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核酸(nucleicacid)
是以核苷酸為基本組成單位的生物大分子,攜帶和傳遞遺傳信息。當(dāng)前第1頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)一、核酸的發(fā)現(xiàn)和研究工作進(jìn)展1868年FridrichMiescher從膿細(xì)胞中提取“核素”1944年Avery等人證實(shí)DNA是遺傳物質(zhì)1953年Watson和Crick發(fā)現(xiàn)DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)1968年Nirenberg發(fā)現(xiàn)遺傳密碼1975年Temin和Baltimore發(fā)現(xiàn)逆轉(zhuǎn)錄酶1981年Gilbert和Sanger建立DNA測(cè)序方法1985年Mullis發(fā)明PCR技術(shù)1990年美國(guó)啟動(dòng)人類基因組計(jì)劃(HGP)
1994年中國(guó)人類基因組計(jì)劃啟動(dòng)2001年美、英等國(guó)完成人類基因組計(jì)劃基本框架當(dāng)前第2頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)二、核酸的分類及分布90%以上分布于細(xì)胞核,其余分布于核外如線粒體,葉綠體,質(zhì)粒等。分布于胞核、胞液。(deoxyribonucleicacid,DNA)(ribonucleicacid,RNA)脫氧核糖核酸核糖核酸攜帶遺傳信息,決定細(xì)胞和個(gè)體的基因型(genotype)。參與細(xì)胞內(nèi)DNA遺傳信息的表達(dá)。某些病毒RNA也可作為遺傳信息的載體。當(dāng)前第3頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)第一節(jié)核酸的化學(xué)組成及其一級(jí)結(jié)構(gòu)TheChemicalComponentandPrimaryStructureofNucleicAcid當(dāng)前第4頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)核酸的化學(xué)組成1.元素組成C、H、O、N、P(9~10%)2.分子組成——堿基(base):嘌呤堿,嘧啶堿——戊糖(ribose):核糖,脫氧核糖——磷酸(phosphate)當(dāng)前第5頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)嘌呤(purine)腺嘌呤(adenine,A)鳥嘌呤(guanine,G)堿基當(dāng)前第6頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)嘧啶(pyrimidine)胞嘧啶(cytosine,C)尿嘧啶(uracil,U)胸腺嘧啶(thymine,T)當(dāng)前第7頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)稀有堿基嘌呤——次黃嘌呤、1-甲基次黃嘌呤、N2、N2-二甲基鳥嘌呤。嘧啶——5-甲基胞嘧啶、5-羥甲基胞嘧啶、二氫尿嘧啶、4-巰尿嘧啶都是基本堿基的化學(xué)修飾型。當(dāng)前第8頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)鳥嘌呤次黃嘌呤1-甲基次黃嘌呤當(dāng)前第9頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)戊糖(構(gòu)成RNA)1′2′3′4′5′核糖(ribose)(構(gòu)成DNA)脫氧核糖(deoxyribose)當(dāng)前第10頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)核苷:AR,GR,UR,CR脫氧核苷:dAR,dGR,dTR,dCR一、核苷酸的結(jié)構(gòu)1.核苷(ribonucleoside)的形成堿基和核糖(脫氧核糖)通過糖苷鍵連接形成核苷(脫氧核苷)。1′1當(dāng)前第11頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)核苷酸:AMP,GMP,UMP,CMP脫氧核苷酸:dAMP,dGMP,dTMP,dCMP
2.核苷酸(ribonucleotide)的結(jié)構(gòu)與命名核苷(脫氧核苷)和磷酸以磷酸酯鍵連接形成核苷酸(脫氧核苷酸)。
當(dāng)前第12頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)例如:AMPadenosinemonophosphate腺苷一磷酸或一磷酸腺苷簡(jiǎn)稱:腺苷酸dAMPdeoxyadenosinemonophosphate脫氧一磷酸腺苷/一磷酸脫氧腺苷簡(jiǎn)稱:脫氧腺苷酸默認(rèn)情況下核苷酸均為5'-核苷酸當(dāng)前第13頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)體內(nèi)重要的游離核苷酸及其衍生物多磷酸核苷酸:NMP,NDP,NTP能量的直接共體能量直接共體當(dāng)前第14頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)
