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文檔簡介
1、 檢索基礎杜志銀文獻檢索教研室教學團隊杜志銀* 浦科學黃成信息管理系文獻檢索教研室68485017(o)侯筱蓉教 材熟悉醫(yī)院醫(yī)療流程查詢資料科研、教學等課程組成教學內(nèi)容目錄(Content)文獻檢索部分臨床信息系統(tǒng)(9學時)第十一章第一章 檢索基礎第二章 搜索引擎 第四章 第1節(jié) 中國生物醫(yī)學文獻服務系統(tǒng)+1次實習第四章 第2、3、4節(jié) 維普及其它中文數(shù)據(jù)庫+1次實習第四章 第六節(jié) PubMed+1次實習第十章 文獻利用與管理1次理論+2次實習27學時上課地點:理論課教室 實習課A1-3樓學生機房第三章 圖書資源檢索參 考 書 目1.郭繼軍, 醫(yī)學文獻檢索. 第三版,2008, 北京: 人民衛(wèi)
2、生出版社.2.羅愛靜, 醫(yī)學文獻信息檢索. 第二版,2010, 北京: 人民衛(wèi)生出版社.方平, 醫(yī)學文獻信息檢索2005, 北京: 人民衛(wèi)生出版社4.趙文龍,醫(yī)學文獻檢索.第二版,2004,北京:科學技術(shù)出版社重慶醫(yī)科大學精品課程網(wǎng)絡教學平臺 或 考 核 方 式考試方式:開卷考試平時成績: 30%期末考試成績:70%中國工程院院士、上海交通大學醫(yī)學院附屬瑞金醫(yī)院終身教授、著名血液學專家王振義,14日榮獲2010年度國家最高科技獎。 他成功實現(xiàn)了將惡性細胞改造為良性細胞的白血病臨床治療新策略,奠定了誘導分化理論的臨床基礎;確立了治療急性早幼粒細胞白血病(APL)的“上海方案”,闡明了其遺傳學基礎
3、與分子機制,樹立了基礎與臨床結(jié)合的成功典范;建立了我國血栓與止血的臨床應用研究體系。 為什么要學習文獻檢索?這些科學家為什么能獲得巨大的成就呢?為什么要學習文獻檢索?對于一個科研工作者來說,在文獻信息方面,一定要具備三方面的能力:一是文獻信息的獲取能力;二是文獻信息管理能力;三是文獻信息分析和利用的能力。文獻檢索研究生階段的課程為什么要學習文獻檢索?文獻檢索的意義 培養(yǎng)良好的信息素養(yǎng)。解答生活和工作中的疑問為參加工作或研究生階段的科學研究與文獻閱讀打下基礎。跟蹤學術(shù)最新動態(tài)有助于科研創(chuàng)新節(jié)省科研時間,提高工作效率避免無效重復研究主要內(nèi)容第一節(jié) 檢索基礎文獻和文獻檢索 醫(yī)學文獻特點第二節(jié) 檢索工
4、具第三節(jié) 文獻檢索的發(fā)展第一節(jié) 檢索基礎醫(yī)學文獻檢索的學科性質(zhì)醫(yī)學文獻檢索(Medical Literature Retrieval)是一門以培養(yǎng)醫(yī)學生的信息意識、掌握用手工或計算機方式從文獻中獲取知識和科技情報信息的工具性課程,是培養(yǎng)人們獨立學習能力的一種專門知識。目的是傳授如何在知識的汪洋大海中獲取所需目標知識,即學會查找文獻,最終使文獻為我所用,也是繼續(xù)學習、提高自我的有效途徑。 基本概念文獻檢索文獻(一)文獻檢索文獻檢索(Literature Retrieval):利用檢索工具,準確、全面地查詢與特定研究課題有關(guān)的文獻資料的過程就是文獻檢索。 文獻檢索屬于信息檢索(Informatio
