第3章-細(xì)胞分化的分子機(jī)制_第1頁
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文檔簡介

第三章細(xì)胞分化的分子機(jī)制細(xì)胞生長細(xì)胞代謝細(xì)胞增殖細(xì)胞分化細(xì)胞通訊細(xì)胞衰老細(xì)胞死亡……細(xì)胞類型形成組織器官形成個(gè)體發(fā)育基因表達(dá)調(diào)控

細(xì)胞的重大生命活動(dòng):細(xì)胞分化(celldifferentiation):細(xì)胞經(jīng)分裂形成在形態(tài)、結(jié)構(gòu)和功能上不同的穩(wěn)定的細(xì)胞類群的過程;是個(gè)體發(fā)育的基礎(chǔ)和核心。1、細(xì)胞分化是生物個(gè)體發(fā)育的中心問題研究細(xì)胞分化的分子機(jī)制是是探索發(fā)育機(jī)制的基礎(chǔ)。在多細(xì)胞生物體內(nèi),每個(gè)細(xì)胞都有一定的性狀-細(xì)胞表型(cellphenotypes)。根據(jù)細(xì)胞表型可將細(xì)胞分為3類:

1)全能細(xì)胞(totipotentcell)

2)多潛能細(xì)胞(pluripotentcell)

3)分化細(xì)胞(differentiatedcell)。細(xì)胞分化的過程是一個(gè)從全能細(xì)胞-多能細(xì)胞-分化細(xì)胞的逐點(diǎn)發(fā)展過程。2、細(xì)胞分化是基因差異性表達(dá)的結(jié)果現(xiàn)代分子生物學(xué)的證據(jù)表明,細(xì)胞分化是由于基因差異性表達(dá)(differentialexpress)的結(jié)果。正是由于不同基因的差異表達(dá),產(chǎn)生特有的專一性蛋白質(zhì)而導(dǎo)致細(xì)胞形態(tài)、結(jié)構(gòu)與功能的差異。差異性基因表達(dá)產(chǎn)生的原因主要來自兩方面:首先是細(xì)胞內(nèi)環(huán)境的差異影響核基因的表達(dá)(不等卵裂導(dǎo)致的卵質(zhì)的不均勻分布);其次是細(xì)胞外環(huán)境的影響(位置效應(yīng)和胚胎誘導(dǎo))。各種細(xì)胞外信號分子,通過誘導(dǎo)和細(xì)胞間的通訊,特別是信號傳導(dǎo)(signaling)間接影響細(xì)胞核基因的表達(dá)。細(xì)胞分化中基因差異性表達(dá),在動(dòng)物發(fā)育過程中呈現(xiàn)出時(shí)空表達(dá)特征?;虿町愋员磉_(dá)的調(diào)控機(jī)制主要在以下幾個(gè)水平完成:

①基因的差異轉(zhuǎn)錄;②RNA前體的選擇加工;③mRNA的選擇翻譯;④差異蛋白質(zhì)的加工。⑤表觀遺傳修飾。事實(shí)上,在胚胎發(fā)育過程中,差異基因表達(dá)的調(diào)控機(jī)制十分復(fù)雜,涉及到多個(gè)水平的調(diào)控:包括染色體水平、DNA水平、轉(zhuǎn)錄水平、轉(zhuǎn)錄后加工、翻譯水平、翻譯后加工等。但以轉(zhuǎn)錄調(diào)控為主。圖3-1真核生物基因表達(dá)調(diào)控示意圖同一有機(jī)體的多種細(xì)胞具有完全相同的一套基因結(jié)構(gòu),即基因組的等同;具有相同基因結(jié)構(gòu)的細(xì)胞由于受到內(nèi)外環(huán)境條件和復(fù)雜的調(diào)控,出現(xiàn)差異基因表達(dá),合成組織專一性產(chǎn)物,呈現(xiàn)細(xì)胞形態(tài)和功能的分化。第一節(jié)

