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1、第七章 蛋白質(zhì)的酶促 降解與氨基酸代謝第七章 蛋白質(zhì)的酶促降解 與氨基酸代謝第一節(jié) 蛋白質(zhì)的酶促降解第二節(jié) 氨基酸的分解與轉(zhuǎn)化第三節(jié) 氨基酸的生物合成第一節(jié) 蛋白質(zhì)的酶促降解一、蛋白水解酶 二、細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的水解三、蛋白質(zhì)降解的意義一、蛋白水解酶 國(guó)際生化協(xié)會(huì)命名委員會(huì)將作用于蛋白質(zhì)分子中肽鍵的酶歸屬于第三大類(水解酶類)第四亞類,該亞類又分二個(gè)亞亞類,即蛋白酶和肽酶(按酶的作用特點(diǎn)分類)。(一)蛋白酶(肽鏈內(nèi)切酶)水解肽鏈內(nèi)部的肽鍵胃蛋白酶、胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、枯草桿菌蛋白酶、彈性蛋白酶、木瓜蛋白酶、菠蘿蛋白酶。(二)肽酶(肽鏈外切酶)分別從多肽鏈游離的羧基端或游離的氨基端逐一地將肽鏈水
2、解成氨基酸(羧肽酶或氨肽酶)1、羧肽酶: 又分為A、B兩種: 羧肽酶A:水解中性氨基酸為羧基末端構(gòu)成的肽鍵。 羧肽酶B:水解由賴氨酸、精氨酸等堿性氨基酸為羧基末端構(gòu)成的肽鍵。2、氨肽酶: 水解氨基末端的肽鍵。3、二肽酶: 水解二肽氨基酸胃蛋白酶:芳香族aaNH2形成的肽鍵。胰蛋白酶:Lys或ArgCOOH形成的肽鍵(堿性,高度專一);Pro抑制水解。胰凝乳蛋白酶:芳香族aaCOOH形成的肽鍵, Leu、Met、His水解速度次之。Pro抑制水解。嗜鹽菌蛋白酶:疏水性強(qiáng)的殘基(Leu、Ile、Phe、Trp、Val、Tyr、Met);Pro或Gly不水解。溴化氰:Met(高度專一)二、細(xì)胞內(nèi)蛋白
3、質(zhì)的水解(一)、溶酶體系統(tǒng) 溶酶體的內(nèi)環(huán)境為酸性(約pH5),含有50多種蛋白酶。溶酶體通過(guò)吞噬將蛋白質(zhì)裹入,然后進(jìn)行水解。溶酶體對(duì)蛋白質(zhì)的水解是非選擇性的。(二)、泛素途經(jīng) 泛素系統(tǒng)可以選擇性的水解蛋白質(zhì)。該途徑要求被降解的目標(biāo)蛋白首先進(jìn)行泛素化標(biāo)記,然后降解。 泛素是一類小分子單體蛋白,含有76個(gè)氨基酸殘基,保守性很強(qiáng),因廣泛存在于真核細(xì)胞而得名。二、細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的水解(二)、泛素途經(jīng)過(guò)程 1、目標(biāo)蛋白的泛素化標(biāo)記 泛素對(duì)目標(biāo)蛋白的靶向 標(biāo)記由3個(gè)酶催化完成: 泛肽活化酶(E1) 泛素?cái)y帶蛋白(E2) 泛素-蛋白連接酶(E3)二、細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的水解(二)、泛素途經(jīng) 2、泛素化蛋白的降解 泛
4、素化蛋白水解在26S蛋白酶體中完成。蛋白酶體是一種存在于細(xì)胞質(zhì)中的多亞基蛋白,目標(biāo)蛋白被水解產(chǎn)生約7-9個(gè)氨基酸殘基的肽段,然后再被細(xì)胞質(zhì)中的肽鏈外切酶水解為氨基酸。 三、蛋白質(zhì)降解的意義1、形成新組織:用于新蛋白質(zhì)的合成,進(jìn)行新陳代謝(自我更新)。2、參加其它代謝:進(jìn)一步降解氧化或轉(zhuǎn)化成他物質(zhì)。第二節(jié) 氨基酸的分解與轉(zhuǎn)化氨基酸在細(xì)胞內(nèi)的代謝途徑有多種:1、經(jīng)生物合成形成蛋白質(zhì)。(作為蛋白質(zhì)合成的原料)2、進(jìn)行分解代謝: 因?yàn)榘被岱肿佣加邪被汪然虼烁鞣N氨基酸都具有共同的代謝途徑: a.脫氨基形成酮酸 糖和脂肪 b.脫羧基一級(jí)胺由于氨基酸側(cè)鏈不同,每種氨基酸還有其特殊的代謝途徑。一、脫氨
