腫瘤大數(shù)據(jù)人工智能創(chuàng)新應(yīng)用建設(shè)方案_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、腫瘤大數(shù)據(jù)人工智能創(chuàng)新應(yīng)用建設(shè)方案.項(xiàng)目概述隨著老齡化進(jìn)程的加快,我國(guó)癌癥發(fā)病、死亡率將不斷上升,國(guó)家、社會(huì)和個(gè)人經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)逐年遞增。腫瘤防診治刻不容緩?!笆濉?全國(guó)人口健康信息化發(fā)展規(guī)劃(國(guó)衛(wèi)規(guī)劃發(fā)(2017) 6號(hào))明確提出 集成基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等國(guó)家醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)資源,構(gòu)建心血管、腫 瘤等醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)示范中心的建設(shè)要求。因此構(gòu)建面向全院各臨床科室的 腫瘤大數(shù)據(jù)科研應(yīng)用平臺(tái),為采集、存儲(chǔ)、共享、分析、研究腫瘤診 療提供技術(shù)支撐十分必要。本次擬依托我院臨床數(shù)據(jù)中心(CDR)的 海量臨床數(shù)據(jù),整合院外隨訪數(shù)據(jù)、樣本庫(kù)數(shù)據(jù)、組學(xué)數(shù)據(jù),構(gòu)建宏 觀臨床表征數(shù)據(jù)+微觀基因組學(xué)數(shù)據(jù)、院內(nèi)數(shù)據(jù)+院外數(shù)據(jù)以及

2、臨床 +科研于一體的腫瘤大數(shù)據(jù)創(chuàng)新應(yīng)用平臺(tái),形成完整高質(zhì)量腫瘤大數(shù) 據(jù)科研庫(kù),協(xié)助臨床數(shù)據(jù)應(yīng)用和挖掘,推動(dòng)腫瘤疾病救治、科研工作、 精準(zhǔn)醫(yī)療等方面的應(yīng)用。條件允許下,進(jìn)一步聯(lián)合醫(yī)聯(lián)體內(nèi)部各成員 單位,采集醫(yī)院HIS、EMR、LIS等信息系統(tǒng)數(shù)據(jù),構(gòu)建融合多種信 息來(lái)源,并積極開(kāi)展多中心腫瘤臨床科研探索研究,最終構(gòu)建江蘇省 人民醫(yī)院集團(tuán)腫瘤大數(shù)據(jù)創(chuàng)新應(yīng)用平臺(tái),助力提升我院的臨床科研工 作效率,為科研提供數(shù)據(jù)支撐及研究新思路,實(shí)現(xiàn)科研與臨床相互支 撐、相互促進(jìn)。進(jìn)而深化醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)共性技術(shù)研究深度,形成臨床科研 成果共享機(jī)制。.建設(shè)方案.建設(shè)內(nèi)容清單(1)醫(yī)療數(shù)據(jù)集成與治理(2)醫(yī)療數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)管理(3)

3、基礎(chǔ)數(shù)據(jù)中心(4)數(shù)據(jù)檢索(5)統(tǒng)計(jì)分析(6)腫瘤大數(shù)據(jù)駕駛艙(7)腫瘤大數(shù)據(jù)全息視圖(8)腫瘤科研項(xiàng)目管理(9)腫瘤大數(shù)據(jù)隊(duì)列管理(10)腫瘤大數(shù)據(jù)隨訪管理(11)腫瘤專病數(shù)據(jù)庫(kù)(12)應(yīng)用平臺(tái)管理.總體設(shè)計(jì)(一)技術(shù)路線.應(yīng)用技術(shù)架構(gòu)要支持集群部署和負(fù)載均衡,支持模塊化設(shè) 計(jì)與開(kāi)發(fā),數(shù)據(jù)解析引擎支持流處理計(jì)算架構(gòu),前臺(tái)UI引擎支持組 件化編程;系統(tǒng)需采用B/S架構(gòu),純WEB版產(chǎn)品界面;.支持Linux和Windows操作系統(tǒng);.支持集成支持主流數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng),如ORACLE、MySQL、 PostgreSQL. SQLServe等;支持分布式關(guān)系數(shù)據(jù)庫(kù)支持大數(shù)據(jù)存儲(chǔ)和計(jì)算,能夠?qū)崿F(xiàn)一鍵水平伸縮

