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文檔簡介

1、Western blot 實驗技術(shù),定義:,印跡法(blotting)是指將樣品轉(zhuǎn)移到固相載體上,而后利用相應(yīng)的探測反應(yīng)來檢測樣品的一種方法。 Western Blot是分子生物學(xué)、生物化學(xué)和免疫遺傳學(xué)中常用的一種實驗方法。 1975年,Southern建立了將DNA轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜(NC膜)上,并利用DNARNA雜交檢測特定的DNA片段的方法,稱為Southern印跡法。 而后人們用類似的方法,對RNA和蛋白質(zhì)進(jìn)行印跡分析,對RNA的印跡分析稱為Northern印跡法,對單向電泳后的蛋白質(zhì)分子的印跡分析稱為Western印跡法,對雙向電泳后蛋白質(zhì)分子的印跡分析稱為Eastern印跡法,We

2、stern Blot基本原理,Western Blot:采用的是聚丙烯酰胺凝膠電泳,被檢測物 是蛋白質(zhì),“探針”是抗體,“顯色”用標(biāo)記的二抗。 經(jīng)過PAGE分離的蛋白質(zhì)樣品,轉(zhuǎn)移到固相載體(例如硝酸纖維素薄膜)上,固相載體以非共價鍵形式吸附蛋白質(zhì),且能保持電泳分離的多肽類型及其生物學(xué)活性不變。以固相載體上的蛋白質(zhì)或多肽作為抗原,與對應(yīng)的抗體起免疫反應(yīng),再與酶或同位素標(biāo)記的第二抗體起反應(yīng),經(jīng)過底物顯色或放射自顯影以檢測電泳分離的特異性目的基因表達(dá)的蛋白成分。,Western Blot一般流程,蛋白樣品的制備 SDS聚丙烯酰胺 凝膠電泳,轉(zhuǎn)膜 封閉 一抗雜交 洗滌 二抗雜交 洗滌 底物顯色,通過有

3、機(jī)溶劑或水溶法制備總蛋白 水溶液提取法 針對水、稀鹽、稀酸或堿溶液中的蛋白質(zhì)。稀鹽和緩沖系統(tǒng)的水溶液 對蛋白質(zhì)穩(wěn)定性好、溶解度大、是提取蛋白質(zhì)最常用的溶劑 。 細(xì)胞裂解液: 0.5ml水+0.5ml裂解液+10l蛋白酶抑制劑+ 10l 泛酸鈉+ 1l pepstain 有機(jī)溶劑提取法 對于分子中非極性側(cè)鏈較多的蛋白質(zhì)可用有機(jī)溶劑提取,包括乙醇、 丙酮和丁醇等。 通過層析或電洗脫法制備目的蛋白,蛋白樣品的制備,細(xì)胞數(shù)量達(dá)5106個時就可以做WB。 將細(xì)胞裂解液再離心,收集上清液 測蛋白濃度(Bca法),統(tǒng)一上樣量 加loading BUFFER 煮樣5min-10min,蛋白樣品制備的注意事項:

4、,煮沸5-15min,以充分變性蛋白,保證蛋白從空間結(jié)構(gòu)變?yōu)橐患壗Y(jié)構(gòu)(多聚體解散為單聚體,氧化狀態(tài)轉(zhuǎn)化為還原狀態(tài)等)。有的也可以在700C加熱5-10min,尤其適用于多次跨膜蛋白的檢測(這些蛋白在煮沸狀態(tài)下容易聚集,而聚集狀態(tài)則會影響標(biāo)本進(jìn)入凝膠的效率。),SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳,原理: SDS 是一種離子性的界面活性劑,它有強(qiáng)離子性的硫酸根離子也帶有疏水 性的長碳鏈.當(dāng) SDS 與蛋白質(zhì)混合時,它會以其碳鏈與蛋白質(zhì)之疏水性胺 基酸結(jié)合將蛋白質(zhì)包起來,而以硫酸根離子外露與水分子作用.大多數(shù)蛋 白質(zhì)和 SDS 的平均結(jié)合量是 1:1.4 (以重量為單位),而蛋白質(zhì)和SDS結(jié)合后,由于 SDS

5、 帶強(qiáng)負(fù)價,使蛋白質(zhì)原先的帶電價微不足道,且 每單位重量的蛋白質(zhì)帶電價一致 (charge density),所以決定不同蛋白的泳動速率就只剩下分子大小一項因素,純凈水(ddH2O) 丙烯酰胺和N,N-亞甲雙丙烯酰胺 (Arc-Bis) SDS Tris-HCL 四甲基乙二胺(TEMED)(催化硫酸銨形成自由基而加速丙烯酰胺和雙丙烯酰胺的聚合) 過硫酸銨(APS)(提供引發(fā)丙烯酰胺和雙丙烯酰胺聚合的自由基),凝膠成份,常用凝膠配置比例,凝膠濃度與蛋白分離范圍,SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳注意事項:,做膠:防止漏膠、進(jìn)氣泡以及花膠(水封、插梳子和拔梳子)。 加樣:加樣量一樣,加樣時間要盡量短,以免樣