基因組的等同和基因的差異表達(dá)一、在發(fā)育中核潛能被限定研究方法:核移植實(shí)驗(yàn)--豹蛙不同胚胎發(fā)育細(xì)胞核移植的觀察、克隆動(dòng)物實(shí)驗(yàn)。實(shí)驗(yàn)結(jié)論:隨著個(gè)體發(fā)育的進(jìn)行,體細(xì)胞核指導(dǎo)發(fā)育的潛能逐點(diǎn)受到限定,且呈現(xiàn)一定的組織特異性。二、細(xì)胞核具有潛在全能性的研究研究方法:核克?。╪uclearcloning)技術(shù)。實(shí)驗(yàn)結(jié)論:已分化的細(xì)胞和不同發(fā)育時(shí)期胚胎細(xì)胞的核與合子核一樣,含有全套物種基因信息具有分化產(chǎn)生有機(jī)體各種細(xì)胞的潛能(P25)。

體細(xì)胞克隆實(shí)驗(yàn)1)1995年,kampbellK(坎貝爾)成功進(jìn)行了綿羊分化細(xì)胞克隆實(shí)驗(yàn)(胚泡內(nèi)細(xì)胞團(tuán)作供體),是世界上首例哺乳動(dòng)物分化細(xì)胞細(xì)胞核具有發(fā)育全能性的報(bào)道。2)1997年,克隆羊Dolly成功誕生(以乳腺細(xì)胞作供體),

1998年4月,多莉通過自然交配產(chǎn)生羊羔-邦莉。3)隨后,人們分別在牛、小鼠、山羊、猴和豬等動(dòng)物體細(xì)胞克隆獲得成功。這些實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步證明了絕大多數(shù)動(dòng)物細(xì)胞的核都具有潛在的全能性。Figure3-2Dollyandherfostermother圖3-3

圖3-4表3-1

細(xì)胞核的全能性是指一個(gè)細(xì)胞核具有該物種完整的遺傳信息,在適當(dāng)條件下能夠發(fā)育成一個(gè)完整個(gè)體的能力。具有全能性的細(xì)胞包括植物體細(xì)胞、動(dòng)物受精卵和早期胚胎細(xì)胞(未決定的細(xì)胞)。細(xì)胞的全能性與細(xì)胞核的全能性是兩個(gè)不同的概念,植物體細(xì)胞具有全能性,而已分化的動(dòng)物細(xì)胞失去全能性,因?yàn)樵趧?dòng)物胚胎發(fā)育過程中,由于內(nèi)外環(huán)境條件的影響,發(fā)育命運(yùn)逐點(diǎn)收到限制,一旦細(xì)胞決定發(fā)生,發(fā)育方向便被確定,隨后出現(xiàn)細(xì)胞分化,一般情況下不可逆。1、染色體消減

1)馬回蟲(Ascarimegaloceplala)發(fā)育過程中體細(xì)胞染色體的減少(丟失80﹪),僅生殖細(xì)胞染色體不減少;

2)癭蠅(Myaetioladestructor)受精卵核分裂中大部分細(xì)胞核染色體由40條減少為8條,這些細(xì)胞將來發(fā)育為體細(xì)胞,僅將來發(fā)育為生殖細(xì)胞的細(xì)胞染色體不減少。2、基因重排:淋巴細(xì)胞分化過程中免疫球蛋白基因的重排。免疫球蛋白(抗體)的多態(tài)性是由其基因重排導(dǎo)致的;三、發(fā)育中基因組的改變圖3-5VJCVJCVJC圖3-6免疫球蛋白IgG基因許多片段發(fā)生重排基因重排的結(jié)果是原來胚胎細(xì)胞基因組中不相連的DNA片段,通過部分切除、重新組合、連接形成抗體基因輕鏈和重鏈,使每個(gè)B淋巴細(xì)胞都具有其獨(dú)特的基因組。T淋巴細(xì)胞受體基因也通過類似的基因重排過程。3、基因擴(kuò)增:兩棲類核糖體RNA基因的基因擴(kuò)增。rRNA基因以串聯(lián)的方式重復(fù)排列:18S、5.8S、28S三種rRNA基因連在一起,構(gòu)成一個(gè)大的RNA基因轉(zhuǎn)錄單位,串聯(lián)重復(fù)5000次。每個(gè)轉(zhuǎn)錄單位具有一個(gè)5'的前導(dǎo)序列、18SrRNA基因編碼序列、轉(zhuǎn)錄間隔(ITS1)、5.8SrRNA基因、轉(zhuǎn)錄間隔(ITS2)28SrRNA基因。Figure3-7TheeukaryoticribosomalDNArepeatingunit發(fā)育的核心是細(xì)胞分化,本質(zhì)是基因的時(shí)空表達(dá)、產(chǎn)生特異性蛋白質(zhì)的過程?;虮磉_(dá)的時(shí)間特異性指有些特異性基因僅在發(fā)育的特定時(shí)期或某些時(shí)期才有活性,其他時(shí)期均無活性。研究方法:減法雜交技術(shù)、斑點(diǎn)印跡和放射自顯影等?;虮磉_(dá)的空間特異性主要指基因表達(dá)的組織特異性。研究方法:原位雜交。第二節(jié)轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控一、差異基因表達(dá)的研究方法1、卵清蛋白基因的轉(zhuǎn)錄卵清蛋白的轉(zhuǎn)錄依賴于雌性激素的調(diào)節(jié);雌性激素進(jìn)入細(xì)胞與受體結(jié)合形成復(fù)合物,經(jīng)構(gòu)相變化后,該復(fù)合物經(jīng)核孔進(jìn)入細(xì)胞核并結(jié)合于染色體的特定區(qū)域,激活和促進(jìn)卵清蛋白基因的轉(zhuǎn)錄。卵白蛋白:卵清蛋白、附卵蛋白、卵粘蛋白和溶菌酶。二、發(fā)育中基因轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控2、珠蛋白基因的轉(zhuǎn)錄紅細(xì)胞發(fā)育中珠蛋白基因的表達(dá)是細(xì)胞分化轉(zhuǎn)錄控制的最好例證:

人和許多動(dòng)物的血紅蛋白為四聚體,在不同發(fā)育時(shí)期的組成均不相同。

圖3-7珠蛋白基因的表達(dá)調(diào)控人胚胎血紅蛋白由2個(gè)ξ-珠蛋白鏈,2個(gè)ε珠蛋白鏈和4個(gè)血紅素分子組成。隨后,隨著胚胎發(fā)育的進(jìn)行,血紅蛋白珠蛋白從胎兒的a2

γ2

,到成人的a2β2

,正常成人的血紅蛋白分子中a2β2占97﹪,a2δ2占2﹪~占3﹪

,a2γ2

占1﹪。人的ξ和a珠蛋白基因位于第16號染色體上,而ε-、γ-、δ-和β-珠蛋白基因相連,在第11號染色體上依次排列,β珠蛋白基因家族的表達(dá)顯示了一種調(diào)控機(jī)制,即指導(dǎo)其從胚胎期-胎兒期-成體型轉(zhuǎn)變的順序開關(guān)。研究發(fā)現(xiàn),其DNA上存在一些位點(diǎn)控制區(qū)(LCR),相當(dāng)于一種超級增強(qiáng)子,進(jìn)行調(diào)控。圖3-8珠蛋白基因家族有功能的珠蛋白基因的基本結(jié)構(gòu):三個(gè)外顯子被兩個(gè)內(nèi)含子隔開。類(16)和類珠蛋白基因家族(11)人在發(fā)育過程中的血紅蛋白類型圖3-93、5SrRNA的基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控整個(gè)發(fā)育過程中,5SrRNA基因表達(dá)調(diào)控都在轉(zhuǎn)錄水平進(jìn)行。5SrRNA基因家族有兩類基因,即卵母細(xì)胞型和體細(xì)胞型。非洲爪蟾有20000個(gè)卵母細(xì)胞型的5SrRNA基因和400個(gè)體細(xì)胞型的5SrRNA基因。在卵子發(fā)生早期,兩類5SRNA基因均開始大量轉(zhuǎn)錄,并維持到囊胚中期,而從囊胚晚期開始,僅有體細(xì)胞型5SRNA基因轉(zhuǎn)錄。中心啟動(dòng)子元件:5SrRNA基因由RNA聚合酶III所控制,它具有一個(gè)特殊的、位于基因中間的啟動(dòng)子-中心啟動(dòng)子元件。該元件包括A、C兩個(gè)區(qū),其中A區(qū)(50-69)與TFIIIC結(jié)合;C區(qū)(80-90)與TFIIIA及RNA聚合酶III結(jié)合。TFIIIC-TFIIIA相互作用共同促進(jìn)5SRNA基因的轉(zhuǎn)錄。

