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文檔簡介
1、蛋白質(zhì)相互作用研究技術(shù),匯報(bào)人: 布沙熱木.阿布力孜 瑪伊熱.努熱艾合買提 夏尤普.玉蘇甫 阿布力米提.莫明,酵母雙雜交 谷胱苷肽-S-轉(zhuǎn)移酶沉淀試驗(yàn)(GST-pull down) 免疫共沉淀 雙分子熒光互補(bǔ)技術(shù)(BIFC) 生物發(fā)光共振能量轉(zhuǎn)移()技術(shù),常用蛋白質(zhì)相互作用的研究技術(shù),一、細(xì)菌雙雜交系統(tǒng),Two-hybrid system 是90年代初發(fā)展起來的新方法,可用于分離能與已知靶蛋白質(zhì)(target protein)相互作用的基因。 基本原理: 真核生物的轉(zhuǎn)錄因子大多是由兩個(gè)結(jié)構(gòu)上分開、功能上獨(dú)立的結(jié)構(gòu)域組成的,如GAL4 (酵母轉(zhuǎn)錄激活蛋白Gal4的基因)。這兩個(gè)結(jié)構(gòu)域各具功能,互
2、不影響。但一個(gè)完整的激活特定基因表達(dá)的激活因子必須同時(shí)含有這兩個(gè)結(jié)構(gòu)域,否則無法完成激活功能。,酵母激活因子 GAL4:N端:147個(gè)氨基酸組成的DNA結(jié)合域(BD), C端:113個(gè)氨基酸組成的轉(zhuǎn)錄激活域(AD)。GAL4分子的DNA結(jié)合域可以和上游激活序列(upstream activating sequence,UAS)結(jié)合,而轉(zhuǎn)錄激活域則能激活UAS下游的基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄。 組成部分:(1)與BD融合的蛋白表達(dá)載體,被表達(dá)的蛋白稱誘餌蛋白(bait);(2)與AD融合的蛋白表達(dá)載體,被其表達(dá)的蛋白稱靶蛋白(prey);(3)帶由一個(gè)或多個(gè)報(bào)告基因的宿主菌株。,BD,A,COOH,AD,B,
3、NH2,COOH,共轉(zhuǎn)化,+,BD,A,AD,Gal4,Gal4,Promoter,Reporter,NH2,Gal4,Gal4,B,酵母雙雜交基本過程,舉 例,二、谷胱苷肽-S-轉(zhuǎn)移酶沉淀試驗(yàn)(GST-pull down)原理,GST-融合蛋白,GST,X,Y,谷胱甘肽-瓊脂糖球珠,細(xì)胞裂解物,tube,4下孵育2h,GST,X,Y,+,GST pull down實(shí)驗(yàn)流程,(1) Glutathione 瓊脂糖珠預(yù)處理。 (2) GST融合蛋白掛柱:取適量GST-融合蛋白與10l已經(jīng)處理過的beads置于1.5ml離心管中, 4, 搖床孵育過夜。 (3) 孵育過夜的蛋白質(zhì)與beads的混合液
4、于4,500g離心5min,上清收集,觀察融合蛋白是否飽和地掛在beads上,用1ml冰冷的細(xì)胞裂解緩沖液洗三次beads。 (4) 將菌體用溶菌酶處理,之后破碎細(xì)菌壁,最大轉(zhuǎn)速4離心20min,收集上清液。 (5) 將細(xì)胞裂解液上清加入beads中,混勻,4,搖床3h。 (6) 3h后,用冰冷的細(xì)胞裂解緩沖液洗三次。 (7) 加15l 2SDS上樣緩沖液,煮沸5min. (8) SDS-PAGE,Western Blot或質(zhì)譜儀分析。,免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)是以抗體和抗原之間的專一性作用為基礎(chǔ)的用于研究蛋白質(zhì)相互作用的經(jīng)典方法。是確定兩種蛋白質(zhì)在完整細(xì)胞內(nèi)
