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1、實(shí)驗(yàn)八質(zhì)粒提取與電泳Extraction and Identification of Recombinant Plasmid實(shí) 驗(yàn) 目 的1、學(xué)習(xí)堿裂解法提取質(zhì)粒的原理2、學(xué)習(xí)DNA瓊脂糖凝膠電泳的原理和方法3、掌握質(zhì)粒提取及鑒定的基本操作實(shí) 驗(yàn) 原 理質(zhì)粒(Plasmid)是細(xì)菌染色體外的遺傳物質(zhì),為環(huán)形閉合的雙股DNA。 質(zhì)粒具有可自主復(fù)制、傳給子代、也可丟失及在細(xì)菌之間轉(zhuǎn)移等特性,與細(xì)菌的遺傳變異有關(guān)。 在基因工程中質(zhì)粒常被用做基因的載體。 DNA瓊脂糖凝膠電泳: 電荷效應(yīng)與分子篩效應(yīng) 核酸從負(fù)極向正極泳動(dòng),小分子泳動(dòng)速度較快 質(zhì)粒DNA較染色體DNA小,且具有超螺旋共價(jià)閉合環(huán)狀的特點(diǎn)。
2、 pH調(diào)至中性,變性的質(zhì)粒DNA恢復(fù)到原來(lái)的構(gòu)型, 而染色體DNA不能復(fù)性,與蛋白質(zhì)一起沉淀。 堿變性條件下, 染色體DNA雙螺旋解開而變性,而質(zhì)粒DNA部分解開, 雙鏈不會(huì)完全分離。實(shí) 驗(yàn) 步 驟取1.5ml菌液,9000rpm離心30秒,盡可能的倒干上清。用250l溶液P1重懸菌體沉淀,槍頭反復(fù)抽吸至菌體徹底懸浮。P1:葡萄糖:制造低滲環(huán)境,增加細(xì)菌細(xì)胞膜的通透性; 增加溶液的粘稠度,使懸浮后的大腸桿菌不會(huì)快速沉底。 EDTA:螯合核酸酶加250l溶液P2,溫和地上下翻轉(zhuǎn)10次使菌體充分裂解至清亮。P2:NaOH/SDS溶液,是最佳的溶解細(xì)胞的試劑。 NaOH使DNA變性,SDS使蛋白質(zhì)變
3、性。染色體與蛋白質(zhì)纏繞。加400l溶液P3,立即溫和地上下翻轉(zhuǎn)10次,放置5min。13000rpm離心10min,小心取上清。P3:醋酸/醋酸鉀溶液,使溶液pH值恢復(fù)接近中性。此時(shí)質(zhì)粒DNA復(fù)性,而染色體DNA難以復(fù)性。SDS遇到K+變成十二烷基硫酸鉀,不溶于水,連同結(jié)合的蛋白質(zhì)和纏繞其上的染色體DNA共同沉淀。加500l去蛋白液PE,13000rpm離心60sec,棄濾液。加500l漂洗液WB,13000rpm離心60sec,棄濾液。(重復(fù)一遍)取出吸附柱,放入干凈離心管中,在吸附膜中間部位加40l洗脫緩沖液EB,放置1min,13000rpm離心1min洗脫DNA,-20保存??罩?30
4、00rpm離心2min。敞口放置3min,除去殘留乙醇。將上清液加入吸附柱中,13000rpm離心1min,棄濾液。注意:吸附柱使用前需先處理。將吸附柱置于收集管上,加500l溶液P4,13000rpm離心1min,棄濾液。P4:緩沖液,濕潤(rùn)、平衡吸附膜加250l溶液P2,溫和地上下翻轉(zhuǎn)610次使菌體充分裂解,至溶液變清亮。取1.5ml菌液,9000rpm離心30秒,盡可能的倒干上清。用250l溶液P1重懸菌體沉淀,槍頭反復(fù)抽吸至菌體徹底懸浮。加400l溶液P3,立即溫和地上下翻轉(zhuǎn)610次,放置5min。13000rpm離心10min,小心取上清。吸附柱置于收集管上,加500l溶液P4,130
5、00rpm離心1min,棄濾液。加500l去蛋白液PE,13000rpm離心3060sec,棄濾液。加500l漂洗液WB,13000rpm離心3060sec,棄濾液。(重復(fù)一次)取出吸附柱,放入干凈離心管中,在吸附膜中間部位加40l洗脫緩沖液EB(洗脫緩沖液事先在6570水浴中加熱效果更好),放置1min,13000rpm離心1min洗脫DNA,-20保存。空柱13000rpm離心2min。放置35min,除去殘留乙醇。將上清液加入吸附柱中,13000rpm離心1min,棄濾液。瓊脂糖凝膠電泳樣品:10 l質(zhì)粒樣品 + 2 l上樣緩沖液,混勻電泳:90120mA,電泳2040分鐘配膠:瓊脂糖凝膠粉,溶于TBE緩沖液中, 配成1%1.2%的瓊脂糖凝膠上樣:將樣品用微量移液器加入凝膠孔中2000bp 1000bp750bp500bp250bp100bpMarkerPEP實(shí) 驗(yàn) 結(jié) 果負(fù)極正極注 意 事 項(xiàng)1、注意無(wú)菌操作,避免細(xì)菌污染質(zhì)粒;2、瓊脂糖凝膠的配制、使用過程中用到溴化乙錠(EB) 是強(qiáng)誘
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