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1、第二章按R基團(tuán)的極性分類(lèi):(4種)(1)非極性氨基酸疏水性側(cè)鏈Ala,Ile,Leu,Phe,Met,Trp,Val,Pro(2)極性不帶電荷氨基酸側(cè)鏈含極性基團(tuán)(不解離)Ser,Thr,Tyr,Asn,Gln,Cys,Gly(3)極性帶正電荷氨基酸側(cè)鏈含氨基或亞氨基Lys,Arg,His(4)極性帶負(fù)電荷氨基酸側(cè)鏈均含1個(gè)羧基Asp,Glu氨基酸化學(xué)性質(zhì):(1)-氨基和-羧基共同參加的反應(yīng)與茚三酮反應(yīng)成肽反應(yīng)a.與水合茚三酮的反應(yīng)(定性、定量)p26茚三酮在弱酸性溶液中與氨基酸共熱,所有具有游離氨基的氨基酸都生成藍(lán)紫色復(fù)合物。脯氨酸和羥脯氨酸與茚三酮反應(yīng)直接生成的是黃色復(fù)合物。b.成肽反應(yīng)(
2、2)- 氨基參加的反應(yīng)a.與甲醛的反應(yīng):甲醛能與氨基酸中的氨基作用,使氨基的堿性消失。這樣就可以用堿來(lái)滴定氨基酸的羧基,從而測(cè)定氨基酸的含量。這稱(chēng)為氨基酸的甲醛滴定法b. 2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反應(yīng)首先被Sanger用來(lái)鑒定多肽或蛋白質(zhì)的N末端氨基酸。2,4二硝基氟苯縮寫(xiě)為DNFB或FDNB,亦稱(chēng)Sanger試劑c.與異硫氰酸苯酯反應(yīng)首先被Edman用于鑒定多肽或蛋白質(zhì)的N端氨基酸。苯異硫氰酸酯縮寫(xiě)為PITCEdman降解法測(cè)定氨基酸序列d.與亞硝酸反應(yīng)鑒定蛋白質(zhì)或N末端主要試劑有2種:2,4二硝基氟苯,異硫氰酸苯酯C末端分析( Sanger試劑,DNFB或FDNB):羧肽酶法;還原
3、法;肼解法1、 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)(一、二、三、四)(1)一級(jí)結(jié)構(gòu):指多肽鏈中氨基酸的組成及排列順序(主要為肽鍵,包括二硫鍵)。一級(jí)結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)空間構(gòu)象和特異生物學(xué)功能的基礎(chǔ)。一級(jí)結(jié)構(gòu) 決定高級(jí)結(jié)構(gòu) 決定 功能(2)二級(jí)結(jié)構(gòu):指肽鏈的主鏈在空間的排列,或規(guī)則的幾何走向、旋轉(zhuǎn)及折疊。由肽鍵和-碳原子構(gòu)成的多肽鏈骨架稱(chēng)為主鏈,伸展在外的R基團(tuán)稱(chēng)為側(cè)鏈。 維系力:鏈內(nèi)或鏈間形成的氫鍵。主要有aa-螺旋、bb-折疊、bb-轉(zhuǎn)角。(3)三級(jí)結(jié)構(gòu):是建立在二級(jí)結(jié)構(gòu)、超二級(jí)結(jié)構(gòu)乃至結(jié)構(gòu)域的基礎(chǔ)上的,多肽鏈進(jìn)一步折疊卷曲形成復(fù)雜的球狀分子結(jié)構(gòu),稱(chēng)為三級(jí)結(jié)構(gòu)。維系力:有氫鍵、疏水鍵、離子鍵和范德華力等三級(jí)結(jié)構(gòu)的重要性:
4、三級(jí)結(jié)構(gòu)形成后,蛋白質(zhì)分子才形成固有的分子形狀;才具有親水膠體的特性;功能蛋白質(zhì)的活性部位得以形成并表現(xiàn)出相應(yīng)的生物學(xué)活性。(4)四級(jí)結(jié)構(gòu):是指寡聚蛋白中亞基的種類(lèi)、數(shù)量以及各個(gè)亞基在寡聚蛋白質(zhì)中的空間排布和亞基間的相互作用。維系力:疏水相互作用、范德華力、鹽鍵。2、穩(wěn)定空間結(jié)構(gòu)的作用力有哪些非共價(jià)鍵:氫鍵、疏水相互作用力、范德華力、鹽鍵共價(jià)鍵:二硫鍵3、二級(jí)結(jié)構(gòu)主要類(lèi)型(螺旋 右手螺旋)影響形成螺旋穩(wěn)定的因素 (問(wèn)答題)側(cè)鏈基團(tuán)大小的影響,甘氨酸由于側(cè)鏈太小,構(gòu)象不穩(wěn)定,是螺旋的破壞者;極大的側(cè)鏈基團(tuán)(存在空間位阻); 連續(xù)存在帶相同電荷的氨基酸殘基(同種電荷的互斥效應(yīng)); 有Pro等亞氨基
