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病原檢測面試試題及答案1.問:PCR技術(shù)的基本原理是什么?熒光定量PCR與普通PCR的主要區(qū)別有哪些?答:PCR(聚合酶鏈式反應(yīng))的核心原理是模擬DNA的天然復(fù)制過程,通過溫度循環(huán)控制實現(xiàn)目標DNA片段的指數(shù)級擴增。具體分為三步:①變性(94-98℃):高溫使雙鏈DNA解旋為單鏈;②退火(50-65℃):引物與單鏈DNA的互補序列特異性結(jié)合;③延伸(72℃左右):DNA聚合酶以dNTP為原料,從引物3'端延伸合成新的DNA鏈。經(jīng)過25-40個循環(huán),目標片段可擴增至百萬倍以上。熒光定量PCR(qPCR)與普通PCR的主要區(qū)別體現(xiàn)在三個方面:①檢測方式:普通PCR通過電泳觀察擴增產(chǎn)物的有無,屬于終點檢測;qPCR在擴增過程中實時監(jiān)測熒光信號(如SYBRGreen嵌合熒光或探針水解熒光),實現(xiàn)動態(tài)定量。②定量能力:普通PCR僅能定性(是否存在目標片段),qPCR通過標準曲線或Ct值(循環(huán)閾值)可準確定量初始模板濃度。③靈敏度與特異性:qPCR因?qū)崟r監(jiān)測避免了電泳污染,且探針法可通過熒光標記提高特異性,靈敏度通常比普通PCR高1-2個數(shù)量級。2.問:病原微生物的抗原檢測與核酸檢測在檢測原理、適用場景上有何差異?答:抗原檢測基于抗原-抗體特異性結(jié)合原理,通過標記抗體(如膠體金、酶)與樣本中的病原體蛋白(如病毒衣殼蛋白、細菌表面抗原)結(jié)合,產(chǎn)生可觀察的信號(如顯色條帶)。核酸檢測則通過擴增病原體特有的核酸片段(DNA或RNA),利用熒光、電泳等技術(shù)確認目標序列存在。適用場景差異:①窗口期:核酸檢測可在感染早期(病毒復(fù)制初期)檢測到低濃度核酸,窗口期短(如新冠病毒感染后1-3天可測);抗原檢測需病毒載量達到一定閾值(通常感染后3-5天),窗口期較長。②靈敏度:核酸檢測靈敏度高(可檢測到10-100拷貝/反應(yīng)),適合確診;抗原檢測靈敏度較低(通常需10?-10?拷貝/反應(yīng)),適合大規(guī)??焖俸Y查。③時效性:抗原檢測操作簡單(15-30分鐘出結(jié)果),適合基層或現(xiàn)場快速檢測;核酸檢測需實驗室設(shè)備(如PCR儀),耗時2-4小時,適合精準診斷。3.問:進行咽拭子樣本采集時,為保證檢測準確性需注意哪些關(guān)鍵步驟?答:關(guān)鍵步驟包括:①采樣部位:咽拭子應(yīng)擦拭雙側(cè)咽扁桃體及咽后壁,避免接觸舌頭、牙齒或唾液,因病原體主要定植于黏膜表面。②采樣深度:需深入咽部(約懸雍垂后1-2cm),確保采集到足夠的上皮細胞和分泌物。③采樣力度:適度旋轉(zhuǎn)擦拭,避免用力過猛導致出血(血液可能抑制PCR反應(yīng))。④樣本保存:采樣后立即將拭子浸入病毒保存液(含RNA酶抑制劑),避免干燥;保存液需覆蓋拭子頭部,且總量符合試劑盒要求(通常2-3mL)。⑤標識與轉(zhuǎn)運:樣本管需標注清晰的患者信息,4℃冷藏轉(zhuǎn)運(24小時內(nèi)檢測),若超過24小時需-70℃凍存,避免反復(fù)凍融破壞核酸。4.問:在病原檢測實驗室中,如何通過室內(nèi)質(zhì)控和室間質(zhì)評確保檢測結(jié)果的準確性?答:室內(nèi)質(zhì)控(IQC)是實驗室日常檢測的核心保障,具體措施包括:①設(shè)置對照:每批次檢測需加入陽性對照(已知濃度的標準品)、陰性對照(無目標病原體的樣本)、空白對照(無樣本的反應(yīng)體系),用于監(jiān)測試劑有效性和污染情況。②失控處理:若陽性對照無擴增、陰性對照出現(xiàn)擴增或Ct值超出均值±2SD(標準差),需立即停止檢測,排查原因(如試劑失效、儀器故障、操作污染),重新檢測并記錄。