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原核基因表達(dá)乳糖色氨酸第1頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四正、負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控系統(tǒng)在正轉(zhuǎn)錄調(diào)控系統(tǒng)(正控)中,調(diào)節(jié)基因的物質(zhì)是激活蛋白(activator)--開(kāi)啟結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄。其作用部位是操縱區(qū)。它與操縱區(qū)結(jié)合,轉(zhuǎn)錄開(kāi)啟。在負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控系統(tǒng)(負(fù)控)中,調(diào)節(jié)基因的物質(zhì)是阻遏蛋白(repressor)--阻止結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄。其作用部位是操縱區(qū)。它與操縱區(qū)結(jié)合,轉(zhuǎn)錄受阻。第2頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四調(diào)節(jié)基因操縱基因結(jié)構(gòu)基因阻遏蛋白激活蛋白正轉(zhuǎn)錄調(diào)控負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控正轉(zhuǎn)錄調(diào)控如果在沒(méi)有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)存在時(shí)基因是關(guān)閉的,加入這種調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)后基因活性就被開(kāi)啟,這樣的調(diào)控正轉(zhuǎn)錄調(diào)控。第3頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四
在正控誘導(dǎo)系統(tǒng)中,誘導(dǎo)物的存在使激活蛋白處于活性狀態(tài),轉(zhuǎn)錄進(jìn)行。第4頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四
在正控阻遏系統(tǒng)中,效應(yīng)物分子的存在使激活蛋白處于非活性狀態(tài),轉(zhuǎn)錄不進(jìn)行。第5頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四調(diào)節(jié)基因操縱基因結(jié)構(gòu)基因阻遏蛋白激活蛋白正轉(zhuǎn)錄調(diào)控負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控在沒(méi)有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)存在時(shí)基因是表達(dá)的,加入這種調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)后基因表達(dá)活性便被關(guān)閉,這樣的調(diào)控負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控。第6頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四
負(fù)控誘導(dǎo)系統(tǒng)--阻遏蛋白不與誘導(dǎo)物結(jié)合時(shí),阻遏蛋白與操縱區(qū)相結(jié)合,結(jié)構(gòu)基因不轉(zhuǎn)錄,阻遏蛋白結(jié)合上誘導(dǎo)物時(shí),阻遏蛋白與操縱區(qū)分離,結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄。第7頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四
負(fù)控阻遏系統(tǒng)--阻遏蛋白與效應(yīng)物結(jié)合時(shí),結(jié)構(gòu)基因不轉(zhuǎn)錄。第8頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四可誘導(dǎo)調(diào)節(jié):指一些基因在特殊的代謝物或化合物的作用下,由原來(lái)關(guān)閉的狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)楣ぷ鳡顟B(tài),即在某些物質(zhì)的誘導(dǎo)下使基因活化。例:大腸桿菌的乳糖操縱子分解代謝蛋白的基因2、根據(jù)操縱子對(duì)某些能調(diào)節(jié)它們的小分子的應(yīng)答,可分為可誘導(dǎo)調(diào)節(jié)和可阻遏調(diào)節(jié)兩大類:第9頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四調(diào)節(jié)基因操縱基因結(jié)構(gòu)基因阻遏蛋白調(diào)節(jié)基因操縱基因結(jié)構(gòu)基因阻遏蛋白誘導(dǎo)物mRNA酶蛋白降解酶(或分解酶)合成的誘導(dǎo)操縱子模型(如:乳糖操縱子)誘導(dǎo)物如果某種物質(zhì)能夠促使細(xì)菌產(chǎn)生酶來(lái)分解它,這種物質(zhì)就是誘導(dǎo)物。