2022年醫(yī)學(xué)專題-肺癌個(gè)體化檢測(cè)及質(zhì)控_第1頁(yè)
2022年醫(yī)學(xué)專題-肺癌個(gè)體化檢測(cè)及質(zhì)控_第2頁(yè)
2022年醫(yī)學(xué)專題-肺癌個(gè)體化檢測(cè)及質(zhì)控_第3頁(yè)
2022年醫(yī)學(xué)專題-肺癌個(gè)體化檢測(cè)及質(zhì)控_第4頁(yè)
2022年醫(yī)學(xué)專題-肺癌個(gè)體化檢測(cè)及質(zhì)控_第5頁(yè)
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上海交通大學(xué)附屬(fùshǔ)上海市胸科醫(yī)院病理科

張杰肺癌個(gè)體化檢測(cè)及質(zhì)量(zhìliàng)控制第一頁(yè),共七十五頁(yè)。9345例手術(shù)切除肺癌(fèiái)標(biāo)本分析

Female2761casesmale6584cases29.5%70.5%1:

2.38

第二頁(yè),共七十五頁(yè)。2004WHOLungCancerClassification

腺癌(xiànái)大細(xì)胞(xìbāo)癌鱗癌腺鱗癌其它(qítā)第三頁(yè),共七十五頁(yè)。腺癌8140/3腺癌,混合性亞型8255/3腺泡性腺癌8550/3乳頭狀腺癌8260/3細(xì)支氣管肺泡癌8250/3非黏液性8252/3黏液性8253/3非黏液和黏液混合性8254/3實(shí)性腺癌伴有黏液產(chǎn)物8230/3胎兒性腺癌8333/3黏液性(“膠樣”)癌8480/3黏液性囊腺癌8470/3印戒細(xì)胞腺癌8490/3透明細(xì)胞腺癌8310/3

肺癌(fèiái)的WHO組織學(xué)分類(2004年)第四頁(yè),共七十五頁(yè)。

浸潤(rùn)前病變非典型腺瘤性增生

原位腺癌(≤3cm原來(lái)的BAC)非黏液(niányè)性黏液性黏液/非黏液混合性微浸潤(rùn)性腺癌(≤3cm貼壁狀為主的腫瘤,浸潤(rùn)灶≤5mm)非黏液性黏液性黏液/非黏液混合性浸潤(rùn)性腺癌

貼壁狀為主(原來(lái)的非黏液性BAC生長(zhǎng)方式,浸潤(rùn)灶>5mm)

腺泡性為主乳頭狀為主微乳頭狀為主

實(shí)性為主伴有黏液產(chǎn)物

浸潤(rùn)性腺癌變型:

浸潤(rùn)性黏液腺癌(原來(lái)的黏液性BAC)膠樣型胎兒型(低度和高度惡性)腸型肺腺癌(xiànái)的IASLC/ATS/ERS分(2011年)第五頁(yè),共七十五頁(yè)。小活檢和/或細(xì)胞學(xué)標(biāo)本難以進(jìn)一步分型,通常診斷為非特指性NSCLC(NSCLC-NOS)提出借助于免疫組織化學(xué)(TTF-1、p63(p40)等)盡可能將NSCLC區(qū)分為傾向腺癌和傾向鱗狀細(xì)胞癌,以提供藥物治療的選擇肺腺癌對(duì)多靶點(diǎn)抗葉酸(yèsuān)藥物培美曲賽(pemetrexed)和抗血管內(nèi)皮生成藥物貝伐單抗(bevacizumab)治療有效,而鱗狀細(xì)胞癌對(duì)培美曲賽治療效果不如腺癌,用貝伐單抗治療可引起威脅生命的大出血小活檢(huójiǎn)和細(xì)胞學(xué)診斷肺癌第六頁(yè),共七十五頁(yè)。TTF-1

鱗癌?腺癌(xiànái)?第七頁(yè),共七十五頁(yè)。

鱗癌?腺癌(xiànái)?P63(p40)

