基于數(shù)據(jù)倉庫技術(shù)的中藥科學(xué)實(shí)驗(yàn)信息數(shù)據(jù)庫

中藥實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)倉庫是科技部基礎(chǔ)性課題--一”中醫(yī)藥科技信息數(shù)據(jù)庫”的子課題之一。收錄范圍是自1990

年以來公開出版在中文醫(yī)學(xué)期刊上的有關(guān)中藥單味藥、方劑、化學(xué)成份在藥理、臨床藥理、毒理方面的一次實(shí)驗(yàn)

文獻(xiàn)。課題總周期三年，目前已經(jīng)送行了兩年。

1.概況：

本數(shù)據(jù)庫采用計(jì)算機(jī)數(shù)據(jù)倉庫技術(shù)，在忠實(shí)于原文獻(xiàn)內(nèi)容的基礎(chǔ)上，按照中藥學(xué)研究的特點(diǎn)，建立了十五個(gè)

空間維，將收錄內(nèi)容進(jìn)行編輯和結(jié)構(gòu)化存儲(chǔ)，實(shí)現(xiàn)了對(duì)中醫(yī)藥文獻(xiàn)資料中出現(xiàn)的術(shù)語進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)表達(dá)以及術(shù)語間的

相互關(guān)系的多重組合形式，用戶可以進(jìn)行研究數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)和相關(guān)多維的頻次統(tǒng)計(jì)，作為藥廠、臨床、科研、管理、

教學(xué)工作者必需的查詢工具，將為啟發(fā)科研思路，開掘出具有突出療效的新藥提供依據(jù)。

在科技部領(lǐng)導(dǎo)的關(guān)心，中醫(yī)研究院領(lǐng)導(dǎo)的支持下，我們采用遠(yuǎn)程建庫的新模式，在浙江大學(xué)計(jì)算機(jī)系的技術(shù)

支持下，由全國六家省級(jí)中醫(yī)藥學(xué)院和研究院的50余位中藥專業(yè)人員通過互聯(lián)網(wǎng)進(jìn)行建庫工作。經(jīng)歷了基礎(chǔ)工

作準(zhǔn)備階段、人員培訓(xùn)與程序測(cè)試階段、大量數(shù)據(jù)加工階段，經(jīng)過深題組全體人員近兩年的共同努力，克服了多

重困難，解決了多項(xiàng)技術(shù)難點(diǎn)，到目前為止，數(shù)據(jù)已經(jīng)做到2002年，文獻(xiàn)量已經(jīng)到達(dá)20000余篇，數(shù)據(jù)量到達(dá)

38900余條，原文圖片到達(dá)55000余張,整體工作已經(jīng)根本完成，可以提供網(wǎng)上數(shù)據(jù)查詢與效勞。局部數(shù)據(jù)已經(jīng)

投入使用與應(yīng)用，實(shí)現(xiàn)了網(wǎng)上科技實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的便利檢索與精確統(tǒng)計(jì)分析利用。

2.目標(biāo)與方案：

2.1目標(biāo)：依據(jù)中醫(yī)藥科技期刊文獻(xiàn)科學(xué)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)，利用數(shù)據(jù)倉庫技術(shù)，建立中醫(yī)藥科學(xué)熨驗(yàn)信息數(shù)據(jù)倉庫，為

中藥新藥開發(fā)、科研創(chuàng)新及中醫(yī)臨床決策提供科研數(shù)據(jù)與思路。

2.2任務(wù)方案：初步完成中藥藥理、毒理、臨床藥理數(shù)據(jù)庫的整體結(jié)構(gòu)的設(shè)計(jì)，合理搭建結(jié)構(gòu)關(guān)聯(lián)型數(shù)據(jù)庫字段。

在完成數(shù)據(jù)庫應(yīng)用程序的設(shè)計(jì)與開發(fā)的基礎(chǔ)上，完成上述數(shù)據(jù)庫1990-2002年約20000條數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)與加工，提

供網(wǎng)上數(shù)據(jù)查詢與效勞。

3.課題設(shè)計(jì)思路與理念：

3.1關(guān)于數(shù)據(jù)倉庫的概念：

數(shù)據(jù)倉庫(DalaWarehouse)是一個(gè)面向主題的、集成的、相對(duì)穩(wěn)定的、反映歷史變化的數(shù)據(jù)集合，用于支

持管理決策。對(duì)丁數(shù)據(jù)倉庫的概念我們可以從兩個(gè)層次予以理解，首先，數(shù)據(jù)倉庫用丁支持決策，面向分析型數(shù)

