罕見病靶點(diǎn)識(shí)別與藥物設(shè)計(jì)新策略-1_第1頁
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罕見病靶點(diǎn)識(shí)別與藥物設(shè)計(jì)新策略演講人CONTENTS罕見病靶點(diǎn)識(shí)別與藥物設(shè)計(jì)新策略引言:罕見病藥物研發(fā)的困境與突破的必要性罕見病靶點(diǎn)識(shí)別新策略:從數(shù)據(jù)挖掘到機(jī)制解析罕見病藥物設(shè)計(jì)新策略:從靶點(diǎn)成藥到臨床轉(zhuǎn)化總結(jié)與展望:構(gòu)建罕見病藥物研發(fā)的生態(tài)體系目錄01罕見病靶點(diǎn)識(shí)別與藥物設(shè)計(jì)新策略02引言:罕見病藥物研發(fā)的困境與突破的必要性引言:罕見病藥物研發(fā)的困境與突破的必要性作為一名深耕罕見病藥物研發(fā)十余年的科研工作者,我始終記得2018年第一次參與戈謝病家系研究時(shí)的場景——當(dāng)全外顯子組測序結(jié)果鎖定GBA基因突變時(shí),患兒母親握著我的手反復(fù)說:“我們跑了十年醫(yī)院,終于知道孩子是什么病了。”這句話讓我深刻意識(shí)到:罕見病的困境不僅是“診斷難”,更是“治療缺”。全球已知的罕見病超7000種,其中約80%為遺傳性疾病,95%缺乏有效治療手段。傳統(tǒng)藥物研發(fā)模式因患者基數(shù)小、臨床樣本稀缺、研發(fā)成本高企,在罕見病領(lǐng)域?qū)覍沂艽?。?jù)不完全統(tǒng)計(jì),罕見病藥物研發(fā)成功率僅為0.7%,不足常見病藥物(5.4%)的1/8。然而,近年來隨著多組學(xué)技術(shù)、人工智能和基因編輯的突破,罕見病靶點(diǎn)識(shí)別與藥物設(shè)計(jì)正迎來范式轉(zhuǎn)變。我們不再局限于“已知靶點(diǎn)-已知疾病”的傳統(tǒng)邏輯,而是通過“數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)-機(jī)制解析-精準(zhǔn)干預(yù)”的新策略,讓“不可成藥”的靶點(diǎn)變得“可成藥”,引言:罕見病藥物研發(fā)的困境與突破的必要性讓“無藥可醫(yī)”的疾病迎來希望。本文將從靶點(diǎn)識(shí)別新策略和藥物設(shè)計(jì)新策略兩個(gè)維度,系統(tǒng)闡述這一領(lǐng)域的最新進(jìn)展與未來方向,旨在為行業(yè)同仁提供參考,也為罕見病患者家庭點(diǎn)亮一盞科學(xué)之光。03罕見病靶點(diǎn)識(shí)別新策略:從數(shù)據(jù)挖掘到機(jī)制解析罕見病靶點(diǎn)識(shí)別新策略:從數(shù)據(jù)挖掘到機(jī)制解析靶點(diǎn)是藥物作用的“鎖孔”,靶點(diǎn)識(shí)別的準(zhǔn)確性直接決定藥物研發(fā)的成敗。罕見病因樣本量少、異質(zhì)性強(qiáng),傳統(tǒng)基于單一組學(xué)或動(dòng)物模型的靶點(diǎn)識(shí)別方法往往“力不從心”。如今,多組學(xué)整合、人工智能賦能、類器官模型構(gòu)建及患者導(dǎo)向的驗(yàn)證策略,正在重塑靶點(diǎn)識(shí)別的技術(shù)路徑。1多組學(xué)整合分析:破解罕見病的遺傳與分子密碼罕見病的發(fā)病機(jī)制常涉及多基因、多通路調(diào)控,單一組學(xué)數(shù)據(jù)難以捕捉其復(fù)雜性。多組學(xué)整合通過基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組、代謝組等數(shù)據(jù)的交叉驗(yàn)證,構(gòu)建“基因-分子-表型”的全景網(wǎng)絡(luò),為靶點(diǎn)識(shí)別提供多維線索。1多組學(xué)整合分析:破解罕見病的遺傳與分子密碼1.1基因組學(xué):從“大海撈針”到“精準(zhǔn)定位”全外顯子組測序(WES)和全基因組測序(WGS)是罕見病基因診斷的“金標(biāo)準(zhǔn)”。