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文檔簡介
生存分析SPSS過程
(SPSSofSurvivalAnalysis)
鄒莉玲預(yù)防醫(yī)學(xué)教研室生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第1頁!1.何為生存分析?
生存分析(survivalanalysis)是將事件的結(jié)果(終點事件)和出現(xiàn)結(jié)果經(jīng)歷的時間結(jié)合起來分析的一種統(tǒng)計分析方法。2.生存分析的目的:描述生存過程:估計不同時間的總體生存率,計算中位生存期,繪制生存函數(shù)曲線。統(tǒng)計方法包括Kaplan-Meier(K-M)法、壽命表法。比較:比較不同處理組的生存率,如比較不同療法治療腦瘤的生存率,以了解哪種治療方案較優(yōu)。統(tǒng)計方法log-rank檢驗等。影響因素分析:研究某個或某些因素對生存率或生存時間的影響作用。如為改善腦瘤病人的預(yù)后,應(yīng)了解影響病人預(yù)后的主要因素,包括病人的年齡、性別、病程、腫瘤分期、治療方案等。統(tǒng)計方法cox比例風險回歸模型等。預(yù)測:建立cox回歸預(yù)測模型。生存分析的理論復(fù)習生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第2頁!生存分析(SurvivalAnalysis)菜單生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第3頁!壽命表(LifeTables)過程Lifetables過程用于(小樣本和大樣本資料):估計某生存時間的生存率,以及中位生存時間。繪制各種曲線:如生存函數(shù)、風險函數(shù)曲線等。對某一研究因素不同水平的生存時間分布的比較??刂屏硪粋€因素后對研究因素不同水平的生存時間分布的比較。對多組生存時間分布進行兩兩比較。(比較總體生存時間分布采用wilcoxon檢驗)生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第4頁!CompanyLogo一、建立數(shù)據(jù)文件(data-01.sav)定義5個變量:生存時間變量:t,值標簽“生存時間(月)”生存狀態(tài)變量:status,取值“1=死亡,0=刪失或存活”頻數(shù)變量:freq,值標簽“人數(shù)”分組變量:group,取值“1=甲組,2=乙組”生存時間序號變量(可無):i生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第5頁!三、主要輸出結(jié)果10月生存率的估計:
甲法48%,標準誤0.1
乙法30%,標準誤0.1
兩組的中位生存期估計:生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第6頁!CompanyLogo4.兩組生存時間分布的比較:生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第7頁!CompanyLogo實例分析例2:(數(shù)據(jù)同例1)為了比較不同手術(shù)方法治療腎上腺腫瘤的療效,某研究者隨機將43例病人分成兩組,甲組23例、乙組20例的生存時間(月)如下所示:其中有“+”者是刪失數(shù)據(jù),表示病人仍生存或失訪,括號內(nèi)為死亡人數(shù)。(1)計算甲、乙兩法各生存時間的生存率和標準誤。(2)估計兩組的中位生存期。(3)繪制各組生存函數(shù)曲線。(4)比較兩組的總體生存時間分布有無差別。生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第8頁!二、操作過程2)水平間的兩兩比較。6.單擊Save按鈕,彈出保存新變量Savenewvariables對話框:√√√生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第9頁!3.繪制生存曲線:生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第10頁!Cox回歸過程Cox回歸過程用于:
1.多個因素對生存時間的影響作用分析和比較2.生存(或死亡)風險預(yù)測生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第11頁!NoX1X2X3X4X5X6tYNoX1X2X3X4X5X6tY1540011052033620001012002570100051034401110140135800011351355010010261443111101030363311000120054801000713757111001200640010006003848100101200744010005803928000103183600011291405410110120193911101700413501011711042010016704247000101811142010006604349101101200124210110870444301000120013511110085045481100015114550100182046440001041154911101760476011100120016521110174048400001016117481110063049320100124118541011110105044000111911938010001000514810010120020401110166152720101024121380001093053420001021221900010241546310110120023671011093055550110012124370011090056390001051254310010151574400010120026490001031584211100120027501111187059740001171285311100120060610101040129321110012006145101101080304601001120062380100024131431011012006362000101613244101101200表17-963名某惡性腫瘤患者的生存時間(月)及影響因素生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第12頁!二、操作過程
