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文檔簡介
1、實驗八ABO 血型的基因型檢測一、實驗?zāi)康呐c原理1.目的了解ABO血型的遺傳學(xué)原理掌握在DNA水平上鑒定ABO基因型的基本原理和操作過程2.原理ABO 血型抗原是由 I A ; IB ; i 基因編碼的特異性糖基轉(zhuǎn)移酶催化合成的紅細(xì)胞膜表面的糖蛋白和糖脂。ABO 基因座位位于第九號染色體上,其3 個等位基因I A 、 IB、 i 形成4 種主要的血型A、B、AB 和O。ABO血型系統(tǒng)遺傳方式 A血型: IA I A ; IAi B血型: I BIB ; IBi AB血型:IAIBO血型: iiIA基因與IB基因之間在cDNA上有7個單堿基替換:A294G、C523G、C654T、G700A、C
2、793A、G800C和G927A。 i基因與IA基因相比只是cDNA的第258位的胞嘧啶缺失,出現(xiàn)框移突變,使第352位的1-rA變成了TAA(終止密碼子),提前終止了轉(zhuǎn)移酶的合成,導(dǎo)致合成的轉(zhuǎn)移酶沒有活性區(qū),所以在紅細(xì)胞膜上沒有, 抗原的產(chǎn)生。 根據(jù)genebank上公布的I A 、 IB 、 i 基因序列設(shè)計引物,擴(kuò)增ABO糖基轉(zhuǎn)移酶基因中的2個區(qū)段。 引物由上海生工合成,引物序列為:引物1:5-CACCGTGGAAGGATGTCCTC-3引物2:5-AATGTCCACAGTCACTCGCC-3引物3:5-GTGGAGATCCTGACTCCGCTG-3引物4:5-CACCGACCCCCCG
3、AAGAA-3用1、2引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,等位基因IA , IB產(chǎn)物為200bp,等位基因i (258位G缺失) 產(chǎn)物為199bp。限制性內(nèi)切酶kpn I : i基因PCR產(chǎn)物 199bp 切出171bp28bp, IA , IB基因PCR產(chǎn)物 200bp沒有該酶的切點依然是200bp。 用3、4引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,等位基因I A 、 IB 、 i的產(chǎn)物均為159bp。限制性內(nèi)切酶Alu I : IB 基因PCR產(chǎn)物 159bp 切出118bp41bp, I A 、 i基因PCR產(chǎn)物 159bp沒有該酶的切點依然是159bp kpnI(1,2引物產(chǎn)物)消化:A,B基因 200bp: 200O基
4、因 199bp: 171 28Alu I消化(3,4引物產(chǎn)物):A,O基因 159bp: 159B基因 159bp: 118 411,2引物產(chǎn)物 kpnI 3,4引物產(chǎn)物 Alun IA 200159B 200118+41O171+28159二、實驗用品PCR擴(kuò)增儀、 電泳儀和電泳槽、微型移液器、恒溫水浴鍋 、凝膠成像系統(tǒng)等,離心管、PCR管、移液器槍頭等蛋白酶K 、Triton X-100、TKM液 、10%SDS、DTT、飽和NaCl、95%冰乙醇、TE緩沖液、10PCR buffer、Taq DNA Polymerase、10Easy Taq DNA Polymerase Buffer
5、、dNTP 、Kpn、10Buffer Kpn(with BSA)、Alu、10BufferAlu(with BSA)、DNA Marker三、實驗內(nèi)容與操作1.材料準(zhǔn)備: 收集志愿者帶有毛囊的頭發(fā)67根,用無水乙醇清洗、蒸餾水漂洗后,自然風(fēng)干待用。每根頭發(fā)取毛根0.5cm,剪為兩段,分別放入至0.2mL 離心管中(每管中的頭發(fā)均取自同一個體)。2. DNA提?。篋TT- TKM-TritonX-100抽提法每管樣品加入200L TKM液,混勻,加1滴TritonX-100,混勻, 6000r/min離心5min ,棄上清。將沉淀溶于40L TKM液,加3L 10%SDS,4L蛋白酶K (0.2 g/L),8L DTT(4 mol/L),劇烈混勻,55 水浴5min。加入15L飽和NaCl(6 mol/L),混勻,13000r/min離心5min。轉(zhuǎn)移上清約40L至另一管中,加2.5倍體積95%冰乙醇,- 20,30min。13000r/min離心10min,棄上清,加75%冰乙醇洗1 次,干燥,溶于100L TE,-20保存。3. 擴(kuò)增反應(yīng):擴(kuò)增程序: 1. 94預(yù)變性5min 2. 94變性50s, 3. 60退火30s, 4. 72延伸60s, 5. 72延伸10min 6. 4保溫。 35次循環(huán)4. 酶切
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