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文檔簡介
1、COX s Proportional Hazard Model Cox比例風險模型,統(tǒng)計學課中介紹了生存分析方法,只能研究一至兩個因素對生存時間的影響,當對生存時間的影響因素有多個時,它們就無能為力了,需要使用Cox Regression過程,這是一種專門用于生存時間的多變量分析的統(tǒng)計方法。,基本概念:,借助于多元線性回歸及Logistic模型構造的思想構筑COX模型,Logistic模型: lnP/(1-P)=0+1X1+ 2X2 +pXp.,多元線回歸 Y 0 +1X1+2X2+pXp,等式右邊不變。能不能左邊直接用時間T代替Y、P?,設不存在因素X1、X2 、Xp的影響下, 病人t 時刻
2、死亡的風險率為h0(t) , 存在因素X1、X2 、Xp 的影響下, t時刻死亡的風險率為h(t) 。,COX提出:用死亡風險率的比 h(t)/h0(t) 代替P/(1-P)即得COX模型。,Cox比例風險回歸模型,lnh(t)/ h0(t)=1X1+2X2+pXp COX比例風險函數(shù)的另一種形式: h(t)= h0(t)exp(1X1+2X2+pXp) X表示可能影響生存的諸因素,也稱協(xié)變量,參數(shù) 1,2,p稱為偏回歸系數(shù) , 由于h0(t)不要求服從特定分布形式,但指數(shù)部分具有參數(shù)模型的形式,所以COX模型稱為半?yún)?shù)模型。,風險率 t表示生存時間; h(t)稱為具有協(xié)變量X的個體在t時刻的
3、風險函數(shù),表示生存時間已達t的個體在t時刻的瞬時風險率或死亡率; h0(t)稱為基線風險函數(shù),表示所有X都取值為0時的個體在t時刻的瞬時風險率或死亡率。,回歸系數(shù)的意義判斷: 當回歸系數(shù)大于0時,對事件發(fā)生的可能性增加,小于0時,減少事件發(fā)生的可能性,等于0時,與事件的發(fā)生無關。,設含有p個變量x1, x2,xp及生存時間T和結局C的 n個觀察對象. 其數(shù)據(jù)結構為: 編號 X1 X2 . XP T C 1 x11 x21 x1p y1 1 2 x21 x22 x2p y2 0 n xn1 xn2 xnp yn . ,數(shù)據(jù)結構,Cox模型的參數(shù)估計,Cox回歸的參數(shù)估計同Logistic回歸分析
4、一樣采用最大似然估計法。其基本思想是先建立偏似然函數(shù)和對數(shù)偏似然函數(shù),求偏似然函數(shù)或對數(shù)偏似然函數(shù)達到極大時參數(shù)的取值,即為參數(shù)的最大似然估計值。,7、Cox模型的檢驗,對Cox模型的檢驗常采用得分檢驗(score test)、wald檢驗和似然比檢驗(likelihood ratio test),均為卡方檢驗,自由度為協(xié)變量個數(shù)。一般score test用于入選變量,wald檢驗多用于剔除變量 ,似然比檢驗用于不同協(xié)變量模型的比較,既可用于變量入選也可用于變量剔除。 檢驗假設 H0:所有的i 為0 , H1:至少有一個 i 不為0 。,8、Cox模型中回歸系數(shù)的檢驗,假設為 H0: ,其它參
5、數(shù)固定; H1: ,其它參數(shù)固定。 H0成立時,統(tǒng)計量 Z bkSE(bk) 服從標準正態(tài)分布。SE(bk)是回歸系數(shù)bk的標準誤。,變量xj暴露水平時的風險率與非暴露水平時的風險率之比稱為風險比hr (hazard ratio) hr= ei,流行病學意義,hr風險比相對危險度RR,參數(shù)的意義及其解釋(1),在其它預后因素固定不變的情況下,預后因素Xj每改變一個觀察單位時所引起的相對風險度改變量的自然對數(shù)值。 0,RR1,說明變量X增加時,危險率增加,即X是危險因素。 0,RR1,說明變量X增加時,危險率下降,即X是保護因素。 =0,RR=1,說明變量X增加時,危險率不變,即X是危險無關因素
6、。,參數(shù)的意義及其解釋(2),9. COX回歸的應用: 和LOGISTIC回歸相似 (1)因素分析 分析哪些因素(協(xié)變量)對生存期的長短有顯著作用。 對各偏回歸系數(shù)作顯著性檢驗,如顯著,則說明在排除其它因素的影響后,該因素與生存期的長短有顯著關系。,(2)求各因素在排除其它因素的影響后,對于死亡的相對危險度(或比數(shù)比) 如某因素Xi的偏回歸系數(shù)為i, 則該因素Xi對于死亡的比數(shù)比為exp(i) 當Xi為二值變量時,如轉移(1=轉移,0=不轉移) exp(i)為轉移相對于不轉移對于死亡的相對危險度(或比數(shù)比),當Xi為等級變量時,如淋巴結轉移,分0,1,2,3,4五個等級。 exp(i)為每增加
