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文檔簡介

第十一章真核生物的基因表達調(diào)控1.真核基因表達調(diào)控的特點2.DNA染色體水平的調(diào)控3.真核基因轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控4.翻譯水平的調(diào)節(jié)因素及其調(diào)節(jié)

真核生物基因表達的調(diào)控是當前分子生物學中最活躍的研究領域之一。人們已經(jīng)能夠利用許多過去不曾具備的先進儀器設備等手段來研究許多分子生物學方面的重大問題,使我們能從分子水平上認識許多復雜的基因表達過程。11.1真核基因表達調(diào)控的特點

真核基因表達調(diào)控的許多基本原理與原核生物基因(以下稱原核基因)相同。主要表現(xiàn)在:①與原核基因的調(diào)控一樣,真核基因表達調(diào)控也有轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控和轉(zhuǎn)錄后的調(diào)控,并且也以轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控為最重要;②在真核結(jié)構(gòu)基因的上游和下游(甚至內(nèi)部)也存在著許多特異的調(diào)控成分,并依靠特異蛋白因子與這些調(diào)控成分的結(jié)合與否調(diào)控基因的轉(zhuǎn)錄。

真核生物和原核生物在基因表達調(diào)控上的區(qū)別是由兩者生活方式的不同所決定的。在真核基因表達調(diào)控中至少有4個方面與原核基因表達調(diào)控不同:①原核細胞的染色質(zhì)是裸露的DNA,而真核細胞染色質(zhì)則是由DNA與組蛋白緊密結(jié)合形成的核小體。在原核細胞中染色質(zhì)結(jié)構(gòu)對基因的表達沒有明顯的調(diào)控作用,而在真核細胞中這種作用十分明顯;②在原核基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控中,既有激活物參與的正調(diào)控,也有阻遏物參與的負調(diào)控,二者同等重要。真核細胞中雖然也有正調(diào)控成分和負調(diào)控成分,但主要是正調(diào)控,且一個真核基因通常有多個調(diào)控序列,必須有多個激活物同時特異地結(jié)合上去才能調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄。③原核基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯通常是相互偶聯(lián)的,即在轉(zhuǎn)錄尚未完成之前翻譯便已開始。真核基因的轉(zhuǎn)錄與翻譯在時空上是分開的,從而使真核基因的表達有多種調(diào)控機制,其中許多機制是原核細胞所沒有的;④真核生物大都為多細胞生物,在個體發(fā)育過程中發(fā)生細胞分化后,不同細胞的功能不同,基因表達的情況也就不一樣,某些基因僅特異地在某種細胞中表達,稱為細胞特異性或組織特異性表達,因而具有調(diào)控這種特異性表達的機制。11.2DNA染色體水平的調(diào)控

每個真核細胞所攜帶的基因數(shù)量及總基因組中蘊藏的遺傳信息量都大大高于原核生物。。基因組DNA中基因之間存在許多重復序列、基因內(nèi)部有大量不編碼蛋白質(zhì)的序列、真核生物的DNA常與蛋白質(zhì)(包括組蛋白和非組蛋白)結(jié)合形成十分復雜的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、染色質(zhì)構(gòu)象的變化、染色質(zhì)中蛋白質(zhì)的變化以及染色質(zhì)對DNA酶敏感程度的不同等,都直接影響著真核基因的表達調(diào)控。

真核細胞基因表達調(diào)控在DNA和染色體水平上主要有以下幾個方面:染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)、DNA在染色體上的位置、基因拷貝數(shù)的變化、基因重組、基因擴增、基因丟失、基因重排、DNA修飾等。11.2.1染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)

在間期細胞中以核小體為基本單位的染色質(zhì)是真核基因組DNA的主要存在方式。DNA盤繞組蛋自核心形成核小體,妨礙了與轉(zhuǎn)錄因子及RNA聚合酶的靠近和結(jié)合。使基因的活性受到抑制。