6、品擴(kuò)散 電泳:將膠夾好放于電泳槽中,加電泳buffer,將電壓調(diào)到90V開始電泳,待樣品在積層膠里壓成一條直線之后,將電壓調(diào)到120V,直到溴酚蘭前沿跑出膠后停止電泳。,膜的選擇,轉(zhuǎn)膜,半干法(用恒流) 將凝膠和固相基質(zhì)象三明治一樣加在用緩沖液濕 潤濾紙之間,電轉(zhuǎn)1030min。 濕法 將凝膠和固相基質(zhì)夾在濾紙中間,浸泡在轉(zhuǎn)移裝 置的緩沖液中,電轉(zhuǎn)1h或過夜。,轉(zhuǎn)膜注意事項(一),泡膜: 轉(zhuǎn)膜之前將海綿、膠、膜都用預(yù)冷的轉(zhuǎn)移buffer浸泡20min (1.凝膠若是沒在預(yù)冷的轉(zhuǎn)膜buffer中浸泡,就會在轉(zhuǎn)膜過程中出現(xiàn)凝膠皺縮,導(dǎo)致出現(xiàn)轉(zhuǎn)移條帶變形。2.PVDF膜具有疏水性,需用甲醇浸泡) 轉(zhuǎn)

7、膜順序: 陰極碳板(黑)+海綿+三濾+膠+膜+三濾+海綿+陽極碳板(白) 轉(zhuǎn)膜條件: 0.4A 250V 1h-90min 冰浴中進(jìn)行轉(zhuǎn)膜 (具體轉(zhuǎn)膜時間要根據(jù)目的蛋白的大小而定;目的蛋白的分子量越大,需要的轉(zhuǎn)膜時間越長,反之則短。),轉(zhuǎn)膜的注意事項(二),避免直接用手碰雜交膜,使用鑷子。因為手上的蛋白和油脂會影響轉(zhuǎn)膜效率并會使膜臟掉。 夾好膜和凝膠后,確定在凝膠/膜和濾紙之間沒有氣泡存在,否則會導(dǎo)致轉(zhuǎn)膜不完全。,封閉(1h)(封閉時間過短會導(dǎo)致背景過深 ),5脫脂奶粉封閉1h,置于搖床上。 封閉前,要用雙蒸水洗3-5min,剪膜,一抗、二抗孵育,把硝酸纖維素濾膜放在密閉塑料盒中,根據(jù)濾膜面積

8、以0.1ml/cm2的量加入一抗溶液與濾膜溫育(抗體濃度過高會導(dǎo)致背景較深,過低會導(dǎo)致和抗原結(jié)合不充分,出現(xiàn)假陰性 )。室溫不少于7小時,4 時過夜。(一般) 回收一抗溶液,用TBST洗膜3次,每次5min(洗滌不充分會導(dǎo)致膜上非特異性條帶處仍有一抗殘留,會影響二抗結(jié)合的位置不準(zhǔn)確 )。 加入二抗溶液,搖床上緩慢搖動, 室溫避光1.5-2h 回收二抗,TBST洗膜3次,每次5min,純凈水洗膜5min。 短時間多次洗膜較長時間少次洗膜更有效。,Tween有助于去除非特異性的結(jié)合,減少背景。,顯色反應(yīng),一般用ECL發(fā)光法 辣根過氧化物酶HRP標(biāo)記二抗,用底物發(fā)光法:將兩種顯色底物1:1等體積混合

9、后將其覆蓋在膜表面使其均勻,用X膠片把膜包起來,馬上在暗室中將X光片覆蓋在膜的上面(時間根據(jù)光的亮度來衡量),顯影、定影。 注意:發(fā)光法檢測的時候曝光時間要恰到好處,過短會導(dǎo)致曝光不徹底, 影響條帶亮度,過長會導(dǎo)致熒光信號衰弱,也會使背景顏色加深。,抗體保存注意事項:,1.收到抗體后按要求離心后再打開管蓋進(jìn)行分裝和保存! 2.對于大部分抗體,比較合適的保存方式是分裝后保存在 -200C。 2.1 分裝的量以一次實驗用完為好,最少不能少于10ul每份。因為分裝體積越小,抗體的濃度越可能會受到蒸發(fā)以及管壁吸附的影響。 2.2 復(fù)融后的分裝抗體如果一次用不完,將剩余母液保存在40C,避免再凍起來!

10、3.大部分抗體收到后40C短暫保存1-2周對抗體活性是沒有影響的。 任何時候,絕對避免反復(fù)凍融!,Western Blot常見問題分析,SDS-PAGE電泳,膠不平? 凝膠漏液?,膠板洗刷干凈 加入APS和TEMED的量要合適 加入試劑后搖勻,使其充分混合,防止部分膠塊聚合不均勻 溫度合適,受熱不均勻?qū)е履z聚合不均勻 兩塊玻璃板底部要對齊,條帶比正常的窄? “微笑”或“倒微笑”條帶?,凝膠聚合不均勻,灌膠時候盡量混合均勻,動作輕緩 拔梳子要迅速,且豎直的拔 樣品鹽濃度過高會擠壓其他條帶導(dǎo)致寬窄不一,純化樣品,調(diào)整鹽濃度 膠板底部有氣泡會影響電泳效果,應(yīng)趕走氣泡。同時注意電泳槽裝置是否合適,轉(zhuǎn)膜及抗

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