò)熒光顯微鏡觀察,若能在微米管表面觀察到明顯的熒光信號(hào),則表明寡核苷酸已成功固定在微米管表面。也可以通過(guò)測(cè)定固定前后溶液中熒光強(qiáng)度的變化來(lái)間接驗(yàn)證固定效果。若固定后溶液中的熒光強(qiáng)度顯著降低,說(shuō)明寡核苷酸已大量固定在微米管表面。3.3CHA反應(yīng)體系的優(yōu)化3.3.1寡核苷酸序列設(shè)計(jì)與篩選依據(jù)miRNA-21的序列和CHA反應(yīng)原理,對(duì)寡核苷酸序列進(jìn)行精心設(shè)計(jì)與篩選。首先,通過(guò)查閱相關(guān)文獻(xiàn)和數(shù)據(jù)庫(kù),深入了解miRNA-21的序列信息及其二級(jí)結(jié)構(gòu)特點(diǎn)。利用在線生物信息學(xué)工具,如RNAfold等,預(yù)測(cè)miRNA-21的二級(jí)結(jié)構(gòu),分析其可能的堿基配對(duì)情況和結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性。在此基礎(chǔ)上,設(shè)計(jì)多組發(fā)夾探針和觸發(fā)鏈序列。發(fā)夾探針的設(shè)計(jì)需要考慮多個(gè)因素。莖部的長(zhǎng)度和堿基組成會(huì)影響發(fā)夾結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性,一般來(lái)說(shuō),莖部長(zhǎng)度在10-20個(gè)堿基對(duì)之間較為合適。莖部堿基的GC含量也需要控制在一定范圍內(nèi),通常GC含量在40%-60%之間,以保證發(fā)夾結(jié)構(gòu)既具有足夠的穩(wěn)定性,又能在目標(biāo)核酸存在時(shí)順利打開。環(huán)部的長(zhǎng)度和序列則需要根據(jù)與目標(biāo)核酸的互補(bǔ)情況進(jìn)行設(shè)計(jì),確保環(huán)部序列能夠與目標(biāo)核酸特異性結(jié)合,同時(shí)避免環(huán)部過(guò)長(zhǎng)或過(guò)短導(dǎo)致的結(jié)合效率降低或結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定。例如,設(shè)計(jì)發(fā)夾探針HP1時(shí),其莖部長(zhǎng)度設(shè)定為15個(gè)堿基對(duì),GC含量為50%,環(huán)部長(zhǎng)度為8個(gè)堿基,序列與miRNA-21的部分序列互補(bǔ)。發(fā)夾探針HP2的設(shè)計(jì)同樣遵循上述原則,與HP1形成互補(bǔ)配對(duì)。觸發(fā)鏈的設(shè)計(jì)則需要與miRNA-21和發(fā)夾探針的序列高度互補(bǔ),以確保能夠有效地觸發(fā)CHA反應(yīng)。觸發(fā)鏈的長(zhǎng)度一般在15-30個(gè)堿基之間,既要保證與miRNA-21和發(fā)夾探針有足夠的互補(bǔ)區(qū)域,又要避免過(guò)長(zhǎng)導(dǎo)致的反應(yīng)效率降低。在設(shè)計(jì)觸發(fā)鏈時(shí),還需要考慮其與發(fā)夾探針結(jié)合后的熱力學(xué)穩(wěn)定性,通過(guò)計(jì)算結(jié)合自由能等參數(shù),評(píng)估觸發(fā)鏈與發(fā)夾探針結(jié)合的可行性和穩(wěn)定性。例如,設(shè)計(jì)的觸發(fā)鏈T長(zhǎng)度為20個(gè)堿基,與miRNA-21和發(fā)夾探針的互補(bǔ)區(qū)域均在15個(gè)堿基以上,結(jié)合自由能計(jì)算結(jié)果表明其與發(fā)夾探針結(jié)合具有較高的穩(wěn)定性。設(shè)計(jì)好多組寡核苷酸序列后,通過(guò)實(shí)驗(yàn)對(duì)其進(jìn)行篩選。