但這種作用可以通過改變?nèi)旧|(zhì)結(jié)構(gòu)來調(diào)節(jié)。染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的一系列重要變化可以暴露順式作用元件及其鄰近區(qū)域,使轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合并起始轉(zhuǎn)錄。DNA(2nm)核小體(10nm)一級結(jié)構(gòu)螺旋管(30nm,6個核小體)二級結(jié)構(gòu)超螺旋管(0.4μm)三級結(jié)構(gòu)染色單體(2μm)四級結(jié)構(gòu)

細胞內(nèi)的染色質(zhì)分為活性的和非活性的染色質(zhì),絕大多數(shù)細胞在特定階段只有不到10%的基因具有轉(zhuǎn)錄活性,多數(shù)基因處于非活性狀態(tài)。活性染色質(zhì)區(qū)域結(jié)構(gòu)疏松,便于結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子并有利于RNA聚合酶沿模板的滑動。在轉(zhuǎn)錄起始區(qū)及某些特殊區(qū)域,核小體構(gòu)象的變化更為明顯。

DNaseI、II和微球菌核酸酶等非特異性內(nèi)切酶可用于檢測核小體構(gòu)象的變化。染色質(zhì)能被DNaseI降解為酸溶性小片段,但由于核小體結(jié)構(gòu)的保護,其對酶的攻擊仍具有一定的耐受性,敏感區(qū)僅相當于染色質(zhì)全長的1/10。當用極低濃度的DNaseI處理染色質(zhì)時,切割首先發(fā)生在少數(shù)特異性位點,其敏感性超出其他區(qū)域100倍以上,稱為超敏感位點(hypersemitiveske)。

DNaseI超敏感位點(100~200bp)的存在是活性染色質(zhì)的重要特征,具有組織特異性,并同基因的表達密切相關(guān)。每個活躍表達的基因都有一個或幾個超敏感位點。大部分位于5′端啟動子區(qū)域,少數(shù)位于轉(zhuǎn)錄單位下游,為RNA聚合酶、轉(zhuǎn)錄因子或其他調(diào)節(jié)蛋白提供結(jié)合位點。

在啟動子區(qū)域,核小體的存在能抑制轉(zhuǎn)錄起始,以至于組蛋白長期被認為是一個轉(zhuǎn)錄抑制因子。由于結(jié)合了組蛋白,真核細胞的染色質(zhì)從整體上被限制在非活性狀態(tài),只有解除了對轉(zhuǎn)錄模板的抑制它才能得到表達。染色質(zhì)是否處于活化狀態(tài)是決定RNA聚合酶能否行使功能的關(guān)鍵。

原核基因:細菌細胞中僅需要改變激活蛋白和抑制蛋白的比例,便能隨時調(diào)節(jié)基因的轉(zhuǎn)錄狀態(tài)。真核生物:以往基因表達調(diào)控的研究側(cè)重于對順式作用元件與反式作用因子及其之間的相互作用,但近年來許多證據(jù)表明,染色質(zhì)和核小體構(gòu)型的改變在轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)中也扮演重要的角色。

占先模型(pre-emptivemodel)可以解釋轉(zhuǎn)錄時染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的變化。該模型認為基因能否轉(zhuǎn)錄取決于特定位置上組蛋白和轉(zhuǎn)錄因子之間的不可逆競爭性結(jié)合。

要阻止核小體形成,則必須保持轉(zhuǎn)錄因子同DNA的持續(xù)結(jié)合。盡管該模型揭示了轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合對核小體結(jié)構(gòu)的影響,但這種簡單的占先原則并不能很好的反映體內(nèi)的實際情況。

動態(tài)模型(dynamicmodel)則較好地解決了上述問題,并不斷被新的實驗結(jié)果所證實。該模型認為轉(zhuǎn)錄因子與組蛋白處于動態(tài)競爭之中,基因轉(zhuǎn)錄前染色質(zhì)必須經(jīng)歷結(jié)構(gòu)上的改變,即轉(zhuǎn)換核小體中的全部或部分成分并重新組裝,這個耗能的基因活化過程稱為染色質(zhì)重構(gòu)(chromatinremodeling)。

