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第1第123 蛋?質(zhì)重要的?物學(xué)功
4所有蛋?質(zhì)均含有:CHON某些蛋?質(zhì)含有:S0.3%-2.5%以及RHCαRHCα 其中構(gòu)成蛋?質(zhì)的有種7
二硫鍵COOH
COOH
NH22CHNH2
CH2
CH 2H NH2
CH2 CHCOOH 胱氨酸8LysValIleLeuLysValIleLeupheMetTrpThrArgArg9 ?中的氨基酸,屬于氨基酸的衍?物,也稱(chēng)為修飾氨基酸:氨基酸?般在 278酪,279?,259 2個(gè)概念:氨基酸的等電點(diǎn)氨基酸的可解離基團(tuán)的pKHenderson-Hasselbalch?
pI=?(pK1+pK2)=?(2.3+9.1)=與茚三酮 氨基的脯氨酸則不能與亞硝酸反應(yīng)VanSlyke( 非酶褐變( Maillard.LC.)反應(yīng)的第一步——羰氨縮合(反應(yīng)主要?級(jí)結(jié)構(gòu)有——α螺旋,β折疊(片層),3.13.1肽鍵(peptidebond)和肽(peptide 例如:下列五肽命名為
3.2蛋?質(zhì)的?級(jí)結(jié)構(gòu)(primary3.3蛋?質(zhì)的?級(jí)結(jié)構(gòu)(secondary3.3蛋?質(zhì)的?級(jí)結(jié)構(gòu)(secondary象。肽平面(peptidene):參與組成肽鍵的6個(gè)原子位(peptideunit)?面角(dihedralangle):肽平鄰的兩個(gè)參與肽鍵形成的C和Na-a-helixb-b-pleatedsheetb-b-turnrandomcoil氫鍵βββββ轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu)主要特點(diǎn)180oPro轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu)通常負(fù)責(zé)各種?級(jí)結(jié)構(gòu)單元之間的連接作?,它對(duì)于轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu)通常負(fù)責(zé)各種?級(jí)結(jié)構(gòu)單元之間的連接作?,它對(duì)于 以下情況均不利于α-螺旋形成 3.4蛋?質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)(tertiary 3.5蛋?質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)(quaternarystructure) 引?等。
HbAβN-Val·His·Leu·Thr·Pro·Glu·
HbSβN-Val·His·Leu·Thr·Pro·Val· (三)(三) 促進(jìn)作用稱(chēng)為正協(xié)同效應(yīng)(positive抑制作用稱(chēng)為負(fù)協(xié)同效應(yīng)(negative變構(gòu)效應(yīng)(allosteric凡蛋白質(zhì)(或亞基)凡蛋白質(zhì)(或亞基)(三)蛋?質(zhì)構(gòu)象?。喝舻?質(zhì)的折疊發(fā)?錯(cuò)誤,盡管其?級(jí)結(jié)構(gòu)不變,但蛋?質(zhì)的構(gòu)象發(fā)?改變,仍可影響其功能,嚴(yán)重時(shí)可導(dǎo)致疾病發(fā)?。————1透析;2鹽析;3————1等電點(diǎn)沉淀;2離?交換層析;3由于蛋?質(zhì)分?中含有共軛雙鍵的酪氨酸和?氨酸,因此在280nm波?處有特征性吸收峰。蛋?關(guān)系,因此可作蛋?質(zhì)定 蛋?質(zhì)變性后的性質(zhì)改變 ( 復(fù)性若蛋?質(zhì)變性程度較輕,去除變性因素后,蛋?質(zhì)仍可恢復(fù)或部分恢復(fù)其原有的構(gòu)
⒈茚三酮反應(yīng)(ninhydrin⒉雙縮脲反應(yīng)(biuret堿性溶液堿性溶液失去?化層(消除相荷,除去?膜),蛋?質(zhì)膠體溶液就不再穩(wěn)定,導(dǎo)致蛋?分??產(chǎn)?沉淀++++++++++++ 堿+———— 酸
+++
++
——+
- 同程度降并先后從溶液中析出,此種現(xiàn)象被離?強(qiáng)度和類(lèi)型分離純化?法— 分離純化?法— 分離純化?法— 溫度:低溫可保持?物?分?活性,同時(shí)降低其溶解度,提?屬離?:?些多價(jià) 凝膠過(guò)濾(gelfiltration)又稱(chēng)分子篩層析:電泳電泳蛋白質(zhì)在高于或低于其pI術(shù),稱(chēng)為電泳。