5、基作用二、氨基酸分解產(chǎn)物的去向三、脫羧基作用第二節(jié) 氨基酸的分解與轉(zhuǎn)化一、脫氨基作用1、氧化脫氨基作用(普遍存在于動(dòng)、植物) 在有氧作用下,氨基酸進(jìn)行氧化脫氨作用,產(chǎn)物是-酮酸和氨。(每消耗1分子氧,產(chǎn)生2分子-酮酸和2分子氨)。谷氨酸脫氫酶在動(dòng)、植物體內(nèi)分布廣泛,且活性及專一性很強(qiáng),只對(duì)L-谷氨酸起催化作用。2、轉(zhuǎn)氨基作用-AA和-酮酸之間氨基的轉(zhuǎn)移作用,是氨基酸脫去氨基的一種重要形式。催化轉(zhuǎn)氨基作用的酶叫轉(zhuǎn)氨酶或氨基轉(zhuǎn)移酶,種類繁多分布廣泛。輔基均為磷酸吡哆醛(B6的磷醛酯) 轉(zhuǎn)氨作用 谷草轉(zhuǎn)氨酶谷丙轉(zhuǎn)氨酶1122轉(zhuǎn)氨+氧化脫氨 一般氨基酸不直接氧化脫氨,而是先與-酮戊二酸通過(guò)轉(zhuǎn)氨形成相應(yīng)
6、的a-酮酸和谷氨酸,谷氨酸再通過(guò)谷氨酸脫氫酶氧化脫氨。3、聯(lián)合脫氨基作用4、非氧化脫氨主要在微生物中進(jìn)行。其方式有以下幾種:還原脫氨基 脫水脫氨基裂解脫氨基5、脫酰胺基作用二、氨基酸分解產(chǎn)物的去向(一)NH3的去路1、重新形成氨基酸 2、形成酰胺(消除NH3毒害,貯存NH3) 生成Gln和Asn,一方面是生物體貯藏和運(yùn)輸氨的主要形式,也是解除氨毒害的最主要途徑。 3、生成銨鹽,保持細(xì)胞pH 4、生成尿素4、尿素循環(huán) 在哺乳動(dòng)物體內(nèi),氨的主要去路是在肝臟中合成尿素并隨尿排出體外。在部分植物體內(nèi)尿素的形成既能解除氨毒,又是氨的一種貯存形式。 (二)-酮酸的代謝去路(C架的去路) 1、轉(zhuǎn)化為丙酮酸2
7、、轉(zhuǎn)化為草酰乙酸3、轉(zhuǎn)化為-酮戊二酸4、轉(zhuǎn)化為琥珀酰CoA5、降解為乙酰CoA和乙酰乙酸6、降解為延胡索酸和乙酰乙酸7、提供一碳單位 一碳基團(tuán)、生糖氨基酸、生酮氨基酸 p269一碳基團(tuán)p267在氨基酸代謝過(guò)程中,可以分解產(chǎn)生具有一個(gè)碳原子的基團(tuán),稱為“一碳基團(tuán)”或“一碳單位”。 輔酶:FH4(四氫葉酸)一碳轉(zhuǎn)移過(guò)程中起輔酶作用。 生物學(xué)意義:(1)一碳基團(tuán)的轉(zhuǎn)移與許多氨基酸代謝有直接關(guān)系。例Gly、Ser、Thr、His等都可作為一碳基團(tuán)的供體。(2)參與嘌呤和胸腺嘧啶的生物合成(3)參與生物體內(nèi)許多活性物質(zhì)的生物合成,例:肌酸、卵磷脂、S-腺苷蛋(甲硫)氨酸(SAM)等的生物合成,都和一碳基
8、團(tuán)的轉(zhuǎn)移有關(guān)。這些化合物中都含有活性甲基。 常見一碳基團(tuán): 甲基 -CH3 亞甲基 -CH2- 次甲基 -CH= 甲?;?CHO 羥甲基 -CH2OH 亞氨甲基 -CH=NH 三、脫羧基作用1、直接脫羧基作用 氨基酸在脫羧酶作用下,進(jìn)行脫羧反應(yīng)生成胺類化合物,脫羧酶輔酶為磷酸吡哆醛。廣泛存在于動(dòng)、植、微生物中2、羥化脫羧基作用 Tyr在Tyr酶催化下發(fā)生羥化作用生成3,4二羥苯丙氨酸(多巴),后者進(jìn)一步脫羧生成3,4二羥苯乙胺(多巴胺)。多巴進(jìn)一步氧化后形成聚合物黑素。馬鈴薯、蘋果、梨、切開長(zhǎng)時(shí)間暴露空氣變黑,形成黑色素。人體的表皮基底層及毛囊中有成黑素細(xì)胞,可將酪氨酸轉(zhuǎn)變?yōu)楹谒?,使皮膚毛發(fā)呈
9、黑色(可吸收紫外光)。白化病人:缺酪氨酸酶。第三節(jié) 氨基酸的生物合成一、氨的來(lái)源二、S的來(lái)源:硫酸的還原 三、C架的來(lái)源四、氨的同化五、氨基酸的合成一、氨的來(lái)源植物:生物固氮 、NO3-N還原、含N有機(jī)物分解動(dòng)物:主要來(lái)源是AA的脫氨基作用,此外嘌呤嘧啶的分解也生成氨。(一)、生物固氮1、固氮微生物把N2NH3的過(guò)程。固氮反應(yīng)固氮酶 :鐵蛋白:電子供體與鉬鐵蛋白之間的電子傳遞體。能提供高還原能力的電子 鉬鐵蛋白 :利用鐵蛋白傳來(lái)的電子還原N2或其它底物形成NH3等還原物PiADPHNHHeATPN+-16210816242固氮酶固氮條件:還原劑: 鐵氧還蛋白(Fd)、黃素氧還蛋白(Fld)、N