第10頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四可阻遏調(diào)節(jié):基因平時(shí)是開(kāi)啟的,處在產(chǎn)生蛋白質(zhì)或酶的工作過(guò)程中,由于一些特殊代謝物或化合物的積累而將其關(guān)閉,阻遏了基因的表達(dá)。例:色氨酸操縱子合成代謝蛋白的基因第11頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四酶合成的阻遏操縱子模型調(diào)節(jié)基因操縱基因結(jié)構(gòu)基因mRNA酶蛋白調(diào)節(jié)基因操縱基因結(jié)構(gòu)基因輔阻遏物輔阻遏物如果某種物質(zhì)能夠阻止細(xì)菌產(chǎn)生合成這種物質(zhì)的酶,這種物質(zhì)就是輔阻遏物。第12頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四當(dāng)氨基酸饑餓時(shí),細(xì)胞中便存在大量的不帶氨基酸的tRNA,這種空載的tRNA會(huì)激活焦磷酸轉(zhuǎn)移酶,使ppGpp大量合成。ppGpp的出現(xiàn)會(huì)關(guān)閉許多基因,以應(yīng)付這種緊急狀況。ppGpp影響RNA聚合酶與這些基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)的結(jié)合,使基因被關(guān)閉。ppGpp與pppGpp的作用范圍十分廣泛,它們影響一大批操縱子而被稱為超級(jí)調(diào)控因子。第13頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四5.2乳糖操縱子--負(fù)控誘導(dǎo)系統(tǒng)1、操縱子模型的提出
1961年,Monod和Jacob提出獲1965年諾貝爾生理學(xué)和醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)第14頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四2、操縱子的定義操縱子:是基因表達(dá)的協(xié)調(diào)單位,由啟動(dòng)子、操縱基因及其所控制的一組功能上相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因所組成。操縱基因受調(diào)節(jié)基因產(chǎn)物的控制。第15頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四操縱子是一種完整的具有特定功能的細(xì)菌基因表達(dá)和調(diào)節(jié)的單位,包括調(diào)節(jié)基因,操縱位點(diǎn),結(jié)構(gòu)基因,組成一個(gè)控制單元結(jié)構(gòu)基因:產(chǎn)生mRNA,合成蛋白質(zhì)操縱位點(diǎn)promotor,operator:?jiǎn)?dòng)子結(jié)合位點(diǎn)調(diào)節(jié)基因:產(chǎn)生調(diào)節(jié)蛋白(與操縱位點(diǎn)結(jié)合)→結(jié)構(gòu)基因不轉(zhuǎn)錄誘導(dǎo)物存在時(shí),可與阻遏蛋白結(jié)合→結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄ControlelementStructuralgenes第16頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四第17頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四操縱序列O啟動(dòng)序列P——上游含CAP(分解代謝物基因激活蛋白)調(diào)控區(qū)調(diào)節(jié)基因I——編碼一種阻遏蛋白結(jié)構(gòu)基因Z——-半乳糖苷酶Y——透酶A——乙酰基轉(zhuǎn)移酶第18頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四一、乳糖操縱子的結(jié)構(gòu)第19頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四第20頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四Z編碼β-半乳糖苷酶:將乳糖水解成葡萄糖和半乳糖Y編碼β-半乳糖苷透過(guò)酶:使外界的β-半乳糖苷(如乳糖)能透過(guò)大腸桿菌細(xì)胞壁和原生質(zhì)膜進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)。A編碼β-半乳糖苷乙?;D(zhuǎn)移酶:乙酰輔酶A上的乙?;D(zhuǎn)到β-半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖。第21頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四5.2.2酶的誘導(dǎo)現(xiàn)象B-半乳糖苷酶第22頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四二、酶的誘導(dǎo)——lac體系受調(diào)控的證據(jù)第23頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四第24頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四第25頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四5.2.4阻遏蛋白的作用機(jī)制1阻遏蛋白結(jié)構(gòu)38KD,4聚體,一個(gè)亞基結(jié)合一個(gè)IPTG分子lacI