細胞內(nèi)的多種蛋白質(zhì)因子都能參與染色質(zhì)的重構(gòu),通過改變核小體中DNA-蛋白質(zhì)的相互作用重建核小體構(gòu)型,影響轉(zhuǎn)錄的起始或延伸。它們分別組成不同的重構(gòu)復合體,一般都包含多個與蛋白質(zhì)或DNA相互作用的亞基。11.2.2組蛋白的修飾

各種核心組蛋白都可能被乙酰化,其中H3和H4上分布著乙?;闹饕稽c。組蛋白的乙酰化與基因表達水平密切相關(guān),是一個動態(tài)過程,高乙?;腔钚匀旧|(zhì)的標志之一,而低乙?;0殡S著轉(zhuǎn)錄沉默而失活,X染色體中H4組蛋白則完全不被乙?;4送釪NA復制過程也伴隨有組蛋白的乙?;?/p>

組蛋白H1能通過維持染色質(zhì)的高級結(jié)構(gòu)從而對轉(zhuǎn)錄進行抑制。磷酸化后的組蛋白H1與DNA的親和力下降,造成染色質(zhì)結(jié)構(gòu)疏松,直接影響其活性。11.2.3DNA甲基化與轉(zhuǎn)錄抑制

動物基因組DNA中約有2%~7%的胞嘧啶是被甲基化修飾的,形成5-甲基胞嘧啶(mC),幾乎所有的mC與其3′的鳥嘌呤以5′mCpG3′的形式存在,可占全部CpG的50%~

70%。當兩條鏈上的胞嘧啶都被甲基化時稱完全甲基化。復制剛完成時,子鏈上的C呈非甲基化狀態(tài),稱為半甲基化,隨著子鏈中的C被甲基化為mC,半甲基化位點逐漸形成全甲基化狀態(tài)。CpG在DNA中的含量差異較大,在某些基因上游的轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)及其附近,存在著CG島(CG-richisland),長達1~2kb。DNA的甲基化是一個動態(tài)修飾過程.3種酶共同控制著甲基化程度:甲基化酶催化甲基與胞嘧淀的共價結(jié)合,(構(gòu)建性甲基化酶和維持性甲基化酶)去甲基化酶則負責去除甲基.

構(gòu)建性甲基化酶可對非甲基化的CpG位點進行甲基化修飾;維持性甲基化酶可在甲基化的DNA模板鏈指導下,使其互補鏈中對應位置上的CpG發(fā)生甲基化,從而使其子代細胞中具備親代的甲基化狀態(tài)。

甲基化的生物學效應依賴于各mCpG結(jié)合蛋白,其中MeCPl和MeCP2是介導甲基化對轉(zhuǎn)錄抑制作用主要的結(jié)合蛋白,缺乏這些蛋白時不能有效阻遏基因的活化。

基因組印記(genomicimprinting)是DNA甲基化影響基因表達的例證。哺乳動物某些等位基因性狀的表達將由于基因的來源不同而呈現(xiàn)差異,甚至只表達單一親系來源(父源或母源)的基因版本,猶如基因被打上了親代的印記。

基因組印記是一個可逆的過程,帶有親代基因組印記的子代個體,其自身產(chǎn)生的配子會因為重新修飾而消除原有印記并產(chǎn)生新的印記。

異染色質(zhì)化能在更大范圍內(nèi)調(diào)節(jié)真核基因的表達,致使連鎖在一起的大量基因同時喪失轉(zhuǎn)錄活性,從而起到遺傳平衡的作用。

人和多數(shù)哺乳動物雌性體細胞中的兩條X染色體,在胚胎早期(如l~16d的人胚)均為常染色質(zhì)狀態(tài),隨后其中一條X染色體將隨機出現(xiàn)異染色質(zhì)化而失活,只允許另一條染色體上的基因活動。

異染色質(zhì)化的組蛋白N-末端區(qū)域的乙酰化水平很低。11.2.4核基質(zhì)與基因活化

在真核細胞的細胞核內(nèi),除核被膜、核纖絲、核仁和染色質(zhì)之外,還存在著一個以蛋白質(zhì)為主的網(wǎng)狀系統(tǒng),即核基質(zhì)(核骨架)。主要有非組蛋白和高分子量RNA組成。