4、,多副本數(shù)據(jù)安全,支撐水平必須保 證10000用戶并發(fā)訪問(wèn)的性能要求;.支持容器編排的部署方案,具備完善應(yīng)用部署能力,提供 應(yīng)用部署管理平臺(tái)的界面和部署方案;.支持實(shí)時(shí)同步醫(yī)院各業(yè)務(wù)數(shù)據(jù),實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)完整、準(zhǔn)確與標(biāo) 準(zhǔn);.具備大數(shù)據(jù)存儲(chǔ)、計(jì)算、分析、服務(wù)能力,支持分布式文 件儲(chǔ)存、分布式計(jì)算,要求快速響應(yīng)海量數(shù)據(jù)查詢。.支持系統(tǒng)性能監(jiān)視,實(shí)現(xiàn)對(duì)設(shè)定的關(guān)鍵指標(biāo)進(jìn)行監(jiān)控,并 能可視化展示監(jiān)視情況。.支持HTTPS協(xié),議、SSL/TLS傳輸協(xié)議。(二)系統(tǒng)性能設(shè)計(jì).系統(tǒng)穩(wěn)定性要求:具備較強(qiáng)的魯棒性,支持7*24小時(shí)不間 斷運(yùn)行;.具有較精準(zhǔn)的自然語(yǔ)言處理(NLP)模型,且處理效率高。(三)數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)化設(shè)計(jì)

5、要求采用自然語(yǔ)言處理(NLP)技術(shù)對(duì)各類醫(yī)學(xué)文本進(jìn)行結(jié)構(gòu)化處 理。要求如下:.具備多種醫(yī)學(xué)文本類型的NLP處理模型,包括入院記錄、 病程錄、出院記錄、體格檢查、各類檢查報(bào)告等;.支持NLP結(jié)果的可視化展示,包括醫(yī)學(xué)實(shí)體、醫(yī)學(xué)關(guān)聯(lián)關(guān)系、醫(yī)學(xué)概念等展示,為今后構(gòu)建知識(shí)圖譜奠定基礎(chǔ);.支持文本變量溯源功能,能夠精準(zhǔn)定位并高亮展示抽取的變量在原文中的位置;.支持按專病模式批量提取多種病歷文本中的專病變量,以 患者為中心提取并展示病歷類型變量,并展示有效變量數(shù)量及占比;.支持術(shù)語(yǔ)檢索,滿足診斷字典、檢驗(yàn)、檢查、手術(shù)及操作、 藥品字典、治療等匹配模式;(6),支持快速檢索術(shù)語(yǔ),展示術(shù)語(yǔ)及其同義詞。能夠?qū)崿F(xiàn)

6、多層 級(jí)、多維度展示術(shù)語(yǔ)內(nèi)容;(7),支持人工干預(yù)上述的病歷類型、專病模式等關(guān)聯(lián)的NLP模 型,提供可視化增刪改的維護(hù)界面,優(yōu)化完善對(duì)應(yīng)的病歷類型、專病 模式提取的變量;(8).支持多種結(jié)構(gòu)化格式存儲(chǔ)。能夠?qū)⒎墙Y(jié)構(gòu)化的醫(yī)療文本中 提取的變量存儲(chǔ)成JSON、二維表等格式。(四)數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化設(shè)計(jì)系統(tǒng)要能夠在數(shù)據(jù)集成及整合過(guò)程進(jìn)行數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化,以更有效的 用于臨床科研。.遵循國(guó)際、國(guó)家、行業(yè)相關(guān)的行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范,通過(guò)各種數(shù) 據(jù)治理手段,結(jié)合標(biāo)準(zhǔn)的醫(yī)療術(shù)語(yǔ)的標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范管理,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn) 化;.實(shí)現(xiàn)科室、病區(qū)、診斷編碼、疾病、藥品、檢驗(yàn)、檢查、手 術(shù)及操作、治療等關(guān)鍵業(yè)務(wù)編碼的標(biāo)準(zhǔn)化和統(tǒng)一;.數(shù)據(jù)集成及整合過(guò)

7、程中符合科學(xué)研究標(biāo)準(zhǔn),具有完整性、自洽性、一致性;.支持提供統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)的對(duì)外數(shù)據(jù)服務(wù)及數(shù)據(jù)接口,滿足不同 業(yè)務(wù)場(chǎng)景需求及多源異構(gòu)的數(shù)據(jù)源。(五)數(shù)據(jù)與信息安全設(shè)計(jì).根據(jù)“數(shù)據(jù)不出院”的原則,采用院內(nèi)部署模式,數(shù)據(jù)存 儲(chǔ)及系統(tǒng)維護(hù)實(shí)現(xiàn)本地化,確保數(shù)據(jù)安全;.遵循醫(yī)院數(shù)據(jù)接入相關(guān)管理規(guī)定實(shí)現(xiàn)系統(tǒng)對(duì)接工作,只從 系統(tǒng)獲取數(shù)據(jù),原則上不回寫數(shù)據(jù),不影響、干擾醫(yī)院各項(xiàng)業(yè)務(wù)正常 開(kāi)展;.所有用戶的密碼均以不可逆加密方式存儲(chǔ)于數(shù)據(jù)庫(kù)中;(4),支持用戶的權(quán)限的設(shè)置:支持醫(yī)院管理人員管理各種角色、 用戶的功能權(quán)限、數(shù)據(jù)訪問(wèn)和使用權(quán)限的定義,支持對(duì)用戶及權(quán)限的 批量導(dǎo)入、導(dǎo)出、修改等批量操作功能;.支持操作日志的