③質(zhì)控圖分析:定期(如每周)繪制質(zhì)控品Ct值的均值-極差圖,觀察趨勢變化,提前發(fā)現(xiàn)系統(tǒng)誤差。室間質(zhì)評(EQA)是外部機構(gòu)對實驗室能力的評估,實驗室需:①按要求參加省級或國家級質(zhì)評計劃(如衛(wèi)健委臨檢中心的病原室間質(zhì)評),每年至少2次。②對質(zhì)評樣本進行盲樣檢測,嚴格按標準操作流程執(zhí)行。③分析質(zhì)評結(jié)果:若出現(xiàn)不符合項(如漏檢、誤判),需撰寫整改報告,明確原因(如引物設(shè)計缺陷、操作失誤)及改進措施(如更換試劑、加強培訓)。5.問:某批次新冠核酸檢測出現(xiàn)多例假陽性結(jié)果,可能的原因有哪些?應(yīng)如何排查和處理?答:可能原因包括:①擴增產(chǎn)物污染:PCR實驗室分區(qū)不嚴格(如擴增區(qū)與樣本制備區(qū)交叉),導致氣溶膠攜帶的陽性產(chǎn)物污染后續(xù)反應(yīng)體系。②引物/探針特異性差:引物設(shè)計時未避開宿主基因組同源序列,或病毒變異導致探針結(jié)合效率下降,引發(fā)非特異性擴增。③樣本交叉污染:采樣時拭子接觸陽性樣本容器、加樣時移液器吸頭重復(fù)使用或未換槍頭。④試劑污染:提取試劑或PCR反應(yīng)液在生產(chǎn)/儲存過程中被目標核酸污染(如質(zhì)粒標準品泄漏)。排查與處理步驟:①立即暫停該批次檢測,保留原始反應(yīng)管和擴增記錄(如熔解曲線)。②重復(fù)檢測:用新批次試劑對可疑樣本重新提取、擴增,若結(jié)果轉(zhuǎn)陰,提示首次檢測污染;若仍陽性,需進一步確認。③環(huán)境監(jiān)測:用棉簽擦拭實驗室臺面、儀器(如離心機、移液器),提取DNA/RNA后進行PCR檢測,定位污染來源(如擴增區(qū)臺面)。④試劑驗證:對當前使用的提取試劑、PCRmix進行空白對照檢測(不加樣本),若出現(xiàn)擴增,需更換試劑批次。⑤流程追溯:檢查采樣記錄(是否同一采樣員操作)、加樣過程(是否規(guī)范更換槍頭)、實驗室分區(qū)(是否嚴格遵循“試劑準備→樣本處理→擴增→分析”單向流程)。6.問:針對疑似禽流感病毒感染的樣本,若選擇RT-PCR檢測,引物設(shè)計需遵循哪些原則?答:引物設(shè)計需滿足以下要求:①特異性:引物序列應(yīng)針對禽流感病毒保守區(qū)(如M基因、HA基因),避免與宿主(如雞、人)或其他呼吸道病毒(如流感B病毒)的同源序列匹配,可通過BLAST數(shù)據(jù)庫比對驗證。②長度與GC含量:引物長度18-25bp,GC含量40%-60%,避免連續(xù)G/C(>4個)或A/T(>4個),防止引物二聚體或非特異性結(jié)合。③Tm值(解鏈溫度):上下游引物Tm值差異≤2℃,通常設(shè)置在58-62℃,確保退火時同時結(jié)合模板。④避免發(fā)夾結(jié)構(gòu):引物自身內(nèi)部不應(yīng)有≥3bp的互補序列(如5'-AAGCC-3'和3'-GGCUU-5'),否則會形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)影響與模板結(jié)合。⑤產(chǎn)物長度:擴增片段以80-200bp為宜(禽流感病毒為RNA病毒,片段過長發(fā)夾結(jié)構(gòu)多,逆轉(zhuǎn)錄效率低),同時需覆蓋病毒變異較少的區(qū)域,避免因HA基因高變區(qū)突變導致漏檢。7.問:使用實時熒光定量PCR儀時,擴增曲線出現(xiàn)“拖尾”現(xiàn)象可能的原因是什么?如何解決?答:拖尾現(xiàn)象指擴增曲線在平臺期后熒光信號未穩(wěn)定,呈緩慢上升或下降趨勢,常見原因及解決方法:①模板濃度過高:高濃度模板會導致dNTP或引物過早耗盡,聚合酶在平臺期后非特異性延伸。