核基質(zhì)纖維直徑3~30nm,主要成分包括DNA拓撲異構(gòu)酶Ⅱ、核基質(zhì)蛋白以及多種DNA結(jié)合蛋白,并含有少量RNA。11.3真核基因轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)節(jié)控制

在基因表達調(diào)控的眾多過程中,轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控最為重要,而轉(zhuǎn)錄調(diào)控又以轉(zhuǎn)錄的起始為關(guān)鍵性的環(huán)節(jié)。11.3.1真核與原核生物轉(zhuǎn)錄調(diào)控的區(qū)別

真核生物的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)與原核生物相比,有相似之處,但也有明顯差異。主要區(qū)別為:

①原核生物功能相關(guān)的基因常組織在一起構(gòu)成操縱子,作為基因表達和調(diào)節(jié)的單元;真核生物基因不組成操縱子,每個基因都有其自身的基本啟動子和調(diào)節(jié)元件,單獨進行轉(zhuǎn)錄;②原核生物的調(diào)節(jié)元件種類較少,主要包括上游的啟動區(qū)域調(diào)控元件和激活蛋白(activator)以及阻遏蛋白(repressor)的結(jié)合位點;真核生物的調(diào)節(jié)元件種類很多,包括上游調(diào)節(jié)元件,如組成型元件、可誘導元件、應答元件、增強子和沉默子以及反式作用因子如激活因子、阻遏因子等。③無論是原核還是真核生物,其轉(zhuǎn)錄都受反式調(diào)節(jié)因子(轉(zhuǎn)錄激活因子或抑制因子)的調(diào)節(jié)。這類調(diào)節(jié)可在兩個水平上進行:一是通過調(diào)節(jié)因子的生物合成(即對其種類和數(shù)量的調(diào)節(jié)),其過程緩慢而持續(xù),主要涉及到細胞的分化等;二是通過對它們進行構(gòu)象轉(zhuǎn)變或共價修飾(即對其活性的調(diào)節(jié))。④真核生物具有染色質(zhì)結(jié)構(gòu),基因活化首先需要改變?nèi)旧|(zhì)的狀態(tài),使轉(zhuǎn)錄因子能夠接觸并作用于啟動子,稱此過程為染色質(zhì)改型(chromatinremodeling)。染色質(zhì)水平的調(diào)節(jié)主要涉及真核生物發(fā)育與細胞分化等調(diào)節(jié)。

圖11-1顯示了原核與真核生物轉(zhuǎn)錄起始位點上游區(qū)的結(jié)構(gòu)。圖11-2給出了真核生物基因的一般結(jié)構(gòu)。1.3.2真核生物轉(zhuǎn)錄調(diào)控的順式作用元件

(1)順反子的概念(2)啟動子(promoter)(3)增強子對轉(zhuǎn)錄的影響(4)絕緣子(insulator)(5)Britten-Davidson模型(1)順反子的概念(2)啟動子(promoter)

(3)增強子對轉(zhuǎn)錄的影響

增強子是指能使基因轉(zhuǎn)錄頻率明顯增加的DNA序列。增強子主要存在于真核生物基因組中。最早發(fā)現(xiàn)的SV40增強子位于轉(zhuǎn)錄起點上游約200bp處的超敏感位點,含有兩個正向重復的72bp序列。作為基因表達的重要順式調(diào)控元件,它能極大促進啟動子的轉(zhuǎn)錄活性。其作用有幾個明顯特點:①增強轉(zhuǎn)錄效應十分明顯,一般能使基因轉(zhuǎn)錄頻率增加10~200倍,有的可以增加上千倍;②能以很遠距離(數(shù)千個核苷酸以外)對啟動子產(chǎn)生影響;③其功能與序列的取向無關(guān),不論增強子以什么方向排列,甚至在基因的下游,均表現(xiàn)出增強效應;④大多為重復序列,一般長約50bp,適合與某些蛋白因子結(jié)合。其內(nèi)部常含有一個核心序列:(G)TGGA/TA/TA/T(G);⑤其增強效應有嚴密的組織和細胞特異性,說明只有特定的蛋白質(zhì)(轉(zhuǎn)錄因子)參與才能發(fā)揮其功能;⑥沒有基因?qū)R恍裕稍诓煌幕蚪M合上表現(xiàn)增強效應;⑦許多增強子還受外部信號的調(diào)控,如金屬硫蛋白的基因啟動區(qū)上游所帶的增強子,就可以對環(huán)境中的鋅、鎘濃度做出反應;⑧沒有生物種屬的特異性,其作用受到細胞發(fā)育和分化的影響。重組實驗證明,如果把SV40增強子上的兩個72bp重復序列同時去除。基因表達的水平會明顯降低。但其中一個重復序列去除時,則基因正常轉(zhuǎn)錄。如果將人β血紅蛋白基因克隆到帶有72bp重復序列的DNA上,這個基因在體內(nèi)的表達水平提高200倍以上,即使72bp序列位于該基因轉(zhuǎn)錄起始位點上游3kb或下游2.5kb處,仍不例外。