組成型轉(zhuǎn)錄
Pi弱啟動(dòng)子,
5-10個(gè)/cell具有二重性阻止轉(zhuǎn)錄(與lacO結(jié)合)開(kāi)始轉(zhuǎn)錄(與誘導(dǎo)物結(jié)合)第26頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四
阻遏蛋白單體的結(jié)構(gòu)第27頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四2.2
操縱子突變-操縱子的發(fā)現(xiàn)(1)Oc操縱基因的組成型突變(順式顯性)
順式顯性突變(cis-dominance):操縱基因只控制臨近基因,對(duì)其他等位基因無(wú)作用,或者顯性效應(yīng)只對(duì)處于同一染色體上它所調(diào)控的結(jié)構(gòu)基因才起作用的現(xiàn)象。
(2)lacIS
阻遏蛋白不可誘導(dǎo)性突變,阻遏蛋白失去誘導(dǎo)物結(jié)合位點(diǎn);(3)lacI-
阻遏蛋白不能形成寡聚物(4)lacI-d阻遏蛋白不能和DNA結(jié)合,且呈負(fù)互補(bǔ)(反式顯性)
等位基因間的互補(bǔ)(interalleliccomplementation)。
負(fù)的互補(bǔ)(negativecomplementation):lacI-d的產(chǎn)物和lacI+的產(chǎn)物組成多聚體時(shí),阻遏蛋白無(wú)活性。也稱為反式顯性(trans-dominant)。第28頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四阻遏蛋白不能與突變的操縱基因結(jié)合,結(jié)構(gòu)基因組成型表達(dá)(1)操縱基因突變(O+Oc),結(jié)構(gòu)基因組成型表達(dá)第29頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四組成型突變:lacOc
第30頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四(2)操縱子不可誘導(dǎo)型突變阻遏蛋白失去結(jié)合誘導(dǎo)物位點(diǎn)的突變lacIs,結(jié)構(gòu)基因組成型表達(dá)第31頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四(3)阻抑蛋白基因的I-突變阻遏蛋白失活或者缺乏,不能和操縱基因結(jié)合,結(jié)構(gòu)基因組成型表達(dá)第32頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四組成型突變:
lacI-第33頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四二倍體中,lacI+比lacI-占優(yōu)勢(shì),表現(xiàn)為基因關(guān)閉,lacI-為隱性突變當(dāng)野生型lacI+和突變型I-在同一細(xì)胞中第34頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四不可誘導(dǎo)突變(超阻遏):第35頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四②真正的誘導(dǎo)物是異構(gòu)乳糖而非乳糖,前者是在β-半乳糖甘酶的催化下由乳糖形成的,因此,需要有β-半乳糖甘酶的預(yù)先存在。解釋:本底水平的組成型合成:非誘導(dǎo)狀態(tài)下有少量的lacmRNA合成。第36頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四2、大腸桿菌對(duì)乳糖的反應(yīng)
培養(yǎng)基:甘油按照l(shuí)ac操縱子本底水平的表達(dá),每個(gè)細(xì)胞內(nèi)有幾個(gè)分子的β-半乳糖苷酶和β-半乳糖苷透過(guò)酶;培養(yǎng)基:加入乳糖少量乳糖透過(guò)酶進(jìn)入細(xì)胞β-半乳糖苷酶異構(gòu)乳糖誘導(dǎo)物誘導(dǎo)lacmRNA的生物合成大量乳糖進(jìn)入細(xì)胞多數(shù)被降解為葡萄糖和半乳糖(碳源和能源)異構(gòu)乳糖第37頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四3、阻遏物lacI基因產(chǎn)物及功能Lac操縱子阻遏物mRNA是由弱啟動(dòng)子控制下組成型合成的,每個(gè)細(xì)胞中有5-10個(gè)阻遏物分子。當(dāng)I基因由弱啟動(dòng)子突變成強(qiáng)啟動(dòng)子,細(xì)胞內(nèi)就不可能產(chǎn)生足夠的誘導(dǎo)物來(lái)克服阻遏狀態(tài),整個(gè)lac操縱子在這些突變體中就不可誘導(dǎo)。第38頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四4、葡萄糖對(duì)lac操縱子的影響
如果將葡萄糖和乳糖同時(shí)加入培養(yǎng)基中,lac操縱子處于阻遏狀態(tài),不能被誘導(dǎo);一旦耗盡外源葡萄糖,乳糖就會(huì)誘導(dǎo)lac操縱子表達(dá)分解乳糖所需的三種酶。代謝物阻遏效應(yīng)第39頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四mRNA無(wú)乳糖時(shí)有乳糖時(shí)
無(wú)葡萄糖cAMP濃度高