解決:將樣本稀釋10-100倍后重新檢測。②Mg2+濃度過高:Mg2+過量會增強聚合酶活性,引發(fā)非特異性擴增。解決:優(yōu)化反應(yīng)體系,降低Mg2+濃度(通常從1.5mM調(diào)整至1.0-2.0mM)。③引物二聚體:引物自身互補導致擴增出非目標片段,熒光信號隨循環(huán)累積。解決:通過熔解曲線分析(若Tm值低于目標片段10℃以上)確認二聚體,重新設(shè)計引物或降低引物濃度(從0.5μM降至0.2-0.3μM)。④反應(yīng)體系污染:殘留的核酸酶或抑制劑(如血紅蛋白、胍鹽)干擾聚合酶活性,導致擴增不徹底。解決:使用高質(zhì)量提取試劑(如含抑制物去除柱的磁珠法),或在反應(yīng)體系中加入BSA(牛血清白蛋白)中和抑制劑。8.問:二級生物安全實驗室(BSL-2)進行病原檢測時,個人防護裝備(PPE)的配置要求是什么?實驗廢棄物應(yīng)如何處理?答:BSL-2實驗室PPE配置需滿足:①防護服:穿連體式或分體式防液體滲透的實驗服(如SMS材質(zhì)),袖口緊束,避免皮膚暴露。②手套:戴雙層無粉乳膠手套(內(nèi)層為檢查手套,外層為厚型操作手套),手套需覆蓋防護服袖口,操作后及時更換(如接觸可能污染的表面后)。③面部防護:操作可能產(chǎn)生氣溶膠的步驟(如樣本渦旋、離心管開蓋)需佩戴護目鏡(防沖擊)或面罩(覆蓋整個面部),配合醫(yī)用外科口罩(或N95口罩,若處理高致病性病原)。④鞋套:穿一次性鞋套或?qū)S脤嶒炐?,避免將污染物帶出實驗室。實驗廢棄物處理:①感染性廢棄物(如樣本管、拭子、手套):放入雙層黃色醫(yī)療廢物袋,標注“感染性廢物”,密封后高壓蒸汽滅菌(121℃,30分鐘),若無法高壓滅菌(如含銳器),需用0.5%次氯酸鈉浸泡2小時后處理。②非感染性廢棄物(如離心管、吸頭):若接觸過樣本,按感染性廢物處理;未接觸樣本的普通廢棄物可放入黑色垃圾袋,按一般垃圾處理。③液體廢棄物(如樣本保存液、PCR廢液):加入終濃度0.5%的次氯酸鈉(或2%戊二醛),作用30分鐘后倒入實驗室專用廢水池,經(jīng)實驗室廢水處理系統(tǒng)(如化學消毒+過濾)達標后排放。9.問:現(xiàn)有病原檢測流程中,樣本前處理環(huán)節(jié)耗時較長,可能影響檢測時效性,可采取哪些措施優(yōu)化?答:優(yōu)化措施包括:①自動化設(shè)備替代手工操作:引入核酸提取儀(如磁珠法提取儀),可同時處理96個樣本,提取時間從手工的1.5小時縮短至30分鐘;使用自動加樣機器人完成反應(yīng)體系配置,減少人為誤差和操作時間。②簡化前處理步驟:對于病毒核酸檢測,若樣本為咽拭子(已保存于病毒保存液),可省略離心步驟(直接取上清提?。?;對于細菌檢測,采用酶消化法(如溶菌酶處理)替代反復(fù)凍融,縮短破壁時間。③并行處理:將樣本前處理與試劑準備同步進行(如在提取核酸的同時配制PCR反應(yīng)液),利用時間重疊提高效率。④優(yōu)化試劑選擇:使用快速提取試劑(如無需結(jié)合/洗滌步驟的裂解液),或選擇一步法RT-PCR試劑盒(將逆轉(zhuǎn)錄與擴增合并為一個反應(yīng)),減少移液次數(shù)。⑤建立樣本優(yōu)先級:對急診樣本(如重癥患者)設(shè)置“綠色通道”,優(yōu)先處理并單獨上機,避免與批量樣本混合導致延遲。10.問:面對一種未知的新發(fā)呼吸道病原體,若需快速建立檢測方法,應(yīng)優(yōu)先選擇哪些技術(shù)?需考慮哪些關(guān)鍵因素?答:優(yōu)先選擇的技術(shù)包括:①宏基因組測序(mNGS):無需已知病原體信息,通過高通量測序分析樣本中所有核酸(病毒、細菌、宿主),可快速鑒定未知病原體。②實時熒光RT-PCR:若通過mNGS獲得病原體特異性序列,可設(shè)計引物探針建立qPCR方法,用于大規(guī)模篩查。③抗原快速檢測:若病原體存在高豐度表面抗原(如衣殼蛋白),可基于單克隆抗體開發(fā)膠體金或免疫層析試紙條,適合現(xiàn)場快速檢測。