有兩種假說可以解釋增強子的作用機理。

一是增強子能為轉(zhuǎn)錄因子提供進入啟動子區(qū)的位點。

第二種假說認為,增強子能改變?nèi)旧|(zhì)的構(gòu)象。(4)絕緣子(insulator)

絕緣子(insulator)是近年發(fā)現(xiàn)的一類特殊順式作用元件,它不同于增強子,其功能是阻止激活或阻遏作用在染色質(zhì)上的傳遞,使染色質(zhì)的活性限定于結(jié)構(gòu)域之內(nèi)。如果將—個絕緣子置于增強子和啟動子之間,它能阻止增強子對啟動子的激活。

另一方面,如果一個絕緣子在活性基因和異染色質(zhì)之間,則它可保護該基因免受異染色質(zhì)化而失活。這些性質(zhì)說明絕緣子可能影響染色質(zhì)的組織結(jié)構(gòu)。(5)Britten-Davidson模型

1969年,Britten和Davidson提出了真核生物單拷貝基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的模型。認為在整合基因的5′端連接著一段具有高度專一性的DNA序列,稱為傳感基因(Sensorgene),當它和某種信號分子(如激素或激素蛋白復合物)相互作用時,激活了整合基因的表達,產(chǎn)生具有生物活性的RNA或蛋白質(zhì)分子;當整合基因的表達產(chǎn)物和受體基因(receptorgene)相互作用時,就啟動了結(jié)構(gòu)基因的表達。

如果許多結(jié)構(gòu)基因的鄰近位置上同時具有相同的受體基因,則這些基因?qū)⑹艿侥骋环N激活因子的控制而表達,這些基因就歸屬到一個組。如果有幾個不同的受體基因與—個結(jié)構(gòu)基因相鄰接,它們能被不同的因子所激活,那么這個結(jié)構(gòu)基因就會在不同的情況下表達。

如果一個傳感基因可以控制幾個整合基因,則一種信號分子就可以通過一個相應的傳感基因激活幾個組中的基因。因此,可以把一個傳感基因所控制的全部基因歸屬為—套。如果一種整合基因重復出現(xiàn)在不同的套中,則同一組基因也可以分屬于不同的套。11.3.3基因的基礎轉(zhuǎn)錄及其調(diào)節(jié)

參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控的蛋白因子有3類:基礎轉(zhuǎn)錄因子(通用轉(zhuǎn)錄因子):廣泛分布于各種細胞類型,與核心啟動子結(jié)合;上游因子:與上游啟動子序列結(jié)合,提高轉(zhuǎn)錄水平;可誘導因子:其識別序列稱為應答元件.

