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1、腫瘤治療相關(guān)基因檢測(cè),2. 腫瘤個(gè)體化治療發(fā)展趨勢(shì),循環(huán)腫瘤細(xì)胞,臨床上治療腫瘤的方法,患者對(duì)藥物是否敏感?毒性是否可耐受? 患者治療后轉(zhuǎn)移復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)有多高?,個(gè)體化治療:醫(yī)學(xué)概念。應(yīng)用它不僅降低并發(fā)癥的發(fā)生,還降低醫(yī)療費(fèi)用。,腫瘤標(biāo)準(zhǔn)化治療 期患者:手術(shù)/化療 、期患者:放/化療+手術(shù) 局部晚期患者:手術(shù)、化療、放療、靶向,腫瘤個(gè)體化治療 標(biāo)本基因檢測(cè)遺傳特性選擇化療/靶向藥物,病理分型,分子分型,已發(fā)現(xiàn)并確認(rèn)至少9種EML4-ALK融合基因的突變體:v1、v2、v3a、v3b、v4、v5a、v5b、v6、v7 檢測(cè)方法:RT-PCR, FISH, PCR-測(cè)序等,EML4和ALK兩個(gè)基因分別
2、位于人類(lèi)2號(hào)染色體的p21和p23帶,克唑替尼的靶標(biāo)EML4-ALK融合基因,靶向EGFR的抗腫瘤藥物,類(lèi)別一:小分子酪氨酸激酶抑制劑( EGFR TKI) 作用機(jī)制:抑制EGFR胞內(nèi)區(qū)酪氨酸激酶活性,阻斷EGFR信號(hào)通路; 藥物代表:吉非替尼(阿斯利康);厄羅替尼(羅氏)。 類(lèi)別二:?jiǎn)慰寺】贵w(mAb) 作用機(jī)制:與EGFR胞外區(qū)結(jié)合,阻斷配體與EGFR的結(jié)合; 藥物代表:西妥昔(默克);貝伐單抗(羅氏)。,基因EGFR熱點(diǎn)突變位點(diǎn),EGFR主要突變?cè)冢和怙@子18,19,20,21 耐藥突變:T790M,靶向藥物西妥昔單抗靶標(biāo)K-ras基因檢測(cè),NCCN明確指出西妥昔單抗(愛(ài)必妥)用藥之前須
3、檢測(cè)K-ras基因突變檢測(cè); K-ras突變型患者并不能從抗EGFR治療(愛(ài)必妥)中獲益,反而徒增不良反應(yīng)危險(xiǎn)和治療費(fèi)用; 中國(guó)人群中K-ras基因突變率15% ! 15%的病人不應(yīng)該使用愛(ài)必妥!,World J Gastroenterol. 2011 November 21; 17(43): 4779-4786.,基因KRAS熱點(diǎn)突變位點(diǎn),10,KRAS主要突變?cè)冢?外顯子2(密碼子12,13 ),3(密碼子61),個(gè)體化檢測(cè)平臺(tái),基因突變檢測(cè) ARMS技術(shù),測(cè)序等,ARMS技術(shù)普通PCR,等位基因特異性擴(kuò)增法(Allele Specific Amplification,ASA)建立于198
4、9年,是PCR技術(shù)應(yīng)用的發(fā)展,也稱(chēng)擴(kuò)增阻滯突變系統(tǒng)(Amplification Refractory Mutation System,ARMS)、等位基因特異性PCR(Allele Specific PCR,ASPCR)等。,方法: 2條正向引物(針對(duì)正常DNA,突變DNA) 1條反向引物 2個(gè)平行的PCR反應(yīng) 普通PCR儀,應(yīng)用:對(duì)微量突變進(jìn)行檢測(cè)。,TaqMan-ARMS技術(shù),TaqMan-ARMS探針技術(shù)基于實(shí)時(shí)PCR平臺(tái),結(jié)合了ARMS突變富集和Taqman-MGB特異性熒光檢測(cè)兩種技術(shù)。,Taqman-MGB:針對(duì)SNP位點(diǎn)特異性擴(kuò)增的探針,可區(qū)分一個(gè)堿基的突變。,一個(gè)PCR體系中:
5、1對(duì)引物,1條探針 每個(gè)位點(diǎn)需要做至少兩管PCR擴(kuò)增!,SNP位點(diǎn)檢測(cè)應(yīng)用,EGFR基因突變檢測(cè)方法靈敏度的比較,測(cè)序技術(shù)發(fā)展歷程,Sanger Sequencing (1977),Ion Semiconductor Sequencing (2011),Next-Gen Sequencing (2005以后),Ion Torrent半導(dǎo)體測(cè)序原理,Ion Torrent半導(dǎo)體測(cè)序平臺(tái)及芯片,PI芯片:sequence exomes and whole transcriptomes(5Gb),目前成熟的腫瘤分子靶向藥物敏感性基因檢測(cè),基因表達(dá)量(mRNA)檢測(cè) 指導(dǎo)個(gè)體化化療,可使標(biāo)準(zhǔn)化療方案得
6、到個(gè)體化應(yīng)用,mRNA檢測(cè)主要技術(shù)特色,采用熒光定量PCR技術(shù),采用內(nèi)參比RNA作為質(zhì)控對(duì)照,應(yīng)用beta-actin作為內(nèi)對(duì)照,定量檢測(cè)檢測(cè)目的基因mRNA表達(dá)水平。 適用于各種腫瘤組織檢測(cè),包括石蠟標(biāo)本、穿刺標(biāo)本、冰凍活檢標(biāo)本等。 國(guó)內(nèi)采用校準(zhǔn)RNA(Calibrator RNA)方法進(jìn)行基因表達(dá)定量。,23,基礎(chǔ):5000例樣本 人種:中國(guó)患者樣本 標(biāo)準(zhǔn):正態(tài)分布 定位:精確到1% 統(tǒng)計(jì):p0.05,Q-PCR檢測(cè)基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù),NCCN 2012年版臨床治療指南明確指出: 患者接受吉西他濱化療前進(jìn)行RRM1 mRNA檢測(cè)可提高治療有效率和患者生存率。,RRM1表達(dá)與吉西他濱療效相關(guān)的臨
7、床數(shù)據(jù),ERCC1表達(dá)與鉑類(lèi)藥物療效相關(guān)的臨床數(shù)據(jù),ERCC1低表達(dá)患者,能從鉑類(lèi)輔助化療中獲益.,BRCA1/2表達(dá)與鉑類(lèi)藥物療效 相關(guān)的臨床數(shù)據(jù),BRCA1過(guò)度表達(dá) 鉑類(lèi)耐藥的預(yù)測(cè)因子 抗微管類(lèi)藥物的敏感因子,28,低TS mRNA水平的腫瘤患者接受氟類(lèi)化療的效果較好,中位生存期較長(zhǎng)。 TS低表達(dá)的患者對(duì)培美曲賽的療效好。,TS高表達(dá)影響氟類(lèi)和培美曲塞藥效,Shirota Y et al. J Clin Oncol. 2001;19:4298-304,TUBB3高表達(dá)對(duì)紫杉醇和長(zhǎng)春堿類(lèi)不敏感,TUBB3陽(yáng)性表達(dá)是抗微管類(lèi)藥物敏感預(yù)測(cè)因子,30,STMN1表達(dá)檢測(cè)意義,預(yù)后: 表達(dá)水平越高,
8、患者的生存率越低,腫瘤發(fā)生轉(zhuǎn)移的風(fēng)險(xiǎn)越高。,療效: 低表達(dá)接受長(zhǎng)春瑞濱/順鉑治療的效果較好,中位生存期較長(zhǎng); STMN1高表達(dá)接受長(zhǎng)春瑞濱/順鉑的療效較差。,Elizabeth A et al. Cancer Res. 2002;62:6864-6869,乳腺癌患者預(yù)后指標(biāo)及曲妥珠單抗治療的靶點(diǎn) 胃癌曲妥珠單抗靶向治療的靶點(diǎn),HER2基因檢測(cè),FDA 2013年關(guān)于胃癌HER2檢測(cè)流程建議,ASCO/CAP2013指南關(guān)于乳腺癌HER2檢測(cè)推薦: IHC檢測(cè)HER2蛋白表達(dá)水平 FISH檢測(cè)HER2基因擴(kuò)增,靶向藥物敏感性解決方案,化療藥物敏感性解決方案,循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)檢測(cè),1869年