白1.2 酶的調(diào)節(jié)1.2.11.2.1什么是酶的核酸,主要參與RNA底物(substrate,S)產(chǎn)物(product,P)Ala+α-酮戊二酸
轉(zhuǎn)氨
酸+Glu1.2.2 系統(tǒng)命名——反應(yīng):葡萄糖 葡萄糖-6-磷酸命名:葡萄糖:ATP1.2.3 AABC,需要1.2.41.2.4酶活性(enzymeV=dP/dt=-dS/1.2.41.2.4酶活性(enzyme酶活性的計(jì)量:EC1961為產(chǎn)物所需要的酶量為1個(gè)酶活國(guó)際單位(IU)。比活性(specificityofenzyme)指的是每毫克酶蛋?比活性=活性單位數(shù)/酶蛋?重量1.2.51.2.5酶的分?結(jié)構(gòu)---單純酶(simple結(jié)合酶(conjugated) 輔助因子
金屬激活酶(metal-activated(prosthetic 氧化還原作?氧化還原作? 其他基團(tuán)的轉(zhuǎn)移也有這種情況如輔酶A參與的轉(zhuǎn)?;磻?yīng),先形成?酰輔酶A,然后再脫去??;?.2.51.2.5酶的分?結(jié)構(gòu)---酶的活性中心(active或稱(chēng)活性部位(activesite),指必需基團(tuán)在空必需基團(tuán)(essential
(binding(binding
(catalytic
vanderWaals1.2.61.2.6加速反應(yīng),酶加速反應(yīng)的機(jī)理是降低反應(yīng)的活化能(activationenergy)?種酶僅作?于?種或?類(lèi)化合物,或?定的化學(xué)鍵,催化?定的化學(xué)反應(yīng)并?成?定的產(chǎn)絕對(duì)特異性(absolute相對(duì)特異性(relative立體結(jié)構(gòu)特異性(stereo
酶反應(yīng):酶反應(yīng): 1.2.61.2.6effect)和定向效應(yīng)(orientationeffect)E+ E+物分?發(fā)?變形,從?使底物分?某些鍵的鍵能減弱,產(chǎn)?鍵,有助于過(guò)度態(tài)的中間產(chǎn)effect)和定向效應(yīng) effect)定向:1.2.71.2.7分,這就是初速度1913年Michaelis和Menten提出反應(yīng)速度與底物濃度關(guān)系的數(shù)學(xué)?程式,即米-曼??程式,簡(jiǎn)稱(chēng)米??程式(Michaelisequation)。VKm+ :最大反應(yīng)速率 umvelocity) 常數(shù)(Michaelis酶與底物形成中間復(fù)合物(enzyme-substrate酶與底物形成中間復(fù)合物(enzyme-substrate 式中,k1、k2、k3、k4表?各反應(yīng)的速度常數(shù)。由于P+E形成于慢反應(yīng)即V=k3[ES](1)S的總濃度遠(yuǎn)遠(yuǎn)?于E初始階段,S的濃度可認(rèn)為不變即[S]=[St]即〔ES〕的形成速度等于〔ES〔ES〕/dt=-d〔ES〕/dt。即[ES]K1([E即〔ES〕的形成速度等于〔ES〔ES〕/dt=-d〔ES〕/dt。即[ES]
=
=Km(米?常數(shù)則(2)變?yōu)?([Et]-[ES])[S]=Km整理得:
[EttKm+
(3)將(3)代入(1)
Km+
(4)[Et]=[ES],反應(yīng)達(dá)最?速度 (5)將(5)代入(4
Km+1.Km值等于酶促反應(yīng)速度為最大反應(yīng)速度一半VV2
=Km+Km可近似表?酶對(duì)底物的親和 酶的特征性常數(shù)之2.2.意義:Vmax=K3的轉(zhuǎn)換數(shù)(turnovernumber),即動(dòng)力學(xué)常數(shù)動(dòng)力學(xué)常數(shù)—當(dāng)酶被底物充分飽和時(shí),單位時(shí)間(三)Km值與Vmax雙倒數(shù)作圖法(doublereciprocalplot),?稱(chēng)為林??(LineweaverBurk)V=1 .
+
(林 方程
當(dāng)[S]當(dāng)[S]>>[E],反應(yīng)速度與酶濃度成正比。關(guān)系式為:VK3
活性 2030 pH最適pH(optimum
(?(?)(?)(?)1.1.