主對話框參數(shù)設(shè)置:時間time框:選入“t”。狀態(tài)status框:選入“y”,擊defineevents鈕,在singlevalue框填入“1”協(xié)變量Covariates框:選入“x1~x6”。方法Method框:選擇自變量進入Cox模型的方法,SPSS提供以下7種方法。√√生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第13頁!2-1.模型檢驗(全變量模型)結(jié)果提示:(1)對模型總體檢驗有顯著意義(P=0.003),即至少有1個自變量的總體回歸系數(shù)不為0。生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第14頁!3.參數(shù)估計(逐步回歸模型,Method=向前法LR,自變量進入P≤0.05,剔除P>0.10)B:偏回歸系數(shù),SE:偏回歸系數(shù)的標準誤Wald:用于檢驗總體偏回歸系數(shù)與0有無顯著差異,v=1時,W=(B/SE)2。Exp(B):相對危險度估計(RR值)(3)X4(治療方式)對生存時間有影響,采用新療法病人的死亡風險降至傳統(tǒng)療法的17.2%(RR的95%CI為0.059~0.503)。(4)X5(淋巴結(jié)是否轉(zhuǎn)移)對生存時間也有影響,有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移病人的死亡風險為無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移病人的2.538倍(RR的95%CI為1.062~6.066)。生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第15頁!5.生存曲線(選入2個變量的模型)生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第16頁!練習2:某研究者隨訪收集了某地男性心絞痛患者2418例,其生存時間數(shù)據(jù)整理后見表2。(1)建立SPSS數(shù)據(jù)文件。(2)估計該地男性心絞痛患者的2年生存率和標準誤,以及中位生存期。生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第17頁!CompanyLogo實例分析例1:為了比較不同手術(shù)方法治療腎上腺腫瘤的療效,某研究者隨機將43例病人分成兩組,甲組23例、乙組20例的生存時間(月)如下所示:其中有“+”者是刪失數(shù)據(jù),表示病人仍生存或失訪,括號內(nèi)為死亡人數(shù)。(1)計算甲、乙兩法術(shù)后10月的生存率和標準誤。(2)估計兩組的中位生存期。(3)繪制各組生存函數(shù)曲線。(4)比較兩組的總體生存時間分布有無差別。生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第18頁!二、操作過程主菜單:分析Analyze生存Survival壽命表Lifetables對話框參數(shù)設(shè)置:時間time框:選入“t”。顯示時間間隔Displaytimeintervals框:步長by前面填入最大生存時間的上限(必須包括生存時間最大值),步長by后面填入生存時間的組距。本例上限填“60”,組距填“1”。狀態(tài)status框:選入“status”,擊defineevents鈕,在singlevalue框填入“1”因子factor框:選入“group”,定義最小值“1”,最大值“2”。單擊選項option按鈕,彈出對話框:1)√壽命表,系統(tǒng)默認。2)圖:√生存函數(shù)3)比較個因子的水平:√整體比較生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第19頁!CompanyLogo3.繪制生存曲線:生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第20頁!Kaplan-Meier過程Kaplan-Meier過程用于(尤其小樣本資料):估計各生存時間的生存率以及中位生存時間。繪制各種曲線:如生存函數(shù)、風險函數(shù)曲線等。比較某研究因素不同水平的生存時間有無差異??刂颇硞€分層因素后對研究因素不同水平的生存時間分布進行比較。對多組生存時間分布進行兩兩比較。(各總體分布比較采用Log-rank等非參數(shù)方法)生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第21頁!一、建立數(shù)據(jù)文件(同前)二、操作過程主菜單:分析Analyze生存SurvivalKaplan-Meier對話框參數(shù)設(shè)置:時間time框:選入“t”。狀態(tài)status框:選入“status”,擊defineevents鈕,在singlevalue框填入“1”。因子factor框:選入“group”。單擊選項option按鈕,彈出對話框:1)統(tǒng)計量:√生存分析表,系統(tǒng)默認?!叹岛椭形簧鏁r間,系統(tǒng)默認。2)圖:√生存函數(shù)5.單擊比較因子CompareFactor按鈕,彈出對話框:1)檢驗統(tǒng)計量TestStatistics:
都用于檢驗時間分布是否相同。√對數(shù)秩Log-rank:各時間點的權(quán)重一樣。Breslow:按各時間點的觀察例數(shù)賦權(quán)。Tarone-Ware:按各時間點觀察例數(shù)的平方根賦權(quán)。生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第22頁!三、主要輸出結(jié)果生存表:略
兩組的中位生存期估計:生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第23頁!CompanyLogo4.兩組生存時間分布的比較:生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第24頁!實例分析例3:為探討某惡性腫瘤的預(yù)后,某研究者收集了63例患者的生存時間、生存結(jié)局及影響因素。影響因素包括病人年齡、性別、組織學(xué)類型、治療方式、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、腫瘤浸潤程度,生存時間以月計算。變量的賦值和所收集的資料分別見表17-8和表17-9。試用Cox回歸模型進行分析。生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第25頁!一、建立數(shù)據(jù)文件(data-03.sav)二、操作過程主菜單:分析Analyze生存SurvivalCoxRegressionCox回歸主對話框生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第26頁!1.分析例數(shù)描述三、主要輸出結(jié)果生存分析SPSS單因素和多因素對生存率的可能分析共31頁,您現(xiàn)在瀏覽的是第27頁!2-2.模型檢驗(逐步回歸模型,Method=向前法LR,自變量進入P≤0.05,剔除P>0.10)(2)采用逐步回歸法進行Cox模型分析的結(jié)果提示:模型擬合自變量進入和剔除的檢
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