第八頁(yè),共七十五頁(yè)。小活檢和細(xì)胞學(xué)標(biāo)本除用于病理診斷外,要適當(dāng)留存一些標(biāo)本做分子檢測(cè)(jiǎncè)(基因突變、擴(kuò)增和染色體易位等)新分類還推薦如有可能,細(xì)胞學(xué)檢查最好與小活檢細(xì)胞學(xué)檢測(cè)一起進(jìn)行,以提高診斷準(zhǔn)確性細(xì)胞學(xué)是一個(gè)有用的診斷方法,尤其是和組織學(xué)相結(jié)合時(shí)從細(xì)胞穿刺或胸腹水標(biāo)本中保存細(xì)胞包埋塊(cellblock),用于分子檢測(cè)小活檢(huójiǎn)和細(xì)胞學(xué)診斷肺癌第九頁(yè),共七十五頁(yè)。2011年NCCN非小細(xì)胞肺癌治療(zhìliáo)指南(中文版)第十頁(yè),共七十五頁(yè)。

2012

NCCN指南推薦所有NSCLC患者進(jìn)行(jìnxíng)檢測(cè)

中國(guó)版NCCN指南與美國(guó)版NCCN指南的區(qū)別:除了腺癌、大細(xì)胞癌和未分類的NSCLC患者,中國(guó)版NCCN指南要求鱗癌也要進(jìn)行EGFR突變檢測(cè)第十一頁(yè),共七十五頁(yè)。2013

NCCN指南推薦更新(gēngxīn),EGFR檢測(cè)更為重要2013NCCN指南與既往不同在于:未知人群減少,腺癌(xiànái)/大細(xì)胞癌患者均需要做檢測(cè)為I類證據(jù)/不吸煙鱗癌也可以EGFR突變檢測(cè)第十二頁(yè),共七十五頁(yè)。衛(wèi)生部原發(fā)性肺癌診療(zhěnliáo)規(guī)范(2011)第十三頁(yè),共七十五頁(yè)。NatureReview2007,7:169非小細(xì)胞肺癌(fèiái)中藥敏相關(guān)的EGFR突變第十四頁(yè),共七十五頁(yè)。外顯子19,21突變?yōu)槌R?jiàn)EGFR敏感(mǐngǎn)突變類型DacicS.AdvAnatPathol2008;15:241-247.RielyGJ,etal.ClinCancerRes2006;12(24):7232-7241.MurrayS,etal.JThoracOncol2008;3:832-839.對(duì)EGFR-TKI的反應(yīng)外顯子突變分布頻率敏感18G719X4%19缺失50%21L858RL861X40%耐藥20T790MD770_N771insNPG6%第十五頁(yè),共七十五頁(yè)。肺癌(fèiái)與EGFR

目前國(guó)內(nèi)開(kāi)展EGFR檢測(cè)的單位逐漸增多有關(guān)中國(guó)人EGFR基因突變研究的報(bào)道增多2011年中華病理學(xué)雜志發(fā)表了“關(guān)于EGFR突變檢測(cè)共識(shí)(ɡònɡshí)”2011年11月15日1成立衛(wèi)生部分子病理質(zhì)控中心第十六頁(yè),共七十五頁(yè)。項(xiàng)目孫孟紅王芳馮勤王立帥趙靜范苗靜張杰合計(jì)技術(shù)測(cè)序TagManPCR優(yōu)化PCRARMS測(cè)序測(cè)序測(cè)序總數(shù)目29914103092651922824543211突變率42.2%28.4%34%30.2%33.3%42.6%48.2%37%吸煙與突變非吸煙/37.6%40.2%41%50%54.3%52.7%46%吸煙/14.4%22.2%15.2%9%32.9%41.1%22.5%性別男33.7%19.8%30.4%22.6%20.9%36%39.5%29%女53.5%43.2%39.2%39.7%51.9%51.3%59.6%48.3%(中華(Zhōnghuá)病理學(xué)雜志2011年10期)第十七頁(yè),共七十五頁(yè)。項(xiàng)目孫孟紅王芳馮勤王立帥趙靜范苗靜張杰合計(jì)外顯子分布182%/5.7%//4.1%3.9%1948.7%48.1%39%40%60.9%48.4%53.9%48.4%206.7%//6%/6.43%6.4%2142.5%51.8%55.2%54%39.1%51.6%44.3%48.2%組織分型腺癌46.5%33.5%38.8%37.8%37.9%47.8%56.8%42.7%BAC/61.3%/58.5%73%47.1%普通/32.4%/37.9%//鱗癌13.3%/22.2%/7.5%23.6%10.3%15.4%腺鱗癌7/13/4/8/2/67/910/18大細(xì)胞癌//3/14/1/5/10/31其他////5//(中華(Zhōnghuá)病理學(xué)雜志2011年10期)第十八頁(yè),共七十五頁(yè)。EML4-ALK檢測(cè):方法(fāngfǎ)概述第十九頁(yè),共七十五頁(yè)。熒光(yíngguāng)原位雜交