需考慮的關(guān)鍵因素:①檢測時效性:mNGS耗時較長(24-48小時),適合早期鑒定;qPCR(2-4小時)和抗原檢測(15分鐘)適合后續(xù)篩查。②樣本類型:呼吸道病原體主要存在于咽拭子、肺泡灌洗液,需確認不同樣本類型的檢測靈敏度(如肺泡灌洗液病毒載量高于咽拭子)。③變異可能性:若病原體為RNA病毒(如冠狀病毒),需選擇保守區(qū)設(shè)計引物(如RdRp基因),避免因變異導致漏檢。④生物安全:未知病原體可能具有高致病性(如BSL-3級),需在相應(yīng)等級實驗室操作,確保人員防護。⑤臨床相關(guān)性:檢測結(jié)果需與臨床癥狀(如發(fā)熱、咳嗽)、影像學(如肺部CT)結(jié)合,避免因樣本污染(如口腔正常菌群)導致誤判。11.問:某份樣本的新冠核酸檢測Ct值為38,結(jié)合《新型冠狀病毒肺炎診療方案》,應(yīng)如何解讀該結(jié)果?答:根據(jù)《新型冠狀病毒肺炎診療方案(試行第十版)》,新冠核酸檢測Ct值≥35時,需結(jié)合病程和抗原檢測等結(jié)果綜合判斷:①若為治愈患者復(fù)診樣本,Ct值≥35且連續(xù)兩次檢測(間隔24小時)均為≥35,可認為病毒已清除,符合出院標準。②若為初篩樣本,Ct值38提示病毒載量極低(通常<1000拷貝/mL),需考慮以下可能:a.感染早期(病毒尚未大量復(fù)制),建議24小時后復(fù)查;b.感染恢復(fù)期(病毒已被清除,殘留核酸片段);c.樣本污染(如實驗室環(huán)境中的擴增產(chǎn)物)。此時應(yīng)同時進行抗原檢測:若抗原陰性,結(jié)合臨床無發(fā)熱等癥狀,可報告“核酸檢測結(jié)果臨界,建議復(fù)查”;若抗原陽性或臨床癥狀典型,需復(fù)核并結(jié)合流行病學史判斷。12.問:新引進的病原體核酸檢測試劑盒在投入使用前,需進行哪些性能驗證?具體指標包括哪些?答:需進行以下驗證:①準確性:用已知陽性(不同濃度)和陰性樣本(包括常見交叉反應(yīng)病原體)檢測,計算符合率(應(yīng)≥95%)。②靈敏度:通過倍比稀釋確定最低檢測限(LOD),要求LOD不高于試劑盒聲稱值(如≤100拷貝/mL)。③特異性:檢測與目標病原體同源性高的其他微生物(如流感A與流感B病毒)、宿主核酸,確保無交叉反應(yīng)(交叉樣本檢測應(yīng)為陰性)。④精密度:重復(fù)檢測同一低濃度樣本(n=20),計算Ct值的變異系數(shù)(CV應(yīng)≤5%);不同批次試劑、不同操作人員檢測同一樣本,結(jié)果應(yīng)一致。⑤穩(wěn)定性:取試劑盒在37℃加速老化7天(模擬常溫運輸),檢測性能應(yīng)與未老化組無顯著差異(Ct值變化≤2)。⑥抗干擾性:檢測含高濃度血紅蛋白(≥5g/L)、膽紅素(≥100μmol/L)、甘油三酯(≥20mmol/L)的樣本,結(jié)果不應(yīng)出現(xiàn)假陰性或假陽性。13.問:設(shè)計多重PCR檢測呼吸道病原體時,如何避免不同靶標引物之間的交叉反應(yīng)?答:避免交叉反應(yīng)的措施包括:①引物特異性優(yōu)化:每個靶標引物需通過BLAST比對,確保與其他靶標序列無≥15bp的連續(xù)同源區(qū);若使用探針法(如TaqMan),探針序列需完全匹配目標區(qū)域,避免與其他靶標雜交。②引物濃度調(diào)整:對擴增效率高的靶標(如拷貝數(shù)高的病毒)降低引物濃度(0.2μM),對效率低的靶標(如拷貝數(shù)低的細菌)提高濃度(0.4μM),平衡各靶標擴增效率。③退火溫度優(yōu)化:通過梯度PCR確定所有引物的最佳共同退火溫度(通常比最低Tm值高2-3℃),避免因溫度過低導致非特異性結(jié)合。