2.2.
3.3.劑結(jié)合劑結(jié)合動(dòng)?學(xué)特點(diǎn):Vmax↓,表觀
核酸(nucleic堿基(base)戊糖(ribose)磷酸核苷:ARGR,UR,脫氧核苷:dARdGR,dTR,CACA
CACAG′CAG核酸中核苷酸的排列順序。
OH 5¢ACTGCTChargaff規(guī)則:[A=[G]”Chargaff 酸-為骨架,以右?螺旋?徑為2nm,形成?溝(majorgroove)及?溝(minor堿基垂直螺旋軸居雙螺旋內(nèi)側(cè),與對(duì)側(cè)堿基形成氫鍵配對(duì)(互補(bǔ)配對(duì)形式:A=T;G”C)。氫鍵維持雙鏈橫向穩(wěn)定性堿基堆積?維持雙4、DNA的超螺旋結(jié)構(gòu)及其在染?質(zhì)中超螺旋結(jié)構(gòu)(superhelix或正超螺旋(positive負(fù)超螺旋(negative 真核?物染?體由DNA和蛋白質(zhì)構(gòu)成,其基本單位是核?體(nucleosome) 組蛋白堿性蛋白質(zhì)有五種類(lèi)型:H1、H2A、H2B、H3、H4,它們富含帶正電荷的堿性氨基酸,能夠同DNA中帶負(fù)電荷DNA的基本功能是以的形式荷載遺 是?命遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ),也是?命活動(dòng)細(xì)胞核和胞 線粒 白體
mt
信使
mt 轉(zhuǎn)運(yùn)核內(nèi)不均?
mt
成熟mRNA胞漿?
參與hnRNA*mRNA
細(xì)胞核內(nèi)初合成的mRNA前體是不均?核RNA(hnRNA),*mRNA?多數(shù)真核mRNA的5′末端均在轉(zhuǎn)錄后加上?個(gè)7-甲基?苷,同時(shí)第?個(gè)核苷酸的C′2也 把DNA所攜帶的遺傳信息,按堿基互
10~20 10~20稀有堿基,如DHU3′CCA-5′末端?多數(shù)為T(mén)yCOH NHH NH 氨基酸氨基酸 反環(huán):反環(huán)中部的三個(gè)堿基可以與mRNA的三聯(lián)體形成堿基互補(bǔ)配對(duì),解讀遺傳,稱(chēng)為反?(anticodon)。次黃嘌呤核苷酸(肌苷酸,I)常出現(xiàn)于反?中——倒L活化、搬運(yùn)氨基酸到核糖體,參與蛋 *rRNA*rRNA參與組成白3 白體RNA(ribosomalRNA)是細(xì)胞內(nèi)含量最多的RNA,約占RNA總量的80%以上,是蛋白質(zhì)合成機(jī)器-----白體(核糖體)(ribosome)的組核糖體蛋白(ribosmalprotein,rp)有數(shù)十種,?多是分?量不?的多肽類(lèi),分布在 白體?12粘度 紫外吸收增加(高?效應(yīng) (2)GC含量越高,Tm越變性在緩慢冷卻時(shí),可以復(fù)性,此過(guò)程稱(chēng)為1.4 從結(jié)構(gòu)上看,它?般是多羥基醛或多 單 雙 雜多糖:透明質(zhì)酸、硫酸軟骨素、(含N或S)(含 五碳糖六碳糖
CH
七碳糖
?酸(C2H4O2)八碳糖
(C3H6O3)例外:例外:鼠李糖(C6H12O5)、脫氧核糖C5H10O4醛糖 酮糖 ?個(gè)或多個(gè)不對(duì)稱(chēng)(?性)碳原?光?向相反,旋光度數(shù)、、沸點(diǎn)
醛糖與酮糖的構(gòu)型是。該在 的稱(chēng)為為型。D-葡萄糖與D-?露糖為C2D-葡萄糖與D-半乳糖為C4
在?溶液中容易形成分?內(nèi)的半縮醛或半縮酮αβ-αβ- 縮醛羥基在平面之下的為α平面之上的為β型。 吡喃糖環(huán)常采取椅式(chair)和船式(boat)構(gòu)象,其中椅式構(gòu)象使扭溶解性溶解性甜度注意:D/L立體異構(gòu)命名與d/l右旋/左旋有三種氧化產(chǎn)物:醛糖酸(Aldonicacid
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