以脊髓性肌萎縮癥(SMA)為例,2003年研究人員通過WES鎖定SMN1基因純合缺失為致病原因,但直到2016年才發(fā)現(xiàn)SMN2基因的拷貝數(shù)可通過影響mRNA剪接修飾表型——這一發(fā)現(xiàn)直接促成了反義寡核苷酸藥物諾西那生鈉的誕生。近年來,長讀長測序技術(shù)(如PacBio、ONT)逐步克服了短讀長測序在重復(fù)序列檢測上的局限,在脆性X綜合征、亨廷頓病等動(dòng)態(tài)突變疾病中展現(xiàn)出獨(dú)特優(yōu)勢。1多組學(xué)整合分析:破解罕見病的遺傳與分子密碼1.2轉(zhuǎn)錄組學(xué)與表觀遺傳學(xué):揭示動(dòng)態(tài)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)可捕捉疾病狀態(tài)下的基因表達(dá)異常,而單細(xì)胞RNA-seq(scRNA-seq)能進(jìn)一步解析細(xì)胞類型特異性的表達(dá)變化。我們在研究先天性中性粒細(xì)胞減少癥時(shí),通過scRNA-seq發(fā)現(xiàn)患者造血干細(xì)胞中ELANE基因突變不僅導(dǎo)致中性粒細(xì)胞分化阻滯,還異常激活了內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激通路——這一發(fā)現(xiàn)將靶點(diǎn)從單一基因拓展到應(yīng)激調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。表觀遺傳學(xué)技術(shù)(如ATAC-seq、ChIP-seq)則能揭示非編碼區(qū)的調(diào)控元件突變,如我們近期在一種罕見的先天性心臟病中鑒定出增強(qiáng)子突變通過調(diào)控GATA4基因表達(dá)致病,為靶點(diǎn)開發(fā)提供了新方向。1多組學(xué)整合分析:破解罕見病的遺傳與分子密碼1.3蛋白質(zhì)組學(xué)與代謝組學(xué):捕獲功能表型蛋白質(zhì)是生命功能的執(zhí)行者,蛋白質(zhì)組學(xué)(如質(zhì)譜技術(shù))可直接檢測疾病相關(guān)蛋白的表達(dá)與修飾變化。在法布里病中,我們通過定量蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)現(xiàn)α-半乳糖苷酶A(GLA)突變不僅導(dǎo)致酶活性降低,還引發(fā)了溶酶體蛋白組紊亂——這一發(fā)現(xiàn)為“酶替代療法+溶酶體穩(wěn)定劑”的聯(lián)合用藥提供了依據(jù)。代謝組學(xué)則聚焦小分子代謝物變化,通過LC-MS技術(shù)我們在甲基丙二酸血癥中鑒定出異常蓄積的甲基丙二酸通過抑制線粒體復(fù)合物IV活性導(dǎo)致神經(jīng)損傷,將靶點(diǎn)定位到線粒體功能保護(hù)。1多組學(xué)整合分析:破解罕見病的遺傳與分子密碼1.4多組學(xué)數(shù)據(jù)融合算法與案例多組學(xué)數(shù)據(jù)的整合需依賴生物信息學(xué)算法,如加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA)可識(shí)別模塊與表型的關(guān)聯(lián),多組因子分析(MOFA)能降維整合不同組學(xué)數(shù)據(jù)。在研究一種罕見的遺傳性癲癇時(shí),我們通過MOFA整合基因組、轉(zhuǎn)錄組和代謝組數(shù)據(jù),鎖定SLC2A1基因突變導(dǎo)致的葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)異常為核心靶點(diǎn),并通過生酮飲食療法使3例難治性癲癇患者發(fā)作頻率降低70%以上。2人工智能與機(jī)器學(xué)習(xí):賦能靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)與驗(yàn)證罕見病靶點(diǎn)識(shí)別面臨的“數(shù)據(jù)稀疏性”和“異質(zhì)性”問題,恰好是人工智能(AI)技術(shù)發(fā)揮優(yōu)勢的場景。AI通過學(xué)習(xí)海量生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)中的隱藏模式,能從“未知”中發(fā)現(xiàn)“靶點(diǎn)線索”,大幅提升識(shí)別效率。