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文檔簡介
ICS65.020.01
CCSB05
15
內(nèi)蒙古自治區(qū)地方標準
DB15/T3279—2023
苜蓿根腐病銳頂鐮刀菌鑒定方法
Identificationoffusariumacuminatumofalfalfarootrot
2023-12-29發(fā)布2024-01-29實施
內(nèi)蒙古自治區(qū)市場監(jiān)督管理局發(fā)布
DB15/T3279—2023
前言
本文件按照GB/T1.1—2020《標準化工作導(dǎo)則第1部分:標準化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定
起草。
本文件由內(nèi)蒙古自治區(qū)畜牧業(yè)標準化技術(shù)委員會(SAM/TC19)歸口。
本文件起草單位:內(nèi)蒙古自治區(qū)農(nóng)牧業(yè)科學(xué)院、內(nèi)蒙古自治區(qū)農(nóng)牧業(yè)技術(shù)推廣中心、內(nèi)蒙古自治區(qū)
鄉(xiāng)村振興研究中心。
本文件主要起草人:史志丹、孫紅霞、丁海君、房永雨、楊永青、郭呈宇、伊風(fēng)艷、燕夢嬌、郭晨、
孫林、劉思博、張英、劉亞東、李國強。
I
DB15/T3279—2023
苜蓿根腐病銳頂鐮刀菌鑒定方法
1范圍
本文件規(guī)定了苜蓿銳頂鐮刀菌根腐病鑒定的主要儀器與用具、主要試劑與材料、實驗室檢測、結(jié)果
判定。
本文件適用于苜蓿銳頂鐮刀菌根腐病的室內(nèi)鑒定。
2規(guī)范性引用文件
本文件沒有規(guī)范性引用文件。
3術(shù)語和定義
下列術(shù)語和定義適用于本文件。
銳頂鐮刀菌根腐病fusariumacuminatumrootrot
由銳頂鐮刀菌(Fusariumacuminatum)引起的苜蓿根腐病,在感染初期,苜蓿的根皮附近會出現(xiàn)
褐色或暗褐色的壞死斑,根系毛根減少,部分葉子出現(xiàn)黃葉,發(fā)病嚴重時葉片枯黃,植株根部的中柱腐
爛霉變,并發(fā)生壞死,根莖出現(xiàn)中空,側(cè)根出現(xiàn)大量腐爛壞死,分枝減少。
4主要儀器與用具
光學(xué)顯微鏡、搖床、培養(yǎng)箱、超凈工作臺、高速冷凍離心機、PCR儀、培養(yǎng)皿、酒精燈、血球計數(shù)
板、解剖刀、接種針、移液器、槍頭、離心管。
5主要試劑與材料
試劑
5.1.1次氯酸鈉。
5.1.2無水乙醇。
5.1.3硫酸鏈霉素(500mg/mL)。
5.1.4真菌基因組提取試劑盒。
5.1.5PCRSuperMix。
5.1.6凝膠電泳試劑:瓊脂糖,TAE,LoadingBuffer,DL2000DNAMarker。
培養(yǎng)基
5.2.1水瓊脂培養(yǎng)基(WA:WaterAgar):瓊脂粉15g,加蒸餾水定容至1000mL,121℃高壓濕熱
1
DB15/T3279—2023
滅菌20min。
5.2.2馬鈴薯葡萄糖瓊脂培養(yǎng)基(PDA:PotatoDextroseAgar):馬鈴薯200g,葡萄糖20g,瓊脂
粉15g,加蒸餾水定容至1000mL,121℃高壓滅菌20min。
5.2.3馬鈴薯葡萄糖液體培養(yǎng)基(PDB:PotatoDextroseBroth):馬鈴薯200g,葡萄糖20g,加
蒸餾水定容至1000mL,121℃高壓滅菌20min。
5.2.4綠豆瓊脂培養(yǎng)基(MBA:MungBeanAgar):綠豆粉60g,瓊脂粉15g,加蒸餾水定容至1000
mL,121℃高壓滅菌20min。
6實驗室檢測
病原菌的分離和純化
6.1.1病原菌的分離
從苜蓿田采集患有根腐病的典型病株。用水清洗樣品表面的砂礫和土壤,從根部病健交界部位切成
約0.5cm×0.5cm的小組織塊,用75%酒精和1%次氯酸鈉分別處理3min和5min,無菌水清洗5次。把表
面消毒的發(fā)病組織放在PDA培養(yǎng)基上25℃培養(yǎng),見附錄A中的圖A.1。
6.1.2病原菌的純化
待PDA培養(yǎng)基長出菌落后取菌落邊緣的菌絲轉(zhuǎn)接3次后再進行單孢分離獲得純化菌株用于后續(xù)試驗,
見附錄A中的圖A.1。用30%滅菌甘油將分離鑒定后的菌株于-80℃保存,對不需長期保存的菌株及時滅
活處理。感染苜蓿根腐病的樣品保存于4℃冰箱中,以備復(fù)核。
菌落培養(yǎng)特性和病菌形態(tài)特征鑒定
6.2.1銳頂鐮刀菌在PDA培養(yǎng)基生長形態(tài)
銳頂鐮刀菌在PDA平板上菌絲呈粉紅色絨毛狀,生長到后期,顏色逐漸加深變成桃紅色,菌絲有隔
且具分支,見附錄A的圖A.2。
6.2.2銳頂鐮刀菌分生孢子
銳頂鐮刀菌小型分生孢子數(shù)量較少,呈長橢圓形,0~1個分隔,大小為6.8μm~14.0μm×3.5μm~
