1、第九章了解微生物的進(jìn)化、系統(tǒng)發(fā)育和分類鑒定，了解微生物的分類鑒定方法類型，作為進(jìn)化表的測(cè)量指標(biāo)，熟悉rRNA序列測(cè)量和分析方法的常用分類群術(shù)語(yǔ)熟悉微生物的快速鑒定和自動(dòng)化分析技術(shù)。1最早的生命形態(tài)，地球已經(jīng)存在了約46億年，微生物生命的化石證據(jù)存在于36億年歷史和不到36億年的巖石中。早期的地球沒有氧氣，比現(xiàn)在的地球熱得多。最初的生化化合物是通過(guò)無(wú)氧合成生產(chǎn)的，提供了生命起源的可能性。最古老的微生物可能是厭氧光陽(yáng)微生物。2進(jìn)化的測(cè)量指標(biāo)，進(jìn)化：生物與生存環(huán)境相互作用的過(guò)程中，隨著時(shí)間的推移，發(fā)生了一系列不可逆轉(zhuǎn)的遺傳信息變化，導(dǎo)致了表型變化和對(duì)生存環(huán)境的相對(duì)適應(yīng)。2.1進(jìn)化表可用于測(cè)量進(jìn)化變化

2、的細(xì)胞大分子。兩個(gè)物種之間的進(jìn)化距離可以通過(guò)兩個(gè)茄子同源大分子的核苷酸或氨基酸的序列差異來(lái)測(cè)定。1)作為進(jìn)化時(shí)鐘大分子的條件，1)牙齒分子廣泛分布在用于研究的分類群中。2)必須在各生物中功能動(dòng)員(功能不相關(guān)的分子沒有序列相似性)。3)分子序列可以線性排列，有利于分析比較。4)序列變化率與測(cè)量的進(jìn)化距離一致，2)進(jìn)化時(shí)鐘核糖體RNA是最適合揭示各種生物親緣關(guān)系的rRNA，特別是16SrRNA。優(yōu)點(diǎn)：功能穩(wěn)定，分布廣，適當(dāng)保守性及相對(duì)分子質(zhì)量適中。您可以在互聯(lián)網(wǎng)上獲得10，000多種rRNA序列(3358RDP WWW./)、2.2 RRNA的順序和演變。1)rRNA序列

3、測(cè)定和分析方法(1)寡核苷酸列表分析方法水解傳記電泳輻射現(xiàn)象16S rRNA片段分離小片段分子序列測(cè)定相似系數(shù)SAB=2NAB/(NA NB)核苷酸列表比較序列印跡序列：2.3系統(tǒng)發(fā)育樹(phylogenetic tree)，2) rRNA排序所提出的系統(tǒng)發(fā)育樹通過(guò)RNA序列分析，表明一般祖先開始的進(jìn)化最初是通過(guò)兩個(gè)茄子方向：細(xì)菌系譜和古生菌-真核生物系譜，以及古生菌和真核生物分化，產(chǎn)生了兩個(gè)茄子主要系譜。形成生命的三個(gè)茄子區(qū)域：Archaea，Bacteria and Eukaryotes。1)概念系統(tǒng)樹分子系統(tǒng)樹：由比較生物大分子序列差異的數(shù)字組成的系統(tǒng)樹。細(xì)菌，學(xué)名Archaea，Euk

4、arya，宇宙生物進(jìn)化樹，3細(xì)菌分類，命名，蜂鳴器手冊(cè)，3.1細(xì)菌分類常用的分類群術(shù)語(yǔ)1)非正式分類單位培養(yǎng)物和純培養(yǎng)物菌株常用的數(shù)字，以及eg 3360 Bacillus subtilis ASI . 398人口(population):表示特定空間中同一個(gè)人的組合。格式(type or form):亞種以下的單位。同種或亞種不同菌株之間的性質(zhì)不能分為新亞種時(shí)的表達(dá)方法。2)物種(species)微生物沒有嚴(yán)格意義上的性交，在微生物之間通過(guò)傳導(dǎo)、轉(zhuǎn)換、結(jié)合等途徑，可以用作盆景的參考。根據(jù)基因序列資料，DNA雜交動(dòng)員性為60%-70%以上或16SrRNA序列動(dòng)員性為97%以上的菌株可以定為一個(gè)

5、品種。，3.2命名1) 2) 3命名法屬物種名稱gar(subsp或var)亞種或變體gar 3)為特定(或未定宗名)EG 3360 Streptomyces IJSB。()新名稱公布時(shí)，應(yīng)添加所屬新分類等級(jí)的縮寫ord.nov。Gen.novSp.nov .3.3蜂鳴器系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)是有關(guān)細(xì)菌和古生菌的主要分類學(xué)著作?！癰ergeys manual of systematic bactereiology(系統(tǒng)手冊(cè))”第二個(gè)板塊5卷的一般內(nèi)容。P340，4微生物分類識(shí)別的特征和技術(shù)，4.1形態(tài)特征4.2生理生化特征4.3血清學(xué)實(shí)驗(yàn)和噬菌體分型血清學(xué)實(shí)驗(yàn)：一般用于種內(nèi)(及個(gè)別屬)不同菌株血清型分類。使用已知抗體鑒定未知抗原(微生物)。噬菌體分型：根據(jù)噬菌體的宿主范圍，將細(xì)菌分為不同的波均衡，利用噬菌體分解作用的特異性進(jìn)行細(xì)菌識(shí)別。4.4氨基酸順序和蛋白質(zhì)分析傳記電泳模式比較；瞳孔酶的傳記游泳遷移率4.5(G C)%與核酸分子雜交的G C含量相同，只是表示親緣關(guān)系可能相似，無(wú)法說(shuō)明是否是動(dòng)員。4.6發(fā)生基因重組的細(xì)菌之間應(yīng)該有廣泛的染色體動(dòng)員性。5微生物的快速鑒定及自動(dòng)化分析技術(shù)，微量多