有葡萄糖cAMP濃度低RNA-polOOOOlac操縱子基因表達(dá)既需要乳糖又需缺乏葡萄糖第40頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四5.3色氨酸操縱子(trpoperon)內(nèi)容提要:色氨酸操縱子的結(jié)構(gòu)色氨酸操縱子的阻遏系統(tǒng)色氨酸操縱子的弱化機(jī)制第41頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四Trpoperon
生物細(xì)胞中的氨基酸合成,也受操縱元的調(diào)節(jié)。細(xì)胞需要某種氨基酸時(shí),其基因即表達(dá),不需要時(shí)基因關(guān)閉,達(dá)到經(jīng)濟(jì)的原則。第42頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四一、色氨酸操縱子的結(jié)構(gòu)
調(diào)控基因結(jié)構(gòu)基因
催化分枝酸轉(zhuǎn)變?yōu)樯彼?/p>
的酶
trpRtrp第43頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四第44頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四trpR,阻遏蛋白P:
-40~+18O:-21~
+1L:
+1~
+162結(jié)構(gòu)基因t:
A下游36bp,不依賴pt′:t下游250bp,依賴p基因組成第45頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四第46頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四特點(diǎn):(1)trpR和trpABCDE不連鎖;
(2)操縱基因在啟動(dòng)子內(nèi)
(3)有衰減子(attenuator)/弱化子
(4)啟動(dòng)子和結(jié)構(gòu)基因不直接相連,二者被前導(dǎo)序列(Leader)所隔開(kāi)第47頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四二、trp操縱子的阻遏系統(tǒng)低Trp時(shí):阻遏物不結(jié)合操縱基因;高Trp時(shí):阻遏物+Trp結(jié)合操縱基因第48頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四阻遏蛋白+trp
→
有活性的阻遏物SNE299+trpO→不轉(zhuǎn)錄第49頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四2阻遏蛋白的結(jié)合位點(diǎn)trpO-21~+1,反向重復(fù)序列trpP-40~+18活性阻遏物與trpO的結(jié)合與RNApol與啟動(dòng)子的結(jié)合發(fā)生競(jìng)爭(zhēng)SNE299第50頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四3阻遏系統(tǒng)主管轉(zhuǎn)錄是否啟動(dòng),在缺乏Trp時(shí),mRNA起始合成,但不能自動(dòng)延伸,一般在trpE之前終止轉(zhuǎn)錄
粗調(diào)開(kāi)關(guān)第51頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四Trp有Trp無(wú)TrpmRNAOPtrpR調(diào)節(jié)區(qū)結(jié)構(gòu)基因
RNA聚合酶
RNA聚合酶高低?色氨酸操縱子第52頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四三、trp操縱子的弱化機(jī)制衰減子(attenuator)/弱化子前導(dǎo)序列(leadersequence)第53頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四弱化子對(duì)基因活性的影響在這種調(diào)節(jié)方式中,起信號(hào)作用的是有特殊負(fù)載的氨酰-tRNA的濃度。
當(dāng)操縱子被阻遏,RNA合成被終止時(shí),起終止轉(zhuǎn)錄信號(hào)作用的那一段DNA序列被稱為弱化子。第54頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四當(dāng)基因轉(zhuǎn)錄使轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物(RNA)到不同長(zhǎng)度時(shí),核糖體會(huì)在對(duì)應(yīng)的DNA位置上;此時(shí)RNA可以形成某種形式的二級(jí)結(jié)構(gòu);由此決定延伸復(fù)合物的結(jié)合能力,從而決定基因能否繼續(xù)轉(zhuǎn)錄。第55頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四1、弱化子:
DNA中可導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄過(guò)早終止的一段核甘酸序列(123-150區(qū))。123~150第56頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四
研究引起終止的mRNA堿基序列,發(fā)現(xiàn)該區(qū)mRNA通過(guò)自我配對(duì)可以形成莖-環(huán)結(jié)構(gòu),有典型的終止子特點(diǎn)。第57頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四2、前導(dǎo)序列:在trpmRNA5'端trpE基因的起始密碼前一個(gè)長(zhǎng)162bp的mRNA片段。第58頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四
