PubMed醫(yī)學文獻檢索PubMed是美國家醫(yī)學圖書館(NationalLibraryofMedicineNLM)下屬的國家生物技術(shù)信息中心(NationalCenterforBiotechnologyInformationNCBI)開發(fā)的、基于WWW的查詢系統(tǒng)。數(shù)據(jù)更新快，檢索系統(tǒng)比較完善，深受廣大醫(yī)務工作者和圖書情報人員的歡迎。網(wǎng)址：或者

背景知識

美國國家健康研究所(院）(NationalInstitutesofHealth,NIH)美國的國家生物技術(shù)信息中心(NationalCenterforBiotechnologyInformation,簡稱NCBI)是是美國國家健康研究院(NIH)所轄美國國家醫(yī)學圖書館(NLM)的一部分.NCBI位于馬里蘭州的貝塞斯達,建立于1988年。NIH--->NLM—>NCBIPubMed系統(tǒng)是用于檢索MEDLINE、PreMED-LINE數(shù)據(jù)庫的網(wǎng)上檢索系統(tǒng)。MEDLINE是美國國立醫(yī)學圖書館最重要的書目文摘數(shù)據(jù)庫，內(nèi)容涉及醫(yī)學、護理學、牙科學、獸醫(yī)學、衛(wèi)生保健和基礎(chǔ)醫(yī)學。收錄了全世界70多個國家和地區(qū)的4500余種生物醫(yī)學期刊，現(xiàn)有書目文摘條目1700萬余條，時間起自1950s。

PubMed網(wǎng)上更新速度是每周一次。PubMed數(shù)據(jù)庫收錄的文獻大多數(shù)原始語種也是英語，或有英文摘要，但1975年以前的文獻無英文摘要。一、輔助檢索功能

輔助檢索功能包括條件限定【Limits】、預覽/索引【Preview/Index】、檢索史【History】和粘貼板【Clipboard】4種功能設(shè)置。

1、條件限定【Limits】的用法：點擊【Limits】按鈕，系統(tǒng)顯示多種限定條件供用戶選擇。其中，“AddedtoPubMedintheLast”指錄入系統(tǒng)的日期；“PublishedintheLast”指出版日期；“Linkstofulltext,Linkstofreefulltext,Abstracts”

（1975年前出版的文章的記錄中沒有文摘）；“Subsets”指只檢索PubMed下屬的文獻數(shù)據(jù)庫（MEDLINE、PreMEDLINE，Publisher和AIDS數(shù)據(jù)庫）。

2預覽/索引【Preview/Index】預覽/索引（Preview/Index）按鈕的用法及功能特征是：（1）在顯示檢索記錄之前先預覽檢索策略和檢索結(jié)果的記錄條數(shù)：在檢索輸入框內(nèi)鍵入檢索詞后，點擊【Preview/Index】按鈕后，顯示檢索策略和檢索結(jié)果的記錄數(shù)。點擊記錄數(shù)【Result】鏈接，系統(tǒng)顯示檢索結(jié)果。（2）修改檢索策略：在“AllFields”，下拉菜單中選擇一個檢索字段，然后在提問框內(nèi)增加檢索詞，點擊【Preview】按鈕，系統(tǒng)顯示新一次檢索結(jié)果的記錄數(shù)。這樣反復進行，直到檢索結(jié)果記錄數(shù)量令人滿意為止。從索引表中選詞檢索：在“AllFields”下拉菜單（PullDownMenu）中選擇一個檢索字段，然后在提問框內(nèi)鍵入與選定字段相對應的檢索詞語，點擊【Index】按鈕，系統(tǒng)顯示相應字段的索引詞表（見上圖）。用鼠標點亮其中一個檢索詞，然后，點擊合適的邏輯運算符（AND、OR或NOT），被點亮的詞會自動加進檢索提問框中。然后再點擊Preview鍵，系統(tǒng)顯示新檢索結(jié)果數(shù)。3檢索史【History】【History】按鈕主要用于查看檢索策略，也可用于查看檢索結(jié)果記錄數(shù)量。點擊【History】，顯示檢索歷史：檢索序號、檢索式、檢索時間和檢索記錄數(shù)。要查看檢索到的記錄，直接點擊檢索結(jié)果數(shù)（Result）按鈕即可。在【History】狀態(tài)下，可以將檢索式用邏輯運算符連接起來后再檢索。如在提問框中鍵入#1AND#2，然后點擊【GO】。要清除檢索史，請點擊ClearHistory鍵。注意事項：

