1,微生物的分類與命名,2,微生物的范圍,細(xì)菌支原體螺旋體立克次體衣原體放線菌真菌病毒,原核型單細(xì)胞,真核型單細(xì)胞,非細(xì)胞形態(tài),3,分類等級,界(kingkom)門(divisions)綱(classes)目(orders)科(families)屬(genera)種(species),4,原核生物和真核生物的比較,5,第二節(jié)細(xì)菌的分類單位、系統(tǒng)和命名,6,一、細(xì)菌的分類單位和命名,種:是細(xì)菌分類的基本單位。形態(tài)學(xué)和生理學(xué)性狀相同的細(xì)菌群體構(gòu)成一個菌種。屬：性狀相近、關(guān)系密切的若干菌種組成屬?？疲合嘟膶贇w為一個科。,7,菌株：同一種不同來源的細(xì)菌稱為該菌的不同菌株。標(biāo)準(zhǔn)株（standardstrain：具有某種細(xì)菌典型特征的菌株稱為該菌的標(biāo)準(zhǔn)株。,8,細(xì)菌種的科學(xué)命名法：1、英文名拉丁文雙命名法屬名在前：為名詞，首字母大寫種名在后：為形容詞，首字母小寫斜體例：結(jié)核分枝桿菌Mycobacteriumtuberculosis2、中文譯名種名在前、屬名在后亞種以上分類按命名法規(guī)的規(guī)定，亞種以下命不受法規(guī)約束。,9,國際細(xì)菌命名法規(guī)（InternationalCodeofNomenclatureofBacteria，簡稱ICNB）：決定細(xì)菌的命名。國際系統(tǒng)菌學(xué)雜志(InternationalJournalofSystematicBacteriology;IJSB)：發(fā)表新細(xì)菌命名提案。,10,二、細(xì)菌的分類系統(tǒng),1、伯杰系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊（BergeysManualofSystemicBacteriology）,11,自1923年伯杰鑒定細(xì)菌學(xué)手冊（Bergeysmannualofdeterminativebacteriology）第一版問世以來，每隔四五年修訂一次，至1974年已出版至第八版。1984年將其易版為伯杰系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊（Bergeysmanualofsystemicbacteriology），共分4卷。在此新版中，對細(xì)菌的高級分類作了重新安排，以細(xì)菌細(xì)胞壁的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)，將原核生物界分為4個菌門：薄壁菌門（Gracilicutes）、厚壁菌門（Firmicutes）、軟壁菌門（Tenericutes）和疵壁菌門（Mendosicutes）。,12,伯杰系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊第1卷（1984年）登載醫(yī)學(xué)、工業(yè)和普通微生物中重要革蘭陰性細(xì)菌；第2卷（1986年）為放線菌外的革蘭陽性菌，第3卷為古細(xì)菌、藍(lán)藻菌和其他革蘭陰性菌；第4卷為放線菌。,13,2、CDC（centerfordiseasecontrolandprevention）分類該系統(tǒng)由美國疾病控制和預(yù)防中心（centerfordiseasecontrolandprevention，CDC）使用核酸雜交和核酸序列分析結(jié)果編排。,14,三、細(xì)菌的分類方法,15,一、生理學(xué)與生物化學(xué)分類法,1、傳統(tǒng)分類法19世紀(jì)以來，以細(xì)菌的形態(tài)、生理特征為依據(jù)的分類奠定了傳統(tǒng)的分類基礎(chǔ)。選擇一些較為穩(wěn)定的生物學(xué)性狀，如細(xì)菌的形態(tài)結(jié)構(gòu)、染色體、培養(yǎng)特性、生化反應(yīng)、抗原性作為分類依據(jù)，然后按主次順序逐級區(qū)分。這種方法使用方便，分類亦較為明確，但往往帶有一定程度的盲目性。,16,2、數(shù)值分類法20世紀(jì)60年代，隨計(jì)算機(jī)的應(yīng)用而發(fā)展的細(xì)菌分類方法。它對細(xì)菌的各種生物學(xué)性狀按“等重要原則”進(jìn)行分類，一般需選用50項(xiàng)以上的生理、生化指標(biāo)逐一進(jìn)行比較，通過計(jì)算機(jī)分析各菌間相似度，劃分細(xì)菌的屬和種，并確定它們的親緣關(guān)系。,17,二、遺傳學(xué)分類法,1、DNAG+Cmol%測定DNA分子兩條鏈上4種堿基的總分子量為100，測定其中G+G或A+T摩爾百分比，能反映出細(xì)菌間DNA分子同源程度，習(xí)慣上以G+C作為細(xì)菌分類標(biāo)記。不同菌屬間的G+Cmol%范圍很大，在25%75%之間，但同一種細(xì)菌G+Cmol%相當(dāng)穩(wěn)定，不受菌齡、培養(yǎng)條件和其他外界因素影響，親緣關(guān)系越近的細(xì)菌，它們G+Cmol/%越相近。目前測定的技術(shù)多用加熱變性法。,18,加熱變性的DNA由于雙鏈DNA分開，使A260紫外吸收度增加。紫外吸收度的增加與解鏈程度成正比。用Tm表示DNA分子中50%解鏈時的溫度，Tm隨G+Cmol%的含量線性增加。在通常條件下，G+Cmol%為40的DNA其Tm約為87，每增加1%G+Cmol含量，Tm約增加0.4，因而通過Tm可測出G+Cmol%含量。,19,2、核酸同源值測定利用DNA分子雜交技術(shù)測定DNA分子的相似度，此辦法較精確。其基本步驟均是先提取菌株的DNA，加熱變性解鏈，然后將兩種變性的DNA（其中一種為標(biāo)記DNA或rRNA）混合液在一定的溫度下保溫復(fù)性，重新得到雜交的雙螺旋DNA分子，鑒定其雙螺旋結(jié)合率。結(jié)合率的大小反映了DNA堿基序列的相似程度和菌種之間的親緣關(guān)系的親疏。DNA/DNA雜交時，同一菌的結(jié)合率為100%，80%90%的同源為同一種內(nèi)、同一亞種的細(xì)菌，60%70%的同源性為同一種內(nèi)不同亞種的細(xì)菌，20%60%則認(rèn)為是同一屬中的不同菌種。,20,3、核蛋白體RNA堿基序列測定細(xì)菌核蛋白體RNA序列比