基因的基礎轉(zhuǎn)錄是指由核心啟動子與通用轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合后起始的轉(zhuǎn)錄過程。只含有通用轉(zhuǎn)錄因子和上游因子識別序列的啟動子可在各種細胞類型中都發(fā)揮作用,由它所控制的基因呈組成型表達,用以合成細胞所必需的各種成分,又稱為管家基因(house-keepinggene)。11.3.4反式作用因子的結(jié)構(gòu)與功能反式作用因子:是指遠離受影響的基因之外的基因所編碼的產(chǎn)物,又稱為轉(zhuǎn)錄因子。它有非特異性和特異性之分。

反式作用因子有三個結(jié)構(gòu)域,即DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域、轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域和二聚化結(jié)構(gòu)域。許多轉(zhuǎn)錄因子含有介導蛋白質(zhì)二聚化的位點,二聚體的形成對它們行使功能具有重要意義。(1)螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋結(jié)構(gòu)基序

(helix-turn-helix,HTH)

螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋結(jié)構(gòu)由兩段α螺旋及連接它們的β轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu)組成,一般長約20個AA殘基,由其中靠近C端的一段螺旋與DNA大溝中的堿基直接接觸,該螺旋稱為識別α螺旋,另一段螺旋沒有特異性,與DNA骨架相接觸(圖11-4)。螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋(helix-turn-helix)(2)鋅指結(jié)構(gòu)基序(zincfinger,ZF)

這類結(jié)構(gòu)主要見于真核生物的調(diào)節(jié)因子。非洲爪蟾由RNA聚合酶III催化的5SrRNA基因轉(zhuǎn)錄的轉(zhuǎn)錄因子TFMA,是由344個AA組成的第一個被發(fā)現(xiàn)的鋅指蛋白。鋅指結(jié)構(gòu)(zincfingermotif)(3)螺旋一突環(huán)一螺旋結(jié)構(gòu)基序

(helix-loop-helix,HLH)

螺旋-突環(huán)-螺旋型DNA結(jié)合蛋白是近年來發(fā)現(xiàn)的一種新型DNA結(jié)合蛋白。由40~50個AA殘基形成兩個兩性的α螺旋,中間由長約9~20個氨基酸殘基間隔的可變連接區(qū)(突環(huán)),通過兼性的螺旋疏水面相互作用形成二聚體。螺旋-環(huán)-螺旋

(4)亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu)基序

(1eucinezipper,ZIP)

亮氨酸拉鏈最初是通過比較酵母轉(zhuǎn)錄激活因子GCN4、哺乳動物轉(zhuǎn)錄因子C/EBP(CAAT區(qū)及SV40增強子核心序列結(jié)合蛋白)以及癌基因產(chǎn)物Fos、Jun和Myc的AA序列時被發(fā)現(xiàn)的。亮氨酸拉鏈中α-螺旋的突出特點是每隔7個AA殘基出現(xiàn)一個leu。亮氨酸拉鏈(leucinezipper)(5)調(diào)控蛋白對特異DNA序列的識別

特異性DNA序列表面(一般是與調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合的面)的結(jié)構(gòu)特點是DNA與蛋白質(zhì)結(jié)合的分子基礎之一。為能進行特異性結(jié)合,調(diào)控蛋白能夠區(qū)分那些它將與之特異結(jié)合的DNA序列與非特異序列。

調(diào)控蛋白與DNA能在DNA的小溝處接觸,但這里形成氫鍵的花式不易于將不同的堿基區(qū)分開。調(diào)控蛋白與DNA結(jié)合時主要依靠分子中的Gln,Asn,Glu,Lys,Arg等。在Gln和Asn與腺嘌呤的N6和N7位之間形成兩個氫鍵,這是特異性的,其他基團之間無此情況;同樣Asn可與鳥瞟呤的N7和O6形成兩個氫鍵(圖11-9)。TACG11.3.5轉(zhuǎn)錄因子的活性調(diào)節(jié)

(1)轉(zhuǎn)錄因子的激活結(jié)構(gòu)域(2)k基因結(jié)合核因子(NF-kB)(1)轉(zhuǎn)錄因子的激活結(jié)構(gòu)域

轉(zhuǎn)錄因子激活區(qū)的結(jié)構(gòu)特點因轉(zhuǎn)錄因子而異,根據(jù)氨基酸組成的特點,主要包括3種類型:①酸性激活結(jié)構(gòu)域,是含酸性AA的保守序列,形成帶負電荷的螺旋區(qū);②富含谷氨酰胺結(jié)構(gòu)域(glutarnine-richdomain)最先在SPl中發(fā)現(xiàn),N端有兩個轉(zhuǎn)錄激活區(qū),其中谷氨酰胺(Gln)殘基含量達25%,主要結(jié)合GC框;③富含脯氨酸結(jié)構(gòu)域(proline-richdomain),如CTF家族(主要識別CCAAT框)的C端區(qū)域,脯氨酸殘基達20%~30%,與轉(zhuǎn)錄的激活有關(guān)。(2)k基因結(jié)合核因子(NF-kB)

