原核生物基因表達(dá)的調(diào)控_第1頁(yè)
原核生物基因表達(dá)的調(diào)控_第2頁(yè)
原核生物基因表達(dá)的調(diào)控_第3頁(yè)
原核生物基因表達(dá)的調(diào)控_第4頁(yè)
原核生物基因表達(dá)的調(diào)控_第5頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

原核生物基因表達(dá)的調(diào)控第1頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四6.1.1DiscoveryofOperon

1961年,F.Jacob&J.Monod提出,此后不斷完善。獲1965年諾貝爾生理學(xué)和醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)1940年,Monod發(fā)現(xiàn):細(xì)菌在含葡萄糖和乳糖的培養(yǎng)基上生長(zhǎng)時(shí),細(xì)菌先利用葡萄糖,葡萄糖用完后,才利用乳糖;在糖源轉(zhuǎn)變期,細(xì)菌的生長(zhǎng)會(huì)出現(xiàn)停頓。即產(chǎn)生“二次生長(zhǎng)曲線”。文獻(xiàn):細(xì)胞中存在兩種酶,即組成酶與誘導(dǎo)酶1947年,報(bào)告:“酶的適應(yīng)現(xiàn)象及其在細(xì)胞分化中的意義”FrancisJacob

JacquesMonod

6.1乳糖操縱元第2頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四1951年,Monod與Jacob合作,發(fā)現(xiàn)兩對(duì)基因:Z基因:與合成β-半乳糖苷酶有關(guān);I基因:決定細(xì)胞對(duì)誘導(dǎo)物的反應(yīng)。Szilard:I基因決定阻遏物的合成,當(dāng)阻遏物存在時(shí),酶無(wú)法合成,只有有誘導(dǎo)物存在,才能去掉該阻遏物。

Jacob:結(jié)構(gòu)基因旁有開(kāi)關(guān)基因(操縱基因),阻遏物通過(guò)與開(kāi)關(guān)基因的結(jié)合,控制結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)。第3頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四乙酰基轉(zhuǎn)移酶半乳糖苷透性酶?-半乳糖苷酶操作位點(diǎn)乳糖操縱元結(jié)構(gòu)調(diào)節(jié)基因第4頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四操縱元是一種完整的具有特定功能的細(xì)菌基因表達(dá)和調(diào)節(jié)的單位,包括調(diào)節(jié)基因,操縱位點(diǎn),結(jié)構(gòu)基因,組成一個(gè)控制單元結(jié)構(gòu)基因:產(chǎn)生mRNA,合成蛋白質(zhì)操縱位點(diǎn)promotor,operator:?jiǎn)?dòng)子結(jié)合位點(diǎn)調(diào)節(jié)基因:產(chǎn)生調(diào)節(jié)蛋白(與操縱位點(diǎn)結(jié)合)→結(jié)構(gòu)基因不轉(zhuǎn)錄誘導(dǎo)物存在時(shí),可與阻遏蛋白結(jié)合→結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄ControlelementStructuralgenes第5頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四6.1.2酶的誘導(dǎo)現(xiàn)象B-半乳糖苷酶第6頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四分解底物的酶只有在底物存在時(shí)才出現(xiàn)!無(wú)乳糖時(shí),幾個(gè)B-gal/cell

加入乳糖時(shí),5000個(gè)再去掉乳糖,lacmRNA下降

乳糖能激發(fā)lacmRNA的合成

乳糖的誘導(dǎo)作用是由酶前體轉(zhuǎn)化而來(lái),還是誘導(dǎo)新酶合成?培養(yǎng)基(35S-aa,無(wú)乳糖)→E.coli繁殖→培養(yǎng)基(無(wú)35S-aa,加入乳糖)→β-gal(無(wú)35S)第7頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四6.1.3調(diào)控機(jī)理1調(diào)控區(qū)結(jié)構(gòu)lacI,1045bp,獨(dú)立PiP,82bp,-82~+1O,35bp,-7~+28lacZYA第8頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四2.阻遏狀態(tài)第9頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四3誘導(dǎo)狀態(tài)誘導(dǎo)物誘導(dǎo)作用:在可誘導(dǎo)的操縱元中,加入對(duì)基因表達(dá)有調(diào)節(jié)作用的小分子后,開(kāi)啟基因的轉(zhuǎn)錄活性第10頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四4誘導(dǎo)物不是乳糖生成lac誘導(dǎo)物乳糖代謝Allolctose異構(gòu)乳糖別乳糖細(xì)胞內(nèi)β-半乳糖苷酶來(lái)源?第11頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四6.1.4阻遏蛋白的作用機(jī)制1阻遏蛋白結(jié)構(gòu)38KD,4聚體,一個(gè)亞基結(jié)合一個(gè)乳糖分子lacI