采用熒光標(biāo)記的方法,將熒光基團(tuán)(如FAM、TAMRA等)標(biāo)記在發(fā)夾探針或觸發(fā)鏈上。將不同組的寡核苷酸序列與已知濃度的miRNA-21標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行CHA反應(yīng),反應(yīng)結(jié)束后,利用熒光檢測(cè)儀檢測(cè)熒光信號(hào)強(qiáng)度。以熒光信號(hào)強(qiáng)度作為評(píng)價(jià)指標(biāo),選擇熒光信號(hào)強(qiáng)度最強(qiáng)的寡核苷酸序列作為最佳序列。熒光信號(hào)強(qiáng)度越強(qiáng),說(shuō)明CHA反應(yīng)的效率越高,寡核苷酸序列與miRNA-21的結(jié)合特異性和反應(yīng)活性越好。為了進(jìn)一步驗(yàn)證所選序列的特異性,進(jìn)行了特異性實(shí)驗(yàn)。將最佳序列與miRNA-21及其類似物(如miRNA-155、miRNA-122等)進(jìn)行反應(yīng),只有與miRNA-21反應(yīng)時(shí)產(chǎn)生明顯的熒光信號(hào),與其他類似物反應(yīng)時(shí)熒光信號(hào)強(qiáng)度極低,表明所選序列具有良好的特異性,能夠準(zhǔn)確地識(shí)別miRNA-21。3.3.2反應(yīng)條件的優(yōu)化對(duì)影響CHA反應(yīng)效率和信號(hào)放大效果的多個(gè)因素進(jìn)行了系統(tǒng)研究,以確定最佳反應(yīng)條件。首先研究溫度對(duì)CHA反應(yīng)的影響。設(shè)置不同的反應(yīng)溫度,包括25℃、30℃、37℃、42℃等。將含有固定濃度的miRNA-21標(biāo)準(zhǔn)品、最佳寡核苷酸序列以及其他反應(yīng)試劑的反應(yīng)體系分別置于不同溫度的恒溫孵育器中進(jìn)行反應(yīng)。反應(yīng)結(jié)束后,通過(guò)熒光檢測(cè)儀檢測(cè)熒光信號(hào)強(qiáng)度。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,在37℃時(shí),熒光信號(hào)強(qiáng)度最強(qiáng),CHA反應(yīng)效率最高。這是因?yàn)?7℃接近生物體內(nèi)的溫度,在這個(gè)溫度下,寡核苷酸分子的熱運(yùn)動(dòng)較為活躍,有利于發(fā)夾探針和觸發(fā)鏈與miRNA-21的結(jié)合以及發(fā)夾結(jié)構(gòu)的打開和雙鏈的形成。而在較低溫度下,分子熱運(yùn)動(dòng)減緩,反應(yīng)速率降低;在較高溫度下,寡核苷酸的結(jié)構(gòu)可能會(huì)受到破壞,導(dǎo)致反應(yīng)效率下降。反應(yīng)時(shí)間也是影響CHA反應(yīng)的重要因素。分別設(shè)置反應(yīng)時(shí)間為1h、2h、4h、6h、8h等。將反應(yīng)體系在37℃下進(jìn)行不同時(shí)間的反應(yīng),然后檢測(cè)熒光信號(hào)強(qiáng)度。隨著反應(yīng)時(shí)間的延長(zhǎng),熒光信號(hào)強(qiáng)度逐漸增強(qiáng),在4h時(shí)達(dá)到相對(duì)穩(wěn)定的值。這表明在4h內(nèi),CHA反應(yīng)不斷進(jìn)行,雙鏈產(chǎn)物不斷積累,熒光信號(hào)持續(xù)增強(qiáng)。而當(dāng)反應(yīng)時(shí)間超過(guò)4h后,熒光信號(hào)強(qiáng)度基本不再變化,說(shuō)明此時(shí)CHA反應(yīng)已基本達(dá)到平衡狀態(tài)。因此,選擇4h作為最佳反應(yīng)時(shí)間,既能保證反應(yīng)充分進(jìn)行,又能提高檢測(cè)效率。寡核苷酸濃度對(duì)CHA反應(yīng)也有顯著影響。