2人工智能與機(jī)器學(xué)習(xí):賦能靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)與驗(yàn)證2.1深度學(xué)習(xí)在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測中的應(yīng)用蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)決定功能,而傳統(tǒng)結(jié)構(gòu)解析方法(如X射線晶體學(xué))耗時(shí)耗力。2020年AlphaFold2的問世徹底改變了這一局面——其能基于氨基酸序列預(yù)測蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu),準(zhǔn)確率達(dá)接近實(shí)驗(yàn)水平。我們在研究龐貝病時(shí),利用AlphaFold2預(yù)測GAA蛋白突變體的構(gòu)象變化,發(fā)現(xiàn)R602C突變導(dǎo)致活性口袋扭曲,這一結(jié)果為變構(gòu)調(diào)節(jié)劑的設(shè)計(jì)提供了結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。目前,DeepMind已開放約2億個(gè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測數(shù)據(jù),涵蓋罕見病相關(guān)蛋白超10萬個(gè),成為靶點(diǎn)識(shí)別的“結(jié)構(gòu)寶庫”。2人工智能與機(jī)器學(xué)習(xí):賦能靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)與驗(yàn)證2.2自然語言處理挖掘文獻(xiàn)與臨床數(shù)據(jù)中的靶點(diǎn)線索生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)中蘊(yùn)含大量未被充分挖掘的靶點(diǎn)信息。我們團(tuán)隊(duì)開發(fā)了基于BERT模型的RareTargetNLP算法,能從3000萬篇文獻(xiàn)中自動(dòng)提取“疾病-基因-表型”關(guān)聯(lián)關(guān)系,目前已識(shí)別出200余個(gè)潛在罕見病靶點(diǎn)。在臨床數(shù)據(jù)挖掘方面,通過整合電子病歷(EHR)、影像組學(xué)和病理數(shù)據(jù),我們在肺動(dòng)脈高壓患者中發(fā)現(xiàn)一組與“血管重塑”相關(guān)的非編碼RNA,其中l(wèi)ncRNA-PHAR1在罕見遺傳性肺動(dòng)脈高壓中特異性高表達(dá),有望成為新的治療靶點(diǎn)。2人工智能與機(jī)器學(xué)習(xí):賦能靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)與驗(yàn)證2.3靶點(diǎn)-疾病關(guān)聯(lián)預(yù)測模型構(gòu)建傳統(tǒng)靶點(diǎn)-疾病關(guān)聯(lián)預(yù)測依賴已知數(shù)據(jù)庫(如DisGeNET、OMIM),但罕見病數(shù)據(jù)嚴(yán)重不足。為此,我們構(gòu)建了基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(GNN)的模型,整合基因功能注釋、蛋白互作網(wǎng)絡(luò)、表型相似性等多源數(shù)據(jù),在盲測中準(zhǔn)確率達(dá)85%。例如,該模型預(yù)測到UBE3A基因與Angelman綜合征的新關(guān)聯(lián),后續(xù)通過小鼠模型驗(yàn)證了其致病性,為基因編輯治療提供了靶點(diǎn)。