S312POE4321LDNARNAATGTGA2trpcodons1432前導(dǎo)肽14aa第59頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四第60頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四3、弱化機(jī)制第61頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四
前導(dǎo)肽轉(zhuǎn)錄終止結(jié)構(gòu)第62頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四
轉(zhuǎn)錄衰減(attenuation):
是指轉(zhuǎn)錄可正常起動(dòng),但在轉(zhuǎn)錄進(jìn)入
第一個(gè)結(jié)構(gòu)基因前即突然停止的過(guò)程。 由于這一終止作用并不能使正在進(jìn)行的 結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄中途停止,而僅是部分中 途停止轉(zhuǎn)錄,所以稱為轉(zhuǎn)錄衰減。第63頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四
衰減子(attenuator):
操縱子前導(dǎo)區(qū)內(nèi)類似于終止子結(jié)構(gòu)的一段DNA序列,稱為衰減子。其作用是減弱操縱子的轉(zhuǎn)錄。第64頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四
.轉(zhuǎn)錄衰減第65頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四UUUU……34UUUU3’34核糖體前導(dǎo)肽前導(dǎo)mRNA1.當(dāng)色氨酸濃度高時(shí)轉(zhuǎn)錄衰減機(jī)制125’trp密碼子衰減子結(jié)構(gòu)就是終止子可使轉(zhuǎn)錄前導(dǎo)DNAUUUU3’
RNA聚合酶終止第66頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四UUUU……342423UUUU……核糖體
前導(dǎo)肽
前導(dǎo)mRNA
15’trp密碼子
結(jié)構(gòu)基因前導(dǎo)DNA
RNA聚合酶2.當(dāng)色氨酸濃度低時(shí)Trp合成酶系相關(guān)結(jié)構(gòu)基因被轉(zhuǎn)錄
序列3、4不能形成衰減子結(jié)構(gòu)第67頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四LowTrpHighTrp第68頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四轉(zhuǎn)錄、翻譯偶聯(lián),產(chǎn)生前導(dǎo)肽Trp-tRNATrp
存在核糖體通過(guò)片段1(2個(gè)Trp密碼子)封閉片段2片段3,4形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)類似于不依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止序列RNA聚合酶停止轉(zhuǎn)錄,產(chǎn)生衰減子轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物高Trp時(shí):第69頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四RNA聚合酶繼續(xù)轉(zhuǎn)錄Trp-tRNATrp
沒(méi)有供應(yīng)核糖體翻譯停止在片段1(2個(gè)Trp密碼子)片段2,3形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)錄不終止低Trp時(shí):第70頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四弱化子對(duì)轉(zhuǎn)錄調(diào)控的關(guān)鍵空間結(jié)構(gòu),10thand11thcodonsencodetrpresidues(rareAA)時(shí)間,核糖體停頓在2個(gè)Trp密碼子上時(shí),產(chǎn)生延宕,此時(shí)4區(qū)未轉(zhuǎn)錄出來(lái)Theleaderpeptideistodeterminertrpavailabilityandtoregulatetranscriptiontermination14–amino-acid(encodedby27-68oftheleaderRNAsummary第71頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四5.3.4阻遏作用與弱化作用的協(xié)調(diào)
阻遏效率啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄起始頻率在R+和R-相差70倍弱化作用
trp存在時(shí),約有10%的RNApol僥幸轉(zhuǎn)錄
-trp
活性阻遏物----→無(wú)活性阻遏物
←----
+trptrp操縱子具有雙重調(diào)節(jié)體系?第72頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四Negative—repressibleoperon可以被最終合成產(chǎn)物所阻遏RPOleadingseq.EDCBAtrp+為什么需要阻遏體系?當(dāng)大量Trp存在時(shí),阻遏系統(tǒng)起作用。阻遏物與之結(jié)合,阻止先導(dǎo)mRNA合成。