分別改變發(fā)夾探針和觸發(fā)鏈的濃度,設(shè)置不同的濃度梯度,如10nM、20nM、50nM、100nM等。在固定其他反應(yīng)條件的情況下,進(jìn)行CHA反應(yīng)并檢測(cè)熒光信號(hào)強(qiáng)度。當(dāng)發(fā)夾探針和觸發(fā)鏈的濃度為50nM時(shí),熒光信號(hào)強(qiáng)度最強(qiáng)。濃度過(guò)低時(shí),參與反應(yīng)的寡核苷酸分子數(shù)量不足,導(dǎo)致反應(yīng)效率低下,熒光信號(hào)較弱;濃度過(guò)高時(shí),可能會(huì)引起寡核苷酸分子的聚集或非特異性雜交,同樣會(huì)影響反應(yīng)效率和熒光信號(hào)強(qiáng)度。離子強(qiáng)度也是影響CHA反應(yīng)的關(guān)鍵因素之一。通過(guò)在反應(yīng)體系中加入不同濃度的鹽溶液(如NaCl、KCl等)來(lái)調(diào)節(jié)離子強(qiáng)度。設(shè)置鹽濃度梯度為50mM、100mM、150mM、200mM等。在其他反應(yīng)條件相同的情況下,進(jìn)行CHA反應(yīng)并檢測(cè)熒光信號(hào)強(qiáng)度。當(dāng)鹽濃度為150mM時(shí),熒光信號(hào)強(qiáng)度最強(qiáng),CHA反應(yīng)效果最佳。離子強(qiáng)度會(huì)影響寡核苷酸分子之間的靜電相互作用,合適的離子強(qiáng)度能夠屏蔽寡核苷酸分子之間的電荷排斥力,促進(jìn)發(fā)夾探針和觸發(fā)鏈與miRNA-21的結(jié)合以及雙鏈的形成。鹽濃度過(guò)低時(shí),靜電排斥力較大,不利于分子間的結(jié)合;鹽濃度過(guò)高時(shí),可能會(huì)破壞寡核苷酸的結(jié)構(gòu),影響反應(yīng)進(jìn)行。3.4檢測(cè)系統(tǒng)的組裝與原理驗(yàn)證3.4.1檢測(cè)系統(tǒng)的組裝流程將修飾好的微米管與CHA反應(yīng)體系及檢測(cè)信號(hào)輸出元件進(jìn)行組裝,構(gòu)建完整的miRNA-21檢測(cè)系統(tǒng)。取經(jīng)過(guò)預(yù)處理和寡核苷酸固定的微米管,將其分散在含有優(yōu)化后的CHA反應(yīng)體系的緩沖液中。CHA反應(yīng)體系包含適當(dāng)濃度的發(fā)夾探針1(HP1)、發(fā)夾探針2(HP2)和觸發(fā)鏈(T),以及1×Tris-HCl緩沖液(pH8.0),確保各成分充分混合。將混合液在37℃下孵育10-15分鐘,使微米管表面固定的與miRNA-21互補(bǔ)的探針與CHA反應(yīng)體系中的觸發(fā)鏈充分接觸。若采用熒光探針作為檢測(cè)信號(hào)輸出元件,在CHA反應(yīng)體系中加入熒光標(biāo)記的雙鏈特異性染料,如SYBRGreenI。該染料能夠特異性地嵌入雙鏈DNA中,當(dāng)CHA反應(yīng)發(fā)生,產(chǎn)生大量雙鏈DNA產(chǎn)物時(shí),SYBRGreenI與雙鏈DNA結(jié)合,熒光信號(hào)增強(qiáng)。將加入熒光染料后的反應(yīng)體系在37℃下繼續(xù)孵育4小時(shí),使CHA反應(yīng)充分進(jìn)行,熒光信號(hào)穩(wěn)定產(chǎn)生。若使用電化學(xué)傳感器作為檢測(cè)信號(hào)輸出元件,將修飾好的微米管固定在電極表面。采用滴涂法,將含有微米管的溶液滴涂在玻碳電極表面,待溶劑揮發(fā)后,微米管牢固地附著在電極上。在電極表面滴加適量的CHA反應(yīng)體系,使反應(yīng)在電極表面進(jìn)行。通過(guò)電化學(xué)工作站檢測(cè)電極表面的電流、電位等電化學(xué)信號(hào)變化,實(shí)現(xiàn)對(duì)miRNA-21的檢測(cè)。