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1、0,第14 章 核酸的物理化學(xué)性質(zhì),DNA與RNA的差異(了解),核酸的物理化學(xué)性質(zhì),核酸的化學(xué)結(jié)構(gòu)和作為高聚物大分子決定著其物理化學(xué)性質(zhì)。 核酸的糖苷鍵和磷酸二酯鍵:可被水解; 磷酸基和堿基:酸堿性質(zhì); 堿基:紫外吸收特性; 雙螺旋結(jié)構(gòu):變性和復(fù)性。 DNA和RNA都微溶于水,不溶于有機(jī)溶劑,提取分離核酸時,可用乙醇將核酸從溶液中沉淀出來。,一、核酸的水解 二、核酸的酸堿性質(zhì) 三、核酸的紫外吸收性質(zhì) 四、核酸的變性、復(fù)性及雜交,核酸的物理化學(xué)性質(zhì),一、核酸的水解,(一)酸水解 糖苷鍵比磷酸二酯鍵更易被酸水解。 嘌呤堿基(DNA,37,pH 1.6)的糖苷鍵比嘧啶堿基(提高溫度,175)的糖苷
2、鍵對酸更不穩(wěn)定。 (二)堿水解 RNA的磷酸酯鍵易被堿水解,產(chǎn)生核苷酸(2-OH基參與反應(yīng)),產(chǎn)生2核苷酸和3核苷酸 。 KOH較好,水解后用HClO4中和,由于KClO4溶解度較小,溶液中大部分K+即被除去。,(1)底物 RNase核糖核酸 DNase脫氧核糖核酸 (2)按作用方式 核酸內(nèi)切酶:作用點(diǎn)在多核苷酸鏈的內(nèi)部 核酸外切酶(5 3外切酶、3 5外切酶) (3)按磷酸二酯鍵斷裂的方式 5磷酸酯鍵 3磷酸酯鍵 (4)其他:雙鏈酶、單鏈酶,非特異性水解磷酸二酯鍵磷酸二酯酶 專一性水解核酸磷酸二酯鍵核酸酶,限制性核酸內(nèi)切酶: 細(xì)菌中,識別并切割特異的雙鏈DNA序列的一種核酸內(nèi)切酶,專門降解外
3、來入侵的異種DNA,對自身無害。,(三)酶水解,一、核酸的水解,二、核酸的酸堿性質(zhì),核酸的堿基、核苷和核苷酸均能發(fā)生解離。在一定的條件下可形成兼性離子,為兩性電解質(zhì),具有等電點(diǎn)。,三、核酸的紫外吸收,核酸最大吸收峰波長max在260nm處,可以作為核酸及其組份定性和定量測定的依據(jù)。,1、判斷樣品的純度 分別讀出260nm和280nm的A值,計算A260/A280。 純的DNA的應(yīng)大于1.8;純的RNA應(yīng)達(dá)到2.0。 2、對純核酸樣品的定量測定 測出260nm的A值,即可計算含量。,三、核酸的紫外吸收P507,增色效應(yīng):由于DNA變性,引起的紫外光吸收增加的效應(yīng) 。 減色效應(yīng):由于DNA復(fù)性,引
4、起的紫外光吸收下降的效應(yīng) 。 原理:雙螺旋結(jié)構(gòu)使堿基對的電子云發(fā)生重疊,減少了對紫外光的吸收。,(一) 核酸的變性 指核酸雙螺旋區(qū)的多聚核苷酸鏈間的氫鍵斷裂,變成單鏈結(jié)構(gòu)的過程。 注意: 變性核酸將失去其部分或全部的生物活性。 核酸的變性并不涉及磷酸二酯鍵的斷裂,所以它的一級結(jié)構(gòu)(堿基順序)保持不變 。 能夠引起核酸變性的因素很多。溫度升高(熱變性)、酸堿度改變、甲醛和尿素等的存在均可引起核酸的變性。,四、核酸的變性、復(fù)性及雜交P508,DNA的變性過程,驟然冷卻,如何判斷核酸是否變性呢?,熱變性和Tm,螺旋雙鏈開始分開,螺旋雙鏈一半解開,螺旋雙鏈完全解開,DNA的變性過程是爆發(fā)式的,它在很窄
5、的溫度區(qū)間內(nèi)完成。 通常把加熱變性使雙螺旋結(jié)構(gòu)失去一半時的溫度稱為該DNA的熔點(diǎn)或熔解溫度,用Tm值表示 。 DNA的Tm一般在82-95之間。 RNA有局部雙螺旋區(qū), Tm較低;tRNA有較多雙螺旋, Tm較高。,DNA的變性在紫外吸收上的變化,影響Tm的因素(了解): 1.DNA的均一性越高,Tm的溫度范圍越小。例如poly d(G-C),溶解過程發(fā)生在較小溫度范圍內(nèi)。 2.G-C含量越高, Tm的值越大,當(dāng)GC的含量上升1%,則Tm上升0.4。 經(jīng)驗(yàn)公式:GC%=(Tm-69.3)2.44 3.介質(zhì)的離子強(qiáng)度較高時, Tm的值較大,溶解范圍小。,DNA制品不保存在極稀的電解質(zhì)溶液中,(二
6、)核酸的復(fù)性,變性DNA在適當(dāng)?shù)臈l件下,兩條彼此分開的單鏈可以重新締合成為雙螺旋結(jié)構(gòu),這一過程稱為復(fù)性 。 DNA復(fù)性后,許多物化性質(zhì)得到恢復(fù)。 DNA復(fù)性的程度、速率與復(fù)性過程的條件有關(guān),與DNA自身也有關(guān)系。,四、核酸的變性、復(fù)性及雜交P508,變性核酸復(fù)性時需緩慢冷卻,故又稱退火。 ,復(fù)性時的 初始濃度 重復(fù)序列 拷貝數(shù)等 片段大小,定義:熱變性的DNA在復(fù)性過程中,具有堿基序列部分互補(bǔ)的不同來源的DNA之間或DNA與RNA之間形成雜化雙鏈的現(xiàn)象。 核酸雜交方法是一種分子生物學(xué)的標(biāo)準(zhǔn)技術(shù),用于檢測DNA或RNA分子的特定序列(靶序列)。,(三)核酸分子雜交,四、核酸的變性、復(fù)性及雜交P508,Sou
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