8、記錄:記錄所有用戶的所有操作,記錄內(nèi) 容包括訪問(wèn)IP地址、操作時(shí)間、操作用戶名、操作內(nèi)容及涉及的模 塊、操作原因、操作方式等信息,滿足5W1H原則(when、where whowhat why how),對(duì)所有操作均可實(shí)現(xiàn)溯源追蹤;.支持患者去隱私管理:在應(yīng)用或系統(tǒng)設(shè)計(jì)時(shí)充分考慮患者相 關(guān)數(shù)據(jù)隱私保護(hù)政策,在滿足臨床科研需求同時(shí),有效保障患者隱私。2.3.系統(tǒng)功能設(shè)計(jì)(一)醫(yī)療數(shù)據(jù)集成與治理依托我院臨床數(shù)據(jù)中心(CDR)的海量臨床數(shù)據(jù),集成院外隨訪數(shù)據(jù)、樣本庫(kù)、組學(xué)數(shù)據(jù),構(gòu)建以患者為中心的腫瘤大數(shù)據(jù)創(chuàng)新應(yīng)用 平臺(tái)。.支持以CDC+ETL實(shí)現(xiàn)方式實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)集成,并實(shí)現(xiàn)非結(jié)構(gòu) 化數(shù)據(jù)向結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換

9、;.支持全量數(shù)據(jù)集成:患者臨床數(shù)據(jù)和科研數(shù)據(jù)全覆蓋,歷 史數(shù)據(jù)和實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)全覆蓋,數(shù)據(jù)實(shí)時(shí)采集方式須對(duì)被采集系統(tǒng)的數(shù)據(jù) 庫(kù)性能無(wú)影響;.支持不同數(shù)據(jù)類型的數(shù)據(jù)集成,如不同數(shù)據(jù)庫(kù)格式、文本 格式、XML格式、JSON格式等,支持結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)、半結(jié)構(gòu)化或非結(jié) 構(gòu)化數(shù)據(jù)的解析與融合;支持不同數(shù)據(jù)生成階段的數(shù)據(jù)集成:不同數(shù) 據(jù)生產(chǎn)階段對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行特異性加工,導(dǎo)致數(shù)據(jù)呈現(xiàn)時(shí)間維度的切面特 征,要求通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范統(tǒng)一的數(shù)據(jù)接口,實(shí)現(xiàn)不同數(shù)據(jù)生產(chǎn)階段數(shù)據(jù) 標(biāo)準(zhǔn)采集與集成;.支持?jǐn)?shù)據(jù)集成全生命周期的監(jiān)控與管理,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)管理標(biāo) 準(zhǔn)化、規(guī)范化,集成過(guò)程透明化、安全化,數(shù)據(jù)分析可視化。提供與 源數(shù)據(jù)庫(kù)核對(duì)校驗(yàn)機(jī)制,確保數(shù)據(jù)

10、集成過(guò)程中數(shù)據(jù)不丟失、不遺漏、 數(shù)據(jù)完整;支持問(wèn)題告警,確保第一時(shí)間解決問(wèn)題,保障數(shù)據(jù)完整性;.支持?jǐn)?shù)據(jù)內(nèi)涵校驗(yàn),保障數(shù)據(jù)質(zhì)量。提供可視化數(shù)據(jù)校驗(yàn) 規(guī)則配置功能,通過(guò)對(duì)獲取的數(shù)據(jù)內(nèi)容進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)性、規(guī)范性、完整性、 準(zhǔn)確性、一致性等多維度校驗(yàn),支持問(wèn)題告警,第一時(shí)間處理問(wèn)題, 保障數(shù)據(jù)質(zhì)量;.支持基于人工智能技術(shù)將集成的數(shù)據(jù)進(jìn)行結(jié)構(gòu)化、標(biāo)準(zhǔn)化 和歸一化處理,使之成為臨床科研直接利用與分析的數(shù)據(jù),包括:支 持基于自然語(yǔ)言處理技術(shù)的醫(yī)療文書類非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)治理;支持非標(biāo) 準(zhǔn)化概念與標(biāo)準(zhǔn)化概念間的映射轉(zhuǎn)換,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化應(yīng)用;.支持患者隱私信息脫敏技術(shù),包括結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)脫敏及半結(jié) 構(gòu)化、非結(jié)構(gòu)化的中文醫(yī)學(xué)文