PuMed最多可保留100個檢索式，超過100個時自動刪除最早的檢索式；進行布爾邏輯運算“AND”、“OR”、“NOT”運算。4、粘貼板【Clipboard】的用法【Clipboard】是在檢索過程中存放檢索結(jié)果的地方，以便于集中存盤、打印或訂購原文時使用。粘貼板最多能存放500條記錄。只要粘貼板中有記錄，就可點擊【Clipboard】查看其中的記錄（記錄為Summary格式）。粘貼板按記錄存放的先后順序顯示記錄題錄。要把檢索全部結(jié)果存入粘貼板，只需直接點擊SendtoClipboard鍵。如果把部分檢索結(jié)果存放在粘貼板，需要點擊該記錄左上角的選擇框作標記后，再點擊SendtoClipboard鍵。粘貼板上的記錄序號顏色均變綠。二、單篇文獻匹配單篇引文匹配檢索是具體到特定的單篇引文檢索，

PubMed提供的“單篇引文檢索”是一個填空表格，項目有雜志名稱、出版時間（可根據(jù)需要精確到年、月、日）、卷、期、起始頁碼、作者，用戶可以選擇性地將已知的相關(guān)信息填入表中，進行檢索。出版時間（Date）輸入格式為：yy/mm/dd，月、日可以省略。適合于一次性查找大量特定記錄，用戶須按以下格式輸入其查詢請求：期刊名稱│出版年限│卷│論文起始頁碼│作者│用戶給該組論文命名│

三、批量文獻匹配四、詞匯自動轉(zhuǎn)換功能

（AutomaticTermMapping）在PubMed主頁的檢索提問框中鍵入檢索詞，系統(tǒng)將按順序使用如下4種表或索引，對檢索詞進行轉(zhuǎn)換后再檢索。

（1）MeSH轉(zhuǎn)換表（MeSHTranslationTable），包括MeSH詞、參見詞、副主題詞等。如果系統(tǒng)在該表中發(fā)現(xiàn)了與檢索詞相匹配的詞，就會自動將其轉(zhuǎn)換為相應的MeSH詞和TextWord詞（題名詞和文摘詞）進行檢索。例如：鍵入“Pancreaticcancer”，系統(tǒng)將其轉(zhuǎn)換成“PanreaticNeoplasms[MeSHTerms]ORPancreaticcancer[Textword]”后進行檢索。

（2）刊名轉(zhuǎn)換表（JournalTanslationTable）包括刊名全稱、MEDLINE形式的縮寫和ISSN號。該轉(zhuǎn)換表能把鍵入的刊名全稱轉(zhuǎn)換為“MEDLINE縮寫[JournalName]”后進行檢索。如：在檢索提問框中鍵入：“newEnglandjournalofmedicine”,PubMed將其轉(zhuǎn)換為“NEnglJMed[JournalName]”后進行檢索。

（3）短語表（4）作者索引五、強制檢索功能

在PubMed主頁的檢索提問框中鍵入一個短語后點擊“Go”，系統(tǒng)會高速用自動轉(zhuǎn)換功能查找到相應的匹配詞后再進行檢索；但是，當鍵入的詞語無匹配詞時，PubMed就會將鍵入的詞語斷開后再重復上述自動詞匯轉(zhuǎn)換過程，若仍然沒有匹配詞，系統(tǒng)就將短語分解成單詞，再用AND聯(lián)在一起在全部字段中檢索。很明顯，這樣檢索的結(jié)果是不符合用戶要求的。因此，PubMed允許使用雙引號（“”）來強制系統(tǒng)進行短語檢索。例如，在PubMed主頁的檢索提問框中鍵入“Singlecell”，并用雙引號引起來，然后點擊“Go”，系統(tǒng)會將其作為一個不可分割的詞組在數(shù)據(jù)庫的全部字段中進行檢索。

