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文檔簡介
PCR反應體系中各種成分的作用資料不同模板濃度的實驗結果用相同的引物、兩種不同的模板,對6種不同模板量進行PCR擴增,發(fā)現(xiàn)在模板量<25ng的條件下,擴增產物強度相應減弱,大約到2ng左右時無擴增產物;當模板量在25ng~200ng之間時,擴增產物基本穩(wěn)定,條帶清晰、穩(wěn)定,分辨率高;當模板量>200ng時,會出現(xiàn)大片段擴增產物的缺失或無擴增產物,且點樣孔至泳道會出現(xiàn)相應增強的彌散背景。綜合考慮,在25μl的PCR反應體系中,模板DNA以25~100ng為最適用量。同時模板DNA在200ng以下不影響擴增結果,但為降低TE緩沖液中EDTA對反應體系中Mg2+的不良影響程度,應該盡量降低DNA模板用量。不同Mg2+濃度時實驗結果設置不同Mg2+濃度,當Mg2+濃度為10mM時,無PCR擴增產物;Mg2+濃度為15~25mM時,隨著Mg2+濃度的增加,PCR擴增產物帶型基本一致,但以20mM的擴增效果最好不同引物濃度對PCR結果的影響設置5種不同濃度的引物進行PCR擴增,當引物濃度在01~02μM時,擴增結果基本一致;但隨著引物濃度的逐漸增加,開始出現(xiàn)彌散背景增強的趨勢,并且有些擴增帶發(fā)生減弱或缺失。為了保證反應結果的穩(wěn)定性和特異性,引物濃度以0.2μM左右為宜。不同dNTP濃度對PCR結果的影響采用2種引物(OPB17、OPA16),分別以4種不同的dNTP濃度進行PCR反應,發(fā)現(xiàn)dNTP濃度在100μM、150μM、200μM、300μM時,隨著濃度的減小,擴增帶明顯減少或擴增強度減弱,當dNTP濃度<200μM時,擴增產物豐富、清晰、帶濃,擴增片段產率與dNTP濃度呈正相關。綜合考慮,以100~200μM的dNTP濃度為佳。TaqDNA聚合酶對擴增結果的影響設置5個梯度的TaqDNA聚合酶濃度,結果表明隨著TaqDNA聚合酶濃度的增高,擴增產物量呈增多趨勢。在05u~25u濃度間均有擴增產物,但隨著TaqDNA聚合酶濃度增加的同時,彌散背景也相應增強。綜合考慮,TaqDNA聚合酶濃度以10~15u結果較好。不同退火溫度下的擴增效果引物用OPD16和OPA01,按照優(yōu)化的PCR反應體系將退火溫度分別設置為33℃、36℃、39℃、42℃。結果表明隨著退火溫度降低,非特異性產物增加,有彌散背景;退火溫度升高,特異性相對增加。Mgcl2與dNTP互相作用及對PCR反應的影響用同一引物OPD07、相同模板DNA比較3種MgCl2濃度與3種dNTP濃度完全隨機相結合的9個處理的PCR結果,研究了Mgcl2與dNTP的相互作用。結果表明,Mgcl2在低濃度時,。過量的dNTP對Mg2+的螯合作用明顯,表現(xiàn)為降低Mg2+的酶催作用,PCR擴增產物減少或無,而低量的dNTP對Mg2+酶催的抑制作用減少,PCR擴增產物增多。在高濃度Mgcl2濃度下,dNTP無抑制作用。在相同Mg2+離子濃度和足量dNTP時,擴增產物相似。1-9泳道分別代表Mgcl2(mM)/dNTP(μM)的濃度(1/100、1/200、1/300、2/100、2/200、2/300、3/100、3/200、3/300)。標準的PCR反應體系:10×擴增緩沖液10ul4種dNTP混合物各200umo
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