開關(guān)基因是指在發(fā)育中決定細(xì)胞向不同命運(yùn)分化的基因。常見的開關(guān)基因有l(wèi)in-12基因、Notch基因和MyoD1基因。

1)線蟲的lin-12基因:決定子宮頸細(xì)胞(Z1.Ppp產(chǎn)生,ac)

和子宮前體細(xì)胞(Z4.Aaa產(chǎn)生,vu)的分化。

2)果蠅的Notch基因:決定果蠅皮膚細(xì)胞和神經(jīng)細(xì)胞分化。

3)脊椎動(dòng)物的MyoD1基因:是肌細(xì)胞分化的主要開關(guān)基因,具有肌細(xì)胞分化表型特異性控制基因的功能,該基因編碼一種核DNA結(jié)合蛋白,能夠與DNA中肌肉特異性基因的臨近片段結(jié)合并激活這些基因,引起肌細(xì)胞分化。4、轉(zhuǎn)錄調(diào)控的開關(guān)基因真核生物的蛋白質(zhì)編碼基因由可轉(zhuǎn)錄、具編碼能力的外顯子和無編碼能力、最終在mRNA成熟中被切除的內(nèi)含子序列、基因表達(dá)調(diào)控序列(如啟動(dòng)子、增強(qiáng)子等)組成。一個(gè)典型的真核生物基因包括核心啟動(dòng)子元件、上游及遠(yuǎn)上游調(diào)控序列、轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)、5'非編碼區(qū)、起始密碼、外顯子、內(nèi)含子、終止密碼、3'非編碼區(qū)及加尾信號等(圖2-15,16)。三、差異基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控機(jī)制1.真核細(xì)胞基因的結(jié)構(gòu)

圖3-10圖3-11真核生物基因轉(zhuǎn)錄起始和表達(dá)的調(diào)控依賴于兩類調(diào)控元件的相互作用:一類是順式作用元件,另一類是反式作用因子。啟動(dòng)子和增強(qiáng)子是基因主要的順式作用元件,控制著與其相鄰的結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)。反式作用因子由染色體上其他位置的基因編碼,包括具有調(diào)控作用的蛋白因子和RNA,它們可作用于目標(biāo)基因的順式作用元件。啟動(dòng)子一般位于結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游,而增強(qiáng)子位置變化較大,主要位于啟動(dòng)子的上游或者遠(yuǎn)上游、也可位于第一內(nèi)含子及基因其他位置(如3'非編碼區(qū))。2、啟動(dòng)子和增強(qiáng)子啟動(dòng)子是位于轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游特殊的DNA序列。它能與RNA聚合酶II及相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子識(shí)別和結(jié)合,決定基因轉(zhuǎn)錄的起始和強(qiáng)度。根據(jù)真核生物基因的類型和RNA聚合酶的種類可分為三類:

1)由RNA聚合酶I識(shí)別的核糖體RNA的基因(包括18SRNA和

28SRNA);

2)由RNA聚合酶II識(shí)別的蛋白質(zhì)編碼基因;

3)由RNA聚合酶III識(shí)別的tRNA及5SRNA的基因。二類基因啟動(dòng)子一般具有TATA框和CAAT框。其中TATA位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游25-30bp處,主要控制轉(zhuǎn)錄的精確起始;CAAT框位于其上游,調(diào)控轉(zhuǎn)錄起始頻率和維持基因轉(zhuǎn)錄強(qiáng)度。1)啟動(dòng)子的結(jié)構(gòu)和功能Figure3-12structureandorganizationofaeukaryoticgene2)增強(qiáng)子的結(jié)構(gòu)和功能增強(qiáng)子是一種能夠提高轉(zhuǎn)錄效率的順式調(diào)控元件,最早是在SV40病毒中發(fā)現(xiàn)的長約200bp的一段DNA,可使旁側(cè)的基因轉(zhuǎn)錄提高100倍,其后在真核生物、原核生物中都發(fā)現(xiàn)。在真核生物基因中,首先發(fā)現(xiàn)的是一種控制細(xì)胞特異性免疫的基因,即免疫球蛋白基因轉(zhuǎn)錄的增強(qiáng)子。這種增強(qiáng)子位于免疫球蛋白重鏈可變區(qū)基因與恒定區(qū)基因之間的內(nèi)含子序列中,對B淋巴細(xì)胞免疫球蛋白基因的特異性轉(zhuǎn)錄是必須的。增強(qiáng)子的功能是激活啟動(dòng)子、控制啟動(dòng)子特異性轉(zhuǎn)錄的效率和速率。而轉(zhuǎn)錄過程的調(diào)節(jié)主要取決于增強(qiáng)子上結(jié)合的蛋白質(zhì)與啟動(dòng)子上裝配的轉(zhuǎn)錄復(fù)合物的相互作用。增強(qiáng)子的作用無位置和方向性。

