2025年大學(xué)《生物信息學(xué)》專(zhuān)業(yè)題庫(kù)——長(zhǎng)鏈非編碼RNA與疾病的生物信息學(xué)分析考試時(shí)間：______分鐘總分：______分姓名：______一、選擇題（每題2分，共20分）1.下列哪一項(xiàng)不屬于長(zhǎng)鏈非編碼RNA（lncRNA）的特征？A.相對(duì)分子量大于200ntB.通常不編碼蛋白質(zhì)C.在基因組中廣泛分布D.具有復(fù)雜的二級(jí)結(jié)構(gòu)2.lncRNA根據(jù)其功能可以分為哪幾類(lèi)？A.啟動(dòng)子調(diào)控、染色質(zhì)修飾、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控B.順式作用、反式作用、混合作用C.終端重復(fù)、內(nèi)部重復(fù)、衛(wèi)星重復(fù)D.啟動(dòng)子相關(guān)、enhancer相關(guān)、silencer相關(guān)3.下列哪種生物信息學(xué)工具可以用于預(yù)測(cè)lncRNA的靶基因？A.CytoscapeB.RNAhybridC.BLASTD.GeneMANIA4.lncRNA的表達(dá)譜分析通常使用什么方法？A.染色質(zhì)免疫共沉淀（ChIP）B.RNA測(cè)序（RNA-seq）C.比較基因組雜交（CGH）D.表觀遺傳學(xué)測(cè)序5.下列哪個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)專(zhuān)門(mén)收集和整理lncRNA相關(guān)的信息？A.NCBIB.EnsemblC.lncipediaD.UniProt6.lncRNA與疾病相關(guān)的生物信息學(xué)分析方法主要包括哪些？A.基因集富集分析、生存分析、機(jī)器學(xué)習(xí)B.序列比對(duì)、結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)、系統(tǒng)發(fā)育分析C.基因表達(dá)譜聚類(lèi)、差異表達(dá)分析、通路分析D.質(zhì)譜分析、核磁共振、X射線(xiàn)晶體學(xué)7.lncRNA在癌癥發(fā)生發(fā)展中的作用機(jī)制可能包括哪些？A.調(diào)控基因表達(dá)、影響染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、參與信號(hào)通路B.促進(jìn)細(xì)胞增殖、抑制細(xì)胞凋亡、促進(jìn)血管生成C.改變細(xì)胞形態(tài)、影響細(xì)胞運(yùn)動(dòng)、促進(jìn)細(xì)胞分化D.以上都是8.下列哪種技術(shù)可以用于檢測(cè)lncRNA與蛋白質(zhì)的相互作用？A.RNA免疫沉淀（RIP）B.蛋白質(zhì)測(cè)序（Proteomics）C.基因編輯（CRISPR）D.基因敲除（Knockout）9.lncRNA作為疾病診斷標(biāo)志物的生物信息學(xué)分析需要考慮哪些因素？A.表達(dá)穩(wěn)定性、特異性、可檢測(cè)性B.基因長(zhǎng)度、基因數(shù)量、基因密度C.堿基組成、二級(jí)結(jié)構(gòu)、三級(jí)結(jié)構(gòu)D.蛋白質(zhì)結(jié)合能力、酶活性、代謝穩(wěn)定性10.lncRNA靶向治療的生物信息學(xué)策略主要包括哪些？A.靶向lncRNA的寡核苷酸藥物設(shè)計(jì)、藥物篩選、作用機(jī)制預(yù)測(cè)B.基因編輯、基因沉默、基因表達(dá)調(diào)控C.蛋白質(zhì)靶向、小分子抑制劑、抗體藥物D.以上都是二、填空題（每空1分，共10分）1.長(zhǎng)鏈非編碼RNA（lncRNA）是長(zhǎng)度大于__200__nt的非蛋白質(zhì)編碼RNA分子。2.lncRNA的表達(dá)調(diào)控機(jī)制主要包括__表觀遺傳修飾__、__轉(zhuǎn)錄調(diào)控__和__轉(zhuǎn)錄后調(diào)控__。3.RNA測(cè)序（RNA-seq）是研究lncRNA表達(dá)譜的常用技術(shù)，它可以提供__基因序列__和__豐度__信息。4.lncRNA與疾病相關(guān)的生物信息學(xué)分析可以幫助我們識(shí)別__疾病標(biāo)志物__和__潛在治療靶點(diǎn)__。5.lncRNA靶向治療是一種基于__lncRNA功能__的疾病治療策略，它可以通過(guò)__抑制或調(diào)控lncRNA的表達(dá)__來(lái)達(dá)到治療目的。三、簡(jiǎn)答題（每題5分，共20分）1.簡(jiǎn)述lncRNA在染色質(zhì)結(jié)構(gòu)中的作用機(jī)制。