(FISH)第二十頁(yè),共七十五頁(yè)。逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)

(RT-PCR)第二十一頁(yè),共七十五頁(yè)。Ⅰ期臨床(línchuánɡ)結(jié)果再回顧第二十二頁(yè),共七十五頁(yè)。三種(sānzhǒnɡ)檢測(cè)方法比較第二十三頁(yè),共七十五頁(yè)。FISH、IHC和RT-PCR比較(bǐjiào)參數(shù)表FISHIHCRT-PCR靈敏度分離信號(hào)細(xì)微使用檢測(cè)增強(qiáng)裝置后靈敏度可提高高檢測(cè)到未知的變異體是是否可否區(qū)分融合類型否否是工作強(qiáng)度大是否否要求非常專業(yè)的培訓(xùn)是否否結(jié)果判讀人為主觀影響大大小同時(shí)細(xì)胞形態(tài)可視化否是否在專業(yè)機(jī)構(gòu)外廣泛使用否是否AdaptedfromMitsudomi,IASLC2011;Abs#MTE22.1Hirsch,IASLC2011;Abs#O05.08第二十四頁(yè),共七十五頁(yè)。ROS1基因(jīyīn)與NSCLCROS1基因位于(wèiyú)6號(hào)染色體長(zhǎng)臂22(6q22)共有43外顯子其mRNA全長(zhǎng)7638bp第二十五頁(yè),共七十五頁(yè)。ROS受體酪氨酸激酶的靶向治療(zhìliáo)原理FN-III

likerepeatsTK

domainROS在腦、肺、胃、乳腺和肝腫瘤/細(xì)胞系中的過(guò)表達(dá)在結(jié)腸癌和腎癌細(xì)胞系中ROS突變(tūbiàn)腫瘤中發(fā)現(xiàn)的ROS

融合FIG-ROS:惡性膠質(zhì)瘤細(xì)胞系SCL34A2-ROS:非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系CD74-ROS:非小細(xì)胞肺癌患者克唑替尼可抑制ROS

融合基因細(xì)胞系的

生長(zhǎng)StructureofROSEl-Deebetal.,MedResRev.2010epub第二十六頁(yè),共七十五頁(yè)。第二十七頁(yè),共七十五頁(yè)。第二十八頁(yè),共七十五頁(yè)。第二十九頁(yè),共七十五頁(yè)。第三十頁(yè),共七十五頁(yè)。克唑替尼:概述(ɡàishù)名稱:PF-02341066通用名:克唑替尼商品名:XALKORITM化學(xué)式:C21H22Cl2FN5O作用機(jī)制:競(jìng)爭(zhēng)性ATP抑制劑主要靶點(diǎn):ALK、c-Met、ROS2011年8月26日美國(guó)FDA批準(zhǔn)(pīzhǔn)用于ALK陽(yáng)性非小細(xì)胞肺癌克唑替尼在ALKATP結(jié)合部位Pfizer,dataonfile第三十一頁(yè),共七十五頁(yè)。第三十二頁(yè),共七十五頁(yè)。ROS1基因(jīyīn)重排ROS1的重排成為了一種繼成功發(fā)現(xiàn)肺癌突變基因KRAS(占25%)、EGFR(占10-15%)、ALK(占4%)后,再一次發(fā)現(xiàn)最新的肺癌基因突變ROS1。ROS1基因突變的癌癥患者常見(jiàn)于年齡偏小,不吸煙,病理類型為腺癌的肺癌。由ROS1基因重新排列引起的癌癥在非小細(xì)胞肺癌中占1%。ROS1重排可引起癌基因ROS1融合激酶的表達(dá)(biǎodá)及對(duì)ROS激酶抑制劑敏感性。Crizotinib作為C-MET、ALK及ROS的小分子酪氨酸激酶抑制劑可能成為進(jìn)展期非小細(xì)胞肺癌有效治療藥物。該藥物已經(jīng)獲準(zhǔn)用于局部進(jìn)展期和轉(zhuǎn)移性ALK陽(yáng)性的非小細(xì)胞肺癌患者的治療。第三十三頁(yè),共七十五頁(yè)。分子靶向基因檢測(cè)質(zhì)量(zhìliàng)問(wèn)題實(shí)驗(yàn)室:達(dá)標(biāo)人員資質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)化檢測(cè)人員上崗培訓(xùn)、上崗證書報(bào)告簽發(fā)人員資質(zhì)、分子病理醫(yī)師實(shí)驗(yàn)條件;檢測(cè)方法:方法越是靈敏,抗污染的問(wèn)題越是突出