①增強(qiáng)子可以提高同一條DNA鏈上基因轉(zhuǎn)錄效率,可以遠(yuǎn)距離作用,通??删嚯x1-4kb、個(gè)別情況下離開所調(diào)控的基因基因30kb仍能發(fā)揮作用。②增強(qiáng)子作用與其序列的正反方向無關(guān),將增強(qiáng)子方向倒置依然能起作用。③增強(qiáng)子必須與特定蛋白質(zhì)因結(jié)合后才能發(fā)揮增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄的作用,且具有組織或細(xì)胞特異性。④增強(qiáng)子要有啟動(dòng)子才能發(fā)揮作用,沒有啟動(dòng)子存在,增強(qiáng)子不能表現(xiàn)活性。

增強(qiáng)子的作用特點(diǎn)3、反式作用因子及轉(zhuǎn)錄因子RNA的轉(zhuǎn)錄起始,除啟動(dòng)子、增強(qiáng)子等順式作用元件外,還必須有與之結(jié)合的RNA聚合酶和各種反式作用因子,其中主要的反式作用因子是轉(zhuǎn)錄因子(transcriptionfactor)。轉(zhuǎn)錄因子能精確、高效地與啟動(dòng)子上的特定順式作用元件結(jié)合,決定基因轉(zhuǎn)錄的時(shí)間特異性和強(qiáng)度。轉(zhuǎn)錄因子一般具有三個(gè)結(jié)構(gòu)域:DNA結(jié)合域、轉(zhuǎn)錄激活域和其他蛋白互作的結(jié)構(gòu)域(圖2-18)。第二類基因的轉(zhuǎn)錄必須有基礎(chǔ)轉(zhuǎn)錄因子的存在,已鑒定的基礎(chǔ)轉(zhuǎn)錄因子有:TFIID、TFIIA、TFIIB、TFIIC、TFIIH、TFIIJ等(圖2-19)。

圖3-13轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)域及活化示意圖

圖3-14轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的形成

1)常見的轉(zhuǎn)錄因子有:TFIID、

TFIIB、TFIIA、TFIIE、

TFIIF等。

2)這些轉(zhuǎn)錄因子按一定順序形成有活性的復(fù)合物發(fā)揮作用。

TFIID-TFIIA-TFIIB-(TFIIE+TFIIF+RNA聚合酶II)。

3)其他因子的進(jìn)一步結(jié)合,形成活性復(fù)合物,開啟基因轉(zhuǎn)錄過程。

除了通用轉(zhuǎn)錄因子,還有大量與啟動(dòng)子上游調(diào)節(jié)元件結(jié)合的特殊轉(zhuǎn)錄因子,它們與RNA聚合酶直接作用或者通過中介蛋白與其間接作用,共同決定基因轉(zhuǎn)錄的強(qiáng)度、時(shí)空特異性。真核生物轉(zhuǎn)錄因子有多種結(jié)構(gòu)模式,如a螺旋-轉(zhuǎn)角-a螺旋、鋅指結(jié)構(gòu)、亮氨酸拉鏈、螺旋-環(huán)-螺旋等(圖3-15)。動(dòng)物發(fā)育中重要的轉(zhuǎn)錄因子有同源異型框蛋白、POU蛋白等:

1)同源異型框蛋白:是由同源異型基因編碼,含60個(gè)氨基酸組成的同源異型結(jié)構(gòu)域的反式作用因子,其突變可導(dǎo)致同源異型突變,產(chǎn)生同源異型現(xiàn)象。具體作用見后。