使用雙引號檢索，會自動關(guān)閉詞匯轉(zhuǎn)換功能。

六、鏈接功能

1相關(guān)文獻鏈接

PubMed系統(tǒng)中的每一條文獻記錄均有一個相關(guān)文獻鏈接，在檢索結(jié)果的顯示狀態(tài)下，每條記錄的右邊均有【RelatedArticles，Links】鏈接，比較整個數(shù)據(jù)庫中所有記錄與指定記錄的相似性，并將超過某一閥值的記錄按與指定記錄相似性高低程度排序輸出。點擊該鏈接按鈕，系統(tǒng)按文獻的相關(guān)度從高到低顯示。利用此超鏈可擴大檢索范圍，獲得與所選記錄相關(guān)的文獻。2全文鏈接

PubMed系統(tǒng)在以“Abstract”格式顯示檢索結(jié)果時，為每條能聯(lián)機獲取全文的記錄都設(shè)置了【FullTextArticle】的相關(guān)超級鏈接(多數(shù)為期刊名稱鏈接)。

PubMed數(shù)據(jù)庫可使用的運算符號

1截詞符*

PubMed允許使用“*”號作為截詞符進行截詞檢索。如：鍵入“physi*”，系統(tǒng)會找到那些前一部分是physi的單詞（如phsics，physical，physiology等），并對其分別進行檢索。如果這種詞少于150個，PuMed會逐個詞檢索，若超過150個（如：med*），pubMed將顯示如下警告信息：“Wildcardsearchfor‘term*’usedonlythefirst150variations.Lengthentherootwordtosearchforallendings.”。截詞功能只限于單詞，對詞組無效。使用截詞檢索功能時，PubMed系統(tǒng)會自動關(guān)閉詞匯轉(zhuǎn)換功能。

2、強制檢索符“

”.3、布爾邏輯運算符PuMed檢索系統(tǒng)允許使用布爾邏輯檢索，但要在提問框中鍵入布爾邏輯運算符（AND，OR或NOT）。如：#1AND#2。而且運算符號AND、OR、NOTPubMed檢索途徑和方法

1、詞語（主題）檢索

2著者檢索3刊名檢索

八、檢索結(jié)果輸出功能

1顯示檢索結(jié)果（Displaying）其默認Summary格式。命中記錄按該記錄被輸入pubMed時間排序輸出,最新的排在最前面。每頁顯示記錄數(shù)默認值為20,“Show”功能鍵所帶的下拉菜單可以更改每頁顯示記錄數(shù),可選項從5條到500條不等。2、保存檢索結(jié)果（Saving）

PuMed系統(tǒng)允許最多可保存5000條記錄。存盤時PubMed默認文件名為“query.fcgi”。該文件名可以修改，文件格式也可在“.Fcgi”和“.txt”中選擇。選擇.txt格式，便于用文字處理軟件和文本編輯器打開所存文件。如果想存為超文本格式，則需要使用Web瀏覽器的“另存為...”功能，并選擇“.html”格式后再存盤。3、打印檢索結(jié)果（printing）

4、訂閱文獻全文（Ordering）

點擊【Order】按鈕，即可訂閱全部檢索記錄的文獻全文；要訂閱部分記錄的文獻全文時，對選定的記錄予以標記后，再點擊【Order】按鈕。如果檢索過程中已進行過多次檢索，可將每次檢索結(jié)果添加到粘貼板后，再從粘貼板中集中訂取文獻全文。該項服務為收費項目。九、其它功能臨床咨詢（Clinicalqueries）

臨床咨詢（Clinicalqueries）是pubMed設(shè)立的一個專供臨床醫(yī)生查找與臨床有關(guān)的數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)。PubMed采用過濾器（filters）技術(shù)，當輸入一個檢索提問詞時，系統(tǒng)只檢索與有關(guān)該提問詞的治療（Therapy）、診斷（Diagnosis）、病因（etiology）、預后（Prognosis）和clinic