7、一個等級,死亡的相對危險度,如等級3相對于等級0其死亡的相對危險度為: exp(3i) 當Xi為連續(xù)變量時,如年齡(歲) exp(i)為每增加一歲時,死亡的相對危險度 如60歲相對于35歲其死亡的相對危險度為exp(25i),(3)比較各因素對于生存期長短的相對重要性 比較各標準化偏回歸系數(shù)i 絕對值的大小,絕對值大的對生存期長短的作用也大。 (4) 考察因素之間的交互作用 如考察XL和XK之間的交互作用是否顯著,再增加一各指標:XLK= XL*XK ,如其偏回歸系數(shù)LK顯著,則XL和XK之間的交互作用顯著。,(5)計算預后指數(shù)(PI) 將所有偏回歸系數(shù)乘上變量賦值然后相加,記得帶值負號不能丟
8、。PI越大,預后越差。,實例分析,為探討某惡性腫瘤的預后,某研究者收集了63例患者的生存時間、生存結局及影響因素。影響因素包括病人年齡、性別、組織學類型、治療方式、淋巴結轉移、腫瘤浸潤程度,生存時間以月計算。變量的賦值和所收集的資料分別見表17-8和表17-9。試用Cox回歸模型進行分析。,表17-9 63名某惡性腫瘤患者的生存時間(月)及影響因素,建立數(shù)據(jù)文件(data-03.sav) 操作過程 主菜單:分析Analyze生存SurvivalCox Regression,Cox回歸主對話框,操作過程,主對話框參數(shù)設置: 時間time框:選入 “ t ”。 狀態(tài)status框:選入“ y ”,
9、擊define events 鈕,在single value框填入“1” 協(xié)變量Covariates框:選入“x1x6”。 方法Method框:選擇自變量進入Cox模型的方法,SPSS提供以下7種方法。,1.分析例數(shù)描述,主要輸出結果,2-1.模型檢驗(全變量模型),結果提示: (1)對模型總體檢驗有顯著意義(P=0.003),即至少 有1個自變量的總體回歸系數(shù)不為0。,2-2.模型檢驗(逐步回歸模型,Method=向前法LR,自變量進入P0.05,剔除P0.10 ),(2)采用逐步回歸法進行Cox模型分析的結果提示:模型擬合自變量進入和 剔除的檢驗水準分別為0.05和0.1時,篩選后的最佳模
10、型包含兩個協(xié)變量, 即X4(治療方式)和X5(淋巴結是否轉移),該擬合模型總體檢驗提示 具有統(tǒng)計學意義(整體卡方=17.594,P0.001)。,3. 參數(shù)估計(逐步回歸模型,Method=向前法LR,自變量進入P0.05,剔除P0.10 ),B :偏回歸系數(shù) ,SE:偏回歸系數(shù)的標準誤 Wald:用于檢驗總體偏回歸系數(shù)與0有無顯著差異, v=1時,W=(B/SE)2 。 Exp(B):相對危險度估計(RR值),(3)X4(治療方式)對生存時間有影響,采用新療法病人的死亡風險降至傳統(tǒng)療法的17.2%(RR的95%CI為0.0590.503)。 (4)X5(淋巴結是否轉移)對生存時間也有影響,有
11、淋巴結轉移病人的死亡風險為無淋巴結轉移病人的2.538倍( RR的95%CI為1.0626.066)。,4. 自/協(xié)變量的均值(選入2個變量的模型),5. 生存曲線(選入2個變量的模型),生存分析結果報告,描述研究事件(如死亡時間等) 說明研究起始時間與終止時間 (如癥狀出現(xiàn)與康復時間,診斷日期與終止日期等) 說明刪失數(shù)據(jù)的種類與原因 說明計算生存率的統(tǒng)計學方法,生存分析結果報告(續(xù)),給出Cox回歸模型,呈現(xiàn)解釋變量與風險之間的聯(lián)系 給出風險比(hazard ratio)及其置信區(qū)間 給出模型整體的假設檢驗結果,分析結果報告,個體的預后指數(shù)及預后分組: 預后指數(shù)(prognostic index,PI) = 預后指數(shù)越小,預后越好; 預后指數(shù)越大,預后越差。,例如: 傳統(tǒng)治療方式,淋巴結轉移,PI2.6929 傳統(tǒng)治療方式,淋巴結無轉移,PI1.7616 新治療方式,淋巴結轉移,PI0.9313 新治療方式,淋巴結無轉移,PI0 據(jù)PI的大小可將病人分為不同的危險組,常見分三組(即低危組、中危組、高危組)或五組。繪制分組的生存曲線,直觀比較各危險組的生存情況,如中位生存期、t年生存率等。,因素篩選與最佳模型建立,因素篩選 剔去缺失數(shù)據(jù)較多,或變異程度幾乎為0 的因子; 逐步回歸前進法第0步為各變量的單變量分析,選擇有統(tǒng)計意義者; 雖無統(tǒng)計學意義,但有明確的
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