5、n Retrieval)的一種,信息檢索的范圍比文獻檢索廣。信息檢索(按檢索對象)文獻檢索:檢索對象為文獻資料(題錄、摘要、全文)數(shù)據(jù)檢索(Data Retrieval):檢索對象為數(shù)值、數(shù)據(jù)(圖表、公式等)事實檢索(Fact Retrieval):檢索對象為客觀事實,如癌癥的治療及預后事實數(shù)據(jù)庫。獲取文獻的方式 1.平時閱讀積累:專業(yè)書、刊、報紙、電視、廣播、Internet 2.同行交流:會議、討論 3.集中檢索獲?。褐饕緩?場所:圖書館、資料室、Internet網(wǎng)絡 工具:工具書、數(shù)據(jù)庫 時間:定期/不定期 4.定題服務:新的獲取文獻信息的方式,前景廣闊定題服務定義:針對特定課題,提供
6、最新文獻的一種服務方式,其服務手段包括: 手工檢索獲取最新文獻服務:圖書館針對專業(yè)用戶的服務方式 RSS服務: 一些網(wǎng)站的個性化服務:我的yahoo!,我的圖書館、Google快訊、my ncbi等方式郵件訂購文獻檢索的手段手工檢索:計算機檢索 (二)文獻問題:你認為什么是文獻?你用過哪些類型的文獻?(二)文獻文獻:記錄有知識的一切載體的統(tǒng)稱。 即用文字、圖像、符號、聲音、音頻、 視頻、編碼等手段記錄的人類知識的各種載體。醫(yī)學文獻根據(jù)不同的劃分標準,可以劃分出種類繁多的各種類型 。常用的標準有: 按載體形式來分 按出版形式分(1)印刷型文獻(2)機讀型文獻:需要借助一定的機器設備方可閱讀的文獻
7、。 縮微型文獻 視聽型文獻 數(shù)字化文獻 印刷型和數(shù)字化型是主要的文獻載體形式按載體形式分(1)圖書(Book): 50頁以上的以印刷方式或其他方式單本刊行的出版物。包括專著、匯編本、多卷本、叢書等 按出版形式分形式特征:書名、作者/編者/譯者、出版者、ISBN號等 優(yōu)點:內(nèi)容全面系統(tǒng),基礎理論性強,論點成熟可靠。 缺點:撰寫、編輯、出版所需要的時間較長,傳遞信息速度慢,內(nèi)容相對陳舊。 適用范圍:對大范圍問題獲得一般性知識,對陌生問題進行一般了解,對熟悉問題進行歷史性的全面系統(tǒng)的回顧(2)期刊(Periodical) :以印刷形式或其他形式逐次刊行的,通常有數(shù)字或年月順序編號,并打算無限期地連續(xù)
8、出版下去的出版物按出版形式分 形式特征:刊名、出版年、卷、期、ISSN號等 優(yōu)點:內(nèi)容新穎;信息量大;按期連續(xù)出版,便于長期跟蹤研究。 缺點:不夠系統(tǒng)全面。 適用范圍:了解學科發(fā)展動態(tài)()會議文獻(Proceeding ):在各種學術(shù)會議上發(fā)表的論文、報告及其他有關(guān)資料。 特點:內(nèi)容新穎,及時性強;學術(shù)水平高,專業(yè)性強,可靠性高,一般是學科關(guān)注的熱點和發(fā)展前沿 按出版形式分()學位論文(Dissertation ):高等院?;蜓芯繖C構(gòu)的學生為獲取某種學位而撰寫的學術(shù)論文。按學位的不同分為學士論文、碩士論文和博士論文 按出版形式分特點:內(nèi)容比較系統(tǒng)、完整、詳細;具有學術(shù)性和獨創(chuàng)性;部分有保密性。
9、但水平可能參差不齊掌握英文單詞()政府(組織)出版物(Government Publication):政府部門及其所屬機構(gòu)所頒發(fā)出版的文獻。 特點:對于了解某國的科技、經(jīng)濟等方面的政策和事件有一定參考價值。 按出版形式分掌握英文單詞()專利文獻(Patent):是專利制度的產(chǎn)物,廣義上是指所有與專利有關(guān)的資料。狹義上的專利文獻僅指專利說明書 特點:內(nèi)容新穎、技術(shù)性強、實用性強并具有法律效力等,是寓技術(shù)、法律和經(jīng)濟于一體的帶有啟發(fā)性的一種重要文獻信息。按出版形式分()標準(Standard Literature):指按規(guī)定程序制訂,經(jīng)公認權(quán)威機構(gòu)(主管機關(guān))批準的一整套在特定范圍(領域)內(nèi)必須執(zhí)
