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1、植物DNA的提取及凝膠電泳分析,學(xué)生:潘園園 指導(dǎo)老師:王慧中 應(yīng)奇才,實(shí)驗(yàn)?zāi)康?了解真核生物基因組DNA提取的原理。 掌握CTAB法提取植物基因組DNA及瓊脂糖凝膠電泳的方法。,1、植物DNA提取 非離子型去污劑十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)可以溶解細(xì)胞膜,并能與核酸形成復(fù)合物,在高鹽溶液中(0.7mol/L NaCl)是可溶的,當(dāng)降低溶液鹽濃度到一定程度(0.3mol/L NaCl)時(shí),從溶液中沉淀,通過離心就可將CTAB-核酸復(fù)合物與蛋白以及多糖類物質(zhì)分開。最后通過乙醇或異丙醇沉淀DNA,使之形成纖維狀絮團(tuán),CTAB溶于乙醇或異丙醇而除去,離心沉淀收集得到DNA。,實(shí)驗(yàn)原理,實(shí)驗(yàn)原理,

2、2、凝膠電泳分析 瓊脂糖或聚丙烯酰胺凝膠是分離和純化DNA片段的標(biāo)準(zhǔn)方法。 聚丙烯酰胺凝膠電泳適用于分離小分子的核酸;瓊脂糖凝膠孔徑較大,應(yīng)用于大分子核酸的分離和純化,分離大小范圍在0.2-50kb的DNA片段。 用低濃度的熒光嵌入染料溴化乙啶(ethidium bromide ,EB)染色,溴化乙錠嵌入堿基對(duì)之間形成熒光絡(luò)合物,在紫外線激發(fā)下發(fā)出紅色熒光。,實(shí)驗(yàn)原理,在紫外光下至少可以檢測(cè)出110ng的DNA條帶,從而可以確定DNA片段在凝膠中的位置。 在一定濃度的瓊脂糖凝膠介質(zhì)中,DNA分子的電泳遷移率與其分子量的常用對(duì)數(shù)成反比。觀察其遷移距離,與標(biāo)準(zhǔn)DNA片段進(jìn)行對(duì)照,就可獲知該樣品分子

3、量大小。,實(shí)驗(yàn)材料和試劑,實(shí)驗(yàn)材料 新鮮煙草葉片 實(shí)驗(yàn)試劑 2CTAB緩沖液 氯仿/異戊醇(24:1) 液氮 70%乙醇 異丙醇 TAE緩沖液 6DNA凝膠上樣緩沖液 瓊脂糖 溴化乙錠(EB) 標(biāo)準(zhǔn)分子量DNA,實(shí)驗(yàn)步驟,CTAB法提取植物總DNA 1、取2cm新鮮煙草葉片于研缽中,加入液氮研磨,研磨成碎粉狀。 2、迅速轉(zhuǎn)移到1.5ml離心管中,加入了600 l 2CTAB提取液(65預(yù)熱) ,緩慢振蕩30s。放入65振蕩水浴鍋中4060 min。 3、加入等體積氯仿/異戊醇,緩慢顛倒混勻至無(wú)明顯分層,室溫靜止12min。室溫下10000r/min離心10min。 4、取500 l上清液,加入

4、2/3體積的異丙醇,緩慢顛倒混勻,絮狀沉淀為DNA,-20放置1h。 5、12000r/min離心10min,去上清,加入200l 70%乙醇洗滌。 6、12000r/min離心5min,去乙醇,風(fēng)干。 7、用30 l TE或者雙蒸水溶解DNA,取5l 電泳,剩余-20保存?zhèn)溆谩?實(shí)驗(yàn)步驟,瓊脂糖凝膠電泳 1、稀釋緩沖液的制備 用50 TAE配置成1 TAE稀釋緩沖液,待用。 2、膠液的制備 稱取1g瓊脂糖,置于200ml錐形瓶中,加入100ml 1TAE,即1%瓊脂糖凝膠。放入微波爐(或電爐)上加熱至瓊脂糖全部熔化,取出搖勻。 3、膠板的制備 向冷卻至4050的瓊脂糖膠液中加入溴化乙錠(EB

5、)溶液,使其終濃度為0.5g/ml,將凝膠倒入膠槽里,注意不要有氣泡。,實(shí)驗(yàn)步驟,4、加樣 取5 l提取的植物DNA溶液與1l 溴粉藍(lán)液混勻,用微量移液槍小心加入樣品槽中。 5、電泳 加完樣后,合上電泳槽蓋,立即接通電源。保持電壓在80110V,電流在40 mA以上。 6.、觀察和拍照 在波長(zhǎng)為254nm的長(zhǎng)波長(zhǎng)紫外燈下電泳膠,并拍照保存。,注意事項(xiàng),1、液氮研磨時(shí),應(yīng)當(dāng)快速轉(zhuǎn)移,降低DNA的降解。 2、CTAB裂解液要預(yù)熱,以抑制Dnase,加速蛋白變性,促進(jìn)DNA溶解。 3、各操作步驟要輕柔,盡量減少機(jī)械外力造成DNA降解。 4、取上清時(shí),不應(yīng)貪多,以防非核酸類成分干擾。 5、異丙醇要預(yù)冷,以減少DNA的降解,促進(jìn)DNA與蛋白等得分相及DNA沉淀。 6、溴化乙錠EB是強(qiáng)誘變劑

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