5、酸存在(不能形成氫鍵) ,脯氨酸由于其亞氨基少一個(gè)氫原子,無(wú)法形成氫鍵,而且CN鍵不能旋轉(zhuǎn),所以是螺旋的破壞者,肽鏈中出現(xiàn)脯氨酸就中斷螺旋,形成一個(gè)“結(jié)節(jié)”。4、蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)特點(diǎn) 44頁(yè)含多種二級(jí)結(jié)構(gòu)單元;有明顯的折疊層次;是緊密的球狀或橢球狀實(shí)體;分子表面有一空穴(活性部位);疏水側(cè)鏈埋藏在分子內(nèi)部,親水側(cè)鏈暴露在分子表面。5、蛋白質(zhì)變性的本質(zhì):概念(名詞解釋?zhuān)?天然蛋白質(zhì)在某些物理或化學(xué)因素的作用下,其空間結(jié)構(gòu)(次級(jí)鍵,特別是氫鍵)被破壞,使其理化性質(zhì)和生物學(xué)性質(zhì)都發(fā)生改變,但一級(jí)結(jié)構(gòu)不被破壞,這種現(xiàn)象稱(chēng)為蛋白質(zhì)的變性。變性實(shí)質(zhì):維系蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的次級(jí)鍵斷裂,其特定的空間結(jié)構(gòu)被改變或破
6、壞。6、蛋白質(zhì)的沉淀反應(yīng):概念(名詞解釋?zhuān)└拍睿涸谝欢l件下,蛋白疏水側(cè)鏈暴露在外,肽鏈融會(huì)相互纏繞繼而聚集,因而從溶液中析出。變性的蛋白質(zhì)易于沉淀,有時(shí)蛋白質(zhì)發(fā)生沉淀,但并不變性。7、蛋白質(zhì)的顏色反應(yīng)第三章:核酸一、核酸分類(lèi)與功能核酸分為兩大類(lèi) :脫氧核糖核酸 核糖核酸 脫氧核糖核酸(DNA):主要分布在細(xì)胞核和線粒體核糖核酸(RNA):主要分布在細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中核酸是一類(lèi)重要的生物大分子,擔(dān)負(fù)著生命信息的儲(chǔ)存與傳遞。堿基核酸的生物功能:生命信息的儲(chǔ)存與傳遞。表現(xiàn)在:DNA的復(fù)制與生物遺傳信息的保持;RNA與生物遺傳信息的表達(dá);酶的催化功能核酸酶(核酶);生物遺傳變異的化學(xué)本質(zhì)DNA結(jié)構(gòu)變化
7、二、核酸完全水解產(chǎn)生(即核酸組成):3個(gè)核苷戊糖核苷酸核酸磷酸核酸完全水解產(chǎn)物:堿基、戊糖和磷酸(組成)核酸的結(jié)結(jié)構(gòu)單元:核苷酸三、DNA與RNA的堿基組成在DNA分子中為 A、G、C、T 四種在RNA分子中為 A、G、C、U 四種DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu): 雙螺旋結(jié)構(gòu)是DNA二級(jí)結(jié)構(gòu)最基本的形式(線形或環(huán)形)四、DNA的結(jié)構(gòu):雙螺旋結(jié)構(gòu) (1)的要點(diǎn)(問(wèn)答)(2)穩(wěn)定他的因素(選擇填空) DNA分子由兩條多聚脫氧核糖核苷酸鏈(簡(jiǎn)稱(chēng)DNA單鏈)組成。 兩條鏈沿著同一中心軸反向平行盤(pán)繞,形成右手雙螺旋。 堿基位于螺旋的內(nèi)側(cè);磷酸和脫氧核糖位于螺旋外側(cè); 通過(guò)3,5磷酸二酯鍵構(gòu)成骨架;堿基環(huán)平面與螺旋軸垂