10、行的規(guī)格、規(guī)則、技術(shù)要求等規(guī)范性文獻。 特點:具有法律約束力;從技術(shù)的新穎程度看,當前標準往往是5年前最新的專利。也有少數(shù)專利很快成為標準。 可反映國家或行業(yè)的生產(chǎn)水平 標準號: GB 7907-87 (核桃豐產(chǎn)與堅果品質(zhì)) 標準名稱 年代 順序號 國別/組織代碼按出版形式分()報紙(Newspaper):以刊載新聞和評論為主的出版周期較短的定期連續(xù)性出版物。 特點:傳遞信息快,信息量大,現(xiàn)實感強,傳播面廣,具有群眾性和通俗性,是重要的社會輿論工具和信息源。 按出版形式分(9)科技報告:某項科研成果的立項報告、中試報告、中期階段性報告、結(jié)題報告,或鑒定報告,是關(guān)于某項研究的階段性進展總結(jié)報告或
11、研究成果的正式報告。一般不是正式出版物。 特點:內(nèi)容較為成熟,專深具體按出版形式分文獻的級別 P5 文獻按文獻所含知識的加工層次,即其內(nèi)容性質(zhì)及結(jié)構(gòu)有無變化,可分為三級。 1一次文獻:即原始文獻,通常指作者的原始創(chuàng)作。專著、期刊論文、學位論文、研究報告、會議論文、專利說明書等都屬于一次文獻。 2二次文獻:通稱檢索工具。題錄、目錄、索引、文摘等屬于二次文獻。 3三次文獻:一般是在廣泛利用二次文獻的基礎上,選用大量的一次文獻,經(jīng)過閱讀研究、并濃縮提煉而成。 被認為是一種高級情報。年鑒、進展、述評、綜述等都屬于三次文獻。零次文獻(灰色文獻):未公開發(fā)表的文獻。數(shù)據(jù)錄入檢索文獻歸納總結(jié)綜述找出原始文獻
12、1.數(shù)量龐大醫(yī)學文獻特點 自學第二節(jié) 檢索工具檢 索 工 具檢索工具(定義):是搜集、報道、存貯和查找文獻線索的工具,具有報道、存儲和檢索三方面的職能,是檢索系統(tǒng)的核心和具體體現(xiàn)。 檢索工具(原理)是把大量的文獻進行分析后按照一定的特征順序組織的文獻集合體(有序化的文獻集合),文獻檢索就是根據(jù)一些既定的標識從文獻集合體中選出有關(guān)的文獻。檢索工具的組成檢索系統(tǒng)數(shù)據(jù)庫一個檢索系可以統(tǒng)容納多個數(shù)據(jù)庫,可以同時對多個數(shù)據(jù)庫進行檢索,也可以僅對一個數(shù)據(jù)庫進行檢索。一個數(shù)據(jù)庫也可以在不同檢索系統(tǒng)中運行。 二者都是檢索工具不可或缺的一部分。我們這里所說的檢索工具主要是指面向讀者使用的部分,其實檢索工具的形成
13、與使用還需要包括數(shù)據(jù)的存儲與檢索兩部分。1按出版形式分(1)書本式 期刊式:以期刊的形式連續(xù)出版。如中文科技資料目錄、美國醫(yī)學索引 單卷式:圍繞一定的學科專題,收集積累多年的有關(guān)文獻而編印的。專業(yè)性、系統(tǒng)性強,使用價值高。如糖尿病文獻索引(2)機讀式 以計算機輸入輸出為手段,為計算機檢索而建立的各種數(shù)據(jù)庫。如Medline、CBMdisc等光盤檢索系統(tǒng),Internet網(wǎng)上綜合的及專業(yè)的搜索引擎如Yahoo、Medical Matrix等檢索工具的種類2按收編類型、范圍分(1)綜合性檢索工具:內(nèi)容涉及多領域、多學科,如全國報刊索引。(2)專業(yè)性檢索工具:內(nèi)容僅限于某一學科領域,如內(nèi)科學文獻索引