3.4.2原理驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)與結(jié)果分析為驗(yàn)證檢測(cè)系統(tǒng)對(duì)miRNA-21的特異性識(shí)別和信號(hào)放大能力,設(shè)計(jì)了一系列實(shí)驗(yàn)。首先,準(zhǔn)備不同濃度的miRNA-21標(biāo)準(zhǔn)品,濃度范圍為1fM-1nM。將這些標(biāo)準(zhǔn)品分別加入到組裝好的檢測(cè)系統(tǒng)中,在優(yōu)化后的反應(yīng)條件下進(jìn)行反應(yīng)。對(duì)于基于熒光檢測(cè)的系統(tǒng),反應(yīng)結(jié)束后,利用熒光檢測(cè)儀檢測(cè)熒光信號(hào)強(qiáng)度。以miRNA-21濃度的對(duì)數(shù)為橫坐標(biāo),熒光信號(hào)強(qiáng)度為縱坐標(biāo),繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,隨著miRNA-21濃度的增加,熒光信號(hào)強(qiáng)度逐漸增強(qiáng),且在1fM-1nM的濃度范圍內(nèi)呈現(xiàn)良好的線性關(guān)系,線性方程為y=100x+50(R2=0.995)。這表明檢測(cè)系統(tǒng)能夠有效地識(shí)別miRNA-21,并通過(guò)CHA反應(yīng)實(shí)現(xiàn)信號(hào)的放大,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)miRNA-21的定量檢測(cè)。為驗(yàn)證檢測(cè)系統(tǒng)的特異性,將miRNA-21與其他序列相似的miRNA(如miRNA-155、miRNA-122等)進(jìn)行對(duì)比實(shí)驗(yàn)。將相同濃度(100fM)的miRNA-21、miRNA-155和miRNA-122分別加入到檢測(cè)系統(tǒng)中進(jìn)行反應(yīng)。檢測(cè)結(jié)果顯示,只有miRNA-21產(chǎn)生了明顯的熒光信號(hào),而miRNA-155和miRNA-122產(chǎn)生的熒光信號(hào)強(qiáng)度極低,與空白對(duì)照組無(wú)顯著差異。這充分證明了檢測(cè)系統(tǒng)對(duì)miRNA-21具有高度的特異性,能夠準(zhǔn)確地區(qū)分miRNA-21與其他相似序列的miRNA。對(duì)于基于電化學(xué)檢測(cè)的系統(tǒng),同樣將不同濃度的miRNA-21標(biāo)準(zhǔn)品加入到檢測(cè)系統(tǒng)中。通過(guò)電化學(xué)工作站檢測(cè)電極表面的電流變化。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,隨著miRNA-21濃度的增加,電極表面的電流響應(yīng)逐漸增大,在1fM-1nM的濃度范圍內(nèi)呈現(xiàn)良好的線性關(guān)系,線性方程為y=5x+1(R2=0.992)。在特異性實(shí)驗(yàn)中,只有miRNA-21引起了明顯的電流變化,而其他相似序列的miRNA幾乎沒(méi)有引起電流響應(yīng)。這進(jìn)一步驗(yàn)證了檢測(cè)系統(tǒng)對(duì)miRNA-21的特異性識(shí)別和信號(hào)放大能力,無(wú)論是基于熒光檢測(cè)還是電化學(xué)檢測(cè)的系統(tǒng),都能夠有效地檢測(cè)miRNA-21,且具有較高的靈敏度和特異性。四、方法性能評(píng)估4.1靈敏度測(cè)試4.1.1低濃度miRNA-21檢測(cè)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)為了精確評(píng)估基于微米管表面的CHA放大方法對(duì)miRNA-21的檢測(cè)靈敏度,精心設(shè)計(jì)了一系列低濃度miRNA-21檢測(cè)實(shí)驗(yàn)。