8、直;糖基環(huán)平面與螺旋軸平行 螺旋橫截面的直徑約為2nm;每條鏈相鄰兩個(gè)堿基平面之間的距離為0.34 nm 每10個(gè)核苷酸形成一個(gè)螺旋,螺距是3.4 nm。 兩個(gè)核苷酸之間的夾角360兩條核苷酸鏈依靠彼此堿基之間形成的氫鍵而結(jié)合在一起。雙螺旋表面形成兩種凹槽,一條較深,稱(chēng)為大溝(寬1.2nm,深0.85nm);一條較淺,稱(chēng)為小溝(寬0.6nm,深0.75nm)。其中大溝對(duì)于DNA和蛋白質(zhì)結(jié)合時(shí)的相互識(shí)別很重要。堿基在一條鏈上的排列順序不受任何限制。但根據(jù)堿基配對(duì)原則,一條核苷酸鏈序列可決定另一條互補(bǔ)鏈的序列。堿基堆積力形成疏水環(huán)境(主要因素)。堿基處于雙螺旋內(nèi)部的疏水環(huán)境中,可免受水溶性活性小分
9、子的攻擊。堿基配對(duì)的氫鍵。GC含量越多,越穩(wěn)定。磷酸基上的負(fù)電荷與介質(zhì)中的陽(yáng)離子或組蛋白的正離子之間形成離子鍵,中和了磷酸基上的負(fù)電荷間的斥力,有助于DNA穩(wěn)定。五、RNA的結(jié)構(gòu)功能堿基組成A、G、C、U (AU/GC); 稀有堿基較多,穩(wěn)定性較差,易水解多為單鏈結(jié)構(gòu),少數(shù)局部形成螺旋; 分子較小六、RNA 的種類(lèi):3種;tRNA, mRNA, rRNA 它們的功能tRNA (轉(zhuǎn)運(yùn)RNA):轉(zhuǎn)運(yùn)氨基酸。(結(jié)合活化氨基酸( 3´-CCA-OH ),搬運(yùn)氨基酸到核糖體;識(shí)別mRNA密碼子,參與蛋白質(zhì)的翻譯。)(分子量最小,約由7393個(gè)核苷酸組成;稀有堿基最多(10-20%)3-末端都具
10、有CCAOH的結(jié)構(gòu);5-末端磷酸化,常為pG(pC)含有保守序列:有十幾個(gè)位置的核苷酸是不變的,如第8位的U,第18,19位的G等, 對(duì)維持tRNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)和生物功能起重要作用。)rRNA:核蛋白體組分占RNA總量的80;核糖體:rRNA+蛋白質(zhì),40%蛋白質(zhì),60% rRNA催化肽鍵合成的是rRNA ;蛋白質(zhì)維持rRNA構(gòu)象,起輔助作用mRNA(信使RNA)蛋白質(zhì)合成的模板(把DNA所攜帶的遺傳信息,按堿基互補(bǔ)配對(duì)原則,抄錄并傳送至核糖體,用以決定其合成蛋白質(zhì)的氨基酸排列順序)占細(xì)胞總RNA的35;代謝快,壽命短堿基的排列順序決定蛋白質(zhì)肽鏈上氨基酸的排列順序七、核酸的變性、復(fù)性1、(1)核
11、酸的變性:在某些理化因素作用下,如加熱,DNA 分子互補(bǔ)堿基對(duì)之間的氫鍵斷裂,使DNA 雙螺旋結(jié)構(gòu)松散,變成單鏈的過(guò)程。不涉及共價(jià)鍵3,5-磷酸二酯鍵的斷裂,所以它的一級(jí)結(jié)構(gòu)(堿基順序)保持不變降解:多核苷酸骨架上共價(jià)鍵斷裂,引起相對(duì)分子質(zhì)量降低(2)變性的因素:溫度升高、酸堿度改變、有機(jī)溶劑(甲醛、尿素)。變性后的表現(xiàn):粘度降低、浮力密度上升,沉降速度增加,增色效應(yīng)等。2、(1)變性DNA在適當(dāng)條件下,兩條互補(bǔ)鏈可重新恢復(fù)天然的雙螺旋構(gòu)象,這一現(xiàn)象稱(chēng)為復(fù)性,產(chǎn)生減色效應(yīng)。DNA復(fù)性后,一系列性質(zhì)將得到恢復(fù),但是生物活性一般只能得到部分的恢復(fù)。對(duì)于熱變性的DNA,在緩慢冷卻的條件下可重新結(jié)合恢
12、復(fù)雙螺旋結(jié)構(gòu),稱(chēng)為退火。(2)復(fù)性的條件:A、將熱變性的DNA驟然冷卻至低溫時(shí),DNA不可能復(fù)性。即淬火。B、將變性的DNA緩慢冷卻時(shí),可以復(fù)性。退火溫度Tm25C、分子量越大復(fù)性越難。濃度越大,復(fù)性越容易。此外,DNA的復(fù)性需要一定的鹽濃度,也與它本身的組成和結(jié)構(gòu)有關(guān)。(3)影響復(fù)興的因素:?jiǎn)捂溒螡舛仍礁?,隨機(jī)碰撞的頻率越高,復(fù)性速度越快。較大的單鏈片段擴(kuò)展困難,鏈間錯(cuò)配頻率高,復(fù)性較慢。片段間的重復(fù)序列多,則容易形成互補(bǔ)區(qū),因而復(fù)性較快。維持溶液一定的離子強(qiáng)度,消除磷酸基負(fù)電荷造成的斥力,可加快復(fù)性速度。八、增色效應(yīng)與減色效應(yīng)概念 (名詞解釋?zhuān)┰錾?yīng):核酸變性后,由于雙螺旋解體,堿基暴