4.9μm。大型分生孢子數(shù)量較多,彎刀型,中間較寬、較胖,兩端稍尖并稍彎曲,2~5個分隔,大小為
18.2μm~38.5μm×3.9μm~6.3μm,見附錄A中的圖A.3。
分子鑒定
6.3.1病原菌基因組DNA的提取
病原菌菌株在25℃下PDA平板上生長5~7d后,轉(zhuǎn)接至裝有50mL的PDB培養(yǎng)基靜置生長3d,離心
收集菌絲,液氮下研磨,使用真菌基因組提取試劑盒提取病原菌DNA后進行分子生物學(xué)鑒定。
6.3.2PCR檢測鑒定
6.3.2.1引物
采用rDNA-ITS區(qū)通用引物ITS1(5'-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3')和ITS4(5'-TCCTCCGCTTATTG
ATATGC-3')和RPB2基因通用引物fRPB2-7Cf(5'-ATGGGYAARCAAGCYATGGG-3')和fRPB2-11aR(5'-G
2
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CRTGGATCTTRTCRTCSACC-3')以及鐮刀菌PHO序列引物Fusphoo-f(5'-ATGCARGGYATYGGHCARC
THGT-3')和Fusphoo-r(5'-ACRTTRGTRGCATCCTTRGWRGART-3')進行PCR擴增。
6.3.2.2PCR結(jié)果
PCR獲得ITS、RPB2、PHO序列大小分別為530bp左右和850bp左右,以及為500bp左右的目的片段,
見附錄A中的圖A.4。送至測序公司進行測序,測序結(jié)果在NCBI數(shù)據(jù)庫比對。
6.3.2.3聚類分析
聚類分析結(jié)果表明,以ITS序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹中,菌株與NCBI數(shù)據(jù)庫中的三線鐮刀菌
(JX989827.1)、燕麥鐮刀菌(KX058547.1)、銳頂鐮刀菌(MT557673.1)聚為同一類,見附錄A中的圖
A.5。以fRPB2序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹中,菌株與NCBI數(shù)據(jù)庫中的銳頂鐮刀菌(HM068335.1)聚為同一類,
見附錄A中的圖A.6。以PHO序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹中,菌株與NCBI數(shù)據(jù)庫中的銳頂鐮刀菌(KJ200247.1)
聚于同一類,見附錄A中的圖A.7。
致病性測定
6.4.1分生孢子懸浮液制備
選取形態(tài)特征與F.acuminatum形態(tài)特征相符且PCR檢測鑒定陽性的分離菌株,在綠豆培養(yǎng)基上培養(yǎng)
獲得分生孢子,用無菌水配置成濃度為106個/mL分生孢子懸浮液。
6.4.2病原菌回接
消毒后的苜蓿種子播種于滅菌營養(yǎng)土中,播種40d后,用分生孢子液接種的大米接種苜蓿根部。采
用針刺法接種苜蓿根部,在傷口處接種10粒左右大米,期間要保持土壤濕潤。在接種后14d~20d。對
接種發(fā)病的苜蓿根部再做病原菌分離、培養(yǎng),觀察是否與F.acuminatum的形態(tài)特征一致,并對分離菌
進行PCR檢測。
7結(jié)果判定
符合銳頂鐮刀菌根腐病為害癥狀,菌落培養(yǎng)特性和病菌形態(tài)學(xué)特征與銳頂鐮刀菌(F.acuminatum)
相符,PCR擴增鑒定為F.acuminatum,且苜蓿致病性測試的分離物,鑒定定為F.acuminatum。
3
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A
A
附錄A
(資料性)
苜蓿根腐病銳頂鐮刀菌的分離鑒定過程
苜蓿根腐病銳頂鐮刀菌的分離鑒定過程見圖A.1~圖A.7。
取樣清洗分離涂板
搖菌鏡檢再次分離
提取測序比對
圖A.1苜蓿根腐病病原菌的分離純化
AB
注:A:銳頂鐮刀菌在PDA平板正面,B:銳頂鐮刀菌在PDA平板背面。
圖A.2PDA培養(yǎng)基銳頂鐮刀菌生長形態(tài)
4
DB15/T3279—2023
ABC
注:A:小型分生孢子B:大型分生孢子C:菌絲。
圖A.3銳頂鐮刀菌孢子與菌絲形態(tài)
A
750bp
500bp
B
1000b
750bp
C
500bp
250bp
注:A:ITS引物PCR電泳圖,M為DL2000DNA,2泳道為CK,13-18泳道為檢測菌株,
B:RBP2引物PCR電泳圖,M為DL2000DNA,21泳道為CK,2-20泳道為檢測菌株,
C:PHO引物PC
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