環(huán)化核苷酸:cAMP,cGMP細(xì)胞內(nèi)的第二信使當(dāng)前第15頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)含核苷酸的生物活性物質(zhì):NAD+、NADP+、CoA-SH、FAD等都含有AMPNADP+NAD+當(dāng)前第16頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)核苷酸的生物學(xué)功用作為核酸合成的原料體內(nèi)能量的利用形式參與代謝和生理調(diào)節(jié)組成輔酶活化中間代謝物當(dāng)前第17頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)5′端3′端3.核苷酸的連接核苷酸之間以磷酸二酯鍵連接形成多核苷酸鏈,即核酸。CGA當(dāng)前第18頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)二、核酸的一級(jí)結(jié)構(gòu)定義核酸中核苷酸的排列順序。由于核苷酸間的差異主要是堿基不同,所以也稱為堿基序列。5′端3′端CGA方向當(dāng)前第19頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)AGP5PTPGPCPTPOH3書寫方法5pApCpTpGpCpT-OH
35
ACTGCT
3當(dāng)前第20頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)第二節(jié)DNA的空間結(jié)構(gòu)與功能DimensionalStructureandFunctionofDNA當(dāng)前第21頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)一、DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)——雙螺旋結(jié)構(gòu)當(dāng)前第22頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)(一)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的研究背景堿基組成分析Chargaff規(guī)則:[A]=[T][G][C]堿基的理化數(shù)據(jù)分析A-T、G-C以氫鍵配對(duì)較合理DNA纖維的X-線衍射圖譜分析當(dāng)前第23頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)A.DNA堿基互補(bǔ)原則腺嘌呤胸腺嘧啶鳥嘌呤胞嘧啶其他組合易相互排斥例如G:T*因此,DNA的雙股系藉著A:T和G
:
C的配對(duì)關(guān)系互相結(jié)合。當(dāng)前第24頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)DNA一股的核苷酸序列與另一股的序列
互補(bǔ)(A-T、G-C)。當(dāng)前第25頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)B.二級(jí)結(jié)構(gòu)—B型雙螺旋結(jié)構(gòu)大部分DNA所具有的雙螺旋結(jié)構(gòu),亦稱為B型小溝大溝1.反向、平行、右手螺旋5`3`5`3`2.鏈間堿基配對(duì)相連3.每10個(gè)堿基對(duì)螺旋上升一周當(dāng)前第26頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)C.雙螺旋結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定因素DNA雙螺旋在生理狀態(tài)下十分穩(wěn)定,結(jié)構(gòu)不發(fā)生變化。提問:起穩(wěn)定作用的有哪些力呢?答案:疏水作用力(主要)
(又稱堿基堆積力)
氫鍵
范德華力當(dāng)前第27頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)(二)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型要點(diǎn)
(Watson,Crick,1953)堿基垂直螺旋軸居雙螺旋內(nèi)側(cè),與對(duì)側(cè)堿基形成氫鍵配對(duì)(互補(bǔ)配對(duì)形式:A=T;GC)。相鄰堿基平面距離0.34nm,螺旋一圈螺距3.4nm,一圈10對(duì)堿基。當(dāng)前第28頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)堿基互補(bǔ)配對(duì)TAGC當(dāng)前第29頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)(二)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型要點(diǎn)
(Watson,Crick,1953)氫鍵維持雙鏈橫向穩(wěn)定性,堿基堆積力維持雙鏈縱向穩(wěn)定性。當(dāng)前第30頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)(三)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的多樣性Z型DNAB型DNAA型DNA當(dāng)前第31頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)二、DNA的超螺旋結(jié)構(gòu)及其在染色質(zhì)中的組裝(一)DNA的超螺旋結(jié)構(gòu)超螺旋結(jié)構(gòu)(superhelix或supercoil)DNA雙螺旋鏈再盤繞即形成超螺旋結(jié)構(gòu)。正超螺旋(positivesupercoil)盤繞方向與DNA雙螺旋方同相同負(fù)超螺旋(negativesupercoil)盤繞方向與DNA雙螺旋方向相反當(dāng)前第32頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)原核生物以及真核生物細(xì)胞器環(huán)狀DNA的超螺旋三級(jí)結(jié)構(gòu)葉綠體中含有環(huán)狀DNA線粒體中含有環(huán)狀DNA細(xì)菌等原核生物質(zhì)粒染色體當(dāng)前第33頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)固定負(fù)超螺旋(右手拓?fù)浣Y(jié)構(gòu))反之,則為正超螺旋自然界通常為負(fù)超螺旋。