13、露,在260nm的吸光值比變性前明顯升高的現(xiàn)象。減色效應(yīng):在DNA復(fù)性(恢復(fù)雙鏈)的過(guò)程中則伴隨著光吸收的減少。九、二級(jí)(三葉草)、三級(jí)(“L”) 問(wèn)答題額外環(huán)四環(huán)四臂D環(huán)UANTC環(huán)反密碼子反密碼子環(huán)321載運(yùn)氨基酸氫鍵和堿基堆積力是穩(wěn)定倒 L的因素。第五章1、生物膜的概念、化學(xué)組成(選擇或判斷)細(xì)胞中各種不同的膜統(tǒng)稱(chēng)為生物膜。包括圍在細(xì)胞質(zhì)外圍的質(zhì)膜和細(xì)胞器的內(nèi)膜系統(tǒng)化學(xué)組成:糖類(lèi)、脂質(zhì)、蛋白質(zhì)2、生物膜的不對(duì)稱(chēng)性、流動(dòng)性結(jié)構(gòu)特點(diǎn)(1)生物膜的不對(duì)稱(chēng)性膜脂的分布不對(duì)稱(chēng),即膜脂雙分子層內(nèi)外兩側(cè)的脂種類(lèi)、含量不同,如人紅細(xì)胞質(zhì)膜:v 膜的外層卵磷脂、鞘磷脂較多v 膜的內(nèi)層腦磷脂、磷脂酰絲氨酸較
14、多膜蛋白的分布不對(duì)稱(chēng) 如線粒體內(nèi)膜中的NADH電子傳遞鏈各組分:v Cyt氧化酶 、琥珀酸脫氫酶在線粒體內(nèi)膜內(nèi)側(cè)v Cytc在線粒體內(nèi)膜外側(cè)糖蛋白和糖脂中的多糖只分布在膜的非細(xì)胞質(zhì)一側(cè)(2)生物膜流動(dòng)性:膜的流動(dòng)性主要是指膜脂及膜蛋白流動(dòng)性n 膜脂的流動(dòng)性主要決定于磷脂分子。n 在生理?xiàng)l件下,磷脂大多呈流動(dòng)的液晶態(tài)磷脂分子在膜內(nèi)作側(cè)向擴(kuò)散或側(cè)向移動(dòng)磷脂分子在脂雙層中作翻轉(zhuǎn)運(yùn)動(dòng)磷脂烴鏈圍繞CC鍵旋轉(zhuǎn)而導(dǎo)致異構(gòu)化運(yùn)動(dòng)磷脂分子圍繞于膜平面相垂直的軸左右擺動(dòng)磷脂分子圍繞于膜平面相垂直的軸作旋轉(zhuǎn)運(yùn)動(dòng)(3)影響膜脂的流動(dòng)性的大小的因素:n 與磷脂分子中脂肪酸鏈的長(zhǎng)短及不飽和程度密切相關(guān):n 鏈越短,不飽和
15、程度越高,流動(dòng)性越大。n 受環(huán)境溫度影響n 在一定限度內(nèi),溫度升高,膜脂流動(dòng)性增強(qiáng);溫度降低,流動(dòng)性減弱。n 當(dāng)溫度降至一定值時(shí),膜脂從流動(dòng)的液晶態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)轭?lèi)似晶體的凝膠態(tài),這個(gè)溫度稱(chēng)為相變溫度。凝膠狀態(tài)也可再熔解為液晶態(tài).3、生物膜的功能保護(hù)細(xì)胞 結(jié)構(gòu)、形狀物質(zhì)傳送 轉(zhuǎn)運(yùn)物質(zhì)信息傳遞 如神經(jīng)信號(hào)傳導(dǎo) 能量交換 如化學(xué)能®生物能細(xì)胞識(shí)別(免疫)專(zhuān)一性抗原受體物質(zhì)傳送分為:主動(dòng)運(yùn)輸(指物質(zhì)逆濃度梯度,需消耗代謝能,并需專(zhuān)一性的載體蛋白。)被動(dòng)運(yùn)輸(被動(dòng)運(yùn)輸指物質(zhì)順濃度梯度,不需要消耗代謝能的運(yùn)輸方式。)又分為簡(jiǎn)單擴(kuò)散(無(wú)需載體)、協(xié)助擴(kuò)散(需要載體)第六章1、酶的概念 :酶是由活性細(xì)胞產(chǎn)