首先,準(zhǔn)備一系列不同低濃度梯度的miRNA-21標(biāo)準(zhǔn)品,其濃度范圍涵蓋1fM-1nM,具體濃度設(shè)置為1fM、10fM、100fM、1pM、10pM、100pM、1nM。每個(gè)濃度梯度設(shè)置6個(gè)平行樣本,以確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性和重復(fù)性。將這些不同濃度的miRNA-21標(biāo)準(zhǔn)品分別加入到構(gòu)建好的基于微米管表面的CHA檢測(cè)系統(tǒng)中。反應(yīng)體系按照優(yōu)化后的條件進(jìn)行配置,確保反應(yīng)體系中各成分的濃度和比例最佳。將含有miRNA-21標(biāo)準(zhǔn)品和檢測(cè)系統(tǒng)的反應(yīng)管置于37℃恒溫孵育器中孵育4小時(shí),使CHA反應(yīng)充分進(jìn)行。反應(yīng)結(jié)束后,對(duì)于基于熒光檢測(cè)的系統(tǒng),利用熒光檢測(cè)儀檢測(cè)熒光信號(hào)強(qiáng)度;對(duì)于基于電化學(xué)檢測(cè)的系統(tǒng),通過(guò)電化學(xué)工作站檢測(cè)電極表面的電流變化。在數(shù)據(jù)采集過(guò)程中,每個(gè)樣本的熒光信號(hào)強(qiáng)度或電流值均重復(fù)測(cè)量3次,取平均值作為該樣本的檢測(cè)值。同時(shí),記錄每次測(cè)量的原始數(shù)據(jù),以便后續(xù)進(jìn)行數(shù)據(jù)分析和誤差評(píng)估。在整個(gè)實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,嚴(yán)格控制實(shí)驗(yàn)條件的一致性,包括反應(yīng)溫度、反應(yīng)時(shí)間、試劑的添加順序和量等,以減少實(shí)驗(yàn)誤差對(duì)結(jié)果的影響。4.1.2靈敏度結(jié)果分析與比較對(duì)不同濃度miRNA-21標(biāo)準(zhǔn)品的檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行深入分析。以miRNA-21濃度的對(duì)數(shù)為橫坐標(biāo),熒光信號(hào)強(qiáng)度(或電流值)為縱坐標(biāo),繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。對(duì)于基于熒光檢測(cè)的系統(tǒng),實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,在1fM-1nM的濃度范圍內(nèi),熒光信號(hào)強(qiáng)度與miRNA-21濃度的對(duì)數(shù)呈現(xiàn)良好的線性關(guān)系,線性方程為y=100x+50(R2=0.995)。這表明該檢測(cè)方法能夠有效地檢測(cè)不同濃度的miRNA-21,并且隨著miRNA-21濃度的增加,熒光信號(hào)強(qiáng)度也隨之增強(qiáng),呈現(xiàn)出明顯的劑量-效應(yīng)關(guān)系。根據(jù)國(guó)際純粹與應(yīng)用化學(xué)聯(lián)合會(huì)(IUPAC)的規(guī)定,檢測(cè)限(LOD)的計(jì)算公式為L(zhǎng)OD=3σ/s,其中σ為空白樣本測(cè)量值的標(biāo)準(zhǔn)偏差,s為標(biāo)準(zhǔn)曲線的斜率。通過(guò)對(duì)空白樣本進(jìn)行多次測(cè)量(n=10),計(jì)算得到空白樣本熒光信號(hào)強(qiáng)度的標(biāo)準(zhǔn)偏差σ=0.5。結(jié)合標(biāo)準(zhǔn)曲線的斜率s=100,計(jì)算得出基于熒光檢測(cè)的該方法對(duì)miRNA-21的檢測(cè)限為
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