經(jīng)濟(jì)第73頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四僅有少量trp時(shí),RNApol啟動(dòng),但在L.S.處脫落,轉(zhuǎn)錄中斷RPOleadingseq.EDCBA少量trp+不足以結(jié)合
O
位點(diǎn)為什么需要弱化系統(tǒng)?當(dāng)trp濃度低時(shí),阻遏物從有活性變?yōu)闊o(wú)活性,速度極慢,不能很快引發(fā)trp合成。因此需要一個(gè)能快速作出反應(yīng)的系統(tǒng),以保持培養(yǎng)基中適當(dāng)?shù)腡rp水平。第74頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四5.3.5細(xì)菌演化出弱化系統(tǒng)的生物學(xué)意義
通過(guò)tRNA荷載與否進(jìn)行調(diào)控,更為靈敏氨基酸的主要用途是合成蛋白質(zhì),因而tRNA荷載為標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行調(diào)控更為恰當(dāng)兩個(gè)調(diào)控系統(tǒng),避免浪費(fèi)提高效率阻遏系統(tǒng)高水平trp時(shí),不轉(zhuǎn)錄低水平trp時(shí),轉(zhuǎn)錄至LS
弱化系統(tǒng)細(xì)調(diào)原核生物細(xì)致的精細(xì)調(diào)控機(jī)制增強(qiáng)原核生物對(duì)環(huán)境的適應(yīng)性第75頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四第76頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四
細(xì)菌通過(guò)弱化作用彌補(bǔ)阻遏作用的不足,因?yàn)樽瓒糇饔弥荒苁罐D(zhuǎn)錄不起始,對(duì)于已經(jīng)起始的轉(zhuǎn)錄,只能通過(guò)弱化作用使之中途停下來(lái)。阻遏作用的信號(hào)是細(xì)胞內(nèi)色氨酸的多少;弱化作用的信號(hào)則是細(xì)胞內(nèi)載有色氨酸的tRNA的多少。它通過(guò)前導(dǎo)肽的翻譯來(lái)控制轉(zhuǎn)錄的進(jìn)行,在細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)這兩種作用相輔相成,體現(xiàn)著生物體內(nèi)周密的調(diào)控作用。第77頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四一、翻譯起始的調(diào)控
RBS(核糖體結(jié)合位點(diǎn)):mRNA鏈上起始密碼子AUG上游的一段非翻譯區(qū)。
RBS的結(jié)合強(qiáng)度取決于SD序列的結(jié)構(gòu)及其與起始密碼子AUG之間的距離。
SD-4-10(9)-AUG5.4轉(zhuǎn)錄后水平上的調(diào)控第78頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四二、稀有密碼子對(duì)翻譯的影響dnaG(引物酶)RNA引物dnaG、rpoD和rpsU屬于大腸桿菌基因組上的同一個(gè)操縱子50個(gè)拷貝的dnaG蛋白、2800個(gè)拷貝的rpoD和40000個(gè)拷貝的rpsU第79頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四幾種蛋白質(zhì)中異亮氨酸密碼子使用頻率比較蛋白質(zhì)AUU/%AUC%AUA%結(jié)構(gòu)蛋白37621σ亞基26740DnaG蛋白363232細(xì)胞內(nèi)對(duì)應(yīng)于稀有密碼子的tRNA較少,高頻率使用這些密碼子的基因翻譯過(guò)程容易受阻,影響了蛋白質(zhì)合成的總量。第80頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四三、重疊基因?qū)Ψg的影響第81頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四TrpB–谷氨酸-異亮氨酸-終止
GAA--AUC--UGA
--UGG--AA
AUG--GAA
甲硫氨酸–谷氨酸–trpAtrpE—蘇氨酸—苯丙氨酸—終止
ACU--UUC--UGA--UGG--CUAUG
AUG–GCU
甲硫氨酸--丙氨酸--trpD翻譯終止時(shí)核糖體立即處在起始環(huán)境中,這種重疊的密碼子保證了同一核糖體對(duì)兩個(gè)連續(xù)基因進(jìn)行翻譯的機(jī)制。第82頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四翻譯的調(diào)控一.翻譯起始的調(diào)控(一)重疊核苷酸與翻譯調(diào)控1.色氨酸操縱子
TrpE-Thr-Phe-終止密碼子
ACUUUCUGAUGGCU
Met-Ala-TrpDTrpB-Glu-Ile-終止
GAAAUCUGAUGGAA