11.3.6RNA結(jié)合蛋白的結(jié)構(gòu)與功能

真核細胞中轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物合成后隨即與細胞核內(nèi)的蛋白質(zhì)相結(jié)合,mRNA前體的加帽、接尾、剪接、核輸出直至翻譯和降解等過程,始終是以核糖核蛋白(ribonudeoprotein,RNP)顆粒的形式完成的。在蛋白質(zhì)識別有規(guī)則雙螺旋結(jié)構(gòu)的DNA時,信號主要來自暴露在大溝中的堿基對,通過非共價鍵的特異組合直接讀出。相比之下RNA不規(guī)則的高級結(jié)構(gòu)使得識別過程更為復雜,不同的RNA結(jié)構(gòu),如螺旋、發(fā)夾、莖中的凸起或內(nèi)環(huán),甚至RNA整體構(gòu)象本身,都可能被RNA結(jié)合蛋白專一巨識別,因而RNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域也就更為復雜多變。1、核糖核蛋白基元

2.富含精氨酸的基元

3.RGG框

4.K同源結(jié)構(gòu)域5.鋅指6.雙鏈RNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域11.4翻譯水平的調(diào)節(jié)因素及其調(diào)節(jié)翻譯水平的調(diào)控是真核基因表達多級調(diào)節(jié)的一個重要環(huán)節(jié)。調(diào)節(jié)過程通常涉及mRNA和多種蛋白因子之間的相互作用,mRNA5′端和3′端所含有的非翻譯區(qū)(untranslatedregion,UTR)是影響翻譯過程的主要調(diào)節(jié)位點。11.4.15′UTR結(jié)構(gòu)與翻譯起始的調(diào)節(jié)

翻譯起始的調(diào)節(jié)是在蛋白質(zhì)合成水平控制基因表達的主要環(huán)節(jié),5′UTR的結(jié)構(gòu)與其調(diào)節(jié)過程密切相關(guān)。5′UTR通常不到100nt,但它的加帽修飾、特殊的二級結(jié)構(gòu)形成和先導序列長度都對翻譯過程產(chǎn)生重要影響。

幾乎所有真核生物和病毒mRNA的5′端都具有以5′—5′磷酸二酯鍵相連的帽子結(jié)構(gòu),甲基轉(zhuǎn)移酶的作用可使帽子結(jié)構(gòu)發(fā)生程度不同的甲基化修飾,由此能區(qū)分出不同的帽子類型。

mRNA的翻譯活性依賴于5′端的帽子結(jié)構(gòu)。

然而脊髓灰質(zhì)炎病毒等小RNA病毒的(+)鏈RNA沒有5′帽子結(jié)構(gòu),它們起始翻譯的機制不同于宿主細胞mRNA的滑動搜索過程。11.4.2蛋白質(zhì)磷酸化對翻譯效率的影響

翻譯的每個階段都有許多蛋白因子參與,其活性常與這些因子自身的磷酸化修飾密切相關(guān)。elF-4F等因子的磷酸化可提高蛋白質(zhì)的生物合成速度,elF-2a等因子的磷酸化卻又阻止翻譯的起始過程。11.4.33′UTR結(jié)構(gòu)與mRNA穩(wěn)定性調(diào)控

1.多聚腺苷酸尾的調(diào)節(jié)作用2.3′UTR序列及結(jié)構(gòu)對mRNA穩(wěn)定性的調(diào)節(jié)1、多聚腺苷酸尾的調(diào)節(jié)作用

真核mRNA的穩(wěn)定性相差懸殊,編碼Fos等調(diào)節(jié)蛋白的mRNA半衰期只有10~30min,而雞輸卵管中卵清蛋白mRNA的半衰期可達24h。

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