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文檔簡(jiǎn)介
ICS65.020.01
CCSB04
15
內(nèi)蒙古自治區(qū)地方標(biāo)準(zhǔn)
DB15/T4108—2025
馬鈴薯病毒RT-PCR檢測(cè)技術(shù)規(guī)程
CodeofpracticeforRT-PCRdetectionofpotatoviruses
2025-07-10發(fā)布2025-08-10實(shí)施
內(nèi)蒙古自治區(qū)市場(chǎng)監(jiān)督管理局發(fā)布
DB15/T4108—2025
前言
本文件按照GB/T1.1—2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定
起草。
本文件由內(nèi)蒙古自治區(qū)果蔬標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)(SAM/TC25)歸口。
本文件起草單位:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)、內(nèi)蒙古師范大學(xué)、內(nèi)蒙古自治區(qū)農(nóng)牧業(yè)科學(xué)院、內(nèi)蒙古民族幼
兒師范高等??茖W(xué)校、鄂爾多斯市農(nóng)牧業(yè)生態(tài)與資源保護(hù)中心。
本文件主要起草人:李正男、張磊、孫平平、張斌、席先梅、呂秀華、曹春梅、張溪、霍宏麗、周
宇、孫宇、牟英男、郭孟澤。
I
DB15/T4108—2025
馬鈴薯病毒RT-PCR檢測(cè)技術(shù)規(guī)程
1范圍
本文件描述馬鈴薯病毒檢測(cè)中的術(shù)語和定義,檢測(cè)對(duì)象,抽樣、取樣、檢測(cè)方法和判定規(guī)則等內(nèi)容。
本文件適用于馬鈴薯病毒的檢測(cè)。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
GB/T34265Sanger法測(cè)序技術(shù)指南
GB/T40974核酸樣本質(zhì)量評(píng)價(jià)方法
SN/T2497.21進(jìn)出口危險(xiǎn)化學(xué)品安全試驗(yàn)方法第21部分:瓊脂糖凝膠電泳試驗(yàn)
3術(shù)語和定義
下列術(shù)語和定義適用于本文件。
RNA病毒RNAviruses
核糖核酸病毒,其遺傳物質(zhì)為RNA。
類病毒viroids
又感染性RNA,是一種和病毒相似,但不具有蛋白質(zhì)外殼的一類環(huán)狀閉合的單鏈RNA分子。
反轉(zhuǎn)錄reversetranscription(RT)
以RNA為模板,逆轉(zhuǎn)錄酶催化合成DNA的過程。
互補(bǔ)DNAcomplementaryDNA(cDNA)
由逆轉(zhuǎn)錄酶催化合成的、與RNA模板互補(bǔ)的DNA。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)Polymerasechainreaction(PCR)
1
DB15/T4108—2025
利用DNA聚合酶,對(duì)DNA或cDNA模板的特定區(qū)域進(jìn)行體外擴(kuò)增的技術(shù)。反應(yīng)混合物通常由DNA聚合酶、
脫氧核苷三磷酸、引物和緩沖液組成,反應(yīng)過程主要包括變性、退火和延伸三個(gè)步驟。
引物Primers
人工合成的具有一定長(zhǎng)度的單鏈DNA分子,與DNA模板鏈的特定區(qū)域互補(bǔ),其3’末端在PCR過程中作
為復(fù)制延伸的起始位點(diǎn)。
4檢測(cè)對(duì)象
主要RNA病毒種類
苜蓿花葉病毒(Alfalfamosaicvirus,AMV)。
黃瓜花葉病毒(Cucumbermosaicvirus,CMV)。
馬鈴薯奧古巴花葉病毒(Potatoaucubamosaicvirus,PAMV)。
馬鈴薯卷葉病毒(Potatoleafrollvirus,PLRV)。
馬鈴薯帚頂病毒(Potatomop-topvirus,PMTV)。
馬鈴薯A病毒(PotatovirusA,PVA)。
馬鈴薯M病毒(PotatovirusM,PVM)。
馬鈴薯S病毒(PotatovirusS,PVS)。
馬鈴薯X病毒(PotatovirusX,PVX)。
馬鈴薯Y病毒(PotatovirusY,PVY)。
主要類病毒種類
馬鈴薯紡錘塊莖類病毒(Potatospindletuberviroid,PSTVd)。
注:類病毒雖然不具有病毒所具有的蛋白質(zhì)外殼,但具有RNA基因組,檢測(cè)方法與RNA病毒一致。因此,列為本標(biāo)準(zhǔn)
的檢測(cè)對(duì)象。
5抽樣方法
采用5點(diǎn)法抽樣。
種植面積小于2001m(含22001m2),抽檢100株。種植面積在2001m2到20010m2之間(含20010m2),
前2001m2抽100株,之后每增2001m2增檢50株。種植面積超過20010m2時(shí),前20010m2按上述方法抽樣,
之后每增加2001m2增檢20株。
6取樣方法
對(duì)樣方內(nèi)的馬鈴薯進(jìn)行采樣,取靠近頂部的新鮮葉或枝條,撣掉灰塵或其他附著物,除去蚜蟲,放
置于自封采樣袋內(nèi)。