16、生的生物催化劑。(除有催化活性的RNA之外幾乎都是蛋白質(zhì)。)2、酶的化學(xué)本質(zhì)(判斷)酶的化學(xué)本質(zhì)蛋白質(zhì)(核酸)3、酶的作用的特點(diǎn)與一般催化劑的相同點(diǎn) 反應(yīng)前后質(zhì)與量不變,且用量少。 .縮短到達(dá)平衡的時(shí)間,不改變平衡點(diǎn)。 .只能催化本來(lái)進(jìn)行的反應(yīng)。.降低反應(yīng)所需活化能。(2)與一般催化劑的不同點(diǎn).高效性 比一般催化劑高1061013倍高度專(zhuān)一 酶對(duì)催化的反應(yīng)和反應(yīng)物有嚴(yán)格的選擇性.條件溫和(酶易失活) 引起蛋白質(zhì)變性的因素都能使酶失活。.活性能調(diào)節(jié)、控制常需要輔助因子4、結(jié)構(gòu)化學(xué)組成1.單純蛋白酶類(lèi):只是由氨基酸組成,此外不含其他成分,其活性僅僅決定于它的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。2.結(jié)合蛋白酶類(lèi):這些酶其蛋
17、白質(zhì)部分稱(chēng)之為酶蛋白,非蛋白質(zhì)部分稱(chēng)為輔因子(或輔助因子)。酶蛋白與輔因子單獨(dú)存在時(shí),均無(wú)催化活力,或活性很弱,結(jié)合在一起組成全酶后,才表現(xiàn)有明顯的催化作用。5、(1)根據(jù)反應(yīng)性質(zhì)可分為:氧化還原酶類(lèi) 轉(zhuǎn)移酶類(lèi) 水解酶類(lèi)裂合酶類(lèi) 異構(gòu)酶類(lèi) 合成酶類(lèi)(2)據(jù)化學(xué)組成分類(lèi):(填空題).單純蛋白酶類(lèi): 只是由氨基酸組成,此外不含其他成分,其活性僅僅決定于它的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。.結(jié)合蛋白酶類(lèi):這些酶其蛋白質(zhì)部分稱(chēng)之為酶蛋白,非蛋白質(zhì)部分稱(chēng)為輔因子(或輔助因子)。酶蛋白與輔因子單獨(dú)存在時(shí),均無(wú)催化活力,或活性很弱,結(jié)合在一起組成全酶后,才表現(xiàn)有明顯的催化作用。絕對(duì)專(zhuān)一6、酶的專(zhuān)一性 (圖) (問(wèn)答題)鍵專(zhuān)一結(jié)
18、構(gòu)專(zhuān)一相對(duì)專(zhuān)一旋光異構(gòu)順?lè)串悩?gòu)基團(tuán)專(zhuān)一立體(異構(gòu))專(zhuān)一專(zhuān)一性酶的專(zhuān)一性:酶對(duì)底物和催化的反應(yīng)有嚴(yán)格的選擇性。一種酶僅能作用于一種底物或結(jié)構(gòu)上相似的一類(lèi)物質(zhì),促進(jìn)發(fā)生一定的化學(xué)反應(yīng)7、輔酶及維生素類(lèi)型(重點(diǎn)掌握B1、B6、B2)維生素的特點(diǎn): 種類(lèi)多 需要量少 常常需要從食物中獲得 大部分充當(dāng)輔酶(1)、維生素B1 硫胺(素)(抗神經(jīng)炎V、抗腳氣病V)缺乏癥:1. 腳氣病 2. 中樞神經(jīng)和腸胃患糖代謝失常功能: 以輔酶方式參加糖的分解代謝。TPP是脫羧酶、脫氫酶的輔酶。分布:在米糠、麥麩、黃豆、酵母、瘦肉等食物中含量最豐富。(2)、維生素B2(又稱(chēng)核黃素)維生素B2的生理功能: 是作為遞氫輔酶(
19、FMN、FAD),參與生物氧化作用。維生素B2每人每天需要量: 兒童0.6mg,成人1.6mg。動(dòng)物體內(nèi)不能合成維生素B2。過(guò)量則排出。膳食中長(zhǎng)期缺乏:口角炎、舌炎、唇炎、眼瞼炎,角膜血管增生等癥狀。分布: 廣泛存在于動(dòng)、植物中。在酵母、肝腎、蛋黃、奶及大豆中含量豐富。(3) 維生素B6又稱(chēng)吡哆素,包括吡哆醇、吡哆醛、吡哆胺。功能:作為輔酶參加多種代謝反應(yīng),包括脫羧、轉(zhuǎn)氨、氨基酸內(nèi)消旋、Trp代謝、含硫氨基酸的脫硫、羥基氨基酸的代謝和氨基酸的脫水等。缺乏癥:導(dǎo)致皮膚、中樞神經(jīng)系統(tǒng)和造血機(jī)構(gòu)的損害,可以引發(fā)皮炎。分布:動(dòng)植物中分布很廣,谷類(lèi)外皮含量尤為豐富。同時(shí)腸道細(xì)菌也能合成供人體需要。8、酶
