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1、質(zhì)粒DNA抽提實(shí)驗(yàn)報(bào)告1 實(shí)驗(yàn)?zāi)康模?.掌握堿裂解法小量快速提取質(zhì)粒DNA的方法,提取的質(zhì)粒DNA可直接用于酶切,PCR擴(kuò)增等。2.學(xué)習(xí)利用水平式瓊脂糖凝脈電泳初步檢測(cè)DNA的純度,構(gòu)型,含量和分子量大小。2 實(shí)驗(yàn)原理:堿變性抽提質(zhì)粒DNA是基于染色體DNA與質(zhì)粒DN結(jié)果A的變性與復(fù)性的差異而達(dá)到分離目的。在pH值高達(dá)12.6的堿性條件下,染色體DNA的氫鍵斷裂,雙螺旋結(jié)構(gòu)解開(kāi)而變性。質(zhì)粒DNA的大部分氫鍵也斷裂,但超螺旋共價(jià)閉合環(huán)狀的兩條互補(bǔ)鏈不會(huì)完全分離,當(dāng)以pH4.8的NaAc高鹽緩沖液去調(diào)節(jié)其pH值至中性時(shí),變性的質(zhì)粒DNA又恢復(fù)原來(lái)的構(gòu)型,保存在溶液中,而染色體DNA不能復(fù)性而形成纏
2、連的網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),通過(guò)離心,染色體DNA與不穩(wěn)定的大分子RNA、蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物等一起沉淀下來(lái)而被除去。3 實(shí)驗(yàn)儀器及試劑:1.5mlEP管、高速離心機(jī)、移液槍溶液I: 50 mmol/L 葡萄糖、10 mmol/L EDTA、25 mmol/L Tris-HCl (pH 8.0)2毫克/毫升 溶菌酶溶液II: 200 mmol/L NaOH、1% SDS溶液III: 3 mol/L NaAc (pH4.8)溶液、TE緩沖液:10 mmol/L Tris-HCl、pH 7.51 mmol/L EDTA4 實(shí)驗(yàn)步驟:1、 取1.5ml細(xì)胞培養(yǎng)物于1.5mlEP管中,12000rpm/min離心1
3、min,去上清液(重復(fù)一次)2、加200l溶液重懸浮細(xì)胞3、加200l溶液,輕輕搖勻,放置5min4、加150l溶液,輕輕搖勻,冰浴5min,12000rpm/min離心5min5、取上清,加入等體積氯仿,搖勻,12000rpm/min離心10min6、去上清,加入等體積異丙醇,室溫放置5min,12000rpm/min離心10min7、70%乙醇洗滌沉淀2次,風(fēng)干8、加20ddH2O溶解沉淀,-20下保存?zhèn)溆梦鍖?shí)驗(yàn)結(jié)果:得到大腸桿菌質(zhì)粒DNAPCR以及電泳實(shí)驗(yàn)報(bào)告1 實(shí)驗(yàn)原理:PCR:該技術(shù)是在模板DNA、引物和四種脫氧核糖核苷酸存在下,依賴于DNA聚合酶的酶促合成反應(yīng)。DNA聚合酶以單鏈D
4、NA為模板,借助一小段雙鏈DNA來(lái)啟動(dòng)合成,通過(guò)一個(gè)或兩個(gè)人工合成的寡核苷酸引物與單鏈DNA模板中的一段互補(bǔ)序列結(jié)合,形成部分雙鏈。在適宜的溫度和環(huán)境下,DNA聚合酶將脫氧單核苷酸加到引物3-OH末端,并以此為起始點(diǎn),沿模板53方向延伸,合成一條新的DNA互補(bǔ)鏈。 電泳:瓊脂糖凝膠可以用于蛋白質(zhì)和核酸的電泳支持介質(zhì),尤其適合于核酸的提純、分析。如濃度為1%的瓊脂糖凝膠的孔徑對(duì)于蛋白質(zhì)來(lái)說(shuō)是比較大的,對(duì)蛋白質(zhì)的阻礙作用較小,這時(shí)蛋白質(zhì)分子大小對(duì)電泳遷移率的影響相對(duì)較小,所以適用于一些忽略蛋白質(zhì)大小而只根據(jù)蛋白質(zhì)天然電荷來(lái)進(jìn)行分離的電泳技術(shù),如免疫電泳、平板等電聚焦電泳等。瓊脂糖也適合于DNA、R
5、NA分子的分離、分析,由于DNA、RNA分子通常較大,所以在分離過(guò)程中會(huì)存在一定的摩擦阻礙作用,這時(shí)分子的大小會(huì)對(duì)電泳遷移率產(chǎn)生明顯影響。二實(shí)驗(yàn)儀器及試劑:EP管、離心機(jī)、PCR儀、電泳槽、電泳儀、移液槍、紫外透射檢測(cè)儀等DNA模板、與特定DNA模板結(jié)合的引物、去離子水、商業(yè)化的DNA聚合酶以及緩沖液、dNTP、DNA熒光染料溴化乙錠、瓊脂糖凝膠3 PCR反應(yīng)體系(25l)2PCRmix 12.5l引物1 1l引物2 1l20ddH2O 10.5l4 操作步驟1、94預(yù)變性5min,然后94,30s-64,45s-72,1min循環(huán)7次2、94,30s-55,45s-72,1min循環(huán)23次3、72,10s4、 電泳檢測(cè)5 實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析分離不同大小的DNA片段所用的最適凝膠濃度是不同的,數(shù)據(jù)見(jiàn)下表:如右圖所示:實(shí)驗(yàn)所用的瓊脂糖凝膠濃度為1.3%,實(shí)驗(yàn)的DNA條帶位置
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