據(jù)處理，它不同于企業(yè)現(xiàn)有的操作型數(shù)據(jù)庫；其次，數(shù)據(jù)倉庫是對(duì)多個(gè)異構(gòu)的數(shù)據(jù)源有效集成，集成后按照主題

進(jìn)行了重組，并包含歷史數(shù)據(jù)，而且存放在數(shù)據(jù)倉庫中的數(shù)據(jù)一般不再修改。

中藥藥理數(shù)據(jù)倉庫就是針對(duì)結(jié)構(gòu)不同的藥理學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)源，進(jìn)行抽取、清理，并有效集成，按照主題進(jìn)行組

織編輯，最后到達(dá)可以進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)和分析的目的。

3.2數(shù)據(jù)倉庫的建模方式：

數(shù)據(jù)倉庫建立的基礎(chǔ)是OracleA'arehouseBuilder,而邏輯建模是其實(shí)施中的重要一環(huán)，因?yàn)樗苤苯臃从?/p>

出技術(shù)需求，同時(shí)對(duì)系統(tǒng)的物理實(shí)施有著重要的指導(dǎo)作用。本數(shù)據(jù)倉庫采用了兩種建模方法，即第三范式和星型

模式。

范式是數(shù)據(jù)庫邏輯模型設(shè)計(jì)的根本理論,一個(gè)關(guān)系模型進(jìn)行無損分解的過程稱為標(biāo)準(zhǔn)化。在數(shù)據(jù)倉庫的模型

設(shè)計(jì)中目前一般采用第三范式，它有非常嚴(yán)格的數(shù)學(xué)定義。即必須具有三個(gè)條件：屬性量值唯一，不具有多義性；

非主屬性必須完全依賴整個(gè)主鍵；非主屬性不能依賴于其他關(guān)系中的屬性。

星型模式由一個(gè)事實(shí)表(FactTable)和一組維表(DimensionTable)組成，是一種多維的數(shù)據(jù)關(guān)系。事實(shí)表

主鍵的每個(gè)元素都是維表的外鍵。事實(shí)表的非主屬性稱為事實(shí)(Fact),它們一般都是數(shù)值或其他可以進(jìn)行計(jì)算的

數(shù)據(jù)；而維大都是文字、時(shí)間等類型的數(shù)據(jù)實(shí)體。

4.課題設(shè)計(jì)謀略與原則：

4.1依照中藥藥理學(xué)科分類，篩選中藥實(shí)驗(yàn)藥理數(shù)據(jù)歸類：

根據(jù)中藥藥理學(xué)科分類特點(diǎn)，按照中藥藥理學(xué)范圍進(jìn)行實(shí)驗(yàn)藥理數(shù)據(jù)歸類；選擇主要數(shù)據(jù)項(xiàng)，利用結(jié)構(gòu)化形式，

表達(dá)數(shù)據(jù)特征與數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)方式。

4.2依照數(shù)據(jù)特點(diǎn)與現(xiàn)狀，設(shè)計(jì)中藥藥理實(shí)驗(yàn)倉庫的結(jié)構(gòu);

利用數(shù)據(jù)倉庫的概念和技術(shù)，從一般數(shù)據(jù)庫中抽取相關(guān)主題所需要的數(shù)據(jù)。找出中藥科學(xué)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分布特點(diǎn)，

研究數(shù)據(jù)的主題信息抽取數(shù)最，是構(gòu)思數(shù)據(jù)倉庫的基礎(chǔ)。在前期對(duì)中藥實(shí)驗(yàn)藥理血瘀證專題的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析與統(tǒng)

計(jì)時(shí)，發(fā)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)方法種類繁多，實(shí)驗(yàn)角度各有不同，數(shù)據(jù)值表達(dá)分散、涉及范圍廣泛，數(shù)據(jù)具有“高維、小樣本"

的特點(diǎn)，過分細(xì)化結(jié)構(gòu)很難發(fā)現(xiàn)共性規(guī)律；因而針對(duì)中藥藥理實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的現(xiàn)狀，降解難度，減少實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)倉庫的

建模方式，篩選了有一定分析與統(tǒng)計(jì)意義的十五個(gè)數(shù)據(jù)維（文獻(xiàn)出處、單味藥、化學(xué)成分、方劑、劑型、疾病、