14、。(3)專題性檢索工具:內(nèi)容僅限于某一特定課題,內(nèi)容更集中,特指性強。如冠心病文獻索引。檢索工具的種類2按著錄格式分 (1)目錄(Catalog) 也稱書目,它是以一個完整出版物(一本書、一種報紙或一本期刊等)為單位,對出版物外表特征進行著錄,如出版物名稱、著者、出版項(出版者、出版地等),沒有具體內(nèi)容。常見的書目有館藏目錄和聯(lián)合目錄。檢索工具的種類2按著錄格式分 (1)目錄(Catalog) 館藏目錄:是揭示圖書館各自收藏書刊資料的目錄。圖書館中最常用的有分類目錄、書名目錄、著者目錄和主題目錄。 聯(lián)合目錄:是匯總?cè)舾蓤D書館或其他收藏單位收藏的書刊資料編制的目錄。利用聯(lián)合目錄可了解館際之間藏書
15、情況,達到資源共享、互通有無。聯(lián)合目錄是館際互借最常使用的檢索工具,有圖書聯(lián)合目錄、期刊聯(lián)合目錄等。檢索工具的種類我校圖書館 2按著錄格式分 (2)索引(Index) 索引是將圖書、期刊等文獻中的論文按內(nèi)容進行分類標引或主題標引后,嚴密組織編排,以題錄的形式注明論文出處。它是以一種完整出版物中的某一知識單元為著錄對象。每一條著錄項就是一條題錄(有時混稱索引為題錄)。 索引還有另一個含義,指某種檢索途徑,如主題索引、著者索引、分子式索引等。檢索工具的種類檢索工具的種類重慶醫(yī)科大學精品課程2按著錄格式分 (3)題錄題錄:指檢索工具所著錄的篇名、著者(可有工作單位和地址)、出處(論文原刊載的刊物名,
16、出版年,卷期頁)、語種等項目,不包括文摘。如中目、外目、美國醫(yī)學索引所著錄的內(nèi)容就是題錄。題錄實例:分 類 號:R457.1; R619.105; R654.1 主 題 詞:手術(shù)后出血/治療; 輸血, 自體; 體外循環(huán); 心臟缺損, 先天性/*外科學2002303047 自體血小板回輸對體外循環(huán)下先天性心臟病患者術(shù)后出血量的影響/韓威力(中國人民解放軍第117醫(yī)院胸心外科)/ 中華醫(yī)學雜志,2002,83(13):926-927檢索工具的種類 (4)文摘(Abstract)文摘是在索引的基礎上更深入一步,以簡明扼要的文字介紹文獻主要內(nèi)容。檢索工具的種類優(yōu)點是幫助判斷檢索是否合乎需要,避免漏檢和
17、誤檢,以及節(jié)省閱讀原文的時間和精力,克服語言障礙。許多外文檢索工具均有英文摘要。網(wǎng)絡時代的文獻信息檢索工具Bibliographic書目 有豐富的元數(shù)據(jù)Full-text全文 用戶最需要的Databases/Collections數(shù)據(jù)庫集合 專業(yè)目錄數(shù)據(jù)庫Aggregations聚合體 通過強大的Web服務 編輯部收到原始論著到刊載出版之間的時間延擱。 刊載原始論文的期刊出版時間與收錄該期刊的檢索工具出版之間的時間差。時差時滯時差是評價檢索工具的指標之一檢索工具的評價信息組織信息組織是文獻檢索的基礎和前提,只有進行信息資源處理并有序化,才能進行有效檢索,文獻檢索則是信息組織的目的和歸宿。信息組
18、織的基本方式包括:主題詞組織法和分類組織法、代碼組織法、字順組織法、時空組織法等。1.主題組織法直接采用信息記錄或信息實體主題概念的詞語標識系統(tǒng)組織排列信息記錄的方法。Nervous System Neoplasms C10.551 神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤 Central Nervous System Neoplasms C10.551.240 中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤 Brain Neoplasms C10.551.240.250 腦腫瘤 Cerebral Ventricle Neoplasms C10.500 腦室腫瘤 Choroid Plexus Neoplasms C10.500.200脈絡叢腫瘤 Pa