標(biāo)本來(lái)源:不同(bùtónɡ)的標(biāo)本,應(yīng)相對(duì)采用不同(bùtónɡ)的檢測(cè)方法第三十四頁(yè),共七十五頁(yè)。分子(fēnzǐ)病理實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量要求

二.PCR實(shí)驗(yàn)室要達(dá)標(biāo),通過(guò)國(guó)家驗(yàn)證

檢測(cè)結(jié)果要做室間比對(duì)

國(guó)際間的室間比對(duì)(

EMQN,ESP,ETOPandESMO)分子(fēnzǐ)病理實(shí)驗(yàn)室要通過(guò)ISO15189認(rèn)可第三十五頁(yè),共七十五頁(yè)。臨床(línchuánɡ)標(biāo)本與研究標(biāo)本的差異標(biāo)本類型腫瘤細(xì)胞含量標(biāo)本處理其他分析前、分析后處理實(shí)際臨床標(biāo)本新鮮組織、蠟塊、穿刺組織、脫落細(xì)胞等隨意性大,無(wú)嚴(yán)格要求固定方式、試劑、標(biāo)本離體時(shí)間各異不定研究標(biāo)本統(tǒng)一要求要求統(tǒng)一,被病理所確認(rèn)統(tǒng)一的保存以及運(yùn)送條件盡量統(tǒng)一第三十六頁(yè),共七十五頁(yè)。分子檢測(cè)(jiǎncè)與靶向治療的關(guān)鍵步驟根據(jù)結(jié)果制定

治療方案臨床采集合適的

組織標(biāo)本選擇合適的檢測(cè)方法123第三十七頁(yè),共七十五頁(yè)。分子檢測(cè)(jiǎncè)與靶向治療的關(guān)鍵步驟根據(jù)結(jié)果制定

治療方案臨床采集合適的

組織標(biāo)本選擇合適的檢測(cè)方法123第三十八頁(yè),共七十五頁(yè)。標(biāo)本(biāoběn)來(lái)源

手術(shù)切除標(biāo)本氣管鏡活檢標(biāo)本經(jīng)皮穿刺標(biāo)本淋巴結(jié)穿刺標(biāo)本胸水/心包細(xì)胞學(xué)標(biāo)本血清DNA標(biāo)本及循環(huán)細(xì)胞標(biāo)本(biāoběn)相關(guān)問(wèn)題標(biāo)本異質(zhì)性標(biāo)本類型標(biāo)本的收集和儲(chǔ)存標(biāo)本是獲得高質(zhì)量檢測(cè)結(jié)果的重要(zhòngyào)前提第三十九頁(yè),共七十五頁(yè)。常用(chánɡyònɡ)標(biāo)本獲取方法CT引導(dǎo)下肺穿刺(chuāncì)活檢模擬氣管鏡引導(dǎo)下經(jīng)支氣管鏡肺組織活檢(VB-TBLB)經(jīng)氣管鏡超聲引導(dǎo)下活檢(EBUS)鎖骨上淋巴結(jié)穿刺活檢胸腔閉式引流術(shù)心包穿刺術(shù)外科開(kāi)胸手術(shù)活檢胸腔鏡活檢縱隔鏡活檢微創(chuàng)手術(shù)活檢第四十頁(yè),共七十五頁(yè)。取樣中存在(cúnzài)的問(wèn)題腫瘤的位置腫瘤生長(zhǎng)的部位有時(shí)難以進(jìn)行內(nèi)科穿刺活檢,需要依靠外科手術(shù)活檢取材細(xì)針穿刺時(shí)使用的器材尺寸可能影響細(xì)胞的獲取量及DNA的質(zhì)量由于無(wú)法保證每次都能取得足夠(zúgòu)的標(biāo)本,需要一些適用于小標(biāo)本的檢測(cè)方法第四十一頁(yè),共七十五頁(yè)。腫瘤標(biāo)本獲取(huòqǔ)的主要途徑手術(shù)(切除/切取)支氣管鏡(活檢:中央型)穿刺(活檢:周圍型)制備蠟塊切片HE染色確認(rèn)癌細(xì)胞以臨床醫(yī)生認(rèn)為最容易獲取的方式原發(fā)病灶/轉(zhuǎn)移灶腫瘤組織胸水等標(biāo)本(biāoběn)的獲取第四十二頁(yè),共七十五頁(yè)。標(biāo)本(biāoběn)的獲?。阂源┐虨槔尚行栽u(píng)估根據(jù)病灶位置選擇合適的穿刺手段復(fù)雜情況(qíngkuàng)的處理