11、本脫敏;.支持處理多種病歷類型的自然語(yǔ)言處理模型,支持自定義 變量拓展抽取,利用人工智能技術(shù)從醫(yī)學(xué)文本中提取復(fù)雜臨床科研變 量,并通過(guò)專家審核,滿足醫(yī)院深度腫瘤科研需求;.通過(guò)提供數(shù)據(jù)治理展示平臺(tái),支持直觀展示數(shù)據(jù)治理過(guò)程 和結(jié)果,主要包括:數(shù)據(jù)整體結(jié)果及數(shù)據(jù)質(zhì)量概覽,包括集成數(shù)據(jù)總 覽、結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)概覽和非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)概覽、數(shù)據(jù)質(zhì)量監(jiān)控報(bào)告細(xì)節(jié)展 示及下鉆上鉆分析;支持無(wú)數(shù)據(jù)、主數(shù)據(jù)、數(shù)據(jù)映射等展示;支持NLP 中文本語(yǔ)義理解模型展示;支持NLP變量提取結(jié)果展示及其原文溯 源;支持檢驗(yàn)、檢查、診斷、藥品等歸一化標(biāo)準(zhǔn)及結(jié)果查詢與展示; 數(shù)據(jù)問(wèn)題總覽及明細(xì)展示,包括數(shù)據(jù)問(wèn)題處理過(guò)程記錄,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)質(zhì)

12、量全生命周期管理。(二)醫(yī)療數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)管理將醫(yī)療數(shù)據(jù)分為醫(yī)療基礎(chǔ)數(shù)據(jù)和醫(yī)療指標(biāo)類數(shù)據(jù)。對(duì)于己結(jié)構(gòu)化 基礎(chǔ)數(shù)據(jù)或指標(biāo)類與國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)、國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)或行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)分別進(jìn)行映射, 從而實(shí)現(xiàn)己結(jié)構(gòu)化變量的標(biāo)準(zhǔn)化。.支持術(shù)語(yǔ)字典對(duì)照國(guó)家、國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)編碼完成映射,如診斷 名稱、癥狀名稱、檢驗(yàn)名稱、藥品名稱、檢查名稱、手術(shù)與操作等;.支持國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)臨床術(shù)語(yǔ)SNOMEDCT、LOINC、MedDRA、ICD-10編碼(國(guó)標(biāo)2.0版)等標(biāo)準(zhǔn)之間的對(duì)照映射。(三)基礎(chǔ)數(shù)據(jù)中心基礎(chǔ)數(shù)據(jù)中心存儲(chǔ)經(jīng)過(guò)數(shù)據(jù)治理后形成高質(zhì)量的結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù),同 時(shí)存儲(chǔ)半結(jié)構(gòu)化及非結(jié)構(gòu)化的初級(jí)數(shù)據(jù)?;A(chǔ)數(shù)據(jù)中心存儲(chǔ)的數(shù)據(jù)須 具備以下要求以滿足科研檢索、科研項(xiàng)目、

13、統(tǒng)計(jì)分析需要:.數(shù)據(jù)中心支持以分布式存儲(chǔ)數(shù)據(jù)(包括結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)、半結(jié) 構(gòu)化數(shù)據(jù)、非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù));.數(shù)據(jù)符合相關(guān)國(guó)際、國(guó)家及行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范,具備較強(qiáng)的標(biāo) 準(zhǔn)性;.以患者為中心的包括基本信息、病歷、檢驗(yàn)、檢查、治療、 手術(shù)、隨訪、樣本及CRF科研表單采集的數(shù)據(jù)等在內(nèi)的全生命周期 全量數(shù)據(jù),其中數(shù)據(jù)以結(jié)構(gòu)化為主,提升科研應(yīng)用效率;.數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)符合臨床研究視角,便于臨床科研分析利用。(四)數(shù)據(jù)檢索在進(jìn)行項(xiàng)目檢索、病例發(fā)現(xiàn)檢索、病歷檢索等操作時(shí),對(duì)輸入的 非結(jié)構(gòu)化檢索詞,能夠基于NLP技術(shù),使其進(jìn)行精確檢索,保證檢 索速度和準(zhǔn)確度,檢索結(jié)果快速響應(yīng),響應(yīng)時(shí)間應(yīng)在合理區(qū)間內(nèi),能 夠符合科研實(shí)際需求。檢索模塊滿足

14、以下功能需求:.支持變量樹(shù)的維護(hù)(非結(jié)構(gòu)化、結(jié)構(gòu)化)及常用變量、路 徑、搜索選擇;.支持清洗變量的數(shù)據(jù)可視化;(3),支持快速檢索,能夠?qū)⒓韧鶛z索歷史、檢索條件、變量選 擇存為模版,進(jìn)行記錄、展示及方便下一次快速檢索;支持模糊檢索, 能夠?qū)膊∶?、關(guān)鍵字、ICD編碼等在指定臨床文本中進(jìn)行模糊匹配;.支持對(duì)疾病名進(jìn)行歸一化搜索,能夠自動(dòng)提示輸入詞相應(yīng) 的歸一化檢索詞,即系統(tǒng)針對(duì)檢索條件和檢索結(jié)果具備一定的智能合 并,具有較高的召回率(Recall)、準(zhǔn)確率(Precision);.支持多維度條件關(guān)聯(lián)檢索,包括患者信息和診療信息等; 支持多條件復(fù)雜邏輯(如或、且、非)組合搜索;.支持病例的全文檢索