2)POU蛋白:該轉(zhuǎn)錄因子除含有同源異型結(jié)構(gòu)域,還含有一個(gè)POU特殊性結(jié)合區(qū),共同構(gòu)成POU結(jié)構(gòu)域。參與許多激素基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控(圖3-16)。圖3-15(1)螺旋-折疊-螺旋結(jié)構(gòu)模式圖3-15(2)鋅指(zincfinger)結(jié)構(gòu)模式圖3-15(3)亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu)模式圖3-15(4)螺旋-環(huán)-螺旋結(jié)構(gòu)模式

圖3-16圖3-174、激素應(yīng)答成分同一種激素可誘導(dǎo)一種類型的細(xì)胞同時(shí)產(chǎn)生幾種特異蛋白,也可誘導(dǎo)不同類型細(xì)胞的多個(gè)基因同時(shí)發(fā)生表達(dá)。在發(fā)育過程中,基因表達(dá)的協(xié)同調(diào)節(jié),是通過不同的結(jié)構(gòu)基因位置接近或者具有相似的增強(qiáng)子所致。特例:糖皮質(zhì)激素作為一種類固醇激素,可調(diào)節(jié)所有類型細(xì)胞的蛋白質(zhì)代謝、減少組織的纖維化。激素受體蛋白具有3個(gè)功能結(jié)構(gòu)域:激素結(jié)合域、DNA結(jié)合域和反式激活域。研究發(fā)現(xiàn),激素對基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控既有正調(diào)控又有負(fù)調(diào)控,但不同結(jié)構(gòu)域的調(diào)控機(jī)制又有所不同。5、免疫球蛋白基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控1)免疫球蛋白基因免疫球蛋白(抗體)的多態(tài)性主要起因于基因重排;抗體由兩個(gè)重鏈和兩個(gè)輕鏈組成;重鏈和輕鏈均分可變區(qū)(N端)和恒定區(qū)(C端),抗體多態(tài)性決定于可變區(qū)。免疫球蛋白輕鏈和重鏈由不同基因片段編碼。編碼抗體輕鏈的基因含有三個(gè)DNA片段:

V片段(300種不同序列片段,編碼可變區(qū)97個(gè)氨基);

J片段(4-5個(gè)不同序列片段,編碼可變區(qū)15-17個(gè)氨基);

C片段(編碼輕鏈恒定區(qū))。編碼抗體重鏈的基因含有4個(gè)片段:

V片段(200種不同片段,編碼可變區(qū)氨基端97個(gè)氨基酸);

D片段(10-15種不同片段,編碼可變區(qū)3-14個(gè)氨基酸);

J片段(四個(gè)不同片段,編碼可變區(qū)最后15-17個(gè)氨基酸);

C片段(編碼重鏈恒定區(qū));2)免疫球蛋白基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)節(jié)在B細(xì)胞的分化過程中,免疫球蛋白基因不同片段經(jīng)過移動(dòng)、剪接和重排,損失部分DNA片段,產(chǎn)生不同表達(dá)基因。免疫球蛋白基因的順式調(diào)節(jié):免疫球蛋白基因轉(zhuǎn)錄的順式調(diào)節(jié)序列主要是啟動(dòng)子和增強(qiáng)子。圖3-18抗體變異的分子基礎(chǔ)A.這些順式作用元件常位于重鏈和輕鏈基因的附近,能與一些細(xì)胞核內(nèi)的因子結(jié)合,參與免疫球蛋白基因的轉(zhuǎn)錄。

B.例如每個(gè)細(xì)胞中有V基因,每個(gè)V基因都有自己的啟動(dòng)子,但在一個(gè)成熟的漿細(xì)胞中僅有一個(gè)V基因表達(dá)。免疫球蛋白基因表達(dá)的反式調(diào)節(jié):反式調(diào)節(jié)因子由免疫球蛋白基因以外的基因編碼,并能與順式調(diào)節(jié)的DNA序列結(jié)合,參與免疫球蛋白基因的表達(dá)(B淋巴細(xì)胞中存在的正調(diào)控)。6、轉(zhuǎn)錄因子活性的調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子能調(diào)控特定基因的轉(zhuǎn)錄,而轉(zhuǎn)錄因子本身也是蛋白質(zhì),其自身合成同樣受到其他轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控。在發(fā)育過程中,通過磷酸化途徑也可調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子的活性。圖3-19RNA加工有多種形式,例如多個(gè)可選擇的5'轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn),多個(gè)內(nèi)含子的可變剪接、可選擇的3'終止信號及RNA堿基的不同修飾等。特例1:B淋巴細(xì)胞重鏈基因lgM和lgD的表達(dá)產(chǎn)物mRNA的不同剪接(圖3-20)。特例2:原肌球蛋白基因在肝、大腦、骨骼肌、平滑肌及成纖維細(xì)胞中的不同表達(dá)等(圖3-21,22)。特例3:果蠅Dscam(唐氏綜合癥細(xì)胞黏附分子)基因的互斥剪接,產(chǎn)生38016種異構(gòu)體(圖3-23)。