證候、表現(xiàn)、病理生理、效應(yīng)部位、微生物、藥理分類、臨床藥理分類、毒理分類、指標(biāo)），十五個(gè)維根本全面

表達(dá)了中藥科學(xué)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的內(nèi)涵值，可以支撐數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析。

4.3依照數(shù)據(jù)倉庫建模方法，編輯加工中藥藥理實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)倉庫數(shù)據(jù)；

中藥藥理數(shù)據(jù)倉庫共建立了十五個(gè)維，每個(gè)維具有獨(dú)立屬性，通過后臺(tái)的相互關(guān)聯(lián)，共同組成事實(shí)表達(dá)方式。

由于數(shù)據(jù)倉庫需要數(shù)據(jù)值的標(biāo)準(zhǔn)化與術(shù)語用語的標(biāo)準(zhǔn)化；囚而，在總體構(gòu)架實(shí)現(xiàn)的基礎(chǔ)上，必須研制中藥藥理學(xué)

科涉及的常用術(shù)語與標(biāo)準(zhǔn)化加工方法。同時(shí)建立了十四張標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)表格，便于數(shù)據(jù)加工與利用。杈據(jù)中藥科學(xué)實(shí)

驗(yàn)數(shù)據(jù)的特點(diǎn)，對(duì)選擇的數(shù)據(jù)進(jìn)行結(jié)構(gòu)化處理，對(duì)中藥科學(xué)實(shí)驗(yàn)的對(duì)象、主要內(nèi)容、方法與研制指標(biāo)等數(shù)據(jù)進(jìn)行

抽取與加工。

5.研制標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)：

5.1科技基礎(chǔ)數(shù)據(jù)收集范圍與原則：

收錄范圍是自1990年以來公開出版在中文生物醫(yī)學(xué)期刊上的有關(guān)中藥單味藥、方劑、化學(xué)成份在藥理、臨

床藥理、毒理方面的一次實(shí)驗(yàn)工程。收錄原則：全面收錄中藥實(shí)驗(yàn)研究的一次文獻(xiàn)數(shù)據(jù)，轉(zhuǎn)載或綜述性文章均不

在收錄范圍內(nèi)。

5.2科技基礎(chǔ)數(shù)據(jù)編輯加工流程：

課題組制定良好的工作流程：口心組文獻(xiàn)初篩與加工人員二次復(fù)篩一一主題抽取一一標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)表一一數(shù)據(jù)

編輯加工、全文圖片上傳一一數(shù)據(jù)初審一一數(shù)據(jù)二審一一總審一一數(shù)據(jù)拆分一一修改補(bǔ)充標(biāo)準(zhǔn)表

5.3數(shù)據(jù)編輯加工標(biāo)準(zhǔn)與細(xì)則：

建立與研制了《中藥藥理數(shù)據(jù)倉庫的編輯流程和技術(shù)要求》、《全文圖片掃描技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)》、《中藥藥理實(shí)驗(yàn)倉

庫的質(zhì)量考核標(biāo)準(zhǔn)》等一系列操作手冊(cè)和質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)。

5.4研制并建立了中藥實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)倉庫標(biāo)準(zhǔn)表：

研制并建立了單味藥、化學(xué)成分、方劑、劑型、疾病、證候、表現(xiàn)、病理生理、效應(yīng)部位、微生物、藥理分

類、臨床藥理分類、毒理分類、指標(biāo)等十四張標(biāo)準(zhǔn)表。

6.研制應(yīng)用程序：在浙江大學(xué)的配合下，完成了具體應(yīng)用程序與數(shù)據(jù)加工管理程序;

程序名稱工具環(huán)境內(nèi)容與功能

數(shù)據(jù)倉庫數(shù)據(jù)AspWin2000,I中藥實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)倉庫的錄入局部，網(wǎng)上建立了基于標(biāo)準(zhǔn)

錄入界面IIS5.0數(shù)據(jù)查詢的功能，可進(jìn)行遠(yuǎn)程數(shù)據(jù)加工、歸類、分組、

整理的操作，并實(shí)現(xiàn)遠(yuǎn)程加工數(shù)據(jù)在線人員管理。

數(shù)據(jù)倉庫分析AspWin2000,中藥系統(tǒng)相關(guān)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析界面，提供了查詢中醫(yī)藥

界面IIS5.0文獻(xiàn)資料中出現(xiàn)的術(shù)語以及術(shù)語組合進(jìn)行頻次統(tǒng)計(jì)