采樣點(diǎn)距離檢測(cè)點(diǎn)較遠(yuǎn)時(shí),用濕紙巾、海綿或布條包裹葉或枝條的切割處,置于采樣自封袋內(nèi)進(jìn)行
運(yùn)輸。
樣品在檢測(cè)點(diǎn)存儲(chǔ)時(shí)間較短時(shí)(一般不超過24h),在4℃存放即可。長(zhǎng)期存放樣品時(shí),需要將樣
品用液氮預(yù)冷后,保存于-80℃超低溫保存箱。
2
DB15/T4108—2025
7檢測(cè)方法
樣品前處理
避開葉片中脈,切取葉片組織用于檢測(cè)。
樣品核酸提取
選擇市售的用于提取含有多糖多酚材料RNA的試劑盒,按照試劑盒自帶的說明書進(jìn)行操作。核酸質(zhì)
量評(píng)價(jià)按照GB/T40974執(zhí)行。
反轉(zhuǎn)錄
以質(zhì)量合格的總RNA為模板,選擇市售的具有基因組DNA去除功能的反轉(zhuǎn)錄試劑盒進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,合成
cDNA。反應(yīng)體系和反應(yīng)程序按照試劑盒自帶的說明書進(jìn)行設(shè)置。
PCR擴(kuò)增
7.4.1PCR反應(yīng)體系
市售產(chǎn)品通常為預(yù)混液或單品,根據(jù)所選產(chǎn)品提供的說明書,進(jìn)行PCR反應(yīng)混合物配制,并按說明
書指示加入cDNA模板以及病毒檢測(cè)引物。各種病毒的特異性檢測(cè)引物見表1。
表1馬鈴薯病毒的特異性檢測(cè)引物
病毒名稱引物名稱引物序列/(5’→3’方向)目標(biāo)DNA片段大小/(bp)
AMVAMV-FaCCATCATGAGTTCTTCACAAA351
AMVAMV-RbTCGTCACGTCATCAGTGAGAC351
CMVCMV-FGTTTATTTACAAGAGCGTACGG650
CMVCMV-RGGTTCGAARRWATAACCGGG650
PAMVPAMY-FACCCAAGCGTTCCTATATACTC360
PAMVPAMV-RGGTCAAATCATTGCCAGCAATC360
PLRVPLRV-FCGCGCTAACAGAGTTCAGCC336
PLRVPLRV-RGCAATGGGGGTCCAACTCAT336
PMTVPMTV-FATGGCTGAAAACAGAGGTGA531
PMTVPMTV-RCTATGCACCAGCCCAGCGTAA531
PVAPVA-FGATGTCGATTTAGGTACTGCTG273
PVAPVA-RTCCATTCTCAATGCACCATAC273
PVMPVM-FACATCTGAGGACATGATGCGC520
PVMPVM-RTGAGCTCGGGACCATTCATAC520
PVSPVS-FTCTCCTTTGAGATAGGTAGG602
PVSPVS-RCAGCCTTTCATTTCTGTTAG602
PVXPVX-FATGTCAGCACCAGCTAGCA711
PVXPVX-RTGGTGGTGGTAGAGTGACAA711
PVYPVY-FGGCATACGGACATAGGAGAAACT447
PVYPVY-RCTCTTTGTGTTCTTCTCTTGTGT447
PSTVdPSTVd-FCACCCTTCCTTTCTTCG359
PSTVdPSTVd-RAAAACCCTGTTTCGGCGGGA359
F表示上游引物。
R表示下游引物。
3
DB15/T4108—2025
7.4.2PCR反應(yīng)程序
95℃預(yù)變性2min。35個(gè)反應(yīng)循環(huán):95℃變性20s;退火20s,退火溫度按引物合成報(bào)告設(shè)置,
兩個(gè)引物退火溫度不一致時(shí),取較低溫度;72℃延伸,延伸時(shí)間根據(jù)所選產(chǎn)品說明書提供的參數(shù)進(jìn)行
計(jì)算。最后,72℃終延伸5min。
瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)
7.5.1瓊脂糖凝膠制備
用Tris-乙酸緩沖液溶解瓊脂糖,制備質(zhì)量體積比為1%的瓊脂糖凝膠。瓊脂糖凝膠的制備按照SN/T
2497.21執(zhí)行。
7.5.2電泳檢測(cè)
用Tris-乙酸緩沖液,在水平板電泳槽中進(jìn)行電泳。上樣、電泳按照SN/T2497.21執(zhí)行。電泳結(jié)束
時(shí),凝膠置于紫外燈或凝膠成像系統(tǒng)進(jìn)行觀測(cè)和拍照,獲取的圖片用于結(jié)果判定。
8判定規(guī)則
異常結(jié)果
根據(jù)瓊脂糖凝膠電泳圖,與圖中DNA相對(duì)分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)品相比,從陰性對(duì)照樣品擴(kuò)增到了預(yù)期大小
的DNA片段,或從陰性對(duì)照和陽性對(duì)照樣品均未擴(kuò)增到預(yù)期大小的DNA片段,此時(shí),判定為檢測(cè)錯(cuò)誤,應(yīng)
重新進(jìn)行檢測(cè)。
陽性結(jié)果
從陰性對(duì)照樣品未擴(kuò)增到預(yù)期大小的DNA片段,從被檢測(cè)樣品擴(kuò)增到了預(yù)期大小的DNA片段。有陽性
對(duì)照時(shí),從陽性對(duì)照擴(kuò)增的DNA片段大小,與判定為陽性的樣品中擴(kuò)增的DNA片段大小
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