④反應(yīng)體系優(yōu)化:加入熱啟動聚合酶(如抗體封閉的Taq酶),減少常溫下引物與模板的非特異性結(jié)合;增加Mg2+濃度(2.0-2.5mM)提高引物與目標模板的結(jié)合穩(wěn)定性。⑤產(chǎn)物長度區(qū)分:設(shè)計不同靶標的擴增片段長度差異≥50bp(如200bp、250bp、300bp),通過熔解曲線(探針法)或電泳(普通PCR)區(qū)分,避免產(chǎn)物混淆。14.問:用于RNA檢測的臨床樣本(如咽拭子)若無法立即檢測,應(yīng)如何保存?保存時間對檢測結(jié)果有何影響?答:保存方法及影響:①4℃短期保存(≤24小時):樣本置于病毒保存液(含胍鹽抑制RNA酶)中4℃冷藏,RNA降解率較低(24小時內(nèi)Ct值變化≤2),適合轉(zhuǎn)運至實驗室后當天檢測。②-20℃保存(≤7天):若24小時內(nèi)無法檢測,可冷凍保存于-20℃,但反復(fù)凍融(>3次)會導致RNA斷裂(Ct值升高5-10),影響檢測靈敏度。③-70℃長期保存(>7天):需轉(zhuǎn)移至-70℃超低溫冰箱(或液氮),可保存6個月以上,RNA完整性基本不受影響(Ct值變化≤1)。保存時間的影響:RNA易被RNA酶降解,保存時間越長,檢測靈敏度越低。例如,新冠病毒RNA在4℃保存48小時后,約30%樣本Ct值升高≥3(相當于病毒載量下降8倍);-20℃保存14天后,約10%樣本可能從陽性轉(zhuǎn)為陰性(Ct值≥40)。因此,RNA樣本應(yīng)遵循“及時檢測>4℃短期保存>-20℃中期保存>-70℃長期保存”的原則,避免因保存不當導致漏檢。15.問:分子生物學實驗室中,如何有效防控擴增產(chǎn)物污染?具體措施包括哪些?答:防控措施分為硬件和軟件兩方面:①硬件防控:實驗室嚴格分區(qū)為試劑準備區(qū)、樣本處理區(qū)、擴增區(qū)、產(chǎn)物分析區(qū),各區(qū)單向流動(無回頭路);各區(qū)配備獨立的空調(diào)、冰箱、移液器(專用且不得交叉使用);擴增區(qū)和產(chǎn)物分析區(qū)安裝紫外燈(254nm,30mJ/cm2),每次使用后照射30分鐘降解氣溶膠中的DNA。②軟件防控:使用帶濾芯的吸頭(防氣溶膠污染),加樣時避免反復(fù)吹打;擴增后的反應(yīng)管在產(chǎn)物分析區(qū)開封,嚴禁返回樣本處理區(qū);每月用DNA清除劑(如10%次氯酸鈉)擦拭臺面、儀器(如離心機、振蕩器);定期更換實驗室工作服(擴增區(qū)工作服不得穿出該區(qū));設(shè)置空白對照(每批次檢測1-2管無模板反應(yīng)),若出現(xiàn)擴增,立即停用并消毒。16.問:當檢測結(jié)果與臨床癥狀不符時(如核酸陰性但臨床高度懷疑感染),檢測人員應(yīng)如何處理?答:處理步驟:①復(fù)核檢測:用原樣本重新提取核酸,使用不同批號的試劑或不同檢測方法(如換用另一種靶標引物的qPCR,或進行抗原檢測)重復(fù)檢測,排除試劑失效或操作誤差。②樣本質(zhì)量評估:檢查樣本采集記錄(如是否為合格的咽拭子)、保存條件(是否4℃運輸)、外觀(是否有溶血或凝固),若樣本不符合要求(如保存液滲漏、拭子干燥),建議重新采樣。③考慮窗口期:若患者處于感染早期(如新冠病毒感染后1-2天),病毒載量低于檢測下限,建議24-48小時后復(fù)查。④排除其他病原體:若臨床癥狀(如發(fā)熱、咳嗽)持續(xù),需考慮合并其他病原體感染(如流感病毒、支原體),建議進行多病原體聯(lián)合檢測(如呼吸道病原體多重PCR)。⑤溝通反饋:與臨床醫(yī)生溝通患者病程(如發(fā)病天數(shù))、用藥情況(如抗病毒治療可能降低病毒載量),結(jié)合影像學(如肺部CT)和血清學(如IgM抗體)結(jié)果綜合判斷,必要時建議進行病毒分離或NGS檢測。17.問:近年來新興的病原體快速檢測技術(shù)(如CRISPR診斷
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