提問:DNA形成三級(jí)結(jié)構(gòu)及染色體的意義何在?答案:壓縮分子空間人體每個(gè)體細(xì)胞DNA長(zhǎng)2m,細(xì)胞直徑0.1mm,細(xì)胞核0.05mm環(huán)狀DNA右旋當(dāng)前第34頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)DNA的三級(jí)結(jié)構(gòu):DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)進(jìn)一步盤曲形成的復(fù)雜結(jié)構(gòu)。以超螺旋最為常見負(fù)超螺旋模型(多見)正超螺旋當(dāng)前第35頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)意義DNA超螺旋結(jié)構(gòu)整體或局部的拓?fù)鋵W(xué)變化及其調(diào)控對(duì)于DNA復(fù)制和RNA轉(zhuǎn)錄過程具有關(guān)鍵作用。當(dāng)前第36頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)(三)DNA在真核生物細(xì)胞核內(nèi)的組裝真核生物染色體由DNA和蛋白質(zhì)構(gòu)成,其基本單位是核小體(nucleosome)。核小體的組成DNA:約200bp組蛋白:H1H2A,H2BH3H4當(dāng)前第37頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)當(dāng)前第38頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)串珠狀核小體結(jié)構(gòu)當(dāng)前第39頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)串珠狀核小體DNA雙螺旋片段染色質(zhì)纖維伸展形染色質(zhì)片段密集形染色質(zhì)片段整個(gè)染色體當(dāng)前第40頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)核小體螺線管真核生物染色體DNA組裝當(dāng)前第41頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn).真核細(xì)胞染色體的DNA念珠狀三級(jí)結(jié)構(gòu)當(dāng)前第42頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)三、DNA的功能DNA的基本功能是以基因的形式荷載遺傳信息,并作為基因復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的模板。它是生命遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ),也是個(gè)體生命活動(dòng)的信息基礎(chǔ)?;驈慕Y(jié)構(gòu)上定義,是指DNA分子中的特定區(qū)段,其中的核苷酸排列順序決定了基因的功能。當(dāng)前第43頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)第三節(jié)
RNA的結(jié)構(gòu)與功能StructureandFunctionofRNA當(dāng)前第44頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)RNA的種類、分布、功能當(dāng)前第45頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)一、信使RNA的結(jié)構(gòu)與功能hnRNA內(nèi)含子(intron)mRNA*mRNA成熟過程
外顯子(exon)當(dāng)前第46頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)*mRNA結(jié)構(gòu)特點(diǎn)1.大多數(shù)真核mRNA的5′末端均在轉(zhuǎn)錄后加上一個(gè)7-甲基鳥苷,同時(shí)第一個(gè)核苷酸的C′2也是甲基化,形成帽子結(jié)構(gòu):m7GpppNm-。2.大多數(shù)真核mRNA的3′末端有一個(gè)多聚腺苷酸(polyA)結(jié)構(gòu),稱為多聚A尾。當(dāng)前第47頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)帽子結(jié)構(gòu)當(dāng)前第48頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)mRNA核內(nèi)向胞質(zhì)的轉(zhuǎn)位mRNA的穩(wěn)定性維系翻譯起始的調(diào)控帽子結(jié)構(gòu)和多聚A尾的功能當(dāng)前第49頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)*mRNA的功能把DNA所攜帶的遺傳信息,按堿基互補(bǔ)配對(duì)原則,抄錄并傳送至核糖體,用以決定其合成蛋白質(zhì)的氨基酸排列順序。DNAmRNA蛋白轉(zhuǎn)錄翻譯原核細(xì)胞細(xì)胞質(zhì)細(xì)胞核DNA內(nèi)含子外顯子轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)錄后剪接轉(zhuǎn)運(yùn)mRNAhnRNA翻譯蛋白真核細(xì)胞當(dāng)前第50頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)*
tRNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)特點(diǎn)含10~20%稀有堿基,如DHU3′末端為—CCA-OH5′末端大多數(shù)為G
具有TC二、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA的結(jié)構(gòu)與功能當(dāng)前第51頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)N,N二甲基鳥嘌呤N6-異戊烯腺嘌呤雙氫尿嘧啶4-巰尿嘧啶稀有堿基當(dāng)前第52頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)*tRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)——三葉草形
氨基酸臂DHU環(huán)反密碼環(huán)額外環(huán)TΨC環(huán)氨基酸臂額外環(huán)當(dāng)前第53頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)*tRNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)——倒L形*tRNA的功能活化、搬運(yùn)氨基酸到核糖體,參與蛋白質(zhì)的翻譯。當(dāng)前第54頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)*rRNA的結(jié)構(gòu)三、核蛋白體RNA的結(jié)構(gòu)與功能*rRNA的功能參與組成核蛋白體,作為蛋白質(zhì)生物合成的場(chǎng)所。當(dāng)前第55頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)*rRNA的種類(根據(jù)沉降系數(shù))真核生物5SrRNA28SrRNA5.8SrRNA18SrRNA原核生物5SrRNA23SrRNA16SrRNA當(dāng)前第56頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)核蛋白體的組成當(dāng)前第57頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)四、其他小分子RNA及RNA組學(xué)除了上述三種RNA外,細(xì)胞的不同部位存在的許多其他種類的小分子RNA,統(tǒng)稱為非mRNA小RNA(smallnon-messengerRNAs,snmRNAs)。
snmRNAs當(dāng)前第58頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)snmRNAs的種類核內(nèi)小RNA核仁小RNA胞質(zhì)小RNA催化性小RNA小片段干涉RNA
snmRNAs的功能參與hnRNA和rRNA的加工和轉(zhuǎn)運(yùn)。當(dāng)前第59頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)RNA組學(xué)研究細(xì)胞中snmRNAs的種類、結(jié)構(gòu)和功能。同一生物體內(nèi)不同種類的細(xì)胞、同一細(xì)胞在不同時(shí)間、不同狀態(tài)下snmRNAs的表達(dá)具有時(shí)間和空間特異性。RNA組學(xué)當(dāng)前第60頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)核酸的理化性質(zhì)ThePhysicalandChemicalCharactersofNucleicAcid第四節(jié)目錄當(dāng)前第61頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)當(dāng)前第62頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)1.DNA或RNA的定量OD260=1.0相當(dāng)于50μg/ml雙鏈DNA40μg/ml單鏈DNA(或RNA)20μg/ml寡核苷酸2.判斷核酸樣品的純度DNA純品:OD260/OD280=1.8RNA純品:OD260/OD280=2.0OD260的應(yīng)用目錄當(dāng)前第63頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)二、DNA的變性(denaturation)定義:在某些理化因素作用下,DNA雙鏈解開成兩條單鏈的過程。方法:過量酸,堿,加熱,變性試劑如尿素、酰胺以及某些有機(jī)溶劑如乙醇、丙酮等。變性后其它理化性質(zhì)變化:OD260增高 粘度下降比旋度下降 浮力密度升高酸堿滴定曲線改變 生物活性喪失目錄當(dāng)前第64頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)DNA變性的本質(zhì)是雙鏈間氫鍵的斷裂當(dāng)前第65頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)例:變性引起紫外吸收值的改變DNA的紫外吸收光譜增色效應(yīng):DNA變性時(shí)其溶液OD260增高的現(xiàn)象。目錄當(dāng)前第66頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)熱變性解鏈曲線:如果在連續(xù)加熱DNA的過程中以溫度對(duì)A260(absorbance,A,A260代表溶液在260nm處的吸光率)值作圖,所得的曲線稱為解鏈曲線。目錄當(dāng)前第67頁\共有75頁\編于星期三\8點(diǎn)Tm:變性是在一個(gè)相當(dāng)窄的溫度范圍內(nèi)完成,在這一范圍內(nèi),紫外光吸收值達(dá)到
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