組成型轉(zhuǎn)錄

Pi弱啟動(dòng)子,

5-10個(gè)/cell具有二重性阻止轉(zhuǎn)錄(與lacO結(jié)合)開(kāi)始轉(zhuǎn)錄(與誘導(dǎo)物結(jié)合)第12頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四

阻遏蛋白的結(jié)構(gòu)域

頭段,-NH2端,lacO結(jié)合區(qū)絞鏈區(qū)

核心段,-COOH,誘導(dǎo)物結(jié)合區(qū)第13頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四4個(gè)亞基的核心片段接觸形成四聚體第14頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四第15頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四

對(duì)稱軸,+11對(duì)稱序列,6bp

阻遏蛋白的結(jié)合位點(diǎn)--lacO的結(jié)構(gòu)第16頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四3阻遏蛋白對(duì)RNApol功能的影響阻遏蛋白和RNApol可同時(shí)與DNA結(jié)合

RNApol與啟動(dòng)子結(jié)合的平衡常數(shù)1.9X107

有阻遏蛋白時(shí),2.5X109結(jié)合著的RNApol不能轉(zhuǎn)錄.但加入誘導(dǎo)物后,釋放出阻遏蛋白,變?yōu)殚_(kāi)放型啟動(dòng)子復(fù)合物.阻遏蛋白實(shí)際上使RNApol貯存在啟動(dòng)子上。這一模式是否存在于其它操縱元系統(tǒng)中?第17頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四+glucose-glucoseTime(hr)Unitsof-galactosidase+lactoseGlucoseadded6.1.5lacoperon的正調(diào)控

1代謝物阻遏效應(yīng)實(shí)驗(yàn),在lac+Glu培養(yǎng)基上

E.coli只利用G,只有G

耗盡時(shí),才會(huì)利用lac葡萄糖抑制lacmRNA的轉(zhuǎn)錄:

可阻止誘導(dǎo)物引起的阻遏物失活效應(yīng)僅去掉阻遏物并不能啟動(dòng)lac基因表達(dá),有其它因素參與第18頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四葡萄糖對(duì)lac操縱元表達(dá)的抑制是間接的

乳糖的降解是通過(guò)cAMP與CAP結(jié)合起作用的

cAMP:環(huán)化腺苷酸CAP,cataboliteactivatorprotein

由crp編碼CRP,catabolitereceptorprotein第19頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四第20頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四2CAP結(jié)合位點(diǎn)CAP為二聚體,45KD,被cAMP激活結(jié)合位點(diǎn)~22bpI-70~-50II-50~-40第21頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四由于序列的差異,使不同基因受cAMP激活的水平不同結(jié)合位點(diǎn)序列保守第22頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四3CAP的結(jié)合對(duì)DNA構(gòu)型的影響DNA彎曲彎曲點(diǎn)位于CAP結(jié)合位點(diǎn)二重對(duì)稱的中心彎曲使CAP能與啟動(dòng)子上的RNApol接觸第23頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四(1)CAP結(jié)合位點(diǎn)與轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的位置CAP與轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的距離,相距數(shù)個(gè)整雙螺旋CAP結(jié)合位點(diǎn)在啟動(dòng)子的上下游,都能發(fā)揮作用4

CAP對(duì)轉(zhuǎn)錄的影響第24頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四(2)基因轉(zhuǎn)錄對(duì)cAMP—CAP系統(tǒng)的依賴性,

與啟動(dòng)子本身的效率有關(guān)cAMP-CAP復(fù)合物的結(jié)合,使位點(diǎn)II附近的富含GC區(qū)域雙螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性降低,因而-10區(qū)的熔解溫度降低,促進(jìn)開(kāi)放型啟動(dòng)子復(fù)合物的形成第25頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四(3)CAP激活轉(zhuǎn)錄的方式CAP直接作用于RNApola亞基缺失RNApola亞基的—C末端時(shí),失去受CAP激活的能力作用于DNA,改變其結(jié)構(gòu)第26頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四6.1.6lacoperon的其它問(wèn)題1.lacoperon的功能是在正負(fù)兩個(gè)調(diào)控體系的協(xié)調(diào)作用(coordinateregulation)下實(shí)現(xiàn)的。阻遏蛋白封閉轉(zhuǎn)錄時(shí),CAP不發(fā)揮作用;如沒(méi)有CAP加強(qiáng)轉(zhuǎn)錄,即使阻遏蛋白從P上解聚仍無(wú)轉(zhuǎn)錄活性CAP組成型合成,所以cAMP-CAP復(fù)合物取決于cAMP含量腺苷酸環(huán)化酶位于細(xì)胞膜上,其活性與葡萄糖運(yùn)輸?shù)拿赣嘘P(guān),因此cAMP-CAP調(diào)控乳糖、半乳糖、阿拉伯糖等糖類代謝有關(guān)的酶降解物敏感型操縱元:只要有葡萄糖存在,這些操縱元就不表達(dá)

