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文檔簡介

1、1,實驗 1,頰粘膜上皮細(xì)胞基因組DNA的抽提及ACE基因多態(tài)性分析,2,一、實驗?zāi)康?掌握從微量來源的組織細(xì)胞中抽提基因組DNA 掌握PCR技術(shù)原理 了解基因多態(tài)性分析的方法。,3,二、原理,基因組DNA抽提 堿裂解法抽提基因組DNA(本實驗) 用蛋白酶K和苯酚提取大分子DNA 裂解-蛋白酶K-沉淀法快速提取DNA ACE基因多態(tài)性分析 PCR方法分析基因多態(tài)性,4,真核生物基因組中非編碼序列多于編碼序列,基因組,編碼序列,非編碼序列,調(diào)控序列,重復(fù)序列,高重復(fù)序列(串聯(lián)排列,大衛(wèi)星、小衛(wèi)星、微衛(wèi)星),中重復(fù)序列(散在分布;部分編碼;Alu家族),低重復(fù)序列或單拷貝,5,Alu家族 重復(fù)單位

2、:300bp左右;130+31+130bp 具Alu酶切位點 30-50萬次 功能:基因調(diào)控 Alu元件的插入、刪除和重組與許多先天性遺傳疾病和癌癥相關(guān),6,ACE基因多態(tài)性分析(血管緊張素轉(zhuǎn)換酶, Angiotesin converting enzyme, ACE),基因診斷:利用現(xiàn)代分子生物學(xué)和分子遺傳學(xué)的方法,從DNA、RNA水平檢測基因的存在、結(jié)構(gòu)異常和表達狀態(tài),從而對疾病做出診斷的方法。 基因多態(tài)性:指在一隨機婚配的群體中,染色體同一基因座位點上有兩種或兩種以上的基因型,它可決定人體對疾病的易感性、臨床表現(xiàn)多樣性和對藥物治療反應(yīng)的差異性。,7,理論基礎(chǔ) ACE基因第16內(nèi)含子存在一段

3、長度為287bp(Alu序列)的插入/缺失(I/D)多態(tài)性片段,I/D多態(tài)性與血液ACE水平有明確關(guān)系,DD型ACE水平最高,ID次之,II最低。左室肥大患者中DD型頻率明顯增高。 實驗原理 以DNA為模板,ACE基因特異的引物序列位于287bp插入/缺失片段的兩側(cè)進行PCR擴增,故II型擴增片段長度約為490bp,DD型擴增片段長度約為190bp,ID型擴增片段為個,分別為190bp和490bp。根據(jù)PCR擴增片段的大小可進行多態(tài)性分析。,8,插入片段,插入型,缺失型,9,操作步驟,基因組DNA抽提 PCR反應(yīng) 瓊脂糖凝膠電泳檢測,10,1. 基因組DNA抽提,溶液 10 ml 漱口20秒

4、收集漱口水; 3000g5minRT,棄上清; 溶液 250 ul 重懸沉淀; 3000g1min,棄上清; 溶液 250 ul 重懸沉淀,振蕩10秒;(變性) 轉(zhuǎn)至0.5 ml離心管, 995min; 加溶液IV 50 ul 振蕩5秒;(中和) 3000g1min, 上清轉(zhuǎn)移至新0.5 ml離心管,取5 ul用于PCR.,11,2. PCR反應(yīng),取消毒的0.5 ml離心管,加入下列成分: 10PCR Buffer dNTP(2.5 mM each) mix: 10l Taq DNA polymerase DNA模板 5 l 引物混合物(10M each) 2 l ddH2O 3 l 總體系 20 l 擴增程序為:94變性30s,55復(fù)性30s,72延伸40s,共反應(yīng)35個循環(huán)。,12,瓊脂糖電泳檢測,制備

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