嚴(yán)重水腫基底部位呼吸動(dòng)度較大部位的腫塊腫塊內(nèi)部支氣管充氣征明顯腫瘤內(nèi)血管豐富

基底部位呼吸動(dòng)度較大部位的腫塊腫瘤內(nèi)血管豐富嚴(yán)重水腫腫塊內(nèi)部支氣管充氣征明顯第四十三頁(yè),共七十五頁(yè)。標(biāo)本(biāoběn)的獲取對(duì)周圍型病變,TBLB創(chuàng)傷小,可重復(fù)性強(qiáng),是一種(yīzhǒnɡ)相對(duì)安全有效的檢查方法,但TBLB取材大小受器械規(guī)格限制,活檢組織易受擠壓變形而影響檢測(cè)結(jié)果1鎖骨上淋巴結(jié)穿刺活檢是一種便捷有效的臨床技術(shù),檢出率高,副反應(yīng)小2,但僅能提供細(xì)胞學(xué)樣本。EBUS可通過(guò)中央氣道取的組織,診斷迅速,并發(fā)癥少,是一種安全性較好的活檢方法。對(duì)肺癌和其他縱膈惡性疾病診斷價(jià)值高,并可協(xié)助分期3胸腔閉式引流術(shù)和心包穿刺術(shù)并發(fā)癥少,容易為患者接受,術(shù)前需行超聲定位,可在超聲引導(dǎo)或CT引導(dǎo)下進(jìn)行4,5。但引流獲得標(biāo)本需進(jìn)一步富集。外科方法可獲取大量、新鮮樣本,但創(chuàng)傷較大或費(fèi)用昂貴第四十四頁(yè),共七十五頁(yè)。經(jīng)支氣管肺活檢腫瘤

<正常細(xì)胞的5%CT引導(dǎo)穿刺肺癌的活檢(huójiǎn)標(biāo)本通常僅含有少量腫瘤細(xì)胞第四十五頁(yè),共七十五頁(yè)。適宜的切片:HE片確認(rèn)*,癌細(xì)胞數(shù)≥200個(gè)(不推薦依經(jīng)驗(yàn)盲取)常規(guī)切片(4~5μm厚,普通載玻片)連續(xù)切片8~10張刀片:一次性(不推薦交叉使用)標(biāo)本處理

:離體后處理:及時(shí)切開(kāi)、固定(盡快)固定液:10%中性福爾馬林(pH≈7.0)(不推薦使用任何其它溶液)固定液量:≥10倍體積固定時(shí)間:6~48小時(shí)如何獲取優(yōu)質(zhì)(yōuzhì)標(biāo)本:標(biāo)本處理第四十六頁(yè),共七十五頁(yè)。如何獲取(huòqǔ)優(yōu)質(zhì)的標(biāo)本:標(biāo)本類型石蠟組織:盡可能送檢一年內(nèi)的石蠟標(biāo)本石蠟切片:含腫瘤細(xì)胞越多越好(50%以上);組織部位面積約6mmx6mm以上包埋組織:組織塊不小于0.5×0.5×0.5(cm)新鮮組織:比石蠟等處理過(guò)的舊組織,DNA保存得更完整,對(duì)PCR實(shí)驗(yàn)更有利,但一定要經(jīng)病理學(xué)確認(rèn)含有腫瘤組織50%以上;重量≥10mg(約米粒大小以上),經(jīng)PBS或生理鹽水沖洗干凈取癌組織的中心位置組織塊(避開(kāi)壞死區(qū)域),固定于10%中性(zhōngxìng)福爾馬林溶液中,盡快送病理科要有病理學(xué)診斷(zhěnduàn)只要能獲得足夠的癌細(xì)胞,各種取材方式均可對(duì)于復(fù)發(fā)的患者,再次活檢不僅可確診,還可以獲得分子標(biāo)志物的信息第四十七頁(yè),共七十五頁(yè)。如何獲取(huòqǔ)優(yōu)質(zhì)的標(biāo)本:標(biāo)本類型盡可能取得大標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè)臨床常用的取樣方法取得標(biāo)本量通常(tōngcháng)較少內(nèi)鏡活檢、穿刺活檢、細(xì)胞學(xué)標(biāo)本(支氣管刷檢,細(xì)針穿刺)小標(biāo)本檢測(cè)失敗率53–66%(內(nèi)鏡活檢與穿刺活檢),而切除活檢標(biāo)本的失敗率僅24%標(biāo)本中腫瘤細(xì)胞的含量也十分重要組織標(biāo)本富集細(xì)胞學(xué)標(biāo)本富集直接測(cè)序要求使用腫瘤細(xì)胞含量較高(50–70%)的標(biāo)本EberhardDA,etal.JClinOncol2008;26:983-984.第四十八頁(yè),共七十五頁(yè)。分子水平的肺癌細(xì)胞存在異質(zhì)性