19、pilloma,Choroid Plexus C10.500.200.500 乳頭狀瘤,脈絡叢醫(yī)學文獻組織中應用最多的就是(醫(yī)學主題詞表MESH)醫(yī)學主題詞表(敘詞表) 分為15個大類,其中包括:A 解剖 H 自然科學B 有機體 I 人類學,教育,社會學和社會現(xiàn)象C 疾病 J 工藝學、工業(yè)、農(nóng)業(yè)D 化學品和藥物 K 人文科學E 分析、診斷、治療技術(shù)和設備 L 情報科學F 精神病學和心理學 M 人群G 生物科學 N 衛(wèi)生保健 Z 地理名稱 Medical Subject Headings,簡稱MeSH ,NLM出版。 23,887個詞和詞組(2004年) 通過注釋、參照系統(tǒng)與樹形編碼,表達MeS
20、H詞的歷史變遷、主題詞的族性類別、屬分關(guān)系、揭示主題詞之間語義關(guān)系 1.主題組織法MESH收編詞的種類 敘詞(即主題詞) 款目詞(Entry Terms. 一般是經(jīng)常使用的關(guān)鍵詞) Acetylsalicylic Acid( 乙酰水楊酸)see Aspirin(阿司匹林)非主題詞(non MeSH) Digestive system fistula 消化系統(tǒng)瘺(non MeSH) Biliary fistula 膽瘺 Esophageal fistula 食管瘺 Tracheo esophageal fistula 氣管食管瘺 Pancreatic fistula胰腺瘺 Gastric fis
21、tula 胃瘺 1.主題組織法特征詞(Check Tags) 人類、動物、病例報告、比較研究、男(雄)性等。 副主題詞(Subheadings) 副主題詞是限定主題概念的規(guī)范化詞匯,對主題詞起細分作用或揭示多個主題詞之間的關(guān)系。 副主題詞沒有獨立的檢索意義,其作用是增加主題概念的專指性,提高檢索效率 。 副主題詞現(xiàn)有83個,使用范圍詳見37-43頁。 1.主題組織法參照系統(tǒng) “見”“代”參照 Acetylsalicylic acid see Aspirin Aspirin X Acetylaslicylic acid “屬”“分”參照 Contraception, immunologic se
22、e under contraception contraception XU Contraception, immunologic 相關(guān)參照:Family planning see related ContraceptionContraception XR Family planning1.主題組織法使用MESH進行檢索2.分類組織法按照事先確定好的分類體系對信息記錄和信息實體進行組織的方法。常用的分類方法是中國圖書館分類法。中國圖書館分類法 中國圖書館分類法(簡稱中圖法)是目前國內(nèi)最常用的體系分類語言。 1975年出版第一版 1998年出版第四版 2010年出版第五版 中圖法以各門學科的特點
23、和規(guī)律為基礎,按照知識門類的邏輯次序,將學科劃分為五個基本部類、二十二個基本大類。 中圖法的五個部類為:馬克思主義、列寧主義、毛澤東思想;哲學;社會科學;自然科學;綜合性圖書。 A 馬克思主義、列寧主義、毛澤東思想B 哲學C 社會科學總論D 政治、法律E 軍事F 經(jīng)濟 G 文化、科學、教育、體育H 語言、文字I 文學 J 藝術(shù)K 歷史、地理N 自然科學總論O 數(shù)理科學和化學P 天文學、地球科學Q 生物科學R 醫(yī)藥、衛(wèi)生S 農(nóng)業(yè)科學T 工業(yè)技術(shù)U 交通運輸V 航空、航天X 環(huán)境科學Z 綜合性圖書中圖法二十二個大類中國圖書館分類法 R1 預防醫(yī)學、衛(wèi)生學 2 中國醫(yī)學 3 基礎醫(yī)學 4 臨床醫(yī)學