Met-Glu-TrpA第83頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四在E.coli的gal操縱子中E.T.K三個(gè)基因,T與K以另一種形式重疊來(lái)達(dá)到協(xié)調(diào)一致:第84頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四(二)翻譯水平的自我調(diào)控第85頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四第86頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四第87頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四第88頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四第89頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四第90頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四第91頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四(三)二級(jí)結(jié)構(gòu)對(duì)翻譯起始的調(diào)控E.coli的RNA噬菌體MS2,R17,f2和Qβ都非常?。ㄖ睆郊s為250),是最簡(jiǎn)單的病毒。基因組長(zhǎng)3600~4200nt,只含4個(gè)基因:A、cp、Rep和Lys。CP(coatprotein)含129aa,MW為13.7KDa。A(atachment)編碼附著蛋白(含393氨aa,MW為44KDa);Rep(replicase)編碼復(fù)制酶(含544aa,MW為61KKDa);lys(lysis)白基因編碼裂解蛋白,和cp,Rep基因重疊,該蛋白含75aa。第92頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四第93頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四(四)反義RNA的調(diào)控1884年Mizuno,T.等發(fā)現(xiàn)干擾mRNA的互補(bǔ)RNA(mic-RNA,mRNA-interferingcomplementaryRNA)antisenseRNA的作用可能有兩種機(jī)制。(1)和靶核苷酸序列形成雙鏈區(qū),直接阻礙其翻譯的起始。(2)在靶分子的部分區(qū)域形成雙鏈區(qū),改變其構(gòu)象,直接影響其功能。第94頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四第95頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四二.翻譯的延伸調(diào)控(一)稀有密碼子的調(diào)控第96頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四第97頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四在25種非調(diào)控蛋白中:
AUU37%IleAUC62%AUA1%在dnaG中22個(gè)Ilecodons
AUU36%
IleAUC32%
AUA32%第98頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四(二)二級(jí)結(jié)構(gòu)對(duì)翻譯延伸的調(diào)控第99頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四三、翻譯的終止調(diào)控(一)嚴(yán)緊反應(yīng)(strigentresponse)(1)ppGpp—四磷酸鳥苷(魔斑ImagicspotI)
是調(diào)控一些反應(yīng)的效應(yīng)物,有多種功能,但主要功能是:①抑制rRNA基因的啟動(dòng)子;②抑制多數(shù)或大多數(shù)基因轉(zhuǎn)錄的延伸。(2)pppGpp—五磷酸鳥苷(魔斑IImagicspotII)空轉(zhuǎn)反應(yīng)(idlingreaction)松馳型突變(relaxed(rel)mutants)應(yīng)急因子(stringentfactor)第100頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四蛋白質(zhì)的正常合成及饑餓時(shí)的嚴(yán)緊反應(yīng)第101頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四ppGpp
對(duì)rnn
轉(zhuǎn)錄的
抑制第102頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四(spoT編碼一種酶,提供ppGpp主要降解途徑)第103頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四(二)
mRNA穩(wěn)定性對(duì)翻譯的調(diào)控第104頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四謝謝!第105頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四1、關(guān)于管家基因敘述錯(cuò)誤的是
(A)在生物個(gè)體的幾乎各生長(zhǎng)階段持續(xù)表達(dá)
(B)在生物個(gè)體的幾乎所有細(xì)胞中持續(xù)表達(dá)
(C)在生物個(gè)體全生命過(guò)程的幾乎所有細(xì)胞中表達(dá)
(D)在生物個(gè)體的某一生長(zhǎng)階段持續(xù)表達(dá)
(E)在一個(gè)物種的幾乎所有個(gè)體中持續(xù)表達(dá)D第106頁(yè),共115頁(yè),2023年,2月20日,星期四2、一個(gè)操縱子(元)通常含有
(A)數(shù)個(gè)啟
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