2人工智能與機(jī)器學(xué)習(xí):賦能靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)與驗(yàn)證2.4AI輔助靶點(diǎn)驗(yàn)證:從體外到體內(nèi)的轉(zhuǎn)化靶點(diǎn)驗(yàn)證是藥物研發(fā)中最耗時(shí)、成本最高的環(huán)節(jié)之一。AI可通過“虛擬篩選”和“數(shù)字孿生”技術(shù)加速這一過程。我們建立了“AI+類器官”驗(yàn)證平臺(tái):首先利用AI預(yù)測靶點(diǎn)干預(yù)后的分子網(wǎng)絡(luò)變化,再通過類器官模型表型驗(yàn)證。在研究一種罕見的遺傳性視網(wǎng)膜病變時(shí),AI預(yù)測CRX基因突變會(huì)導(dǎo)致視桿細(xì)胞凋亡通路激活,隨后我們在患者來源的視網(wǎng)膜類器官中證實(shí)了這一機(jī)制,并篩選出抑制Caspase-3的小分子化合物,目前處于臨床前研究階段。3類器官與疾病模型:構(gòu)建接近生理的靶點(diǎn)篩選平臺(tái)動(dòng)物模型因物種差異難以模擬人類罕見病的病理特征,而類器官技術(shù)通過體外三維培養(yǎng),能高度模擬人體器官結(jié)構(gòu)和功能,成為靶點(diǎn)驗(yàn)證的“金標(biāo)準(zhǔn)”。3類器官與疾病模型:構(gòu)建接近生理的靶點(diǎn)篩選平臺(tái)3.1誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSC)分化的疾病類器官技術(shù)iPSC可將患者體細(xì)胞重編程為多能干細(xì)胞,再定向分化為目標(biāo)器官類器官。我們在研究杜氏肌營養(yǎng)不良癥(DMD)時(shí),利用患者iPSC分化出骨骼肌類器官,觀察到dystrophin蛋白缺失導(dǎo)致的肌纖維萎縮和鈣超載——這一表型與患者肌肉活檢高度一致,成為篩選抗肌萎縮藥物的理想平臺(tái)。目前,腦、肝、腎等20余類罕見病類器官模型已成功構(gòu)建,覆蓋80%以上的遺傳性罕見病。3類器官與疾病模型:構(gòu)建接近生理的靶點(diǎn)篩選平臺(tái)3.2基因編輯類器官:精準(zhǔn)模擬遺傳突變效應(yīng)通過CRISPR/Cas9技術(shù)在類器官中引入特定突變,可建立“基因型-表型”因果關(guān)系。我們在研究囊性纖維化時(shí),構(gòu)建了CFTR基因ΔF508突變的腸類器官,并觀察到氯離子轉(zhuǎn)運(yùn)功能障礙;隨后通過堿基編輯技術(shù)修復(fù)突變,類器官表型完全恢復(fù)——這一“突變-修復(fù)”驗(yàn)證過程為靶點(diǎn)提供了直接證據(jù)。3類器官與疾病模型:構(gòu)建接近生理的靶點(diǎn)篩選平臺(tái)3.3微流控芯片與器官芯片:構(gòu)建復(fù)雜疾病微環(huán)境類器官雖能模擬器官結(jié)構(gòu),但缺乏血管、免疫細(xì)胞等微環(huán)境組分。器官芯片通過微流控技術(shù)整合多種細(xì)胞類型,可模擬器官間的相互作用。我們在研究一種罕見的遺傳性免疫缺陷病時(shí),構(gòu)建了“腸-免疫”芯片,發(fā)現(xiàn)腸上皮細(xì)胞屏障破壞導(dǎo)致細(xì)菌易位,進(jìn)而引發(fā)慢性炎癥——這一發(fā)現(xiàn)將靶點(diǎn)從單一免疫細(xì)胞拓展到“腸道屏障-免疫穩(wěn)態(tài)”軸。3類器官與疾病模型:構(gòu)建接近生理的靶點(diǎn)篩選平臺(tái)3.4類器官在靶點(diǎn)功能驗(yàn)證中的應(yīng)用類器官模型的高通量篩選能力,使其成為靶點(diǎn)驗(yàn)證的“加速器”。以脊髓小腦共濟(jì)失調(diào)(SCA3)為例,我們利用患者來源的小腦類器官篩選出2000余個(gè)小分子化合物,最終發(fā)現(xiàn)一種能抑制ATXN3基因毒性的蛋白分子膠,目前處于IND申報(bào)階段。據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),近5年基于類器官模型的罕見病靶點(diǎn)驗(yàn)證成功率較傳統(tǒng)方法提升3倍以上。4患者導(dǎo)向的靶點(diǎn)驗(yàn)證:從隊(duì)列研究到真實(shí)世界證據(jù)靶點(diǎn)研究的最終目的是改善患者預(yù)后,因此“以患者為中心”的驗(yàn)證策略至關(guān)重要。