的有效途徑。

標(biāo)準(zhǔn)詞匯表杳AspWin2000,基于web的標(biāo)準(zhǔn)庫查詢系統(tǒng)，為中藥基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫與中

詢IIS5.0藥實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)庫提供了標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)查詢與應(yīng)用。

Web標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)VBWindows用于web標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)庫的管理界面，實(shí)現(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)的倒

庫管理界面入、倒出與標(biāo)準(zhǔn)表的增加、刪除與修改等功能。

數(shù)據(jù)倉庫管理VBWindows用于數(shù)據(jù)倉庫數(shù)據(jù)的管理界面，實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)倉庫的審校

界面與加工數(shù)據(jù)量的統(tǒng)計(jì)，并對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行結(jié)構(gòu)拆分，將數(shù)

據(jù)倒入15維的數(shù)據(jù)倉庫中，實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)庫拆分功能。

標(biāo)準(zhǔn)表管理程VBWindows中藥標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)庫的VB錄入界面，可實(shí)現(xiàn)本地對(duì)中藥

序基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)加工、修改與審定，并可實(shí)現(xiàn)新數(shù)

據(jù)的增加與管理。

Oracle文獻(xiàn)數(shù)VBWindows把文獻(xiàn)庫和圖片庫相關(guān)檢索和瀏覽，在本地局域網(wǎng)內(nèi)

據(jù)庫和全文庫實(shí)現(xiàn)了對(duì)圖片的查詢。

的連接

7.完成課題任務(wù):

7.1完成數(shù)據(jù)庫加工建設(shè)任務(wù)：

本課題采用遠(yuǎn)程建庫的新模式，在浙江大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院的技術(shù)支持下，由全國六家省級(jí)中醫(yī)藥學(xué)

院和研究院的50余位中藥專業(yè)人員通過國際互聯(lián)網(wǎng)進(jìn)行建庫工作c經(jīng)歷了基礎(chǔ)工作準(zhǔn)備階段、人員培訓(xùn)與程序

測(cè)試階段、大量數(shù)據(jù)加工階段，經(jīng)過課題組全體人員近兩年的共同努力，克服了多重困難，解決了多項(xiàng)技術(shù)難點(diǎn),

到目前為止，實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)已收錄了20000余項(xiàng)，數(shù)據(jù)量到達(dá)38900余條，原文圖片到達(dá)55000余張。

7.2建立了數(shù)據(jù)管理與質(zhì)量控制方式：

設(shè)立了遠(yuǎn)程三級(jí)審校管理界面，實(shí)現(xiàn)了對(duì)異地遠(yuǎn)程加工過程的監(jiān)控與管理，不同的工作性質(zhì)擁有不同的管理

權(quán)限，實(shí)現(xiàn)了數(shù)據(jù)的三級(jí)管理方式與人員的遠(yuǎn)程在線管理。

7.3建立了數(shù)據(jù)倉庫應(yīng)用平臺(tái)：

數(shù)據(jù)倉庫平臺(tái)實(shí)現(xiàn)了對(duì)中藥科學(xué)實(shí)驗(yàn)文獻(xiàn)中出現(xiàn)的術(shù)語進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化表達(dá)，同時(shí)實(shí)現(xiàn)了術(shù)語間相互關(guān)系的多重

組合，用戶可根據(jù)不同需求進(jìn)行中藥科學(xué)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)，以及多維數(shù)據(jù)出現(xiàn)頻次的統(tǒng)計(jì)，通過頻次顯示相關(guān)數(shù)

據(jù)值在199()年后獲得重視的程度，用戶可在此科學(xué)實(shí)驗(yàn)信息數(shù)據(jù)倉庫的基礎(chǔ)上，了解與分析近年來中藥科學(xué)實(shí)

驗(yàn)的進(jìn)展情況，該平臺(tái)將成為藥廠、臨床、科研、管理、教學(xué)工作者有效的查詢工具，將為啟發(fā)科研思路，開掘

出具有突出療效的新藥提供依據(jù)。用戶可根據(jù)自己的需求，執(zhí)行相關(guān)操作程序，獲得所需數(shù)據(jù)。

7.4其他:

7.4.1人員技術(shù)培訓(xùn)：進(jìn)行了分中心人員技術(shù)培訓(xùn)，從計(jì)算機(jī)軟硬件配置，網(wǎng)絡(luò)條件、編輯和審校人員素質(zhì)、工