第27頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四2.A基因及其生理功能編碼B-半乳糖苷乙?;D(zhuǎn)移酶,使半乳糖苷乙?;T撁覆粎⑴c乳糖代謝!生理意義:在細(xì)胞中有許多能被半乳糖苷酶降解的半乳糖苷類物質(zhì),其分解產(chǎn)物不能進(jìn)一步代謝,積累,抑制細(xì)胞生長(zhǎng)。半乳糖苷乙酰化后,即無(wú)毒.所以lacA雖不在乳糖降解中起作用,但可抑制有害物質(zhì)的積累3.lac基因產(chǎn)物數(shù)量,1:0.5:0.2

不同酶的數(shù)量差異,是由于在翻譯水平上的調(diào)節(jié).方式有二:核糖體脫離:多順?lè)醋拥牟顒e性翻譯

內(nèi)切酶作用:在lacmRNA分子內(nèi)部,a基因比z基因更易受內(nèi)切酶作用第28頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四Summary第29頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四第30頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四SummaryoflacoperonregulationGlucosecAMPLactoseTranscriptionoflacmRNAHighLowPresentlowrateofexpressionHighLowAbsentessentiallynoneLowHighAbsentessentiallynoneLowHighPresenthighrateofexpression第31頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四6.2Trpoperon生物細(xì)胞中的氨基酸合成,也受操縱元的調(diào)節(jié)。細(xì)胞需要某種氨基酸時(shí),其基因即表達(dá),不需要時(shí)基因關(guān)閉,達(dá)到經(jīng)濟(jì)的原則。第32頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四trpR,阻遏蛋白P,-40~+18O,-21~+1L,+1~+162結(jié)構(gòu)基因t,A下游36bp,不依賴pt’,t下游250bp,依賴p6.2.1基因組成第33頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四sne298第34頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四6.2.2Trpoperon的阻遏系統(tǒng)1TrpR四聚體第35頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四阻遏蛋白+trp

有活性的阻遏物SNE299+trpO→不轉(zhuǎn)錄第36頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四2阻遏蛋白的結(jié)合位點(diǎn)

trpO-21~+1,反向重復(fù)序列trpP-40~+18活性阻遏物與trpO的結(jié)合與RNApol與啟動(dòng)子的結(jié)合發(fā)生競(jìng)爭(zhēng)SNE299第37頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四3阻遏系統(tǒng)主管轉(zhuǎn)錄是否啟動(dòng),在培養(yǎng)基中有少量Trp時(shí),mRNA起始合成,但不能自動(dòng)延伸,一般在trpE之前終止轉(zhuǎn)錄

粗調(diào)開(kāi)關(guān)第38頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四6.2.3弱化作用

attenuation1弱化子,衰減子,α前導(dǎo)RNA,140bpα第39頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四弱化子,衰減子,α第40頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四序列分析發(fā)現(xiàn),其中4個(gè)片段進(jìn)行配對(duì),形成不同的二級(jí)結(jié)構(gòu)Terminator第41頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四

S3122前導(dǎo)肽14aa第42頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四第43頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四3轉(zhuǎn)錄弱化作用LackoftrpLackofaminoacyltRNARibosomepauseattrpcodons,occludingsequence1Form2:3hairpinanti-terminator

TranscriptionintotrpEandbeyond第44頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四HightrpTrpisinsertedatthetrpcodonsTranslatetotheendofleadermessageRibosomeoccludesequence2Terminatetranscriptionat(3:4formterminator)第45頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四弱化子對(duì)轉(zhuǎn)錄調(diào)控的關(guān)鍵空間結(jié)構(gòu),10thand11thcodonsencodetrpresidues(rareAA)時(shí)間,核糖體停頓在2個(gè)Trp密碼子上時(shí),產(chǎn)生延宕,此時(shí)4區(qū)未轉(zhuǎn)錄出來(lái)Theleaderpeptideistodeterminertrpavailabilityandtoregulatetranscriptiontermination14–amino-acid(encodedby27-68oftheleaderRNAsummary第46頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四6.2.4阻遏作用與弱化作用的協(xié)調(diào)