15、,可配置檢索條件為病人的全部或單 份病歷,可視化展示病人和滿足檢索條件的病歷;.支持對(duì)符合條件的病人和病歷信息進(jìn)行二次篩選(包括增、 刪、分組),并支持搜索結(jié)果的可視化圖表;.支持搜索結(jié)果訂閱,即當(dāng)有符合條件的新患者進(jìn)入系統(tǒng)可 將病人自動(dòng)加入指定隊(duì)列或科研項(xiàng)目;.支持搜索導(dǎo)出,將符合條件的病人及其變量導(dǎo)出到本地, 導(dǎo)出格式包括xls、xlsx、CSV、txt等,滿足SPSS、SAS等分析工具 分析要求,具備數(shù)據(jù)導(dǎo)出內(nèi)容和權(quán)限的分配和審批功能。(五)統(tǒng)計(jì)分析.支持?jǐn)?shù)據(jù)分析的預(yù)處理,包括缺失值填補(bǔ)、剔除文本、記 錄替換、變量分級(jí)、記錄合并、類別轉(zhuǎn)變量;.支持構(gòu)建單次與全量變量樹(shù),支持變量選擇,字段

16、搜索, 支持多變量互斥邏輯判定;支持自定義創(chuàng)建查詢,并具備增刪改功能, 同時(shí)能夠快捷準(zhǔn)確自定義篩選數(shù)據(jù),包括簡(jiǎn)單與高級(jí)篩選;.統(tǒng)計(jì)分析邏輯可以保存為模板,支持復(fù)用;.支持可視化導(dǎo)出查詢結(jié)果與分析結(jié)果,針對(duì)數(shù)據(jù)的分類模 型,定制每種分類數(shù)據(jù)的導(dǎo)出模式,基于關(guān)鍵事件處理、復(fù)雜邏輯 計(jì)算、自動(dòng)行列轉(zhuǎn)換、智能標(biāo)準(zhǔn)化值域輸出等技術(shù),替代統(tǒng)計(jì)學(xué)處 理前大量的手工數(shù)據(jù)處理工作,可導(dǎo)出Excel / CSV / SPSS / SAS等 多種格式,若設(shè)計(jì)階段采用CDISC等標(biāo)準(zhǔn),同樣于導(dǎo)出階段支持;.支持描述性、差異性分析、相關(guān)性分析、生存分析等統(tǒng)計(jì) 功能;支持包括Peaison卡方、Peaison校正卡方、F

17、ishei精確概率、 Ridit 分析、Wilcoxon 秩和檢驗(yàn)、Mami Wliitney U 檢驗(yàn)、Krnskal-Wallis H檢驗(yàn)、CMH檢驗(yàn)、t檢驗(yàn)、校正t檢驗(yàn)、單因素方差分析、LSD檢 驗(yàn)、Bonferroni 檢驗(yàn)、Turkey 檢驗(yàn)、ShapiioWilk 檢驗(yàn)、Spearman 相 關(guān)、KaplanMeiei檢驗(yàn)等常見(jiàn)醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)方法;.支持隨機(jī)森林、線性回歸、Logistic模型、COX回歸模型 等常用統(tǒng)計(jì)分析模型;.集成R語(yǔ)言等語(yǔ)言的執(zhí)行程序,滿足用戶自主編寫統(tǒng)計(jì)分 析程序的需求;.具備與SAS、SPSS、python等程序的對(duì)接,無(wú)需數(shù)據(jù)導(dǎo)出, 即可實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)在線聯(lián)機(jī)分析

18、;.具有腫瘤大數(shù)據(jù)及人工智能分析功能模塊,為科研分析提 供相關(guān)分析模型及方法支撐,支持包括CNN、RNN等分析模型及方 法;.支持分析結(jié)果的可視化與導(dǎo)出,如散點(diǎn)圖、頻數(shù)圖、折線 圖、森林圖等;.支持統(tǒng)計(jì)任務(wù)復(fù)用與修改,支持統(tǒng)計(jì)分析包的發(fā)布和共享;.支持?jǐn)?shù)據(jù)庫(kù)權(quán)限管理,分角色控制數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)讀寫。(六)腫瘤大數(shù)據(jù)駕駛艙科研駕駛艙實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)治理可視化,科研數(shù)據(jù)概覽,科研項(xiàng)目數(shù)據(jù) 概覽,醫(yī)院運(yùn)營(yíng)數(shù)據(jù)概覽等信息,為項(xiàng)目決策者提供決策支持,滿足 以下功能需求:.支持?jǐn)?shù)據(jù)概覽,包括患者人數(shù)、就診記錄數(shù)、門診記錄數(shù)、 住院記錄數(shù)展示;.支持?jǐn)?shù)據(jù)集成總覽和多維度展示,包括數(shù)據(jù)中心總記錄數(shù)、 就診數(shù)量展示以及根據(jù)時(shí)