20、蛋白結(jié)構(gòu)分為3種(1).單體酶(2).寡聚酶(3).多酶復(fù)合物9、酶的結(jié)構(gòu)(圖)結(jié)合部位催化部位酶的結(jié)構(gòu) 必需基團(tuán)其它部分活性中心活性中心以外的必需基團(tuán)必需基團(tuán):直接或間接與酶催化活性相關(guān)的多肽鏈上某些氨基酸殘基組成的功能基團(tuán)10、酶的作用機(jī)理:(大題)(1)酶作用專(zhuān)一性機(jī)理1.鎖鑰學(xué)說(shuō):認(rèn)為整個(gè)酶分子的天然構(gòu)象是具有剛性結(jié)構(gòu)的,酶表面具有特定的形狀。酶與底物的結(jié)合如同一把鑰匙對(duì)一把鎖一樣。此學(xué)說(shuō)可以較好的解釋酶的立體異構(gòu)專(zhuān)一性;但不能解釋酶的多底物現(xiàn)象、酶對(duì)正反方向的催化等。 2.誘導(dǎo)契合學(xué)說(shuō)酶受底物誘導(dǎo)而變形該學(xué)說(shuō)認(rèn)為酶的活性部位并不是和底物的形狀正好互補(bǔ)的。而是在酶和底物結(jié)合的過(guò)程中,底
21、物分子或酶分子,有時(shí)是兩者的構(gòu)象同時(shí)發(fā)生了一定的變化后才互補(bǔ)的。這時(shí)催化基團(tuán)的位置也正好在所催化底物鍵的斷裂和即將生成鍵的適當(dāng)位置。這個(gè)動(dòng)態(tài)的辨認(rèn)過(guò)程稱(chēng)為誘導(dǎo)契合。(2)酶作用高效性機(jī)理 中間產(chǎn)物學(xué)說(shuō)(3)影響酶高效性的因素 1.鄰近定向效應(yīng) 2.底物的形變和誘導(dǎo)契合 3.親核催化/親電催化(共價(jià)催化) 4.酸堿催化 5.微環(huán)境的影響11、抑制劑對(duì)酶反應(yīng)速度的影響:(1)抑制作用與抑制劑(2)抑制作用的類(lèi)型(3)可逆抑制作用的動(dòng)力學(xué)特征(4)一些重要的抑制劑抑制作用的類(lèi)型:一些重要的抑制劑a不可逆抑制劑1.有機(jī)磷化合物與酶活性直接有關(guān)的絲氨酸上的-OH牢固地結(jié)合,從而抑制某些蛋白酶或酯酶。(敵
22、百蟲(chóng)、敵敵畏、農(nóng)藥1605等)2.有機(jī)汞、有機(jī)砷化合物與酶蛋白上的-SH作用,從而抑制含-SH酶的活性。(對(duì)氯汞苯甲酸)3.氰化物、硫化物和CO這類(lèi)物質(zhì)能與酶中的金屬離子形成較為穩(wěn)定的絡(luò)合物,使酶的活性受到抑制。4.重金屬Ag、Cu、Hg等鹽能使大多數(shù)酶失活,加入EDTA可以除去。5.烷化劑這一類(lèi)試劑中往往含一個(gè)活潑的鹵素原子,如碘乙酸、碘乙酰胺和2,4-二硝基氟苯等,使酶蛋白中的 SH、-NH2、-OH等發(fā)生烷基化, 失活。6.青霉素抗菌素類(lèi)藥物,與糖肽轉(zhuǎn)肽酶活性部位Ser-OH共價(jià)結(jié)合,使酶失活b. 可逆抑制劑在可逆抑制劑中最重要的是競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑。 如:磺胺藥、氨基葉酸等。用增加底物濃度的
23、方法可以減弱抑制作用。 12、別構(gòu)調(diào)控 、 共價(jià)修飾 (名詞解釋?zhuān)﹦e構(gòu)調(diào)控:酶分子除了具有活性中心外,還具有調(diào)節(jié)部位,酶的調(diào)節(jié)部位可以與某些化合物可逆地非共價(jià)結(jié)合,使酶的構(gòu)象發(fā)生改變,進(jìn)而改變酶催化活性,這種調(diào)節(jié)方式稱(chēng)為別夠調(diào)控。共價(jià)修飾:在其他酶的催化作用下,某些酶蛋白肽鏈上的一些基團(tuán)可與某種化學(xué)基團(tuán)發(fā)生可逆的共價(jià)結(jié)合,從而改變酶的活性,此過(guò)程稱(chēng)為共價(jià)修飾。13、酶原的激活及本質(zhì)酶原與酶原的激活:酶原酶在生物體內(nèi)首先合成出來(lái)的無(wú)活性前體。酶原的激活酶原必須在一定的條件下去掉一個(gè)或幾個(gè)特殊的肽鍵,從而使酶的構(gòu)象發(fā)生一定的變化,才有活性,這一過(guò)程稱(chēng)為酶原激活。激活的本質(zhì)或本質(zhì):酶的活性中心形成或