一、差別RNA加工與基因產(chǎn)物的多樣性第三節(jié)RNA加工水平的調(diào)控圖3-20圖3-21圖3-22圖3-23圖3-23RNA選擇性剪接在動(dòng)物性別決定中的作用的典型例證是果蠅的性別決定。性別決定是指進(jìn)行有性生殖的生物中性腺發(fā)育以及其他與性別有關(guān)的性狀分化的過程。果蠅的性別決定與Y染色體的存在與否無關(guān),而是由受精卵(或胚胎)中X染色體數(shù)與常染色體套數(shù)(A)的比值所決定的。而X/A的比值只是果蠅性別決定的第一步,由這一比值引發(fā)隨后一系列基因之間RNA選擇性剪接水平的“級聯(lián)”調(diào)控反應(yīng),最終完成性別的發(fā)育和分化。研究表明,參與果蠅的性別決定的“級聯(lián)”反應(yīng)的相關(guān)基因主要有:性別致死基因(Sxl)、性別轉(zhuǎn)換基因(tra)、雙性基因(dsx)等二、選擇性RNA加工與性別決定1)X/A比值決定Sxl基因在雌性胚胎產(chǎn)生有功能的蛋白產(chǎn)物①

X/A比值高時(shí)(≥1),“分子”產(chǎn)物較“分母”產(chǎn)物多,形成同源二聚體,與雌性化基因Sxl的早期啟動(dòng)子(PE)結(jié)合,在受精后兩小時(shí)內(nèi)即激活Sxl基因的表達(dá)。②

X/A比值低時(shí)(≤0.5),Sxl基因早期啟動(dòng)子不能被激活,稍后的晚些時(shí)候,晚期啟動(dòng)子(PL)被激活,導(dǎo)致在兩種性別的胚胎中都可進(jìn)行轉(zhuǎn)錄。③雌性胚胎中,Sxl早期表達(dá)產(chǎn)物與通過Sxlm-RNA前體結(jié)合改變后者的剪接方式,產(chǎn)生有功能SXL蛋白,使胚胎進(jìn)入雌性決定途徑;雄性胚胎由于缺乏Sxl基因的早期表達(dá)產(chǎn)物,后期轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物被剪接成雄性特有的Sxl-mRNA,不能產(chǎn)生有功能的SXL蛋白,胚胎進(jìn)入雄性決定途徑。圖3-242)Sxl

基因產(chǎn)物啟動(dòng)性別決定的層次剪接的級聯(lián)反應(yīng)①SXL蛋白是一種RNA結(jié)合蛋白,它不僅可以跟Sxl自身的mRNA

前體結(jié)合,還能夠與tra基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物結(jié)合,使后者被剪接成雌性專一性的tramRNA,編碼有功能的蛋白質(zhì)。②有功能的tra基因產(chǎn)物與tra2在兩種性別中都表達(dá),基因產(chǎn)物共同作用于dsx(doublesex)基因,引發(fā)新一輪的選擇性剪接,使后者被剪接成雌性特異的RNA,編碼雌性特異的dxs

基因產(chǎn)物-DSX-F。③在雄性胚胎中,由于缺乏SXL蛋白,tra原始轉(zhuǎn)錄物被剪接成另一種mRNA,編碼沒有功能的短肽,導(dǎo)致dxs基因產(chǎn)物被剪接成雄性特有的mRNA,編碼的蛋白質(zhì)為SDX-M。雌雄普遍圖3-25圖3-26XX:AAsex-lethaltransformer雌性表現(xiàn)XY:AAsex-lethaltransformer雄性表現(xiàn)非功能mRNA雄性特異性mRNA非功能mRNA雌性特異性mRNA雌性特異性mRNA雌性特異性mRNA圖3-27基因在翻譯水平的調(diào)控有多種方式,不同細(xì)胞采取的方式不同;翻譯水平的調(diào)控主要有兩個(gè)方面:

1)根據(jù)細(xì)胞狀態(tài)決定是否翻譯-合成大量蛋白質(zhì);

2)對已有mRNA的微調(diào)機(jī)制-蛋白質(zhì)質(zhì)和量。

第四節(jié)

翻譯和翻譯后水平的調(diào)控RNA的壽命決定其指導(dǎo)翻譯蛋白質(zhì)的時(shí)間,半衰期的長短主要決定于選擇性降解的速度,不同mRNA的結(jié)構(gòu),特別是3'端非翻譯區(qū)的序列決定其壽命。研究表明:mRNA的許多結(jié)構(gòu)影響其壽命,5'帽子的類型、3'polyA的長度、5'、3'非翻譯區(qū)的長度和結(jié)構(gòu)等都不同程度地決定mRNA的降解速度(圖3-28)。細(xì)胞質(zhì)中也存在一種異常的RNA偵測系統(tǒng),可檢測如無義突變、mRNA的翻譯次數(shù)等;激素也可在翻譯水平調(diào)節(jié)mRNA的壽命,如催乳素可延長酪蛋白mRNA的壽命達(dá)25倍等。一、mRNA壽命與蛋白質(zhì)合成圖14-33mRNA的降解途徑圖3-28

鐵蛋白是一種在細(xì)胞質(zhì)內(nèi)儲(chǔ)存多余鐵離子的蛋白,可以保護(hù)細(xì)胞免受游離三價(jià)鐵離子的毒性影響。鐵調(diào)節(jié)蛋白(ironregulatoryprotein,IRP):鐵蛋白mRNA的翻譯受一種特異性阻遏物的調(diào)節(jié),這種阻遏物稱之鐵調(diào)節(jié)蛋白。它的活性依賴于細(xì)胞內(nèi)非結(jié)合鐵的濃度。鐵應(yīng)答元件(iron-responseelement,IRE):能夠與IRP結(jié)合的、鐵蛋白mRNA的5'UTR的特異序列。

-----當(dāng)鐵濃度低時(shí),IRP與IRE結(jié)合,干擾了核糖體與mRNA5'末端的

UTR序列結(jié)合,從而抑制翻譯的起始;

-----

當(dāng)鐵濃度升高時(shí),鐵和IRP結(jié)合,改變其構(gòu)象使其與IRE解離,并允許mRNA翻譯形成鐵蛋白(圖3-29)。

mRNA的翻譯速率受特定機(jī)制調(diào)節(jié),典型例證是細(xì)胞內(nèi)鐵蛋白圖14-32細(xì)胞內(nèi)鐵蛋白合成的調(diào)控圖3-29卵母細(xì)胞也存在翻譯調(diào)控,轉(zhuǎn)錄后產(chǎn)生大量母源性mRNA,由于結(jié)合特定的蛋白質(zhì)而被“掩蔽”(表3-2),直到受精后才指導(dǎo)蛋白質(zhì)的合成。另外,卵母細(xì)胞mRNA3端UTR通過改變其polyA“尾巴”長度而調(diào)控其翻譯能力(圖3-30)二、mRNA的結(jié)構(gòu)與翻譯效率真核生物mRNA的5端有“帽子”結(jié)構(gòu)(保護(hù)和促進(jìn)翻譯的起始),3端有polyA結(jié)構(gòu)(影響壽命);5'端非翻譯區(qū)的長度、結(jié)構(gòu)及核苷酸組成影響其翻譯效率。有些基因的5'端很長,可形成復(fù)雜結(jié)構(gòu),與細(xì)胞小分子代謝物可逆結(jié)合,影響翻譯的起始、內(nèi)含子的加工及mRNA的穩(wěn)定性--核糖開關(guān)(ribos-witch)。表3-2圖3-30一些蛋白質(zhì)合成后就具有功能,但更多的蛋白質(zhì)必須經(jīng)過適當(dāng)?shù)募庸ぁ⑿揎椇蟛庞泄δ堋?/p>

1)一些蛋白質(zhì)需要在分子伴侶作用下正確折疊成一定空間結(jié)構(gòu)才有活性。

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