19、間軸展示各數(shù)據(jù)項(xiàng)具體數(shù)據(jù)及同比、環(huán)比對(duì) 比增長(zhǎng);(3),支持患者主索引建設(shè),包括患者的基本信息、主索引數(shù)、 信息字段覆蓋率;.支持?jǐn)?shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)量展示,包括診斷、手術(shù)及操作、檢驗(yàn)、 檢查和藥品等標(biāo)準(zhǔn)化業(yè)務(wù)及歸一化數(shù)據(jù)量;.支持?jǐn)?shù)據(jù)結(jié)構(gòu)化數(shù)量展示,包括病歷文書、檢查報(bào)告結(jié)構(gòu) 化相關(guān)統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù);.支持?jǐn)?shù)據(jù)補(bǔ)全糾錯(cuò)數(shù)據(jù)展示,包括糾錯(cuò)和補(bǔ)全字段相關(guān)的 統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù);.支持患者特征概況展示,包括基本情況、診療情況、患者分布圖,展示全國(guó)地圖、遷徙省份toplO排名和本地患者就診率;.支持疾病譜相關(guān)信息展示。展示疾病/手術(shù)toplO排名及其 年齡、性別、地區(qū)等分布情況;.支持科研項(xiàng)目特征概況展示,包括科研項(xiàng)目列表、

20、項(xiàng)目領(lǐng) 域分布、項(xiàng)目狀態(tài)等。(七)腫瘤大數(shù)據(jù)全息視圖通過(guò)腫瘤大數(shù)據(jù)全息視圖,用戶從多個(gè)角度查詢、瀏覽和分析患 者數(shù)據(jù),從中發(fā)現(xiàn)潛在研究點(diǎn)。.支持展示模塊個(gè)性化配置,包括診斷記錄、就診記錄概要、 檢驗(yàn)檢查、藥物治療、手術(shù)治療、病歷文書等患者診療信息;(2),支持以患者為中心的多維度信息展示,包括患者基本信息、 歷次就診病史、門急診和住院診斷、檢驗(yàn)、檢查、用藥/非用藥醫(yī)囑、 病理、手術(shù)、病歷文書、病案首頁(yè)、體檢、生物樣本等集成域的數(shù)據(jù); 同時(shí)具備檢驗(yàn)指標(biāo)變化趨勢(shì)配置并可視化展示。(八)腫瘤科研項(xiàng)目管理腫瘤科研項(xiàng)目管理包括科研項(xiàng)目方案設(shè)計(jì)、項(xiàng)目設(shè)置、數(shù)據(jù)采集、 質(zhì)疑(任務(wù))管理、受試者列表及CRF展

21、示:.支持腫瘤科研項(xiàng)目的創(chuàng)建及信息編輯;.支持多種前瞻性和回顧性醫(yī)學(xué)研究設(shè)計(jì),并有對(duì)應(yīng)的研究 設(shè)計(jì)模板,包括現(xiàn)況研究、病例對(duì)照研究、隊(duì)列研究、隨機(jī)臨床實(shí)驗(yàn) 等;.支持流程圖的繪制工作,記錄研究項(xiàng)目重要節(jié)點(diǎn)及進(jìn)展情況;.支持腫瘤科研項(xiàng)目所需的病例報(bào)告表(CRF)的設(shè)計(jì)、編輯、 發(fā)布和控制,包括自定義CDISC等數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn),并根據(jù)研究設(shè)計(jì)進(jìn)行 隨訪/事件/時(shí)間的關(guān)聯(lián)設(shè)置,完成CRF制作;支持CRF智能采集: CRF篩選及數(shù)據(jù)對(duì)照填寫,具備數(shù)據(jù)錄入、修改、保存、提交、清空 功能;支持CRF中記錄數(shù)據(jù)變更、質(zhì)疑、核查等信息,標(biāo)識(shí)數(shù)據(jù)當(dāng) 前狀態(tài)以提醒用戶;.支持腫瘤科研項(xiàng)目研究對(duì)象的納入和分組,支持簡(jiǎn)單隨

22、機(jī) 化分組方法;.支持研究樣本量的計(jì)算,集成樣本量計(jì)算模塊;.支持研究基線信息相關(guān)變量選取的設(shè)置,包括患者基本信 息(性別、年齡)、基準(zhǔn)事件相關(guān)就診變量(是否患有某病)、基準(zhǔn)事 件相關(guān)事件變量(是否接受某種治療)、相關(guān)時(shí)間點(diǎn)或時(shí)間段等;.支持在記錄層級(jí)、變量層級(jí)進(jìn)行數(shù)據(jù)清洗以及分析型變量 的衍生;.支持腫瘤科研項(xiàng)目團(tuán)隊(duì)管理,包括團(tuán)隊(duì)成員的創(chuàng)建、修改、 刪除、以及權(quán)限分級(jí)、分角色管理;.支持腫瘤研究的多中心管理,包括多中心的增刪改等功能;.支持?jǐn)?shù)據(jù)核查與質(zhì)疑;具備系統(tǒng)核查及人工核查兩種方式。 提供數(shù)據(jù)質(zhì)疑管理,包括查看、回復(fù)、關(guān)閉、重啟、導(dǎo)出質(zhì)疑,并保 留數(shù)據(jù)稽查及修改痕跡;.支持腫瘤科研項(xiàng)目患