24、暴露的過(guò)程14、影響酶促反應(yīng)速度的因素:底物濃度S、酶濃度E、反應(yīng)溫度、pH 值、抑制劑、激活劑第八章1、能量流通的貨幣:ATP(ATP作用:是能量的攜帶者或傳遞者,而非貯存者, ATP是磷酸基團(tuán)的傳遞者。)2、新陳代謝、生物氧化的概念 (名詞解釋?zhuān)┬玛惔x概念:生物與外界環(huán)境進(jìn)行物質(zhì)交換與能量交換的全過(guò)程生物氧化的概念:有機(jī)物在生物體內(nèi)氧的作用下,生成H20和CO2并釋放出能量的過(guò)程。也稱(chēng)呼吸作用。水和二氧化碳的生成過(guò)程(1)CO2的生成 方式:糖、脂、蛋白質(zhì)等有機(jī)物經(jīng)一系列脫氫、加水反應(yīng),轉(zhuǎn)變成含羧基的中間化合物,然后在酶催化下脫羧而生成CO2。 類(lèi)型:直接脫羧和氧化脫羧(2)H2O的生成
25、 代謝物在脫氫酶催化下脫下的氫由相應(yīng)的氫載體(NAD+、NADP+、FAD、FMN等)所接受,再通過(guò)一系列遞氫體或遞電子體傳遞給氧而生成H2O 。3、電子傳遞鏈(呼吸鏈)的位置: 真核線粒體內(nèi)膜; 原核.細(xì)胞核) (填空) 呼吸鏈的五個(gè)成員 (填空題)(1)煙酰胺脫氫酶類(lèi)(2)黃素脫氫酶類(lèi)(3)鐵硫蛋白類(lèi)(4)輔酶Q類(lèi)(5)細(xì)胞色素類(lèi)4、呼吸鏈的分類(lèi):根據(jù)接受氫的初受體不同,典型的呼吸鏈有兩條NADH呼吸鏈和FADH2呼吸鏈5、線粒體內(nèi)膜.作用細(xì)胞內(nèi)的線粒體是生物氧化和氧化磷酸化的主要場(chǎng)所,Ø 線粒體內(nèi)膜向內(nèi)折疊形成嵴(cristae),擴(kuò)大了內(nèi)膜的面積。Ø 內(nèi)膜表面含有&
26、#252; 執(zhí)行氧化反應(yīng)的電子傳遞鏈ü ATP合成酶ü 線粒體內(nèi)膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白6、氧化磷酸化的抑制劑(4種);呼吸鏈阻斷劑、解偶聯(lián)劑、離子載體抑制劑、質(zhì)子通道阻斷劑 (懂得選那種抑制劑)第九章1、糖 (分為單糖、寡糖、多糖、結(jié)合糖) 血糖指葡萄糖體內(nèi)糖的來(lái)源內(nèi)源性:量少,不能滿足機(jī)體對(duì)能量的需要外源性:主要來(lái)自植物,從動(dòng)物性食物中攝入的糖量很少。嬰兒,乳汁中的乳糖是主要來(lái)源2、糖原分解的三個(gè)過(guò)程(三種酶)協(xié)同作用磷酸化酶(催化1.4-糖苷鍵斷裂)、轉(zhuǎn)移酶(催化寡聚葡萄糖片段轉(zhuǎn)移)、脫枝酶(催化1.6-糖苷鍵斷裂)糖的分解代謝一般指葡萄糖(1)需氧(2)不需氧1分子C6H12O6
27、 生成2分子丙酮酸,去路。丙酮酸葡萄糖“糖酵解”不需氧“磷酸戊糖途徑”需氧有氧情況缺氧情況好氧生物厭氧生物“三羧酸循環(huán)”“乙醛酸循環(huán)” CO2+ H2O“乳酸發(fā)酵”、“乙醇發(fā)酵”乳酸 CO2 + H2O乳酸或乙醇“乳酸發(fā)酵”3、糖酵解的位置和3個(gè)關(guān)鍵酶糖酵解的位置:糖酵解是在細(xì)胞質(zhì)中進(jìn)行。不論有氧還是無(wú)氧條件均能發(fā)生三個(gè)關(guān)鍵酶:6磷酸果糖激酶1、己糖激酶(或葡萄糖激酶)、丙酮酸激酶4、三羧酸循環(huán)的概念 (名詞解釋?zhuān)?關(guān)鍵酶因?yàn)樵谘h(huán)的一系列反應(yīng)中,關(guān)鍵的化合物是檸檬酸,所以稱(chēng)為檸檬酸循環(huán),又因?yàn)樗腥齻€(gè)羧基,所以亦稱(chēng)為三羧酸循環(huán), 簡(jiǎn)稱(chēng)TCA循環(huán)。三羧酸循環(huán)的關(guān)鍵酶是檸檬酸合酶、異檸檬酸脫氫酶