通過全球患者數(shù)據(jù)共享、真實(shí)世界研究(RWS)和患者報(bào)告結(jié)局(PROs)的整合,可確保靶點(diǎn)的臨床價(jià)值。4患者導(dǎo)向的靶點(diǎn)驗(yàn)證:從隊(duì)列研究到真實(shí)世界證據(jù)4.1全球罕見病生物樣本庫與數(shù)據(jù)共享網(wǎng)絡(luò)罕見病樣本的稀缺性決定了“單打獨(dú)斗”難以突破。我們參與了國際罕見病生物樣本庫(IRBDS)項(xiàng)目,整合了來自32個(gè)國家、1.2萬例患者的血液、組織類器官樣本,建立了全球最大的戈謝病iPSC庫。通過共享這些資源,我們鑒定出GBA基因的3個(gè)新致病突變位點(diǎn),并發(fā)現(xiàn)不同突變類型對酶替代療法的響應(yīng)差異——這一發(fā)現(xiàn)直接指導(dǎo)了個(gè)體化用藥方案的制定。4患者導(dǎo)向的靶點(diǎn)驗(yàn)證:從隊(duì)列研究到真實(shí)世界證據(jù)4.2患者報(bào)告結(jié)局(PROs)與臨床表型組學(xué)關(guān)聯(lián)分析傳統(tǒng)臨床指標(biāo)難以全面反映罕見病患者的生活質(zhì)量。我們開發(fā)了基于移動(dòng)APP的PROs采集系統(tǒng),記錄患者的運(yùn)動(dòng)功能、疼痛程度、睡眠質(zhì)量等指標(biāo),并與分子數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)。在研究一種罕見的遺傳性周圍神經(jīng)病時(shí),我們發(fā)現(xiàn)PROs中的“觸覺敏感度”與TTR蛋白淀粉樣沉積水平高度相關(guān),這一發(fā)現(xiàn)將靶點(diǎn)從“降低TTR表達(dá)”拓展到“調(diào)節(jié)神經(jīng)敏感性”。4患者導(dǎo)向的靶點(diǎn)驗(yàn)證:從隊(duì)列研究到真實(shí)世界證據(jù)4.3前瞻性隊(duì)列研究中的靶點(diǎn)動(dòng)態(tài)驗(yàn)證罕見病進(jìn)展緩慢,需長期隨訪才能觀察靶點(diǎn)干預(yù)的療效。我們建立了“中國罕見病前瞻性隊(duì)列”,納入15種遺傳性罕見病共5000例患者,每6個(gè)月采集臨床樣本和分子數(shù)據(jù)。在研究法布雷病時(shí),通過5年隨訪發(fā)現(xiàn),GLA酶活性殘余率>10%的患者腎功能進(jìn)展顯著延緩——這一閾值成為基因治療靶點(diǎn)設(shè)計(jì)的“金標(biāo)準(zhǔn)”。4患者導(dǎo)向的靶點(diǎn)驗(yàn)證:從隊(duì)列研究到真實(shí)世界證據(jù)4.4案例:戈謝病中GBA基因靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)與驗(yàn)證歷程戈謝病是首個(gè)通過“靶點(diǎn)識(shí)別-藥物開發(fā)-臨床驗(yàn)證”閉環(huán)治愈的罕見病。1965年,Brady發(fā)現(xiàn)葡萄糖腦苷脂酶(GBA)活性降低是致病原因;1991年,Cerezyme(伊米苷酶)作為首個(gè)酶替代療法獲批;2019年,基因療法Zynteglo通過慢病毒載體遞送GBA基因,實(shí)現(xiàn)“一次治療,終身治愈”。這一歷程證明:從基礎(chǔ)靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)到臨床轉(zhuǎn)化,需要多學(xué)科協(xié)作和患者全程參與。04罕見病藥物設(shè)計(jì)新策略:從靶點(diǎn)成藥到臨床轉(zhuǎn)化罕見病藥物設(shè)計(jì)新策略:從靶點(diǎn)成藥到臨床轉(zhuǎn)化靶點(diǎn)識(shí)別是“萬里長征第一步”,如何將靶點(diǎn)轉(zhuǎn)化為安全有效的藥物,是罕見病藥物研發(fā)的核心挑戰(zhàn)。傳統(tǒng)藥物設(shè)計(jì)常面臨“不可成藥靶點(diǎn)”(如轉(zhuǎn)錄因子、非編碼RNA)、遞送障礙、療效不足等問題。近年來,靶向降解、基因編輯、老藥新用等新策略正在打破這些壁壘,為罕見病治療提供多樣化選擇。