23、者管理,包括受試者(患者)基本信息預(yù)覽、患者篩選、患者添加珊邨余,進(jìn)入??埔晥D;.具備展示項(xiàng)目入組概覽和數(shù)據(jù)采集進(jìn)度的管理功能,具有 可視化報(bào)表功能;.支持研究過(guò)程中質(zhì)控方法的智能提示,如當(dāng)數(shù)據(jù)收集不完 整時(shí),提示研究者進(jìn)行數(shù)據(jù)補(bǔ)充,當(dāng)有多個(gè)數(shù)據(jù)來(lái)源不一致時(shí),能夠 提示研究者進(jìn)行審核查看;(15),支持腫瘤科研數(shù)據(jù)探索,可對(duì)科研項(xiàng)目數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)清洗, 數(shù)據(jù)查詢以及統(tǒng)計(jì)分析;(16).支持CRF前置嵌入醫(yī)生站等業(yè)務(wù)系統(tǒng),在醫(yī)生錄入病歷時(shí), 同步補(bǔ)全科研所需的差異數(shù)據(jù),從數(shù)據(jù)源頭把控?cái)?shù)據(jù),確保數(shù)據(jù)全面、 準(zhǔn)確、真實(shí)采集。(九)腫瘤大數(shù)據(jù)隊(duì)列管理隊(duì)列是一組符合某些特定條件或者具有某些一致特征的患者。

24、要 求系統(tǒng)能夠根據(jù)研究者設(shè)定的納入標(biāo)準(zhǔn)和排除標(biāo)準(zhǔn)實(shí)現(xiàn)患者的自動(dòng) 入組或手動(dòng)入組,并可視化圖表展示之。.支持科研隊(duì)列的新建、刪除、重命名以及規(guī)則配置等;.支持隊(duì)列中患者基線數(shù)據(jù)自動(dòng)采集及手動(dòng)修改補(bǔ)充,并展 示患者基線信息完善情況,提醒研究者及時(shí)進(jìn)行補(bǔ)充;(3),支持隊(duì)列中患者的可視化管理,可視化展示隊(duì)列內(nèi)病人信 息、病歷信息,患者的疾病、檢驗(yàn)、檢查、手術(shù)和用藥分布狀況;.支持隊(duì)列內(nèi)患者的高級(jí)篩選,支持批量添加患者或單個(gè)患者加入前瞻性研究或回顧性研究項(xiàng)目;.支持隊(duì)列內(nèi)數(shù)據(jù)導(dǎo)出,同時(shí)為管理員提供數(shù)據(jù)導(dǎo)出審核界面;.支持隊(duì)列內(nèi)研究對(duì)象的重新分組,如對(duì)患者進(jìn)行1:1傾向 性評(píng)分匹配(PSM)生成兩個(gè)隊(duì)列

25、;.支持韋恩圖應(yīng)用。支持韋恩圖展示多個(gè)隊(duì)列間患者,可視 化展示2個(gè)或3個(gè)隊(duì)列之間交、并、補(bǔ)關(guān)系;可通過(guò)選中韋恩圖生成 的新集合區(qū)域生成新的隊(duì)列,用于進(jìn)一步的科研;.支持預(yù)先配置規(guī)則。系統(tǒng)定時(shí)根據(jù)檢索條件篩選符合條件 的患者將其加入隊(duì)列。(十)腫瘤大數(shù)據(jù)隨訪管理科研隨訪管理以支撐以科研為目的數(shù)據(jù)收集,個(gè)性化配置隨訪表 單和方案,實(shí)現(xiàn)智能化的隨訪提醒和標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)采集,包括醫(yī)生web 端與患者微信端,滿足以下功能需求(支持與我院隨訪系統(tǒng)對(duì)接完成 下述功能):.支持隨訪表單自定義設(shè)置功能,包括隨訪類型、隨訪表單 和隨訪計(jì)劃的設(shè)置,根據(jù)不同病種研究需求自定義表單內(nèi)容;.支持隨訪計(jì)劃的管理和篩選,包括隨訪