5、生理性相互作用的有效方法。 當(dāng)細(xì)胞在非變性條件下被裂解時(shí),完整細(xì)胞內(nèi)存在的許多蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)間的相互作用被保留了下來。當(dāng)用預(yù)先固化在argarose beads上的蛋白質(zhì)A的抗體免疫沉淀A蛋白,那么與A蛋白在體內(nèi)結(jié)合的蛋白質(zhì)B也能一起沉淀下來。再通過蛋白變性分離,對(duì)B蛋白進(jìn)行檢測(cè),進(jìn)而證明兩者間的相互作用。,三、免疫共沉淀原理,三、免疫共沉淀原理,免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)流程,(1)將菌體用溶菌酶處理,冰上裂解30min,之后破碎細(xì)菌壁,最大轉(zhuǎn)速4離心30min,收集上清液。冰上裂解30min, (2) 取少量裂解液以備Western blot分析,剩余裂解液加1g相應(yīng)的抗體加入到細(xì)菌裂解液,4C緩慢搖晃
6、孵育過夜。 (3) 取10l protein A 瓊脂糖珠,用適量裂解緩沖液洗3 次,每次3,000 rpm離心3 min。 (4) 將預(yù)處理過的10l protein A 瓊脂糖珠加入到和抗體孵育過夜的細(xì)胞裂解液中4C緩慢搖晃孵育2-4h,使抗體與protein A瓊脂糖珠偶連。 (5) 免疫沉淀反應(yīng)后,在4C 以3,000 rpm 速度離心3 min,將瓊脂糖珠離心至管底。將上清小心吸去,瓊脂糖珠用1ml裂解緩沖液洗34次。最后加入15l的2SDS 上樣緩沖液,沸水煮5分鐘。 (6) SDS-PAGE, Western blotting或質(zhì)譜儀分析.,四、雙分子熒光互補(bǔ)技術(shù)( bimole
7、cularfluorescence complementation , BIFC),BiFC技術(shù)是將熒光蛋白(GFP、YFP、CFP)分割成兩個(gè)不具有熒光活性的分子片段,再分別與目標(biāo)蛋白連接。如果兩個(gè)目標(biāo)蛋白因?yàn)橛邢嗷プ饔枚咏褪沟脽晒獾鞍椎膬蓚€(gè)分子片段在空間上相互靠近,重新形成活性的熒光基因而發(fā)出熒光。在熒光顯微鏡下,就能直接觀察到兩目標(biāo)蛋白是否具有相互作用,對(duì)研究蛋白質(zhì)相互作用有重要意義。,BIFC的優(yōu)勢(shì),在最接近活細(xì)胞生理狀態(tài)的條件下觀察到其相互作用的蛋白發(fā)生的時(shí)間、位置、強(qiáng)弱、所形成蛋白復(fù)合物的穩(wěn)定性,以及細(xì)胞信號(hào)分子對(duì)其相互作用的影響等。,五、生物發(fā)光共振能量轉(zhuǎn)移()技術(shù),技術(shù)是近年來出現(xiàn)的一種新的檢測(cè)蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)相互作用的技術(shù)。是建立在非輻射能量轉(zhuǎn)移的基礎(chǔ)上,在一個(gè)發(fā)光或熒光供體發(fā)光酶(lux)和一個(gè)熒光受體(如綠色熒光蛋白G)之間會(huì)發(fā)生能量轉(zhuǎn)移。供體發(fā)光酶在相應(yīng)底物存在時(shí)發(fā)射光波。能量受體是熒光蛋白,在一定波長范圍內(nèi)吸收光波,并在一定的波長范圍內(nèi)發(fā)射光波。 將兩個(gè)目的蛋白分別和供體和受體形成融合蛋白,兩個(gè)目的蛋白之間距離足夠近并發(fā)生相互作用,即可檢測(cè)到信號(hào)。,蛋白質(zhì)
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