28、和a-酮戊二酸脫氫酶系5、三羧酸循環(huán)總圖 每完成一次循環(huán),氧化分解掉一份子乙酰輔酶A,可生成10分子ATP6、1分子蛋白質(zhì)經(jīng)過(guò)糖酵解生成7、活性葡萄糖又稱(chēng)尿苷二磷酸葡萄糖第十章b-氧化磷酸C3化合物丙酮酸乙酰輔酶A糖TCA甘油脂肪酸脂肪脂肪分解代謝總覽動(dòng)物體b-羥丁酸丙酮乙酰乙酰輔酶A乙酰乙酸1、食物中的脂肪是 脂肪 :分 甘油 、 脂肪酸 (填空)2、氧化分為3個(gè)步驟 (重點(diǎn)) : 脂肪酸活化為脂酰CoA(細(xì)胞液) 脂酰CoA轉(zhuǎn)運(yùn)進(jìn)入線粒體(限速步驟)載體:肉毒堿( L-羥基-三甲氨基丁酸)。肉毒堿脂酰轉(zhuǎn)移酶:CAT-:位于內(nèi)膜外側(cè),催化正反應(yīng),是限速酶。CAT-:位于內(nèi)膜內(nèi)側(cè),催化逆反應(yīng)。
29、 脂酰CoA的-氧化過(guò)程(線粒體)氧化過(guò)程包括四個(gè)循環(huán)步驟:氧化脫氫、水化(加水)、再氧化脫氫、硫解3、酮體代謝(饑餓的時(shí)候產(chǎn)生) 酮體:糖代謝非正常時(shí),在肝臟中脂肪酸經(jīng)b-氧化生成的乙酰CoA,大部分轉(zhuǎn)變?yōu)橐阴R宜帷羥丁酸和少量丙酮,這三種物質(zhì)統(tǒng)稱(chēng)為酮體。產(chǎn)生部位(肝臟線粒體)、的利用(肝外組織) 酮體過(guò)量 酮血癥或酸尿癥4、合成代謝的關(guān)鍵酶第十一章1、 氨基酸代謝2、 氨基酸分解的共同途徑:脫氨基作用、脫羧基作用 (選、填)3、 氨基酸產(chǎn)生的NH3以尿素的形式排出體外尿素合成的部位在肝臟第十二章1、 嘌呤核苷酸的分解代謝及分解代謝的產(chǎn)物是尿酸別嘌呤醇治療痛風(fēng)癥機(jī)理:1、抑制黃嘌呤氧化酶2
30、、反饋抑制嘌呤核苷酸從頭合成的酶系TMP合成:在胸苷酸合成酶催化下,由dUMP甲基化生成;甲基供體:N5,N10-甲烯FH4;dUMP來(lái)源:dUDP或dCMP2、 核苷酸的從頭合成 p3183、 嘧啶核苷酸的合成合成部位:主要在肝細(xì)胞液。原料:Gln、Asp、CO2、PRPP等合成方式:先合成嘧啶環(huán),再與磷酸核糖相連(與嘌呤核苷酸的合成不同)。關(guān)鍵的中間化合物:乳清酸。合成過(guò)程:先合成UMP,再轉(zhuǎn)變成其他嘧啶核苷酸。第十三章1、轉(zhuǎn)錄、復(fù)制、翻譯、逆轉(zhuǎn)錄 (名詞解釋?zhuān)?#183; 復(fù)制:以親代雙鏈DNA為模板,按照堿基互補(bǔ)配對(duì)的原則,合成出與親代DNA相同的子代DNA分子的過(guò)程。· 轉(zhuǎn)
31、錄:雙鏈DNA中的一條鏈為模板,按照堿基互補(bǔ)配對(duì)的原則,合成出與模板DNA互補(bǔ)的RNA分子的過(guò)程。· 翻譯: 在mRNA指令下,按照三個(gè)核苷酸(三聯(lián)體密碼子)決定一個(gè)氨基酸的原則,把mRNA上的遺傳信息轉(zhuǎn)換成蛋白質(zhì)中特定的氨基酸序列的過(guò)程。逆轉(zhuǎn)錄:病毒以RNA為模扳指導(dǎo)合成DNA的過(guò)程2、DNA鏈合成(復(fù)制)的條件、 參與DNA復(fù)制的條件 (底物、模板、引物、酶和蛋白質(zhì)因子 (大題)DNA鏈合成的條件(重點(diǎn))底物:dNTP (dATP, dGTP ,dCTP, dTTP)模板:?jiǎn)捂湹腄NA引物:寡核苷酸引物(RNA)酶和蛋白質(zhì)因子3、DNA聚合酶及分類(lèi):DNA輔酶、 的作用分類(lèi)看筆記 (大題)RNA的合成過(guò)程DNA聚合酶不是復(fù)制酶,而是修復(fù)酶DNA聚合酶活性,可以使DNA鏈沿5´3´方向延長(zhǎng),起始雙鏈DNA局部解開(kāi)磷酸二酯鍵形成終止階段解鏈區(qū)到達(dá)基因終點(diǎn)延長(zhǎng)階段3´ 5´核酸外切酶的活性,由3´端開(kāi)始水解DNA鏈;5´3´核酸外切酶的活性,由5´端開(kāi)始水解DNA鏈;DNA聚合酶DNA聚合酶是多亞基酶以dNTP為引物,從5´ 3´方向合成DNA有3´ 5´外切酶的活力,沒(méi)有5´ 3
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