24、R551 造血系疾病 5 內(nèi)科學 552 血液疾病 55 血液系疾病 554 出血性疾病 6 外科學 56 呼吸系疾病 556 貧血病 71 婦產(chǎn)科學 57 消化系疾病 5566 溶血性貧血 72 兒科學 58 內(nèi)分泌疾病 557 白細胞疾病 73 腫瘤學 74 神經(jīng)病學與精神病學 75 皮膚病學與性病學 76 耳鼻咽喉科學 77 眼科學 78 口腔科學 79 外國民族醫(yī)學 8 特種醫(yī)學 9 藥學 R51 傳染病 52 結(jié)核病 53 寄生蟲病 54 心血管疾病R 醫(yī)藥、衛(wèi)生中圖法層層隸屬、逐級展開的邏輯體系 中國圖書館分類法 類名: 老年病學 分類號: R592 注釋: 總論老年醫(yī)學、老年病學
25、的文獻入此, 專論入有關(guān)各類。例如:老年生理入R339.34; 老年口腔疾病入R787; 老年心理學入B844.4。中國圖書館分類法 中圖法可以用到圖書館圖書分類排架,圖書在版編目,數(shù)據(jù)庫組織,網(wǎng)絡資源組織等方面計算機檢索的基本技術(shù) 計算機檢索的查尋過程實際上就是將用戶的檢索提問與數(shù)據(jù)庫的檢索標識相比較決定取舍的過程,兩者比較結(jié)果相一致者即為命中。命中的中間結(jié)果可以再次與新的提問式相比較匹配。一個檢索課題通常經(jīng)過如此多次的修飾匹配檢索,直至最終命中檢出的文獻符合用戶的需求。在這個查尋過程中,主要采用以下幾種基本檢索技術(shù)。 布爾邏輯檢索 截詞檢索 字段限制檢索位置檢索計算機檢索的基本技術(shù)布爾邏輯
26、檢索 布爾邏輯檢索有三個基本運算符:邏輯與(積),邏輯或,邏輯非。 邏輯與 計算機運算符為:A and B 或 A*B 邏輯與是指檢索結(jié)果應同時滿足兩個和多個檢索概念,即在命中結(jié)果中同時出現(xiàn)A和B兩個檢索詞,黑色部分即為命中結(jié)果。 AB邏輯或 計算機運算符為:A or B 或 A+B 邏輯或是指命中結(jié)果無論論及A或B均為命中,圖示劃線部分即為命中結(jié)果。 BA計算機檢索的基本技術(shù)邏輯非 計算機運算符:A not B 或 A and not B 或 A-B 邏輯非是指一個命中結(jié)果中去除含有另一主題的文獻。A not B表示在A文獻中去除論及B的文獻的文獻。 AB計算機檢索的基本技術(shù)運算優(yōu)先級為:
27、( ) NOT AND OR。 重慶醫(yī)科大學精品課程截詞檢索 截詞(Truncation)檢索就是把檢索詞截斷,取其中的一部分片段,再加上截詞符號一起檢索,計算機按照詞的片段與數(shù)據(jù)庫里的索引詞對比匹配,凡包含有這些詞的片段的文獻均被檢出。 截詞方式有右(后)截詞、左(前)截詞和中間截詞(插入)截詞三種。 截詞符號有問號?、星號*、井字符#等。 右(后)截詞是使用最多的一種截詞檢索方式。 計算機檢索的基本技術(shù)字段限制檢索 指定檢索提問在特定字段中出現(xiàn),只有在指定的字段中出現(xiàn)與檢索提問相同的記錄才被檢索出來。如要求檢索的內(nèi)容在題目中出現(xiàn)。一般形式:選擇字段,輸入關(guān)鍵詞進行限定; 或直接輸入字段符號和檢索詞進行限定 不同數(shù)據(jù)庫有不同形
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