9、 Aust Med J,Ashworth最早在轉(zhuǎn)移性癌癥患者血液中觀察到。 2005年 N Engl J Med,Cristofanilli證實(shí)治療前CTC數(shù)目是轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者無(wú)進(jìn)展生存期和總生存期的獨(dú)立預(yù)測(cè)因子。,循環(huán)腫瘤細(xì)胞指從實(shí)體瘤中脫離出來(lái)并進(jìn)入外周血液循環(huán)的腫瘤細(xì)胞。,循環(huán)腫瘤細(xì)胞,循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)檢測(cè),全球唯一一個(gè)獲得FDA和SFDA認(rèn)證的循環(huán)腫瘤細(xì)胞檢測(cè)系統(tǒng),(Circulating Tumor Cell),強(qiáng)生CellSearch系統(tǒng)國(guó)內(nèi)注冊(cè)情況,如何鑒別出CTC?,CTC,Anti-EpCAM磁珠,Anti-CK-PE,Nucleus DAPI,CK,EpCAM,在C
10、ellSearch檢測(cè)中,CTC 被設(shè)定為: EpCam (上皮來(lái)源細(xì)胞表面抗原) CK-8,18 和/或19 (腫瘤細(xì)胞表面抗原) DAPI (細(xì)胞核染料) CD45 (白細(xì)胞表面抗原),+ + + -,CTC數(shù)量與無(wú)進(jìn)展生存期和總生存期的關(guān)系,化療后CTC數(shù)量少于閾值的患者無(wú)進(jìn)展生存期和總生存期明顯高于CTC數(shù)量大于閾值的患者。 化療前后CTC數(shù)量都少于閾值 的患者無(wú)進(jìn)展生存期和總生存期明顯高于只有一次測(cè)出CTC數(shù)量少于閾值的患者。,乳腺癌閾值5,結(jié)直腸癌閾值3,前列腺癌閾值5,為什么要選擇使用CTC系統(tǒng)? 唯一的標(biāo)準(zhǔn)化,自動(dòng)化循環(huán)腫瘤細(xì)胞計(jì)數(shù)系統(tǒng) 具可重復(fù)性和高敏感度 系統(tǒng)最低檢測(cè)限度:
11、7.5ml外周血中的1個(gè)腫瘤細(xì)胞 臨床意義 預(yù)測(cè)無(wú)進(jìn)展生存期和總生存期 轉(zhuǎn)移性癌癥的監(jiān)護(hù) 療效監(jiān)控 復(fù)查(早于影像學(xué)發(fā)現(xiàn)疾病進(jìn)展情況),CTC檢測(cè)樣本,使用CellSave儲(chǔ)存管采集靜脈血液標(biāo)本10ml 輕輕顛倒8次,防止凝塊 樣本室溫條件(15-30攝氏度)下96小時(shí)之內(nèi)接受處理 接受阿霉素治療的患者給藥之后,至少需要等待7天 術(shù)后15天以后,樣本溶血及結(jié)塊不能用于CTC檢測(cè)!,送檢樣本要求,腫瘤個(gè)體化用藥是發(fā)展趨勢(shì) 腫瘤個(gè)體化用藥分子靶標(biāo)及靶向藥物開(kāi)發(fā)的關(guān)聯(lián)研究越來(lái)越多 部分基因檢測(cè)近年已逐步在臨床推廣 比較完整的個(gè)體化診療解決方案逐步誕生,結(jié) 語(yǔ),腫瘤個(gè)體化治療發(fā)展趨勢(shì),為什么要做分子檢測(cè)?,腫瘤分子分型時(shí)代要到來(lái)?,在美國(guó)華盛頓大學(xué),Lukas Wartman醫(yī)生患上了成人急性淋巴細(xì)胞白血病。 Lukas的病情很快
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