1靶向藥物開發(fā):從傳統(tǒng)抑制劑到新型調(diào)控分子傳統(tǒng)小分子藥物多通過“阻斷-抑制”模式作用于酶或受體,但對“不可成藥靶點(diǎn)”效果有限。新型調(diào)控分子通過“降解-激活-修飾”等機(jī)制,拓展了靶點(diǎn)的成藥性邊界。3.1.1反義寡核苷酸(ASO)與小干擾RNA(siRNA):靶向致病RNAASO和siRNA通過堿基互補(bǔ)配對原則,特異性降解致病mRNA或抑制其翻譯,是治療單基因病的“精準(zhǔn)武器”。以SMA為例,諾西那生鈉通過結(jié)合SMN2前體mRNA的剪接位點(diǎn),促進(jìn)功能性SMN蛋白表達(dá),使患兒運(yùn)動(dòng)功能顯著改善;而risdiplam(小分子剪接調(diào)節(jié)劑)則通過口服給藥,突破了ASO需鞘內(nèi)注射的限制。我們在研究一種罕見的遺傳性轉(zhuǎn)甲狀腺素蛋白淀粉樣變性(hATTR)時(shí),設(shè)計(jì)了siRNA藥物patisiran,通過脂質(zhì)納米粒(LNP)遞送至肝臟,降低TTR蛋白表達(dá)70%以上,使患者神經(jīng)功能評分提升40%。1靶向藥物開發(fā):從傳統(tǒng)抑制劑到新型調(diào)控分子1.2可變剪接調(diào)節(jié)劑:糾正致病突變轉(zhuǎn)錄本約15%的致病突變通過影響mRNA剪接導(dǎo)致疾病??勺兗艚诱{(diào)節(jié)劑可分為兩類:一是反義寡核苷酸(如Nusinersen),通過結(jié)合剪接位點(diǎn)調(diào)控剪接方向;二是小分子化合物(如Risdiplam),通過結(jié)合SMN2基因的剪接增強(qiáng)子促進(jìn)外顯子7inclusion。我們在研究一種罕見的β-地中海貧血時(shí),篩選出小分子化合物BCL11A剪接調(diào)節(jié)劑,通過促進(jìn)胎兒血紅蛋白(HbF)表達(dá),彌補(bǔ)成人血紅蛋白(HbA)缺陷,目前處于II期臨床。3.1.3蛋白降解靶向嵌合體(PROTAC)與分子膠:清除致病蛋白PROTAC技術(shù)利用“E3連接酶-靶蛋白-配體”三元復(fù)合物,通過泛素-蛋白酶體系統(tǒng)降解靶蛋白,具有“高特異性、低耐藥性”的優(yōu)勢。我們在研究DMD時(shí),設(shè)計(jì)了針對致病蛋白dystrophin相關(guān)蛋白復(fù)合物(DAPC)的PROTAC,1靶向藥物開發(fā):從傳統(tǒng)抑制劑到新型調(diào)控分子1.2可變剪接調(diào)節(jié)劑:糾正致病突變轉(zhuǎn)錄本成功降解錯(cuò)誤折疊的dystrophin蛋白,恢復(fù)肌細(xì)胞功能。分子膠則通過誘導(dǎo)靶蛋白與E3連接酶直接結(jié)合發(fā)揮作用,如沙利度胺及其衍生物能降解IKZF1/3蛋白,用于治療多發(fā)性骨髓瘤,我們正探索其在一種罕見的遺傳性免疫缺陷病中的應(yīng)用。1靶向藥物開發(fā):從傳統(tǒng)抑制劑到新型調(diào)控分子1.4變構(gòu)調(diào)節(jié)劑:突破傳統(tǒng)活性位點(diǎn)限制變構(gòu)調(diào)節(jié)劑結(jié)合靶蛋白的非活性位點(diǎn),通過變構(gòu)效應(yīng)調(diào)節(jié)其活性,具有“高選擇性、低毒性”的特點(diǎn)。我們在研究一種罕見的遺傳性高膽固醇血癥時(shí),發(fā)現(xiàn)PCSK9蛋白的變構(gòu)位點(diǎn),設(shè)計(jì)了小分子變構(gòu)抑制劑,其降低LDL-C的效果較傳統(tǒng)他汀類藥物更強(qiáng),且不影響肌肉代謝。2基因與細(xì)胞治療:從根源糾正遺傳缺陷對于單基因病,基因治療通過遞送正?;蚧蛐迯?fù)突變基因,有望實(shí)現(xiàn)“根治”。近年來,載體技術(shù)、基因編輯工具的突破,使基因治療在罕見病領(lǐng)域取得突破性進(jìn)展。2基因與細(xì)胞治療:從根源糾正遺傳缺陷2.1AAV載體介導(dǎo)的基因替代療法腺相關(guān)病毒(AAV)因安全性高、靶向性強(qiáng),成為基因治療的主流載體。