10、ADPH、Na2S2O4。 ATP厭氧條件2、固氮過(guò)程中的氫代謝 固氮生物種催化氫代謝的酶:固氮酶、可逆性氫酶和單向性氫酶(吸氫酶) 固氮酶:能催化還原H+生成H2。(當(dāng)有N2時(shí),H+和N2的還原同時(shí)進(jìn)行。所以H+是N2的競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑。)不受CO抑制,需ATP??赡嫘詺涿福捍呋赡娣艢浞磻?yīng) 2H+ +2e- H2,一般生理?xiàng)l件下放H2 ,除去過(guò)剩還原力,保證細(xì)胞正常生理活動(dòng)。不需ATP,受CO抑制。 單向性氫酶:催化 需ATP,KCN抑制。H2OOH2生物固氮的意義意義:有益于生物固氮H2氧化生成ATP,用于固氮。吸氫酶催化的羥化反應(yīng)消耗大量O2,從而保護(hù)固氮酶系統(tǒng)免受O2的破壞吸氫酶防止H2
11、的積累,避免H2對(duì)固氮酶的抑制H2的利用可間接產(chǎn)生還原力。(二)NO3-N還原植物體所需要的氮素營(yíng)養(yǎng)除了生物固氮外,絕大部分來(lái)自土壤中的氮素,主要是植物吸收土壤中的NO3-在硝酸還原酶和亞硝酸還原酶的作用形成氨。 2e- 6e- NO3- NO2- NH4+ 硝酸還原酶 亞硝酸還原酶 1、硝酸還原酶誘導(dǎo)酶,環(huán)境中須有NO3-,需光照條件。根據(jù)反應(yīng)中電子供體不同又分為:鐵氧還蛋白硝酸還原酶NAD(P)H硝酸還原酶OHFdNOHFdNO223222+-+-氧化態(tài)還原態(tài)()()OHPNADNOHHPNADNO223+-+-2、亞硝酸還原酶 正常情況下,NO2-在植物細(xì)胞內(nèi)很少積累,很快在亞硝酸還原酶
12、催化下,進(jìn)一步還原成氨。 NO2- + 7H+ + 6e- NH3 + 2H2O 電子供體:Fd(鐵氧還蛋白) NAD(P)H 二、S的來(lái)源:硫酸的還原細(xì)胞、藻類、高等植物能吸收SO42-在體內(nèi)還原成H2S,用于含硫氨基酸的合成。動(dòng)物中不存在。 (一)硫酸離子的活化:活化分兩步:(二)還原APS或PAPS的還原可以有不同的途徑,在小球藻和高等植物內(nèi),APS將其磺?;D(zhuǎn)移給一個(gè)含巰基的載體,再被鐵氧還蛋白還原成載體-S-SH,即可用于合成半胱氨酸。載體 SH或 載體 載體S SH 三、C架的來(lái)源來(lái)源于糖酵解、三羧酸循環(huán)、PPP途徑、光呼吸、乙醛酸循環(huán)等途徑代謝中間產(chǎn)物。四、氨的同化 在氮素循環(huán)中
13、,生物固氮和硝酸鹽還原形成了無(wú)機(jī)態(tài)氨,進(jìn)一步氨便被同化轉(zhuǎn)變成含氮有機(jī)化合物。生物體內(nèi)有兩種方式同化氨。 p2701、谷氨酸合成途徑(1)谷氨酰胺合成酶和谷氨酸合酶催化合成,現(xiàn)有試驗(yàn)證明,谷氨酸的合成,主要通過(guò)這條雙酶途徑催化的。(2)非主要途徑2、氨甲酰磷酸的形成 有二種酶能催化 NH3、CO2、ATP共同合成氨甲酰磷酸氨甲酰激酶 氨甲酰磷酸合成酶ADPPi五、氨基酸的合成(一)氨基酸的合成與轉(zhuǎn)氨基作用在轉(zhuǎn)氨酶的作用下,谷氨酸的氨基轉(zhuǎn)給其它-酮酸,形成相應(yīng)的氨基酸。轉(zhuǎn)氨酶催化可逆反應(yīng),即在氨基酸分解代謝起作用,也在氨基酸合成代謝中起作用。 (二)個(gè)別氨基酸的合成1、谷氨酸族(Glu Gln Pro Arg)c架:-戊酮二酸(TCA循環(huán)) -戊酮二酸谷氨酸谷氨酰胺脯氨酸精氨酸GluPro的過(guò)程如下 GluArg2、絲氨酸族(Ser、Gly、Gys)C架:3-磷酸 甘油酸 (EMP及光合碳循環(huán))乙醛酸(光呼吸乙醇途徑)3、天冬氨酸族(Asp Asn Lys Ile Thr Met) C架:
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