蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)第二章一、穩(wěn)定三維結(jié)構(gòu)的作用力二、多肽主鏈折疊的空間限制1.肽平面2.拉氏構(gòu)象圖三、蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)分子中某一段肽鏈的局部空間結(jié)構(gòu)，即該段肽鏈主鏈骨架原子的相對空間位置，并不涉及氨基酸殘基側(cè)鏈的構(gòu)象

。定義

主要的化學鍵：

氫鍵

蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的主要形式

-螺旋(-helix)

-折疊(-pleatedsheet)

-轉(zhuǎn)角(-turn)

無規(guī)卷曲(randomcoil)

1偶極矩2α-螺旋的右旋和左旋脯氨酸（亞氨基酸）（二）-折疊片（二）-折疊片（三）-轉(zhuǎn)角和-凸起-轉(zhuǎn)角-轉(zhuǎn)角-凸起1α-角蛋白1α-角蛋白2-角蛋白3膠原蛋白:一種三股螺旋3膠原蛋白:一種三股螺旋六結(jié)構(gòu)域六結(jié)構(gòu)域結(jié)構(gòu)域分類七蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)與球蛋白疏水鍵、離子鍵、氫鍵和VanderWaals力等。主要的化學鍵整條肽鏈中全部氨基酸殘基的相對空間位置。即肽鏈中所有原子在三維空間的排布位置。三級結(jié)構(gòu)定義

球狀蛋白1多肽鏈折疊成球形

2大多包含幾個二級結(jié)構(gòu)

3功能多樣:酶調(diào)節(jié)蛋白肌紅蛋白三維結(jié)構(gòu)特征纖維狀蛋白質(zhì)通常只含一種二級結(jié)構(gòu),而球蛋白通常含有多種二級結(jié)構(gòu).球狀蛋白質(zhì)具有明顯的折疊層次一級結(jié)構(gòu)二級結(jié)構(gòu)超二級結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)域三級結(jié)構(gòu)或亞基四級結(jié)構(gòu)球蛋白是緊密的球狀或橢球狀實體疏水殘基埋藏于球體內(nèi),親水殘基暴露于球體外表面有一空穴(裂溝,凹槽或口袋),這個空穴能結(jié)合配體,蛋白質(zhì)的活性部位由二級結(jié)構(gòu)向三級結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)變的主要動力是疏水作用.八蛋白質(zhì)變性與復性變性由于受到某些外力的作用,導致蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)(構(gòu)象)的破壞,原有活性的喪失的現(xiàn)象.實質(zhì)次級鍵的斷裂(肽鍵,二硫鍵等共價鍵完好)變性蛋白質(zhì)生物活性喪失側(cè)鏈基團暴露,水溶性降低易被蛋白酶水解變性因素物理因素:加熱高壓紫外線等化學因素:有機溶劑脲胍酸堿等復性變性蛋白質(zhì)在去除變性因素后恢復原有天然構(gòu)象的現(xiàn)象.

天然狀態(tài)，有催化活性尿素、β-巰基乙醇去除尿素、β-巰基乙醇非折疊狀態(tài)，無活性亞基之間的結(jié)合力主要是疏水作用，其次是氫鍵和離子鍵。九、蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)分子中各亞基的空間排布及亞基接觸部位的布局和相互作用，稱為蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)。有些蛋白質(zhì)分子含有二條或多條多肽鏈，每一條多肽鏈都有完整的三級結(jié)構(gòu)，稱為蛋白質(zhì)的亞基(subunit)。由2個至多個三級結(jié)構(gòu)的亞基締合形成四級結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)單體蛋白:只有一個亞基(三級結(jié)構(gòu))寡聚蛋白:由少量的亞基聚合而成的蛋白質(zhì),如四聚體血紅蛋白多聚蛋白:由很多的亞基聚合成的蛋白質(zhì),如180聚體的番茄從矮病毒外殼蛋白四級結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)按亞基的類型分為同多聚蛋白:由相同亞基聚合成的蛋白質(zhì),如肝乙醇脫氫酶,酵母糖激酶雜多聚蛋白:由不同類型的亞基聚合成的蛋白質(zhì),如血紅蛋白亞基聚合的動力主要動力:疏水作用其他動力:二疏鍵,離子鍵,氫鍵等蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)1、對稱性血紅蛋白質(zhì)四級結(jié)構(gòu)多聚蛋白:病毒外殼2、締合蛋白的優(yōu)越性增強穩(wěn)定性:減少蛋白質(zhì)的相對表面積自身締合穩(wěn)定的需要屏蔽亞基上的疏水殘基以利于更加穩(wěn)定提高遺傳經(jīng)濟和效率編碼同聚蛋白的小亞基比編碼大一倍的蛋白質(zhì)更經(jīng)濟使催化集團靠近亞基的催化基團聚集以形成活性中心不同催化亞基聚合催化