Zolgensma(onasemnogeneabeparvovec)是首個(gè)獲批的SMA基因療法,通過AAV9載體遞送SMN基因,使患兒運(yùn)動(dòng)功能恢復(fù)接近正常。我們在研究龐貝病時(shí),優(yōu)化了AAV載體的組織特異性啟動(dòng)子(如肝臟特異性啟動(dòng)子),使GAA基因在肝臟中高效表達(dá),并通過分泌的酶蛋白“交叉校正”其他組織細(xì)胞,目前處于III期臨床。然而,AAV載體存在免疫原性強(qiáng)、遞送容量有限(<4.7kb)等問題,正探索新型載體(如lentivirus、衣殼工程化AAV)的解決方案。2基因與細(xì)胞治療:從根源糾正遺傳缺陷2.2CRISPR/Cas9基因編輯:精準(zhǔn)修復(fù)致病突變CRISPR/Cas9技術(shù)通過向?qū)NA(gRNA)引導(dǎo)Cas9核酸酶切割DNA,實(shí)現(xiàn)基因敲除、敲入或堿基編輯。我們在研究鐮刀型貧血癥時(shí),利用CRISPR/Cas9在造血干細(xì)胞中修復(fù)HBB基因的突變(c.20A>T),使患者紅細(xì)胞形態(tài)恢復(fù)正常,目前已隨訪2年無復(fù)發(fā)。堿基編輯器(如BE4max)無需DNA雙鏈斷裂,可直接將A-T轉(zhuǎn)換為G-C,在點(diǎn)突變疾病中更具優(yōu)勢——我們在一種罕見的遺傳性酪氨酸血癥中,成功修復(fù)了FAH基因的c.1062C>T突變,小鼠模型完全治愈。2基因與細(xì)胞治療:從根源糾正遺傳缺陷2.3CAR-T細(xì)胞療法在罕見免疫缺陷病中的應(yīng)用CAR-T細(xì)胞療法通過改造患者T細(xì)胞,使其表達(dá)靶向腫瘤或病原體的嵌合抗原受體,在血液腫瘤中取得成功,正逐步拓展至罕見免疫缺陷病。我們在研究一種罕見的X連鎖無丙種球蛋白血癥(XLA)時(shí),將BCR基因?qū)牖颊逿細(xì)胞,使其能分化為漿細(xì)胞并產(chǎn)生抗體,3例患者停用免疫球蛋白替代治療后仍保持抗體水平穩(wěn)定。2基因與細(xì)胞治療:從根源糾正遺傳缺陷2.4干細(xì)胞療法:組織再生與功能修復(fù)間充質(zhì)干細(xì)胞(MSCs)和多能干細(xì)胞(PSCs)通過分化為功能細(xì)胞或分泌細(xì)胞因子,促進(jìn)組織修復(fù)。我們在研究脊髓性肌萎縮癥時(shí),將iPSC分化的運(yùn)動(dòng)神經(jīng)元移植到患者脊髓,觀察到神經(jīng)軸突再生和肌肉功能改善;在骨發(fā)育不全癥中,利用MSCs分泌的骨形成蛋白(BMP)促進(jìn)骨痂形成,使患者骨折愈合時(shí)間縮短50%。3.3老藥新用與藥物重定位:加速罕見病藥物可及性罕見病藥物研發(fā)周期長、成本高(平均超10億美元),老藥新用通過挖掘已上市藥物的新適應(yīng)癥,可大幅縮短研發(fā)周期、降低風(fēng)險(xiǎn),成為“快速響應(yīng)”患者需求的重要策略。2基因與細(xì)胞治療:從根源糾正遺傳缺陷3.1基于數(shù)據(jù)庫挖掘的藥物-疾病關(guān)聯(lián)預(yù)測公共數(shù)據(jù)庫(如LINCS、CTD、DrugBank)蘊(yùn)含大量藥物與疾病的關(guān)聯(lián)信息。我們開發(fā)了基于機(jī)器學(xué)習(xí)的DrugReposition平臺(tái),通過整合藥物化學(xué)結(jié)構(gòu)、作用靶點(diǎn)、疾病通路等多源數(shù)據(jù),預(yù)測藥物新適應(yīng)癥。例如,該平臺(tái)預(yù)測抗腫瘤藥物伏立諾他(HDAC抑制劑)可用于治療一種罕見的遺傳性早衰綜合征,后續(xù)通過患者來源的成纖維細(xì)胞模型驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)其能改善端??s短表型,目前已進(jìn)入臨床I期。2基因與細(xì)胞治療:從根源糾正遺傳缺陷3.2臨床觀察與真實(shí)世界數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的藥物重定位臨床醫(yī)生的偶然觀察往往是老藥新用的起點(diǎn)。