2.簡(jiǎn)述lncRNA與蛋白質(zhì)相互作用的幾種主要方式。3.簡(jiǎn)述lncRNA作為疾病診斷標(biāo)志物的優(yōu)勢(shì)。4.簡(jiǎn)述lncRNA靶向治療的挑戰(zhàn)和前景。四、論述題（10分）結(jié)合你所學(xué)的知識(shí)，論述lncRNA在癌癥發(fā)生發(fā)展中的作用及其生物信息學(xué)分析策略。試卷答案一、選擇題1.D解析：lncRNA通常不形成復(fù)雜的二級(jí)結(jié)構(gòu)。2.A解析：lncRNA根據(jù)其功能可以分為啟動(dòng)子調(diào)控、染色質(zhì)修飾、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控等類(lèi)別。3.B解析：RNAhybrid是用于預(yù)測(cè)lncRNA靶基因的經(jīng)典生物信息學(xué)工具。4.B解析：RNA測(cè)序（RNA-seq）可以全面分析lncRNA的表達(dá)譜。5.C解析：lncipedia是一個(gè)專(zhuān)門(mén)收集和整理lncRNA信息的數(shù)據(jù)庫(kù)。6.A解析：基因集富集分析、生存分析、機(jī)器學(xué)習(xí)是lncRNA與疾病相關(guān)的常用生物信息學(xué)分析方法。7.D解析：lncRNA在癌癥發(fā)生發(fā)展中的作用機(jī)制包括調(diào)控基因表達(dá)、影響染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、參與信號(hào)通路等，ABC都是其作用機(jī)制的具體表現(xiàn)。8.A解析：RNA免疫沉淀（RIP）可以檢測(cè)lncRNA與蛋白質(zhì)的相互作用。9.A解析：lncRNA作為疾病診斷標(biāo)志物需要考慮表達(dá)穩(wěn)定性、特異性、可檢測(cè)性等因素。10.D解析：lncRNA靶向治療的生物信息學(xué)策略包括靶向lncRNA的寡核苷酸藥物設(shè)計(jì)、藥物篩選、作用機(jī)制預(yù)測(cè)，基因編輯、基因沉默、基因表達(dá)調(diào)控，蛋白質(zhì)靶向、小分子抑制劑、抗體藥物等。二、填空題1.200解析：lncRNA的定義是長(zhǎng)度大于200nt的非蛋白質(zhì)編碼RNA分子。2.表觀遺傳修飾、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控解析：lncRNA的表達(dá)調(diào)控機(jī)制主要包括表觀遺傳修飾、轉(zhuǎn)錄調(diào)控和轉(zhuǎn)錄后調(diào)控。3.基因序列、豐度解析：RNA測(cè)序（RNA-seq）可以提供lncRNA的基因序列和豐度信息。4.疾病標(biāo)志物、潛在治療靶點(diǎn)解析：lncRNA與疾病相關(guān)的生物信息學(xué)分析可以幫助我們識(shí)別疾病標(biāo)志物和潛在治療靶點(diǎn)。5.lncRNA功能、抑制或調(diào)控lncRNA的表達(dá)解析：lncRNA靶向治療是一種基于lncRNA功能的疾病治療策略，它可以通過(guò)抑制或調(diào)控lncRNA的表達(dá)來(lái)達(dá)到治療目的。三、簡(jiǎn)答題1.lncRNA可以通過(guò)與蛋白質(zhì)結(jié)合形成復(fù)合物，影響染色質(zhì)結(jié)構(gòu)，例如通過(guò)招募組蛋白修飾酶來(lái)改變組蛋白乙?；?、甲基化等狀態(tài)，從而調(diào)控基因的表達(dá)。2.lncRNA與蛋白質(zhì)相互作用的方式主要包括：直接與蛋白質(zhì)結(jié)合、通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合RNA結(jié)合蛋白（RBP）間接影響蛋白質(zhì)功能、通過(guò)與其他RNA分子相互作用進(jìn)而影響蛋白質(zhì)功能。3.lncRNA作為疾病診斷標(biāo)志物的優(yōu)勢(shì)在于其表達(dá)具有組織特異性和疾病特異性，且相對(duì)穩(wěn)定，易于檢測(cè)。4.lncRNA靶向治療的挑戰(zhàn)在于lncRNA的序列保守性較低、靶點(diǎn)特異性不高、體內(nèi)穩(wěn)定性差等。前景在于隨著生物信息學(xué)技術(shù)的進(jìn)步和藥物delivery系統(tǒng)的優(yōu)化，有望成為癌癥等疾病的新型治療策略。四、論述題lncRNA在癌癥發(fā)生發(fā)展中的作用包括：通過(guò)調(diào)控靶基因的表達(dá)影響細(xì)胞增殖、凋亡、侵襲和轉(zhuǎn)移等過(guò)程；通過(guò)影響染色質(zhì)結(jié)構(gòu)調(diào)