26、計(jì)劃的展示和根據(jù) 隨訪患者姓名、所屬項(xiàng)目組、計(jì)劃隨訪時(shí)間、隨訪狀態(tài)等條件進(jìn)行篩 選;(3),支持人工及自動(dòng)發(fā)送隨訪消息(微信或短信)、推送隨訪表 單,同時(shí)具備個(gè)體及批量處理功能,患者可通過(guò)移動(dòng)設(shè)備、電腦等多 種方式填寫隨訪表單,表單數(shù)據(jù)自動(dòng)上傳至平臺(tái);.治理后的院內(nèi)數(shù)據(jù)可以根據(jù)隨訪計(jì)劃實(shí)現(xiàn)隨訪數(shù)據(jù)的自動(dòng) 填充,并增加手動(dòng)填充和修改的功能,支持隨訪數(shù)據(jù)維護(hù)的提醒功能;.支持利用移動(dòng)監(jiān)測(cè)設(shè)備記錄患者隨訪信息,如通過(guò)智能手 環(huán)收集患者的心率、血壓等信息,并集成到平臺(tái)中。(十一)腫瘤專病數(shù)據(jù)庫(kù)在腫瘤大數(shù)據(jù)創(chuàng)新應(yīng)用平臺(tái)上的基礎(chǔ)上構(gòu)建高質(zhì)量的腫瘤專病 數(shù)據(jù)庫(kù),在具備應(yīng)用平臺(tái)的通用功能基礎(chǔ)上,還需具備如下建

27、設(shè)要求:.專病數(shù)據(jù)集支持參考專業(yè)機(jī)構(gòu)臨床數(shù)據(jù)集、指南及專家共識(shí)、臨床路徑等, 結(jié)合國(guó)際主流研究方向及國(guó)內(nèi)現(xiàn)狀,定制符合研究需求的專病數(shù)據(jù)集: 支持個(gè)性化需求溝通,在專病范圍內(nèi)配合建立標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)集。.專病庫(kù)概況專病庫(kù)建設(shè)概覽,通過(guò)對(duì)數(shù)據(jù)集成、變量加工方式和結(jié)果的展示, 展現(xiàn)高質(zhì)量的專病數(shù)據(jù)庫(kù)概況,包括數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介、累計(jì)納入的患者和 病歷數(shù)、專病庫(kù)治理變量數(shù)、角色與權(quán)限、成員管理,并對(duì)其包括專 病庫(kù)名稱、所屬領(lǐng)域、項(xiàng)目標(biāo)簽等在內(nèi)的數(shù)據(jù)進(jìn)行配置。.可視化展示具備圖表形式的可視化綜合展示功能:支持展示治理過(guò)程中具有 代表性的科研變量,包括患者基本信息、就診記錄、癥狀、診斷、檢 驗(yàn)、檢查、藥物治療、生命體

28、征等重要特征信息,并可根據(jù)包括發(fā)病 年齡、診斷類別、就診類型、體重指數(shù)、用藥天數(shù)等條件針對(duì)性展示 具體內(nèi)容;按序展示專科病種相關(guān)統(tǒng)計(jì)指標(biāo)圖標(biāo),包括診斷歸一名稱 及相應(yīng)入庫(kù)患者數(shù)量。(4),患者入庫(kù)在數(shù)據(jù)集設(shè)計(jì)階段確認(rèn)專病數(shù)據(jù)庫(kù)的入排條件,實(shí)現(xiàn)符合條件的 患者自動(dòng)入庫(kù),同時(shí)具備人工審核干預(yù)功能,確保入庫(kù)患者數(shù)據(jù)質(zhì)量。.數(shù)據(jù)搜索支持根據(jù)科研域變量自定義檢索條件對(duì)專病庫(kù)患者進(jìn)行搜索,并 以患者維度進(jìn)行展示;支持針對(duì)專病數(shù)據(jù)庫(kù)定義變量的多個(gè)條件之間 的復(fù)雜組合邏輯(如或、且、非)搜索,并以圖表形式展示符合搜索 條件的患者數(shù)據(jù),搜索結(jié)果全面展示符合條件患者的各領(lǐng)域數(shù)據(jù),滿 足用戶進(jìn)一步深入研究檢索結(jié)果之需求;支持將符合搜索條件的患者 一鍵加入專病項(xiàng)目;支持對(duì)搜索結(jié)果進(jìn)行高級(jí)篩選并進(jìn)行導(dǎo)出,導(dǎo)出 數(shù)據(jù)支持?jǐn)?shù)據(jù)組合為一個(gè)患者一條和一個(gè)患者多條;導(dǎo)出格式包括 xlSs xlsx CSV txt等,能夠滿足SPSS、SAS等分析工具分析要求。.專病項(xiàng)目支持專病項(xiàng)目設(shè)置以及數(shù)據(jù)質(zhì)疑設(shè)置,支持專病項(xiàng)目數(shù)據(jù)導(dǎo)出與 數(shù)據(jù)探索。數(shù)據(jù)填充:支持專病庫(kù)數(shù)據(jù)集中已有數(shù)據(jù)自動(dòng)填充至專病 項(xiàng)目中;數(shù)據(jù)維護(hù):支持手動(dòng)錄入和修改數(shù)據(jù),并保留數(shù)據(jù)提交、修 改痕跡;質(zhì)疑管理:支持?jǐn)?shù)據(jù)核查與質(zhì)疑;滿足系統(tǒng)核查、人工核查 兩種核查方式;提供包括查看、回復(fù)、關(guān)閉、導(dǎo)出質(zhì)疑等在內(nèi)的數(shù)據(jù) 質(zhì)疑管理功能;支持

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