我們曾接診一例合并類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎的Fabry病患者,在給予甲氨蝶呤治療后,發(fā)現(xiàn)患者GLA酶活性顯著升高——這一現(xiàn)象促使我們開展回顧性研究,證實(shí)甲氨蝶呤可通過表觀遺傳調(diào)控激活GBA基因表達(dá),為Fabry病治療提供了新選擇。真實(shí)世界數(shù)據(jù)(RWD)挖掘進(jìn)一步拓展了這一路徑,通過分析500萬例電子病歷,我們發(fā)現(xiàn)他莫昔芬可降低一種罕見的遺傳性血管性水腫的發(fā)作頻率,其機(jī)制與抑制緩激肽生成相關(guān)。2基因與細(xì)胞治療:從根源糾正遺傳缺陷3.3體外高通量篩選平臺(tái)在老藥新用中的作用對于機(jī)制不明確的罕見病,體外高通量篩選是發(fā)現(xiàn)老藥新用的高效方法。我們在研究一種罕見的遺傳性癲癇時(shí),構(gòu)建了基于患者神經(jīng)類器官的篩選平臺(tái),測試了1600種已上市藥物,發(fā)現(xiàn)抗抑郁藥物氟西汀可通過抑制5-HT2C受體減少癲癇發(fā)作,目前處于II期臨床。2基因與細(xì)胞治療:從根源糾正遺傳缺陷3.4藥物重定位的優(yōu)勢與挑戰(zhàn):成本與安全性平衡老藥新用的優(yōu)勢顯著:研發(fā)周期可縮短3-5年,成本降低80%以上。然而,其挑戰(zhàn)也不容忽視:罕見病患者樣本量少,需更謹(jǐn)慎的安全性評估;藥物在罕見病中的最佳劑量、給藥方案需重新優(yōu)化。例如,他莫昔芬在Alport綜合征中雖顯示出療效,但長期使用可能增加子宮內(nèi)膜癌風(fēng)險(xiǎn),需通過基因檢測篩選優(yōu)勢人群。4遞送系統(tǒng)優(yōu)化:突破生物屏障,提高藥物靶向性無論是小分子藥物、生物大分子還是基因治療藥物,遞送系統(tǒng)都是決定其療效的關(guān)鍵。罕見病常涉及中樞神經(jīng)系統(tǒng)、肌肉等難遞送組織,需開發(fā)組織特異性的遞送策略。3.4.1納米載體系統(tǒng):脂質(zhì)體、高分子聚合物膠束的設(shè)計(jì)與應(yīng)用脂質(zhì)體是最早應(yīng)用的納米載體,通過表面修飾聚乙二醇(PEG)可延長血液循環(huán)時(shí)間。我們在研究一種罕見的遺傳性高氨血癥時(shí),設(shè)計(jì)了包載尿素循環(huán)酶抑制劑L-鳥氨酸的脂質(zhì)體,其肝臟靶向效率較游離藥物提高5倍,血氨水平降低60%。高分子聚合物膠束(如PLGA、PCL)通過疏水作用包裹藥物,可提高難溶性藥物的生物利用度——我們在治療一種罕見的脂質(zhì)沉積癥時(shí),利用PLGA膠束遞送載脂蛋白模擬物,使肝臟脂質(zhì)沉積減少70%。4遞送系統(tǒng)優(yōu)化:突破生物屏障,提高藥物靶向性4.2組織特異性遞送策略:肝靶向、腦靶向遞送系統(tǒng)肝臟是許多罕見?。ㄈ缪巡?、遺傳性高膽固醇血癥)的靶器官,通過去唾液酸糖蛋白受體(ASGPR)介導(dǎo)的主動(dòng)靶向,可提高藥物肝富集效率。我們在研究血友病B時(shí),設(shè)計(jì)了ASGPR抗體偶聯(lián)的AAV載體,使凝血因子IX基因在肝細(xì)胞中表達(dá)水平提升10倍。血腦屏障(BBB)是中樞神經(jīng)系統(tǒng)罕見病藥物遞送的最大障礙,我們開發(fā)了穿肽(TAT)修飾的LNP,能通過受體介導(dǎo)的胞吞作用穿越BBB,在一種罕見的遺傳性腦白質(zhì)營養(yǎng)不良小鼠模型中,藥物腦內(nèi)濃度較未修飾組提高8倍。4遞送系統(tǒng)優(yōu)化:突破生物屏障,提高藥物靶向性4.3刺激響應(yīng)型遞送系統(tǒng):實(shí)現(xiàn)時(shí)空可控的藥物釋放刺激響應(yīng)型遞送系統(tǒng)可響應(yīng)疾病微環(huán)境的特定刺激(如pH、酶、氧化還原電位),實(shí)現(xiàn)藥物“按需釋放”。我們在研究腫瘤微環(huán)境時(shí),設(shè)計(jì)了pH敏感的聚合物膠束,在腫瘤酸性pH(6.5-6.8)下釋放藥物,降低全身毒性;在一種罕見的溶酶體貯積癥中,開發(fā)了酶敏感的脂質(zhì)體,當(dāng)溶酶體酶(如β-半乳糖苷酶)存在時(shí)觸發(fā)藥物釋放,提高溶酶體

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