一、 鞠建華：緒論、酶1 .生物有機化學(xué)（Bioorganic Chemistry)：有機化學(xué)和生物化學(xué)的交叉學(xué)科，運用有機化學(xué)的理論和方法在分子水平上研究生命現(xiàn)象的化學(xué)本質(zhì)。2 .你還了解哪些天然產(chǎn)物或者分子具有哪些生物學(xué)功能？3 共價鍵、氫鍵、配價鍵、離子鍵、疏水作用、范德華作用力4 化學(xué)鍵，范德華力，氫鍵比較5 R/S 構(gòu)型生物分子立體效應(yīng)的影響主要表現(xiàn)在：影響反應(yīng)的活性和方向性；生物分子間的相互作用等。1. 對反應(yīng)活性的影響 鄰基效應(yīng)（proximity effects） 2. 對反應(yīng)立體選擇性的影響（ 酶促反應(yīng)的立體選擇性例子）生物體內(nèi)的基本有機反應(yīng) 1.水解反應(yīng): 包括酯鍵、酰胺鍵和糖苷鍵的水解。 2.縮合反應(yīng):生成酰胺鍵、酯鍵、糖苷鍵的反應(yīng) , 其它縮合反應(yīng)（羥醛縮合反應(yīng)、克萊森酯縮合反應(yīng)、迪克曼縮合）3. 磷?；磻?yīng) 4. 氧化和還原反應(yīng) 5. 烷基化反應(yīng)（脂肪酸碳鏈增長反應(yīng)）6. 加成反應(yīng)（親電加成反應(yīng)、親核加成反應(yīng)、環(huán)加成反應(yīng)即迪爾斯-阿爾德反應(yīng)）7. 消除反應(yīng) 8. 分子重排反應(yīng)（克萊森重排、頻哪醇重排、法沃爾斯基重排）9. 異構(gòu)化反應(yīng) 酶（enzyme）是一類由活細(xì)胞產(chǎn)生的，對其特異底物具有高效催化作用的生物催化劑。 生物催化（biocatalysis）是指利用酶或者生物有機體（細(xì)胞、細(xì)胞器、組織等）作為催化劑進行化學(xué)轉(zhuǎn)化的過程。舉出生活中，酶應(yīng)用的具體例子。1.醫(yī)用：胰蛋白酶用于促進傷口愈合和溶解血凝塊，還可用于去除壞死組織，抑制污染微生物的繁殖。 2.日用：加酶洗衣粉3.食用：凝乳酶奶酪生產(chǎn)的凝結(jié)劑，并可用于分解蛋白質(zhì)。 乳糖酶降解乳糖為葡萄糖和半乳糖，獲得沒有乳糖的牛乳制品，有利于乳品的消化吸收。4.美容： 酶對生物催化的貢獻與一般化學(xué)催化劑的異同？酶為什么需要形成活性中心？共性：在反應(yīng)前后沒有質(zhì)和量的變化；只能催化熱力學(xué)允許的化學(xué)反應(yīng)；只能加速可逆反應(yīng)的進程，而不改變反應(yīng)的平衡點；作用機制都降低反應(yīng)活化能不同點：酶效率高；底物特異性；酶在體系內(nèi)處于不斷變化中；催化作用由多種因素調(diào)節(jié)；對反應(yīng)條件嚴(yán)格為什么酶的催化效率遠(yuǎn)遠(yuǎn)地比非催化劑或一般催化劑高？酶原：酶分子沒有活性的前體物質(zhì)。酶原的激活：在一定條件下，酶原像有活性的酶轉(zhuǎn)化的過程。別構(gòu)調(diào)節(jié)：指小分子化合物與酶蛋白分子活性中心以外的某一部位特異結(jié)合,引起酶蛋白分子構(gòu)像變化、從而改變酶的活性。抑制劑：引起酶活力降低的別構(gòu)效應(yīng)劑。激活劑：引起酶活力增加的別構(gòu)效應(yīng)劑。舉例說明，研究酶抑制劑的現(xiàn)實意義？醫(yī)學(xué) : 磺胺藥是二氫葉酸合成酶的競爭性抑制劑，進而減少菌體內(nèi)四氫葉酸的合成，使核酸合成障礙，導(dǎo)致細(xì)菌死亡新藥研發(fā):農(nóng)業(yè) : 苯磺?。?磺酰脲類除草劑，抑制乙酰乳酸合成酶（ALS）的抑制劑，通過抑制ALS，阻礙側(cè)鏈氨基酸如纈氨酸，亮氨酸，異亮氨酸的生物合成，導(dǎo)致雜草生長受破壞而死。畜牧業(yè): 脲酶抑制劑不但能抑制瘤胃內(nèi)脲酶活性，降低瘤胃中氨的濃度，而且可使氨的釋放速度平穩(wěn)，有利于微生物合成菌體豆角、決而提高反芻動物對尿素的利用率,并提高飼料轉(zhuǎn)化率X-衍射晶體學(xué)手段研究酶的意義? 測定酶分子的三維結(jié)構(gòu)，明確其三維構(gòu)件及結(jié)構(gòu)域分布。 從原子級別，理解酶催化的機制。 基于酶分子三維結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計。酶作為藥物靶向目標(biāo)，為藥物前期開發(fā)提供了數(shù)據(jù)支持。相比于化學(xué)合成，酶催化的合成有什么優(yōu)勢？化學(xué)合成：涉及糖分子中羥基的保護與脫保護，步驟多，產(chǎn)率低。 糖苷合成酶：催化糖苷合成，一步反應(yīng)得到目標(biāo)產(chǎn)物。 聚酮類化合物是一大類由細(xì)菌、真菌和植物將低級羧酸通過連續(xù)的縮合反應(yīng)產(chǎn)生的天然產(chǎn)物，具有多樣的碳骨架結(jié)構(gòu)： 聚肽類化合物是一類不以 mRNA 為模板，不需核糖體、 tRNA 的參與，由非核糖體肽合成酶（non-ribosomal peptide synthetases，NRPSs）催化合成的天然產(chǎn)物。其氨基酸原料除了 20 種蛋白質(zhì)源的氨基酸外，還含有大量的非蛋白源氨基酸。AT（acyl transferase， ?；D(zhuǎn)移酶）： 負(fù)責(zé)將低級脂肪酸以 CoA 酯形式通過酰基攜帶蛋白ACP 的輔基； AT 結(jié)構(gòu)域?qū)Φ孜镒R別的特異性決定碳鏈延長單位的組成，AT 結(jié)構(gòu)域的數(shù)量和相應(yīng)的模塊決定聚酮體鏈的長度 ACP（acyl carrier protein，?；d體蛋白）：在聚酮鏈延伸中起到?；D(zhuǎn)移的攜帶作用KS（ketoacyl-ACP synthase，酮脂酰 -ACP 合成酶）：在聚酮鏈的延長中，起到催化新進入的酰基-ACP 與已延長的聚酮中間體之間的縮合作用，使聚酮鏈得到進一步的延長 KR（ketoreductase，酮基轉(zhuǎn)移酶）：參與聚酮鏈形成過程中酮基的還原，使酮基變?yōu)榱u基DH（dehydratase，脫水酶）：參與聚酮體碳鏈羥基的脫水； ER（enoyl reductase，烯醇還原酶） ，參與聚