腫瘤(zhǒngliú)內(nèi)異質(zhì)性

原發(fā)部位與轉(zhuǎn)移部位的異質(zhì)性如何獲取優(yōu)質(zhì)(yōuzhì)的標(biāo)本:標(biāo)本異質(zhì)性EberhardDA,etal.JClinOncol2008;26:983-984.腫瘤異質(zhì)性可能影響研究結(jié)果如果可行,至少取得3個(gè)代表性部位的標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè)第四十九頁(yè),共七十五頁(yè)。如何獲取優(yōu)質(zhì)的標(biāo)本:標(biāo)本的采集(cǎijí)和儲(chǔ)存經(jīng)福爾馬林固定處理的標(biāo)本可能(kěnéng)存在以下問(wèn)題

核酸分解片段長(zhǎng)度縮短干擾PCR結(jié)果固定標(biāo)本中可能存在序列改變EberhardDA,etal.JClinOncol2008;26:983-984.盡量采用新鮮冰凍組織采用標(biāo)準(zhǔn)濃度的固定液(10%中性福爾馬林緩沖液

,8–24小時(shí))記錄固定液標(biāo)本以原始大小保存,而不是切片保存如果是切片標(biāo)本,應(yīng)記錄切片時(shí)間

第五十頁(yè),共七十五頁(yè)。如何(rúhé)獲取優(yōu)質(zhì)的標(biāo)本:標(biāo)本含量一些突變患者可能沒(méi)有被檢測(cè)到(假陰性)取決于檢測(cè)方法的敏感度為保證DNA測(cè)序的敏感性,要求檢測(cè)標(biāo)本中腫瘤細(xì)胞≥50%第五十一頁(yè),共七十五頁(yè)。分子檢測(cè)(jiǎncè)與靶向治療的關(guān)鍵步驟根據(jù)結(jié)果制定

治療方案臨床采集合適的

組織標(biāo)本選擇合適的檢測(cè)方法123第五十二頁(yè),共七十五頁(yè)?;蛲蛔?jīyīntūbiàn)檢測(cè)影響因素---方法學(xué)因素ME-PCR/SequencingO=產(chǎn)物轉(zhuǎn)移/加入(jiārù)試劑/開(kāi)管操作qPCR:

Real-time

DetectionPCRClean-upSequencingRxnCapillarySequencingPCRPCRClean-upSequencingRxnCapillarySequencingPCRHetero-

duplexCapillaryElectro-phoresisARMS&PNA-LNAclampPCR/SequencingNestedPCR/SequencingPCR/

HRMA/

dHPLCPCR/

RFLPPCRRFLPElectro-phoresisSizingPCRPCRClean-upSequencingRxnCapillarySequencingRFLPOOOOOOOOOOOOTaqMan

Clean-upOClean-upOClean-upOOOOPCRSURVEYORcleavagedHPLCSizingOConfirmationbysequencingPCR/

SURVEYORPCRClean-upPyro-sequencingRxnPyroSequencingOO123456Steps7ConfirmationbysequencingOConfirmationbysequencingOOO1%~10%3-10%10%3-12%20~30%20~30%<1%qPCR:

Real-time

Detection~10%第五十三頁(yè),共七十五頁(yè)。直接(zhíjiē)測(cè)序法第五十四頁(yè),共七十五頁(yè)。熒光(yíngguāng)定量PCR第五十五頁(yè),共七十五頁(yè)。石蠟切片顯微切割Scorpions-ARMSIPASS第五十六頁(yè),共七十五頁(yè)。ARMSvs.DNA測(cè)序中華(Zhōnghuá)病理學(xué)雜志2008;37(5):294-9.結(jié)果檢出率成功率共計(jì)可分析不可分析突變無(wú)突變ScorpionsARMS**4240051.2%100%82例直接測(cè)序***25332430.5%70.7%82例*肺癌手術(shù)(shǒushù)石蠟切片標(biāo)本檢測(cè)EGFR基因突變**IPASS方法學(xué)

***INTEREST方法學(xué)第五十七頁(yè),共七十五頁(yè)。ARMSvs.DNA測(cè)序測(cè)序法ARMS敏感度25%1%石蠟組織標(biāo)本成功率低高商用試劑盒無(wú)有流程與速度復(fù)雜/慢簡(jiǎn)單/快數(shù)據(jù)分析要求高低試劑成本相對(duì)低相對(duì)高儀器成本高低1.DacicS.AdvAnatPathol2008;15(4):241-247.2.中國(guó)非小細(xì)胞肺癌患者表皮生長(zhǎng)因子受體基因突變檢測(cè)專家組.中華(Zhōnghuá)病理學(xué)雜志2011;40(10):700-702.第五十八頁(yè),共七十五頁(yè)。第五十九頁(yè),共七十五頁(yè)。第六十頁(yè),共七十五頁(yè)。第六十一頁(yè),共七十五頁(yè)。EGFR基因突變檢測(cè)方法(fāngfǎ)的選擇DNA測(cè)序在部分(bùfen)地區(qū)仍然是EGFR檢測(cè)的金標(biāo)準(zhǔn)其他方法,比如ARMS可能比直接測(cè)序更敏感,目前已被廣泛應(yīng)用新的EGFR基因檢測(cè)方法層出不窮,其檢驗(yàn)效能有待進(jìn)一步考證優(yōu)化檢測(cè)途徑,最大限度提高檢測(cè)敏感性、降低(jiàngdī)假陽(yáng)性和假陰性率以獲得可靠的檢測(cè)結(jié)果對(duì)每個(gè)患者來(lái)說(shuō)都至關(guān)重要第六十二頁(yè),共七十五頁(yè)。

關(guān)于EGFR突變檢測(cè)共識(shí)(ɡònɡshí)(中華病理學(xué)雜志2011年10期)關(guān)于EGFR檢測(cè)時(shí)間活檢:1小時(shí)內(nèi)送病理科及時(shí)固定于4%中性(zhōngxìng)甲醛中小標(biāo)本6-12h大標(biāo)本6-48h病理報(bào)告3個(gè)工作日(包括免疫組化)EGFR5-7個(gè)工作日總共10個(gè)工作日,完成全部診斷和檢測(cè)工作第六十三頁(yè),共七十五頁(yè)。

關(guān)于EGFR突變檢測(cè)(jiǎncè)共識(shí)DNA提取:

PCR擴(kuò)增成敗最關(guān)鍵步驟

建議采用正規(guī)公司的DNA提取試劑盒

DNA提取質(zhì)量比數(shù)量更為重要建議對(duì)提取DNA模板做質(zhì)量檢測(cè)(jiǎncè)OD值DNA標(biāo)本質(zhì)量不符質(zhì)量,陽(yáng)性則罷陰性要注明。組織切片中要有200-400個(gè)細(xì)胞5-10um切片

10張第六十四頁(yè),共七十五頁(yè)。EGFR突變(tūbiàn)檢測(cè)病理質(zhì)控2011年11月15日1成立(chénglì)衛(wèi)生部分子病理質(zhì)控中心非小細(xì)胞肺癌EGFR基因突變的檢測(cè)共識(shí)結(jié)直腸癌和非小細(xì)胞肺癌K-ras基因突變的檢測(cè)共識(shí)開(kāi)展分子病理質(zhì)量控制檢查第六十五頁(yè),共七十五頁(yè)。

全國(guó)EGFR基因突變質(zhì)量(zhìliàng)控制檢測(cè)國(guó)內(nèi)選擇幾個(gè)(jǐɡè)大的檢測(cè)

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