作數(shù)量和質(zhì)量控制等各方面，對(duì)其進(jìn)行了培訓(xùn)，為課題順利進(jìn)行打下了基礎(chǔ)；

7.4.2人員權(quán)限分級(jí)管理：開設(shè)了遠(yuǎn)程編輯人員與遠(yuǎn)程審校人員的權(quán)限分級(jí)帳號(hào)，便于管理；

7.4.3遠(yuǎn)程培訓(xùn)與編輯工作同步進(jìn)行：管理人員通過本地管理程序進(jìn)行及時(shí)的數(shù)據(jù)審校，發(fā)現(xiàn)問題即時(shí)與編輯人

員聯(lián)系，實(shí)現(xiàn)了遠(yuǎn)程培訓(xùn)與工作同步進(jìn)行；

7.4.4無時(shí)差、多途徑、遠(yuǎn)程培訓(xùn)模式：用各種現(xiàn)代化通訊方式，創(chuàng)立了無時(shí)差、多途徑、遠(yuǎn)程培訓(xùn)模式，在工

作中及時(shí)發(fā)現(xiàn)并解決問題，力爭把問題解決在萌芽狀態(tài)；

7.4.5年度考核：在年中、年末分別進(jìn)行了進(jìn)度和質(zhì)量考核，對(duì)先進(jìn)集體進(jìn)行精神和物質(zhì)嘉獎(jiǎng)；

7.4.6鼓勵(lì)機(jī)制：為了保護(hù)分中心人員的工作熱情，特別設(shè)置了“實(shí)驗(yàn)庫半月排行榜〃，每兩周進(jìn)行一次工作數(shù)

量、數(shù)據(jù)質(zhì)量、圖片質(zhì)量等各方面工作的名次排行，極大地表彰了先進(jìn)，鼓勵(lì)了暫時(shí)落后的單位。這個(gè)舉措得到

領(lǐng)導(dǎo)和各單位的一致好評(píng)；

7.4.7專題論證：組織對(duì)中藥實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)倉庫的論證，反復(fù)修改程序，召開論證會(huì)三次；

7.4.8廣泛征求專家意見:收集中藥實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)倉庫使用意見,就不同的導(dǎo)航形式與應(yīng)用方法廣泛征求了專家意見。

7.4.9設(shè)備更新與網(wǎng)絡(luò)升級(jí)：為保證果題軟硬件的實(shí)施，中心與各分中心進(jìn)行設(shè)備更新與網(wǎng)絡(luò)升級(jí)等工作，保證

了課題的順利進(jìn)行：

8.中藥藥理實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)倉庫應(yīng)用平臺(tái)：

本課題為中藥科學(xué)實(shí)驗(yàn)信息數(shù)據(jù)的利用提供了新的思路，提高了中藥科學(xué)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的利用度，對(duì)促進(jìn)中藥科

研的開展具有重要意義。中藥數(shù)據(jù)倉庫提供了用戶應(yīng)用平臺(tái)，構(gòu)建了數(shù)據(jù)查詢與應(yīng)用界面，作為口藥實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)倉

庫首次效勞于用戶，成為中藥學(xué)科及相關(guān)專業(yè)必備的工具。由于中藥數(shù)據(jù)倉庫技術(shù)起點(diǎn)高、結(jié)構(gòu)清晰、數(shù)據(jù)抽取

主題概念明確，因而提供了最大的效勞與應(yīng)用空間。同時(shí)，本平臺(tái)具備數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與頻次排序，提供了數(shù)據(jù)評(píng)價(jià)的

功能。上述兩點(diǎn)特性，使中藥實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)倉庫應(yīng)用平臺(tái)能夠?yàn)橹兴幹R(shí)發(fā)現(xiàn)與挖掘提供思路與依據(jù)。

9.中藥藥理實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)倉庫應(yīng)用平臺(tái)的特點(diǎn)和應(yīng)用范圍：

9.1數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)合理，數(shù)據(jù)加工標(biāo)準(zhǔn)，具備準(zhǔn)確地普適型檢索的特點(diǎn):

良好的數(shù)據(jù)導(dǎo)航，為數(shù)據(jù)檢索與查詢提供了便利的方式，用戶可以按照數(shù)據(jù)導(dǎo)航介紹，進(jìn)行一藥科學(xué)實(shí)驗(yàn)數(shù)

據(jù)準(zhǔn)確、結(jié)構(gòu)清晰、目的明確的檢索；由于中藥數(shù)據(jù)倉庫是基于文就數(shù)據(jù)庫的結(jié)構(gòu)化處理，因而