阻遏效率啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄起始頻率在R+和R-相差70倍弱化作用

trp存在時(shí),約有10%的RNApol僥幸轉(zhuǎn)錄trp操縱子具有雙重調(diào)節(jié)體系?第47頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四Negative—repressibleoperon可以被最終合成產(chǎn)物所阻遏RPOleadingseq.EDCBAtrp+為什么需要阻遏體系?當(dāng)大量Trp存在時(shí),阻遏系統(tǒng)起作用。阻遏物與之結(jié)合,阻止先導(dǎo)mRNA合成。

經(jīng)濟(jì)第48頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四僅有少量trp時(shí),RNApol啟動(dòng),但在L.S.處脫落,轉(zhuǎn)錄中斷RPOleadingseq.EDCBA少量trp+不足以結(jié)合

O

位點(diǎn)為什么需要弱化系統(tǒng)?當(dāng)trp濃度低時(shí),阻遏物從有活性變?yōu)闊o(wú)活性,速度極慢,不能很快引發(fā)trp合成。因此需要一個(gè)能快速作出反應(yīng)的系統(tǒng),以保持培養(yǎng)基中適當(dāng)?shù)腡rp水平,弱化系統(tǒng)恰恰符合此要求。第49頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四第50頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四6.2.5正控制系統(tǒng)和負(fù)控制系統(tǒng)1負(fù)控制系統(tǒng):在沒(méi)有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)存在時(shí)基因表達(dá),加入調(diào)節(jié)蛋白后基因表達(dá)活性被關(guān)閉阻遏蛋白:負(fù)控制系統(tǒng)中的調(diào)節(jié)蛋白第51頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四Addsignalmol.OperonoffCo-repressor輔阻遏物Addsignalmol.OperononInducer誘導(dǎo)物(inducibleoperon)(repressibleoperon)負(fù)控誘導(dǎo)負(fù)控阻遏第52頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四2正控制系統(tǒng):沒(méi)有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)存在時(shí)基因關(guān)閉,加入這種調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)后基因活性被開(kāi)啟誘導(dǎo)蛋白第53頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四6.3基因轉(zhuǎn)錄的時(shí)序調(diào)控概念:原核生物在生長(zhǎng)發(fā)育的各個(gè)階段,基因的表達(dá)是按照一定時(shí)間順序進(jìn)行的意義有效利用能源避免不適當(dāng)?shù)谋磉_(dá),造成的危害途徑亞基的更換(枯草桿菌,E.coli,T4phage)

T7噬菌體生長(zhǎng)過(guò)程中RNApol的替代噬菌體基因表達(dá)的調(diào)控第54頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四亞基的更換8.3.1枯草桿菌噬菌體SPO1早中晚基因表達(dá)的轉(zhuǎn)換SPO1,烈性噬菌體如何實(shí)現(xiàn)早中晚基因表達(dá)的轉(zhuǎn)換?通過(guò)更換亞基,使SPO1的早中晚基因有條不紊地表達(dá)因子的負(fù)責(zé)識(shí)別啟動(dòng)子的保守序列,是轉(zhuǎn)錄起始唯一需要的因子。許多細(xì)菌能生產(chǎn)多種可取代的因子,以識(shí)別不同的啟動(dòng)子。當(dāng)細(xì)胞從基本的轉(zhuǎn)錄機(jī)制轉(zhuǎn)入各種特定基因表達(dá)時(shí),需要不同的因子指導(dǎo)RNA聚合酶與各種啟動(dòng)子結(jié)合第55頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四早期,2‘55,產(chǎn)生gp28gp28

取代

55第56頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四中期,gp28取代55產(chǎn)生gp33,gp34第57頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四晚期,gp33,gp34取代

gp28,

55第58頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四枯草桿菌中每個(gè)因子都能識(shí)別具有特征性的一致序列的一組啟動(dòng)子調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)相互取代的原因,可能是它們與核心酶的親和力所決定的第59頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四6.4小分子RNA的翻譯調(diào)節(jié)6.4.1干擾mRNA的互補(bǔ)RNAmRNA-interferingcomplementaryRNA1983年,Mizuno,Simon幾乎同時(shí)發(fā)現(xiàn)RNA可作為調(diào)節(jié)因子,與調(diào)節(jié)蛋白一樣,RNA合成后,可擴(kuò)散到靶位點(diǎn)。RNA也可作為調(diào)節(jié)物質(zhì)?!反義RNA,可與mRNA結(jié)合結(jié)合位點(diǎn)是S-D,AUG,部分N端密碼子與RNA形成雙螺旋結(jié)構(gòu),作為內(nèi)切酶底物與轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物結(jié)合,使轉(zhuǎn)錄提前終止第60頁(yè),共67頁(yè),2023年,2月20日,星期四例,

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